2016年的年度技术是什么?NatureMethods最新公布

在2016年的最后一个工作日,Nature Methods赶着发布了2017年的新刊,并在其中公布了2016年度技术,你们肯定会猜年度技术就是CRISPR系统,然并卵,对于前瞻性的每年盘点的年度技术来说,一个并不常见的名词:Epitranscriptome analysis(表观转录组学分析,生物通译)才是正解。 2006年,Andrew Fire和Craig Mello因发现RNA干扰而荣获诺贝尔生理学和医学奖。他们的发现引发了针对非编码RNA功能的狂潮,而这一直持续到今天。关于RNA分子本身是如何调节的一个新出现的问题就是:具体来说,在所有RNA种类中发现的转录后修饰的功能是什么? 近年来主要由基于测序的方法引发的技术突破成就了表观转录组学分析,即在全基因组范围内分析这种RNA修饰,并且已经指出了表观转录组的一些重要功能作用。 Epitranscriptome analysis名称是由希腊语“epi”作为前缀,指的......阅读全文

RNA-反转录

            实验材料 poly(A)+RNA 反转录酶 鼠源反转酶  或禽源反转录酶 试剂、试剂盒 oligo

CCAAT转录因子

中文名称CCAAT转录因子英文名称CCAAT transcription factor定  义可与启动子中的CCAAT元件发生特异性相互作用的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

核转录分析

            实验材料 cDNA 0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA 试剂、试剂盒 PBS

转录因子组成

真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分:亚基RNA聚合酶的亚基,它们是转录必须的,但并不对某一启动子有特异性。复合物某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复

核转录分析

实验材料 cDNA0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA试剂、试剂盒 PBS NP-40 裂解缓: 20XSSC LNaOH 甘油储存缓冲液 10X 转录缓冲液 核苷酸:ATPGTPCTP 200uCi「α32P]-UTP 10XSET 蛋占酶 K 无 RNase 的 DNase

辅助转录因子

中文名称辅助转录因子英文名称ancillary transcription factor定  义协助RNA聚合酶同启动子结合,并促进已结合的RNA聚合酶启动转录速率的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

Nature年度技术:定向蛋白质组学

  时近岁末,各大杂志接连进行了年终盘点,此前出版的《Nature》杂志也对2012年进行了回顾,评点了2012年的科技进展,科技政策以及重要人物,中国科学家王俊入选了人物篇。同时《Nature Methods》也盘点了今年与明年的技术热点,选出了2012年度技术成果:定向蛋白质组学(targe

转录组测序与转录表达谱测序的异同

转录组测序可以得到特定条件下所有mRNA转录本的丰度信息,从而发现新的转录本和可变剪接体基因表达谱(gene expression profile):指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特

RNA的转录与逆转录相关介绍

转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大

转录组测序和全转录组测序的区别

全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术,可以全面获取样本中转录产物信息,结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制, 进行联合分析,深入挖掘转录水平调控网络。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有

Nature2015最佳评论文章:汤富酬、文路、马晓娅入选

  Nature杂志近日展开了一年一度的年终大盘点,评出了2015年的最佳评论文章。本次盘点选入了三名中国学者的两篇文章,他们分别是北京大学的研究员汤富酬和研究员文路,以及云南大学的研究员马晓娅。  汤富酬和文路在这篇文章中重点介绍了Grün等人开发的RaceID的算法,该算法能够在复杂的细胞混合物

新的基因编辑领域突破口——表观遗传调控(一)

几十年来,DNA一直被认为是决定生命遗传信息的核心物质,但是近些年不断的研究表明,生命遗传信息从来就不是基因所能完全决定的,比如科学家们发现,可以在不影响DNA序列的情况下改变基因组的修饰,这种改变不仅影响个体的发育,而且还可遗传给后代。如肿瘤等多种疾病并非仅由基因突变而引起,且与DNA和组蛋白修饰

中美学者Nature子刊:表观遗传研究的新蛋白微阵列技术

  生物分子间相互作用,尤其是基于动态修饰的生物分子间识别互作,是生命活动在分子层面的具体体现,也是生命调控的重要生化分子基础。因此,发现和鉴定生物分子互作对是了解信号转导、基因调控、以及功能复合物形成的基础和前提。  来自清华大学医学院,美国德州大学MD安德森癌症中心等处的研究人员发表了题为“De

天津工生所酵母转录单元高效组装整合技术获进展

  酿酒酵母广泛应用于能源燃料、化学品和天然化合物等的合成生产。开发简易高效的,能够在酵母染色体上组装整合大量转录单位的技术方法,实现复杂异源代谢途径在酵母中的组装与表达,是酵母合成生物学与代谢工程研究的热点。  中国科学院天津工业生物技术研究所微生物与合成生物学研究团队和新酶设计与酵母基因组工程研

