美国成功完成地中海果蝇的全基因组测序

美国农业部农业研究局(ARS)近日宣布,其组织的一个由来自全球25个研究机构的64位科学家组成的研究团队成功完成了地中海果蝇的全基因组测序。地中海果蝇对全球260余种水果、蔬菜和坚果形成危害,每年因其形成的农产品出口制裁、市场准入限制和其它成本增加等因素,对全球农作物造成数十亿美元的直接损失。 ARS发布的报告指出,科学家从基因组生物学的角度进一步发现了地中海果蝇的生命轨迹。该成果为研究人员寻找果蝇的生命弱点提供了线索,尤其是为分析其自身繁殖、病原体抗体、寄主植物、外界毒素分解能力等相关基因研究提供了路径。此次发现使人们更深入地掌握了果蝇作为入侵害虫的基因所在。 研究人员计划通过深挖地中海果蝇的基因组,掌握可以改善昆虫不育技术(SIT)有效性的信息。目前,SIT是全球范围内通用的一种研究方法,主要指在实验室大规模繁育雄性昆虫,并在对其进行消毒灭菌后,将其释放到野外进行交配,导致果蝇卵不能孵化,达到对其种群进行灭杀的......阅读全文

全基因组测序揭示肝癌相关基因突变

  由亚洲癌症研究组织(ACRG)、深圳华大基因研究院等多家单位合作完成的与肝细胞癌相关的基因突变研究成果于2013年6月20日在《基因组研究》(Genome Research)杂志上发表。这是继2012年3月份在《自然-遗传学》上发表的乙肝病毒整合机制研究之后,该研究团队在肝癌研究中所取得的又

科研论文|Sikun-2000全基因组测序性能卓越

上海交通大学联合思昆生物在国际期刊Scientific Reports发表了题为“Comparative assessment of the Sikun 2000 sequencing platform for whole genome sequencing”的研究成果。研究成果表明Sikun 20

Nature发布大型全基因组RNA分析研究

  由来自宾夕法尼亚州立大学的化学家和植物生物学家领导的一个研究小组开发出了一种分子技术,将有助于科学团体以从前不可能达到的规模,来分析在基因表达调控中起重要作用的分子。   科学家们开发出了一种方法,能够更精确预测在活细胞内核糖核酸分子(RNAs)的折叠情况,由此阐明植物以及其他的活体生物对环境

基因是否表达:cfDNA全基因组测序可揭晓

  《Nature Genetics》杂志上的研究表明,血循环游离DNA(cfDNA)可提供线索来预测基因的表达。  全基因组测序就能知道基因是否表达  基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中的遗传信息经过转录和翻译,最后转变成具有生物活性的蛋白质分子的

果蝇数量性状实验

【实验目的】1、以果蝇(Drosophila melanogaster)腹片着生的小刚毛为对象,研究数量性状遗传的特点。2、学习估算遗传(heritability)【实验原理】在生物中凡是可数、可度、可衡等并可用数字形式描述的性状,称数量性状(quantitative character)。数量性状

果蝇数量性状实验

【实验目的】1、以果蝇(Drosophila melanogaster)腹片着生的小刚毛为对象,研究数量性状遗传的特点。2、学习估算遗传(heritability)【实验原理】在生物中凡是可数、可度、可衡等并可用数字形式描述的性状,称数量性状(quantitative character)。数量性状

果蝇数量性状实验

【实验目的】 1、以果蝇(Drosophila melanogaster)腹片着生的小刚毛为对象,研究数量性状遗传的特点。 2、学习估算遗传(heritability)【实验原理】   在生物中凡是可数、可度、可衡等并可用数字形式描述的性状,称数量性状(quantitative character)

果蝇数量性状实验

【实验目的】1、以果蝇(Drosophila melanogaster)腹片着生的小刚毛为对象,研究数量性状遗传的特点。2、学习估算遗传(heritability)【实验原理】在生物中凡是可数、可度、可衡等并可用数字形式描述的性状,称数量性状(quantitative character)。数量性状

果蝇数量性状实验

【实验目的】1、以果蝇(Drosophila melanogaster)腹片着生的小刚毛为对象,研究数量性状遗传的特点。2、学习估算遗传(heritability)【实验原理】在生物中凡是可数、可度、可衡等并可用数字形式描述的性状,称数量性状(quantitative character)。数量性状

