2016年的年度技术是什么?NatureMethods最新公布
在2016年的最后一个工作日,Nature Methods赶着发布了2017年的新刊,并在其中公布了2016年度技术,你们肯定会猜年度技术就是CRISPR系统,然并卵,对于前瞻性的每年盘点的年度技术来说,一个并不常见的名词:Epitranscriptome analysis(表观转录组学分析,生物通译)才是正解。 2006年,Andrew Fire和Craig Mello因发现RNA干扰而荣获诺贝尔生理学和医学奖。他们的发现引发了针对非编码RNA功能的狂潮,而这一直持续到今天。关于RNA分子本身是如何调节的一个新出现的问题就是:具体来说,在所有RNA种类中发现的转录后修饰的功能是什么? 近年来主要由基于测序的方法引发的技术突破成就了表观转录组学分析,即在全基因组范围内分析这种RNA修饰,并且已经指出了表观转录组的一些重要功能作用。 Epitranscriptome analysis名称是由希腊语“epi”作为前缀,指的......阅读全文
转录组学新技术揭露细胞何时崩溃
买房关键看位置,细胞在人体内也有类似的生存法则。3月,来自美国得克萨斯大学的癌症研究者在一场报告会上介绍了团队新成果:在肿瘤细胞周围,那些表面看似无恙的细胞,内部已有变化——它们比正常组织表现的更像肿瘤,且更易扩散。 据《科学》报道,这项成果的关键是空间转录组学技术,该技术能帮助研究者定位细胞
差示反转录PCR[mRNA差异显示技术
mRNA差异显示技术是由美国波斯顿Dena-Farber癌症研究所的Liang Peng博士和Arthur Pardee博士在1992年创立的。它也称为差示反转录PCR(differential display of reverse transcriptional PCR)简称DDRT-PCR。mR
差示反转录PCR[mRNA差异显示技术]
mRNA差异显示技术是由美国波斯顿Dena-Farber癌症研究所的Liang Peng博士和Arthur Pardee博士在1992年创立的。它也称为差示反转录PCR(differential display of reverse transcriptional PCR)简称DDRT-PCR。mR
逆转录病毒介导的基因技术
是目前将外源基因导入细胞的最有效的方法。此系统包括重组逆转录病毒载体和包装细胞两个部分,广泛应用的逆病毒载体LNL6是以Moloney鼠白血病病毒(MO-MLV)改建的。该病毒为RNA病毒,感染细胞后,其基因组RNA经逆转产生双链DNA拷贝插入宿主染色体形成前病毒,前病毒转录产生正链即为病毒基因组R
逆转录病毒介导的基因技术
是目前将外源基因导入细胞的最有效的方法。此系统包括重组逆转录病毒载体和包装细胞两个部分,广泛应用的逆病毒载体LNL6是以Moloney鼠白血病病毒(MO-MLV)改建的。该病毒为RNA病毒,感染细胞后,其基因组RNA经逆转产生双链DNA拷贝插入宿主染色体形成前病毒,前病毒转录产生正链即为病毒基因组R
Nature子刊:新技术开辟表观遗传研究新领域
来自犹他大学Huntsman癌症研究所(HCI)的研究人员,开发了一种强有力的新技术,可在人类RNA中鉴别出一组称作RNA胞嘧啶甲基转移酶(RMTs)的酶的靶标。他们将这一技术应用于一种与人类精神发育迟滞和癌症相关的特异RMT——NSUN2上,发现并确认了大量从前未知的RMT靶标,从而表明了这一
国外新技术可同时绘制多个表观遗传标记
瑞典卡罗林斯卡医学院和斯德哥尔摩大学的科研人员开发了Nano-CT,可以同时探测单个细胞和数千个细胞中的几种不同组蛋白标记,更详细地研究小鼠大脑中细胞如何获得独特属性和专门化。研究结果发表在《自然生物技术》杂志上。 该技术基于新型小蛋白质分子纳米体。这种纳米体在识别具有高特异性的其他蛋白质方面
表观密度简介
表观密度是指材料在自然状态下(长期在空气中存放的干燥状态),单位体积的干质量。通常表观密度是指材料在干燥的状态下的表观密度,其他含水情况应注明。多数材料为多孔物质,具有与外部相通的开口孔和不通的闭孔,将含有闭孔材料的密度称为“表观密度”。
表观密度概述
对于形状规则的材料,直接测量体积;对于形状非规则的材料,可用蜡封法封闭孔隙,然后再用排液法测量体积;对于混凝土用的砂石骨料,直接用排液法测量体积,此时的体积是实体积与闭口孔隙体积之和,即不包括与外界连通的开口孔隙体积。由于砂石比较密实,孔隙很少,开口孔隙体积更少,所以用排液法测得的密度也称为表观
北京生科院提出环形RNA全长转录本解析技术
4月12日,中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-实验手册》(Nature Protocols)上,发表了题为Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究论文,建立了环形RNA全长
科研家提出环形RNA全长转录本解析技术
近日,中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-实验手册》(Nature Protocols)上,发表了题为Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究论文,建立了环形RNA全长转录本解析
单细胞转录组制备仪的技术指标
将 C1 应用于单细胞 mRNA 测序,可以从多个细胞个 体平行处理多达 96 个 cDNA 文库,在任何 Illumina 测序仪上对 mRNA表达进行相对定量。此系统的主要特征包括: 高通量 -可对 96 个单细胞进行大规模平行、连贯的制备, 引入条形码序列标记(Barcode),可将测序
转录图谱的转录图谱的意义
在于它能有效地反应在正常或受控条件中表达的全基因的时空图。通过这张图可以了解某一基因在不同时间不同组织、不同水平的表达;也可以了解一种组织中不同时间、不同基因中不同水平的表达,还可以了解某一特定时间、不同组织中的不同基因不同水平的表达。人类基因组是一个国际合作项目:表征人类基因组,选择的模式生物的D
RNA复制、转录与逆转录
转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大
RNA的转录和逆转录
转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大
关于基因转录的转录因子介绍
转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态,RNA聚合酶自身无法启动基因转录,只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后,基因才开始表达。转录因子的结合位点
表观视角的概念
中文名称表观视角英文名称apparent visual angle定 义根据光源大应用学科机械工程(一级学科),光学仪器(二级学科),激光器件和激光设备-激光安全(三级学科)
表观视角的定义
中文名称表观视角英文名称apparent visual angle定 义根据光源大应用学科机械工程(一级学科),光学仪器(二级学科),激光器件和激光设备-激光安全(三级学科)
什么是表观遗传?
