上海生科院揭示RNA可变剪接在细胞周期时序性的调控机制
3月25日，国际学术期刊Elife 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所王泽峰研究组的最新论文“An extensive program of periodic alternative splicing linked to cell cycle progression”。该工作首次发现了RNA可变剪接的时序性调控，阐述了细胞周期中RNA剪接的周期性波动对细胞分裂增殖的调节作用。在机理上进一步揭示SR蛋白激酶CLK1在这些周期性可变剪接中的作用机制。 选择性剪接对于蛋白表达的多样性具有重要意义：超过90%的人类基因可以通过可变剪接产生不同功能的蛋白亚型。在生物体中，可变剪接被严格调控，同一基因在不同组织细胞中或同一组织的不同发育阶段里经常表达为有不同的剪接亚型，剪接的异常调控与癌症等许多疾病密切相关。 在以往的报道中，细胞周期是通过调控特定基因的周期性表达来协调实现的。该研究首次发现了人类基因组中普遍存在......阅读全文
环形RNA可变反向剪接和可变剪接表达图谱被系统绘制
6月30日，国际学术期刊Genome Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所杨力研究组和生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于环形RNA研究的最新进展：Diverse alternative back-splicing and alternative spl
RNA－剪接
中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定 义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子，连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞遗传（二级学科）
GUT揭示癌症治疗靶点调控RNA可变剪接的分子机制
来自浙江大学基础医学院，中国药科大学等处的研究人员发表了题为“SRSF6-Regulated Alternative Splicing that Promotes Tumor Progression Offers a Therapy Target for Colorectal Cancer”的文
关于可变剪接的基本介绍
可变剪接(alternative splicing)是指在同一个mRNA前体内部数个外显子之间产生的差异性连接。这种剪接可以使同一个基因在不同的发育阶段、不同分化状态甚至不同生理状态下,得到多个相似但有差异的mRNA,进而被翻译为氨基酸序列相近似、性质和功能有差异的蛋白质。高度通用性的剪接位点G
调控玉米性状－可变剪接“火”起来
最近，中国农业大学国家玉米改良中心田丰教授团队与杨小红教授团队合作研究，以368份玉米自交系未成熟籽粒为实验材料，定位玉米种全基因组水平QTL(数量性状位点），全面解析了其可变剪接的调控机制，并为研究表型变异提供了重要线索。相关论文近日发表在《植物细胞》杂志上。 可变剪接，这个早在上世纪就
调控玉米性状－可变剪接“火”起来
可变剪接，这个早在上世纪就被提出的概念，在近几年的研究中，又“火”了起来。科学家们发现，可变剪接不仅丰富蛋白质组多样性，还在生物体内起着重要的调控作用。 可变剪接是什么？这项研究有了什么新发现？是怎样得出来的？实验中的难点是什么？对之后的研究有怎样的借鉴意义？科技日报就此采访了该研究团队。
上海生科院揭示RNA可变剪接在细胞周期时序性的调控机制
3月25日，国际学术期刊Elife 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所王泽峰研究组的最新论文“An extensive program of periodic alternative splicing linked to cell cycle progression”。该工作
杨力受邀发表MolecularCell综述解析可变剪接
中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所杨力研究组受邀在《分子细胞》（Molecular Cell）发表了题为RNA structure switches RBP binding 的专评文章，对该刊同期发表的一项题为RNA sequence context effects measured in
概述RNA剪接的类型
RNA剪接及其机制的研究,不仅解决了不连续基因“连续”转录产物的问题,而且对于了解不连续基因的起源乃至整个生命起源与进化等问题,均产生极大的推动作用,另外,由此发现了核酸分子的催化功能,进一步拓宽了对于酶的认识。不连续基因中的介入序列称为内含子；被内含子隔开的基因序列称为外显子(exon)。一个
关于RNA剪接的简介
