lncRNA在农业领域的研究成果(二)
【思路及相应结果】内容与图片源:(王立方,2015)【结论】通过全转录组测序、lncRNA测序和实时荧光定量的方法发现和鉴定了与家蚕产丝相关的lncRNA和其在不同产丝阶段的表达量变化,挑出了与家蚕产丝调控紧密相关的非编码RNA和lncRNA。例如位于P25基因下游互补链的lncR2034,与P25基因在后部丝腺呈相反的表达关系,表明lncR2034可能在5龄后部丝腺具有负向调控P25基因表达的作用(上图红括号标出)。 二、牛脂肪细胞分化【目的】脂肪或肌肉组织中的脂肪和脂肪酸成分,对牛肉的外观、质地、风味、硬度和保质期等都有积极影响,是肉类营养价值的核心,阐明脂肪生成的调控机制对于提高肉品质具有重要意义。本研究为秦川牛优异肉质性状遗传机制、改善其生长速度,培育我国专门化的肉牛品种、提高畜牧业竞争力等方面奠定了基础。【方法】研究中运用了RNA高通量测序技术、cDNA末端快速扩增、RNA荧光原位杂交、基因过表达、RNA干扰、双荧光素......阅读全文
调控免疫的lncRNA
当过度活化或脱靶时,免疫系统中正常对抗感染的一些细胞会转而攻击个体自身的组织。这一过程会推动作为自身免疫性疾病组成部分的炎症。现在,来自纽约大学Langone医学中心的一项新研究揭示出了抑制这些机制的一种新方法,有可能会影响未来的药物设计。相关论文 发布在12月16日的《自然》(Natur
lncRNA功能机制研究(二)
实验路线(1)LINC00346调控胃癌发展的上游机制结果:转录因子KLF5和MYC可与LINC00346启动子结合,并增强其表达a. 转录因子MYC、KLF5和 LINC00346的Oncoprint分析;b. 在含有或未含有胃癌KLF5/ MYC / LINC00346 SCNAs的转录因子
lncRNA研究策略与技术
研究背景:长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类不编码蛋白的RNA分子,长度在200 bp以上,起初被认为是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能;近期的研究表明lncRNA具有保守的二级结构,可以与蛋白、DNA和RNA相互作用,参与多种生物学过程的调控
lncRNA功能机制研究(一)
文章导读LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱和生物学功能
eLife:lncRNA调控癌症关键基因
Salk研究所的科学家们发现,一种长非编码RNA(lncRNA)是癌症发展过程中的一个关键基因开关。这项研究于四月二十九日发表在eLife杂志上,为相关癌症的治疗提供了一条新的途径。 研究人员将这种lncRNA命名为PACER(p50-associated COX-2 extragenic
lncRNA甲基化如何研究?
lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能,这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能轻松的变废为宝,竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章,你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化,作为最新的国自然热点受到
lncRNA助力叶酸研究新成果
LncRNA研究发表的成果五花八门,然而借助于lncRNA芯片,挖掘其中的高通量数据,发表5分影响因子的文章,还是可行的。本研究是以叶酸处理肥胖模型为基础,让我们来看看到底怎么样就可以在《Cellular Physiology and Biochemistry》(IF=5.104)上发表。研究背
如何快速查找LncRNA序列
查找LncRNA序列的网站有很多,包括Genebank,Ensembl,RefSeq,UCSC数据库等。今天,小编就给大家讲讲如何通过LncRNA ID号查找LncRNA的序列。 一.根据LncRNA来源数据库,进入相应链接。 1. Genebank:https://www.ncb
lncRNA的概念及形成过程
lncRNA,即Long non-coding RNA,你可以把它理解为不表达蛋白的mRNA。它的很多特征与mRNA很类似。比如,它与mRNA一样有启动子、有polyA尾巴、有不同剪接、有动态表达水平。除了不表达蛋白这一点以外,仅从核苷酸水平上来看,可以说它与mRNA并无实质分别。所以对于设计PC
lncRNA表达与RNA的延伸
LncRNA的火热研究已经有几年的时间了,关于lncRNA总归是有说不完的话题。目前对lncRNA的基础分析都已形成了一定的模式。然后,今年来lncRNA的相关文章依然如雨后春笋。 长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RN
如何快速查找LncRNA序列?