果蝇做菜你敢吃吗?以色列推出果蝇蛋白粉

  蛋白质是最重要也是最贵的营养物质之一。以色列一家初创企业表示,果蝇幼虫可以生产出大量既经济又安全的蛋白质。  从营养学的角度来看,果蝇幼虫富含蛋白质、钙、铁、镁等营养要素,而且不含胆固醇,是一种非常健康的食材。另外果蝇还具有培养周期短、速度快的特点,与其他昆虫相比,果蝇的饲养成本也十分低廉。  

香港基因组计划细节公布!将进行两万人全基因组测序

  基因大数据是精准医学的基础,全世界已经启动了众多大规模基因组学计划,朝着精准医疗的目标迈进。根据香港特区政府食物及卫生局本周提交的一份文件,作为香港基因组计划(Hong Kong Genome Project,HKGP)的一部分,香港计划对20,000名参与者进行基因组测序和分析。相关文件将于下

基因组所参与的人类全基因组关联分析合作研究获重要进展

与血小板数量相关的GWAS SNP与222 kb 以外的JAK2基因相关联  日前,中科院北京基因组研究所重大疾病基因组与个体化医疗实验室“百人计划”方向东研究员项目组助理研究员渠鸿竹博士等参与开展的国际合作研究“人类疾病全基因组关联分析研究”获得重大进展。相关研究成果Systema

香港中大破解鼻咽癌全基因组图谱

  香港中文大学7日宣布,该校医学院研究人员成功破解鼻咽癌的全基因组图谱,这一突破性发现有助评估鼻咽癌病人的预后情况,并向鼻咽癌的个人化治疗迈出一大步。  鼻咽癌是华南地区常见的癌症,也是一种极具侵略性的头颈癌。据介绍,鼻咽癌大多与感染EB病毒相关。由于缺乏早期病征,60%至70%患者于确诊时已届晚

我国首次完成寨卡病毒全基因组序列测定

  2月22日,记者从军事医学科学院获悉,该院与广州市第八人民医院、出入境检验检疫系统相关单位密切合作,在获得从委内瑞拉归国患者临床标本后,采用高通量测序技术,于2月21日直接从尿液中获得病毒全基因组序列。  寨卡病毒属黄病毒科,是一种主要由伊蚊传播的虫媒病毒。1947年首次在乌干达寨卡丛林中的恒河

Genome-Res:全基因组测序追踪耐药细菌传播机制

  耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)是一种常见的引发院内感染的致病菌,其也是资源不足医院感染的一大负担,此前当资源较好的临床机构运用全基因组测序来追踪MRSA的扩散时,针对有限的感染控制的传播动力学常常并不清楚,近日,来自剑桥大学的研究人员就利用全基因组测序的技术揭示了高传播率的资源受限医院中M

中国诞生全球首张水稻全基因组育种芯片

  中国中化集团公司下属中国种子集团有限公司联合华中农业大学、北京大学近日共同研制出全球首张水稻全基因组育种芯片,将大幅提高种子真实性检测准确性,有助提高育种效率,杜绝假种子危害。     中种公司生命科技中心喻辉辉博士表示,目前业内判断水稻种子真实性通常采用国标推荐的24个SSR标记检测结果,

张强峰博士Nature解析全基因组蛋白互作

  来自美国哥伦比亚大学,同济大学等处的研究人员发表了题为“Structure-based prediction of proteinCprotein interactions on a genome-wide scale”的文章,提出了一种基于三维结构信息的全基因组蛋白质相互作用计算预测方

我科学家主导完成白菜全基因组研究

  8月29日,由多国科学家共同合作完成的白菜全基因组研究成果在《自然—遗传学》上在线发表。这是由中国科学家主导,通过国际合作完成的又一重大成果。   白菜类蔬菜包括结球白菜、小白菜、菜心和芜菁等形态各异的一大类蔬菜。据了解,科学家开展了白菜基因组注释、比较基因组学、基因组进化和各种

全基因组测序是癌症诊断的强有力工具

  一位没有明显癌症家族史的妇女却罹患了早发性乳腺癌和卵巢癌,以及与治疗有关的急性髓细胞样白血病。研究人员对这名妇女进行了全基因组测序,所用的是从该患者的皮肤和骨髓中获取的DNA。在许多被怀疑患癌症可能性增加了的病人中,常规性的候选基因测试(如BRCA1  和  BRCA2突变检测)无法显示出有用的