表观遗传学是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下,基因表达的可遗传的变化的一门遗传学分支学科。表观遗传的现象很多,已知的有DNA甲基化(DNA methylation),基因组印记(genomic imprinting),母体效应(maternal effects),基因沉默(gene silen
材料表观密度定义
表观密度表观密度(apparent density)又称视密度,是指多孔材料固体的质量与表观体积之比,表观体积是材料固体骨架部分所占体积加闭口孔隙所占体积,此体积即材料排开水的体积,其表达公式为:ρa = m / (V固+V闭)ρa—多孔材料的真密度,kg/m3;m—多孔材料固体的质量,kg;V固—
Nature-Methods公布2015年度技术
时近岁末,各大杂志接连进行了年终盘点,12月30日的《Nature Methods》也盘点了年度技术,选出了2015年最受关注,影响广泛的技术成果:单粒子低温电子显微镜(cryo-EM)。 一个蛋白质或蛋白质复合物的三维结构可以提供有关其生物学功能的重要见解。作为一种结构测定技术,单粒子cry
Nature-Methods公布2018年度技术
岁末,Nature Methods年度技术出炉——无限制行为动物成像(Imaging in freely behaving animals)。 入选理由为:成像技术和荧光传感器的技术进步帮助科学家们更加详细分析动物各种行为背后的神经元活动,这些动物包括大鼠,小鼠,鱼,果蝇和线虫。 一般来说,
关于体外转录的转录条件介绍
转录模板必须满足: 1. 在基因组全长克隆过程中,在正向引物5‘末端添加T7启动子序列; 2. 以T7启动子作为体外转录启动子,在启动子后面靶位序列连续带有3个G,转录效率最 高; 3. 在正向引物5/端添加一个帽子G,有利于提高体外转录RNA分子的侵染活性。
转录因子的转录调控区的介绍
同一家族的转录因子之间的区别主要在转录调控区。 转录调控区包括转录激活区(transcription activation domain)和转录抑制区(transcription repression domain)二种。近年来,转录的激活区被深入研究。它们一般包含DNA结合区之外的30-10
Cell-Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破
2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
Cell-Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破
2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
新型表观基因组技术——助力了解人体如何对抗疾病
关于疾病,以及我们的身体对疾病的反应方式,至今我们仍然知之甚少,部分原因在于人类基因组是一个完整的DNA组装体,我们每个人都有独一无二的序列。 弗吉尼亚理工大学的一个研究小组近期研发了一种新的表观基因组技术,可以帮助我们了解人体如何对抗疾病。这一研究成果公布在Nature Protocols
表观生物获Nature级RICseq技术成果转化授权!
近日,表观生物与中科院生物物理研究所签订RIC-seq技术转让(ZL实施许可)协议,获得全球范围内实施RIC-seq技术成果转化的授权,为生命科学研究提供RIC-seq技术服务和RIC-seq建库试剂盒销售。 什么是RIC-seq? RIC-seq是一项全球领先的原始创新技术,由中科院生
“细胞编程”重大研究计划2014项目指南发布
关于发布“细胞编程与重编程的表观遗传机制”重大研究计划2014年度项目指南的通告 国科金发计〔2014〕13号 根据国家自然科学基金“细胞编程与重编程的表观遗传机制”重大研究计划的总体工作安排,现公布本重大研究计划2014年度项目指南,请依托单位及申请人按要求提出项目申请。 附件: “细
RNA测序技术如何绘制全基因组转录终止?
近日,南方科技大学生命科学学院翟继先团队利用纳米孔单分子RNA测序技术绘制了拟南芥全基因组水平转录终止图谱。该方法能同时捕获包括已转录过polyA位点的 readthrough转录本、完成3’末端切割的5’或3’切割产物、以及已完成或正在进行多腺苷酸化(polyadenylation)的转录本在