查找LncRNA序列的网站有很多,包括Genebank,Ensembl,RefSeq,UCSC数据库等。今天,小编就给大家讲讲如何通过LncRNA ID号查找LncRNA的序列。一.根据LncRNA来源数据库,进入相应链接。 Genebank:https://www.ncbi.nlm.nih.gov
Nature重要发现:调控免疫的lncRNA
当过度活化或脱靶时,免疫系统中正常对抗感染的一些细胞会转而攻击个体自身的组织。这一过 程会推动作为自身免疫性疾病组成部分的炎症。现在,来自纽约大学Langone医学中心的一项新研究揭示出了抑制这些机制的一种新方法,有可能会影响未来 的药物设计。相关论文发布在12月16日的《自然》(Nature)
LncRNA芯片应用于胃癌研究
研究背景 在全世界分范围内,每年因肝癌死亡的病例超过50万人,是主要的致死恶性肿瘤之一。在过去的十年中,随着影像学的进步以及健康体检的普及,越来越多的肝癌病人在患病早期被发现。但由于肝脏捐赠者的短缺,外科肝脏切除术仍然是治疗早期肝癌病人的最主要方法。目前对于术后患者缺乏准确
国际知名学者综述:LncRNA分类
美国St. Laurent Institute的Philipp Kapranov教授,是基因组学与系统生物学领域具有重要国际影响的专家,长期从事系统生物学和基因组功能方面的研究,其发现人类基因组能够产生大量的有功能作用的非编码RNA,在概念层次上重新定义了“基因”,这一发现被Science选为最
LncRNA芯片应用于胃癌研究
上海交通大学附属仁济医院房静远教授主要从事消化系统肿瘤发生的分子机制、早期诊断和分子治疗等相关研究。近期,该课题组应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片分析了胃癌组织的lncRNAs表达情况,筛选到可预测胃癌发生的分子标志物GClnc1,并且阐明了GClnc1在胃癌的发生和发展中是如何发挥
Cell重要发现:调控免疫的lncRNA
由麻省大学医学院Katherine A. Fitzgerald领导的研究小组证实,一种长链非编码RNA lincRNA-EPS发挥转录刹车作用限制了炎症。这一重要的研究发现发布在6月16日的《细胞》(Cell)杂志上。 细胞类型特异性的调控回路以复杂、动态和短暂调节的方式控制着基因表达。了解这
上海交大LncRNA研究刊登国际期刊
长非编码RNA(lncRNA)不编码蛋白质,最初被认为是基因组“暗物质”的一部分。最近,有研究表明,lncRNAs在染色质修饰复合物的招募过程中发挥作用,并能影响基因的表达。然而,是否lncRNAs以类似的方式在癌症中发挥作用,尚不明确。延伸阅读:中美学者JBC解析lncRNA在EMT中的作用。
新机制:lncRNA可调控小麦开花
冬小麦开花需要长时间低温环境的诱导,该过程称之为春化作用。这一过程受到外部环境因子和植物内在发育状态的双重复杂精准的调控。冬小麦不同品种的春化特性与其产量直接相关。在六倍体小麦中,TaVRN1是受低温诱导、可加速开花转换的关键调控因子。然而,目前对于在春化过程中TaVRN1逐步激活的分子机制尚不
lncRNA逆转录的引物如何设计
目前发现的大多数lncRNA都带有poly(A),可以通过Oligo(dT)、随机引物进行反转录扩增合成cDNA
长链非编码-RNA(lncRNA)研究策略
长链非编码 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)指的是转录本长度在 200-100000 nt 之间的 RNA 分子,它们不编码蛋白,位于细胞核或胞质内,具有保守的二级结构。研究显示,lncRNA 并非以前所认识的那样没有功能,它可与蛋白质、DNA 和 RNA 相互作
lncRNA在农业领域的研究成果
miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar --没想到在农业上大展身手啦 你没看错!不是标题党。说到miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar,想必聪明博学的你就已经猜到了是lncRNA。今天大阅哥要给大家挖一挖lncRNA在农业上的研究进展。为了写这篇主题
