2016年的年度技术是什么?NatureMethods最新公布

在2016年的最后一个工作日,Nature Methods赶着发布了2017年的新刊,并在其中公布了2016年度技术,你们肯定会猜年度技术就是CRISPR系统,然并卵,对于前瞻性的每年盘点的年度技术来说,一个并不常见的名词:Epitranscriptome analysis(表观转录组学分析,生物通译)才是正解。 2006年,Andrew Fire和Craig Mello因发现RNA干扰而荣获诺贝尔生理学和医学奖。他们的发现引发了针对非编码RNA功能的狂潮,而这一直持续到今天。关于RNA分子本身是如何调节的一个新出现的问题就是:具体来说,在所有RNA种类中发现的转录后修饰的功能是什么? 近年来主要由基于测序的方法引发的技术突破成就了表观转录组学分析,即在全基因组范围内分析这种RNA修饰,并且已经指出了表观转录组的一些重要功能作用。 Epitranscriptome analysis名称是由希腊语“epi”作为前缀,指的......阅读全文

测量任一细胞因子转录因子的其他技术

虽然其他技术可以测量任一细胞因子,转录因子,或另外的磷酸化蛋白质,细胞内流式细胞仪可以测量多个细胞内标记同时上面的singlecell电平。这种方法提供了数据信号反应,分化状态,和其他细胞活动。特定的细胞表面和细胞内标记物的荧光抗体的结合使用使高分辨率的样本之间的多种细胞类型内的表型和功能的差异比较

Cell-Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

新型表观基因组技术——助力了解人体如何对抗疾病

   关于疾病,以及我们的身体对疾病的反应方式,至今我们仍然知之甚少,部分原因在于人类基因组是一个完整的DNA组装体,我们每个人都有独一无二的序列。  弗吉尼亚理工大学的一个研究小组近期研发了一种新的表观基因组技术,可以帮助我们了解人体如何对抗疾病。这一研究成果公布在Nature Protocols

Cell-Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

表观生物获Nature级RICseq技术成果转化授权!

    近日,表观生物与中科院生物物理研究所签订RIC-seq技术转让(ZL实施许可)协议,获得全球范围内实施RIC-seq技术成果转化的授权,为生命科学研究提供RIC-seq技术服务和RIC-seq建库试剂盒销售。  什么是RIC-seq?  RIC-seq是一项全球领先的原始创新技术,由中科院生

关于转录因子的转录抑制区的介绍

  也是转录因子调控表达的重要位点,但是对其作用机理研究尚不深入。可能的作用方式有三种:1)与启动子的调控位点结合,阻止其它转录因子的结合;2)作用于其它转录因子,抑制其它因子的作用;3)通过改变DNA的高级结构阻止转录的发生。  转录因子必须在核内作用,才能起到调控表达的目的。因此,转录因子上的核

Nature-Methods公布2015年度技术

  时近岁末,各大杂志接连进行了年终盘点,12月30日的《Nature Methods》也盘点了年度技术,选出了2015年最受关注,影响广泛的技术成果:单粒子低温电子显微镜(cryo-EM)。  一个蛋白质或蛋白质复合物的三维结构可以提供有关其生物学功能的重要见解。作为一种结构测定技术,单粒子cry

Nature-Methods公布2018年度技术

  岁末,Nature Methods年度技术出炉——无限制行为动物成像(Imaging in freely behaving animals)。  入选理由为:成像技术和荧光传感器的技术进步帮助科学家们更加详细分析动物各种行为背后的神经元活动,这些动物包括大鼠,小鼠,鱼,果蝇和线虫。  一般来说,

“细胞编程”重大研究计划2014项目指南发布

关于发布“细胞编程与重编程的表观遗传机制”重大研究计划2014年度项目指南的通告 国科金发计〔2014〕13号   根据国家自然科学基金“细胞编程与重编程的表观遗传机制”重大研究计划的总体工作安排,现公布本重大研究计划2014年度项目指南,请依托单位及申请人按要求提出项目申请。 附件: “细

CCAAT转录因子

中文名称CCAAT转录因子英文名称CCAAT transcription factor定  义可与启动子中的CCAAT元件发生特异性相互作用的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

核转录分析

实验材料 cDNA0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA试剂、试剂盒 PBS NP-40 裂解缓: 20XSSC LNaOH 甘油储存缓冲液 10X 转录缓冲液 核苷酸:ATPGTPCTP 200uCi「α32P]-UTP 10XSET 蛋占酶 K 无 RNase 的 DNase

转录因子组成

真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分:亚基RNA聚合酶的亚基,它们是转录必须的,但并不对某一启动子有特异性。复合物某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复

转录的特点

转录时,细胞通过碱基互补的原则来生成一条带有互补碱基的mRNA,通过它携带密码子到核糖体中可以实现蛋白质的合成。与DNA的复制相比,转录有很多相同或相似之处,亦有其自己的特点。转录中,一个基因会被读取并复制为mRNA。就是说,以特定的DNA片段作为模板,以DNA依赖的RNA聚合酶作为催化剂,合成前体

体外转录

·         In Vitro RNA Transcription (Promega)For in vitro preparation single-stranded RNA probes or microgram quantities of defined RNA transcripts f