动物所建立高通量大视野空间转录组学新技术

在生物医学研究领域,空间转录组学技术已成为揭示细胞组成、空间异质性以及细胞间复杂相互作用的关键工具,对探讨胚胎发育、神经科学及疾病发生机制等至关重要。然而,该技术在实际应用中受限于成本高昂、视野范围有限和数据处理通量不足等技术瓶颈。这些限制在构建三维及多时空全转录组图谱时尤为突出。9月10日,中国科

科学家开发单细胞全转录组测序新技术

  北京大学生物动态光学成像中心黄岩谊、汤富酬课题组在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表题为“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的论文。该研究利用微流控芯片技术实现了高质量单细胞的全转录组测序样品准备,全面提高了单细胞全

ddRTPCR(差示反转录PCR,又mRNA差别显示技术)

mRNA差别显示技术也称为差示反转录 PCR(Differential Display of reverse Transcriptional PCR)简称为ddRT-PCR。它是将 mRNA反转录技术与PCR技术二者相互结合发展起来的一种RNA指纹图谱技术。 目前已广泛应用于

《Cell》重磅!全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制

  2月7日,加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序,结合后续的功能机制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制!该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Ci

Cell》重磅!全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制!

  2月7日,加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序,结合后续的功能机制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制!该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Ci

RNA复制的转录与逆转录的过程介绍

  转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成

信使RNA的反转录酶与反转录过程

  定义:以反义RNA为模版,通过反转录酶,进行的RNA转录  1.概念反转录是以RNA为模板合成DNA的过程,也称逆转录。这是DNA生物合成的一种特殊方式。  2.反转录酶与反转录过程  反转录过程由反转录酶催化,该酶也称依赖RNA的DNA聚合酶(RDDP),即以RNA为模板催化DNA链的合成。合

表观遗传“淘金热”袭来

  一些奇思妙想似乎会突然冒出来,不过2008年,Chuan He却有意地寻找这样一个想法。美国国立卫生研究院当时刚刚启动资金支持高风险、高影响项目,伊利诺伊州芝加哥大学化学家He打算申请。不过,他首先需要一个好的领域。  他一直在研究修复损伤DNA的蛋白家族,他开始怀疑这些酶可能也会对RNA产生作

表观相对分子量

中文名称表观相对分子量英文名称apparent relative molecular weight定  义利用已知分子量的标准参照物通过凝胶层析或SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳等实验结果推导所得生物大分子的分子量。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

Nature发布表观遗传重要发现

  营养繁殖是无性繁殖的一种形式,常用于商业化大规模生产园林植物和树,因为它能够实现高性能、基因相同个体的快速繁殖。然而对于某些物种,营养繁殖有着严苛的要求,需要技术先进的无菌培养来生成可以发育为苗木的克隆胚胎。而有一部分以这种方式繁殖的植物会因遗传变异或表观遗传改变显示出发育异常。  在9月9日的

Cell发布表观遗传重要成果

  为了将两米长的DNA分子装入到只有几千分之一毫米大小的细胞核中,DNA长片段必须强力地紧密压缩。表观遗传学标记维持着这些称作异染色体的部分。来自马克思普朗克免疫生物学和表观遗传学研究所的科学家们现在进一步发现了异染色质形成必需的两种机制。相关论文发布在近期的《细胞》(Cell)杂志上。   由

成年干细胞的表观控制

  Linheng Li及同事完成的一项新的研究工作研究的是,造血干细胞中H19“差异化甲基化区域” (H19-DMR) 的删除所产生的效应。DMR已知控制印记基因H19 和 Igf2从H19–Igf2 位点的表达,将H19 的表达限制于母方等位基因,将Igf2的表达限制于父方等位基因。作者

表观遗传调节的概念介绍

中文名称表观遗传调节英文名称epigenetic regulation定  义与DNA排列顺序的变化无关的,调节基因表达的频率、速度或者表达度的过程。如DNA甲基化、组蛋白修饰等。这种调节不能通过种系或生殖细胞传递,但可通过细胞分裂传给子代,在静止细胞的细胞质中也能稳定地自我繁殖。这种调节的失误或减

Science:祖母的表观遗传“原罪”

  如果一名孕妇营养不良,由于所谓的“表观遗传”效应,她的孩子罹患肥胖症和2型糖尿病的风险要高于一般人。一项小鼠新研究证实,妊娠期的这种营养“记忆”还可通过雄性后代的精子传递给下一代,提高她们孙辈的疾病风险。换句话说,其印证了一句老的格言“你祖母的饮食都会影响你”。这项研究还对表观遗传效应如何代代相

-Science:父亲“原罪”之表观遗传

  如果你患有糖尿病、癌症或甚至有心脏问题,或许你应该将其归罪于父亲或甚至祖父的行为或环境。近年来,科学家们已证实甚至在母亲怀上后代之前,父亲的生活经历包括食物、药物、暴露于毒性产物、压力等都可以影响他的孩子、甚至孙子的发育和健康。  然而,尽管科学家们在这一领域已开展了十年的研究工作,对于延续数代

表观基因组的概念

中文名称表观基因组英文名称epigenome定  义全基因组的甲基化图谱。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)