亲本lncRNA-MISSEN调控水稻胚乳的发育
胚乳是水稻的重要组成成分,是水稻种子的主要食用部分。因此,胚乳的发育情况直接影响稻米的产量和品质。长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度超过200nt的非编码RNA,其数量众多,在植物生长的各个环节发挥重要功能;然而其在胚乳发育调控过程中的作用机制未见报道。 近日,中山大学生命科学学院陈
华裔学者Cell发表lncRNA研究的利器
长非编码RNA(lncRNA)是长达两百个核苷酸以上的转录本,绝大多数位于细胞核内。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,这说明lncRNA具有重要的生物学意义。在测序技术的帮助下,人们已经发现了数千种lncRNA,但这些lncRNA的生物学功能依然
华人学者Nature-Genetics发布lncRNA重要发现
研究人员通过研究遗传变异准确地找到了45个与前列腺癌疾病发生发展有关的基因。 项目负责人、大学健康网络玛格丽特公主癌症中心科学家、多伦多大学医学生物物理学系助理教授Hansen He说,发布在《自然遗传学》(Nature Genetics)上的研究结果,阐明了这些称作为“长链非编码RNA”(l
中国学者解析肝癌中的lncRNA
肝细胞癌(HCC)是原发性肝癌的主要类型, 也是恶性程度最高的肿瘤之一。作为全世界最常见的一种癌症类型,全球每年有超过50万新患者,严重地危害着人们的身体健康。我国是肝癌高发国家,每年约有11万人死于肝癌,其死亡率在我国十大恶性肿瘤的排名中已从第三位上升到第二位。尽管HCC的诊断和治疗已经取得了
Diabetes:新研究发现调节leptin表达的lncRNA
长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200nt的非编码RNA,其在转录沉默、转录激活、染色体修饰等方面有重要的功能。许多研究已经发现肥胖会诱导脂肪细胞发生剧烈的转录组变化,最近一些证据表明长非编码RNA在该过程中发挥关键作用。来自新加坡的研究人员对棕色脂肪细胞和白色脂肪细胞中与肥胖相关
lncRNA在农业领域的研究成果(一)
miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar --没想到在农业上大展身手啦 你没看错!不是标题党。说到miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar,想必聪明博学的你就已经猜到了是lncRNA。今天大阅哥要给大家挖一挖lncRNA在农业上的研究进展。为了写这篇主题,大阅哥呕心沥
lncRNA在农业领域的研究成果(二)
【思路及相应结果】内容与图片源:(王立方,2015)【结论】通过全转录组测序、lncRNA测序和实时荧光定量的方法发现和鉴定了与家蚕产丝相关的lncRNA和其在不同产丝阶段的表达量变化,挑出了与家蚕产丝调控紧密相关的非编码RNA和lncRNA。例如位于P25基因下游互补链的lncR2034,与P25
Cell子刊:挑战传统理论的lncRNA
几乎整个人类基因组都会转录成RNA,但只有一部分RNA被用于蛋白质生产。大多数RNA(非编码转录组)的功能还是未知的,长非编码RNA(lncRNA)就是其中之一。 德国亥姆霍兹慕尼黑中心(Helmholtz Zentrum München)的研究人员发现,一种lncRNA(称为PARTICLE
Nature:神秘lncRNA让免疫无过无不及
根据宾夕法尼亚大学Perelman医学院病理学和实验医学助理教授Jorge Henao-Mejia博士领导的一项研究,称作长链非编码(lncRNAs)的特殊RNA分子是维持免疫健康的关键控制因子。这一研究发现为以一组白细胞异常寿命为特征的一些炎症性疾病提供了一个潜在药物靶点。研究论文发布在《自然