RNA-反转录

            实验材料 poly(A)+RNA 反转录酶 鼠源反转酶  或禽源反转录酶 试剂、试剂盒 oligo

核转录分析

            实验材料 cDNA 0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA 试剂、试剂盒 PBS

辅助转录因子

中文名称辅助转录因子英文名称ancillary transcription factor定  义协助RNA聚合酶同启动子结合,并促进已结合的RNA聚合酶启动转录速率的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

RNA-反转录

 实验材料 poly(A)+RNA反转录酶鼠源反转酶 或禽源反转录酶试剂、试剂盒 oligo(dT)12-18 lmol LTris-Cl 1mol LTris-Cl lmol LKC1 25 mmol LMgCl2 dNTP 混合物 0.lmol LDTT RNasin实验步骤 一材料与设备1)p

关于逆转录病毒介导的基因技术的介绍

  是目前将外源基因导入细胞的最有效的方法。此系统包括重组逆转录病毒载体和包装细胞两个部分,广泛应用的逆病毒载体LNL6是以Moloney鼠白血病病毒(MO-MLV)改建的。该病毒为RNA病毒,感染细胞后,其基因组RNA经逆转产生双链DNA拷贝插入宿主染色体形成前病毒,前病毒转录产生正链即为病毒基因

空间转录组测序技术在肿瘤研究进展的应用

  空间转录组测序技术是一种基于组织空间结构进行高通量转录组测序的技术。通过该技术,可以得到组织空间位置的基因表达图谱。因此,空间转录组技术是现阶段可实现空间二维基因表达检测的高通量技术。该技术为基于空间的发育研究和疾病异质性问题提供了一个解决方案。   空间转录组测序运用方向(Trends Bi

中科院学者Nature-Protocols:空间转录组测序新技术

  在真核细胞中,转录组的空间组织已经成为调节RNA转录后命运的一种有力手段,但是一般研究采用的是原位杂交或者原位的荧光染色,这项技术操作困难且通量低。近期来自中科院生物化学与细胞生物学研究所细胞生物学国家重点实验室等处的研究人员作建立了一种可以获得具有空间位置信息的少量细胞转录组图谱的技术方法:G

单仪细胞转录组制备的技术指标及功能

  技术指标  将 C1 应用于单细胞 mRNA 测序,可以从多个细胞个 体平行处理多达 96 个 cDNA 文库,在任何 Illumina 测序仪上对 mRNA表达进行相对定量。此系统的主要特征包括: 高通量  -可对 96 个单细胞进行大规模平行、连贯的制备, 引入条形码序列标记(Barcode

全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制(一)

2月7日,加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序,结合后续的功能机制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制!该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Circ

空间转录组测序技术在肿瘤研究进展的应用

空间转录组测序技术是一种基于组织空间结构进行高通量转录组测序的技术。通过该技术,可以得到组织空间位置的基因表达图谱。因此,空间转录组技术是现阶段可实现空间二维基因表达检测的高通量技术。该技术为基于空间的发育研究和疾病异质性问题提供了一个解决方案。空间转录组测序运用方向(Trends Biotechn

全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制(二)

3. 环状RNA的差异表达与前列腺癌的进展有关研究者对144个前列腺癌进行了聚类分析,与线性RNA相比,环状RNA最强模式与它们在每个样本中的总体丰度相一致。另外,极端circRNA分布的患者的预后明显较circRNA分布稳定的患者差,同时极端circRNA index组也与更高的转移发生率

空间转录组技术用于免疫治疗的研究与展望

肿瘤免疫治疗现状近年来,免疫疗法,这种通过激活患者的免疫系统来杀死癌细胞的策略,已成为对抗癌症的新希望。目前的免疫疗法主要基于癌症疫苗,细胞因子(例如白介素2),继细胞转移(ACT)和免疫检查点抑制。基于他们的特点,特别针对程序性细胞死亡-1 /程序性细胞死亡配体1(PD-1 / PD-L1)途

浙江大学携手华裔牛人发表表观遗传学新技术

  理解染色质修饰在发育和疾病中的调控作用是非常重要的,不过这样的研究往往会受到样本量的限制。基于染色质免疫共沉淀的深度测序(ChIP-seq)近来在这一领域取得了一定进展,但要实现高质量的图谱分析还面临着不少挑战。  浙江大学和卡内基科学研究所的研究人员开发了两项新技术,RP-ChIP-seq(r

表观遗传学测序技术助力三阴性乳腺癌患者分层

  一组澳大利亚的研究员使用甲基化特异性测序技术发现了三阴性乳腺癌中某些甲基化的差异,这些差异可能具有预后价值。  如果患者缺乏雌激素、孕激素受体,并且HER2基因没有过表达或者扩增,则认为乳腺癌是“三阴性”的。具有三阴性乳腺癌(或TNBC)的患者,可以分成两部分,即癌症进展非常迅速或者进展非常缓慢

当下最流行的表观遗传研究检测技术是什么?看看这里……

  11月17日Cell杂志SnapShot专栏介绍了表观遗传研究的检测方法,这四种方法包括:亚硫酸氢钠测序法(bisulfite sequencing)、染色质免疫沉淀测序技术(chromatin immunoprecipiation sequencing)、开放染色质测定(determinati

表观粘度怎么测

表观粘度计指的是对于非牛顿液体。一般非牛顿液体粘度随各种条件的变化也不断改变。那么我们就在一定温度一定转子转速的条件下,并观察一定时间,粘度变化最小,趋于稳定。选取的值就是我们说的液体其表观粘度。