玉米全基因组选择育种973项目启动

  2月18日,由中国农业科学院作物科学研究所牵头的973项目“玉米产量和品质性状全基因组选择育种的基础研究”启动会在京召开。科技部基础司副处长钱万强、农业部科教司巡视员石燕泉、中国农科院副院长刘旭、中国农科院科技局局长梅旭荣等领导出席了会议。中国农科院作科所所长万建民致欢迎辞,对各级领导及各位专家

全基因组测序可作为一线诊断工具

近日,一项涉及54个国家1000个家庭的研究表明,全基因组测序对未确诊疾病的诊断率比经典遗传诊断方法还高。科学家们呼吁将全基因组测序作为未确诊疾病的一线诊断工具,以给患者带来更好的医疗护理。相关结果以《Clinical exome sequencing: results from 2819 sa

近期全基因组测序研究进展一览

【1】Cell:全基因组测序揭示出自闭症新的基因变异doi:10.1016/j.cell.2017.08.047自闭症有遗传的根源,但是大多数病例并不能够通过当前的遗传测试加以解释。如今,在自闭症儿童中发现的基因组模式---细胞内完整的一套遗传指令---揭示这种出这种疾病的一种新的遗传特征。这种特征

JAMA:全基因组测序用于临床仍存在技术挑

  据3月12日发表在《美国医学会杂志》上的一则研究报告披露,在一项有12名成年人参与的探索性研究中,应用全基因组测序(WGS)与不完整的遗传性疾病基因的覆盖、检测具有最高潜在临床影响的基因变异的低复验性,以及临床报告发现的不确定性有关,尽管在某些案例中,WGS会发现基因变异株从而引入早期的医疗干预

科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱

  近日,中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作,破译了褐牙鲆全基因组序列,通过与半滑舌鳎全基因组比较分析,初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。  通过与半滑舌鳎全基因组

我国科学家率先完成枣全基因组测序

  日前,河北农业大学教授刘孟军团队与深圳华大基因科技服务有限公司合作,在世界上率先完成枣树的高质量全基因组测序,使枣树成为世界鼠李科植物和我国干果树种中第一个完成基因组测序的物种。《自然—通讯》10月29日在线发表了该成果。  刘孟军说,其团队自2010年启动枣基因组计划,从枣基因组大小

Science新闻:英国公布大型全基因组测序计划

  基因分析技术在快速发展,昨日英国首相宣布了一项大型计划,将对患有癌症及罕见疾病的十万英国人进行全基因组测序。现在许多国家都在为治疗疾病而努力解码国民的DNA,而英国这一新项目的不同之处在于,其测序的是全基因组而非基因组个别区域。   英国首相David Cameron在声明中称,英国国民医

定位全基因组范围DNA修复的新方法

  北卡罗来纳大学的研究人员近日开发出一种全基因组范围的测序分析,可定位DNA切除修复。这种被称为切除修复测序(XR-seq)的方法发表在新一期的《Genes & Development》杂志上。  这项研究的通讯作者是北卡罗来纳大学医学院生物化学及生物物理系的Aziz Sancar以及芝加哥大学人

《PLoS生物学》:老鼠全基因组测序图公布

  最新一期的开放存取的《公共科学图书馆·生物学》(PLoS Biology)杂志上,美国、英国和瑞典的研究人员公布了老鼠的全基因组测序图。老鼠成为继人类之后第二个完成全基因组测序的哺乳动物。   在对人类和老鼠的基因测序图进行综合性比较后,研究人员发现两者之间的遗传差异要比人们预想的大得多。老鼠

首个中国地区古人全基因组数据被测序

  近日,《当代生物学》发表了首次针对中国地区古人类的全基因组研究成果。该项目由中国科学院古脊椎动物与古人类研究所和德国马普进化人类研究所等团队合作完成,研究分析了距今4万年前出土于北京房山田园洞的一具男性个体基因组,发现东亚早期人群组成十分复杂。  虽然欧洲和西伯利亚地区都有古人类样本基因组被测序

科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱

  近日,中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作,破译了褐牙鲆全基因组序列,通过与半滑舌鳎全基因组比较分析,初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。  通过与半滑舌鳎全基因组