大多数脊椎动物基因的编码序列,无论是编码多肽的基因还是编码除mRNA以外的RNA分子的基因,都是由非编码的间隔序列(内含子)分隔为各个外显子部分。这些基因的外显子和内含子都转录在一条初级RNA转录分子中,接下来,此初级RNA转录分子要经过RNA剪接,此过程包括一系列的加工反应：RNA的内含子部分
遗传发育所在大豆可变剪接研究中取得进展
作为一种重要的基因转录后调控机制，可变剪接在真核生物中普遍发生，在基因表达和功能多样性调控中起着重要的作用。不同物种、同一物种的不同组织以及不同基因家族的可变剪接在形式和比例上都存在差异，然而，决定这些差异的因素还尚不为人知。 中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜课题组通过对来自大豆不同
tRAS（转录组可变剪接调控深度分析）
本公司采用自主研发与成熟开源软件相结合的方式构建了专业高效的生物信息分析流程，对您获得的海量RNA-seq序列的质量、特征等重要信息进行图形可视化；根据对照和实验组，系统分析您样品中所蕴藏的可变剪接调控规律，中肯分析所揭示出的重要科学规律；让您快速“发现”所关注的生物学，医学和农业问题的答案。 我们
RNA剪接为什么会出错
“这项研究不仅提出了用小分子药物治疗维斯科特-奥尔德里奇综合征的新目标，而且为RNA剪切的基础生物学提供了新的线索，这是一个重要的但尚未完全被理解的过程，”共同通信作者Juan Carlos Izpisua Belmonte说，他是Salk基因表达实验室的教授和Roger Guillemin主席。患
关于RNA剪接的基本介绍
RNA剪接 （RNA splicing）是指从DNA模板链转录出的最初转录产物中除去内含子,并将外显子连接起来形成一个连续的RNA分子的过程。RNA剪接机制的研究,是80年代生物化学和分子生物学领域中最有生机的研究课题之一,它不仅解决不连续基因转录产物的剪接问题,而且对于了解不连续基因的起源乃至
关于RNA剪接的定义介绍
RNA剪接是真核细胞基因表达中非常重要的一个生物过程,通过RNA剪接,可以产生许多具有功能的,带有编码信息的mRNA,它对生物的发育及进化至关重要。所以RNA剪接识别是正确理解基因表达过程的重要一步,而剪接的识别的关键是依赖于剪接位点的判定。真核细胞pre-mRNA的剪接位点处存在一定的序列保守
关于RNA剪接第Ⅱ类内含子的自我剪接介绍
第Ⅱ类内含子,其5’剪接点和3’剪接点的序列多为…外显子…↓GUGCG…内含子…嘧啶碱AU↓…外显子…,除了剪接点序列特征之外,在离3’剪接点上游6-12bp有一段比较保守的序列,一致序列为CUCAC,在这一保守序列A的两侧各有一段3~5核苷酸的短序列能与上游方向的核苷酸互补,而A总是不包含在这
tNAS（转录组新可变剪接位点的发现）
本公司采用自主研发与成熟开源软件相结合的方式构建了专业高效的生物信息分析流程，对您获得的海量RNA-seq序列的质量、特征等重要信息进行图形可视化；发现您样品中的新可变剪接事件，揭示出的重要科学问题进行中肯分析；让您快速“发现”所关注生物学问题，医学问题和农业问题的答案。 我们的流程：1. Pr
新研究揭示可变剪接调控光形态建成的分子机制
太阳光不仅是植物光合作用的能量来源，也是一种重要的环境信号，调节植物的生长发育进程。其中幼苗光形态建成受光质、光量的精确调控，涉及不同的光受体和一系列信号调控因子。COP1是光形态建成的一个明星蛋白，它作为一种E3泛素连接酶，与目标蛋白互作并促进其降解，COP1在植物和动物中广泛存在。真核生物
RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析,所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析,来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必需的
RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析，所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析，来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必需的
RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析，所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析，来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必需的
PNAS：RNA剪接调控研究方面新的进展
近日，PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展。该研究揭示了RNA二级结构在剪接调控中的新机制，并首次证明了MYC调控蛋白FUBP1同样具有剪接调控活性。 RNA剪接是连接转录与翻译的重要桥梁，也是生物体蛋白质多样性的重要保证。在真核生物中，mRNA前体被剪
Nature：针对RNA转录和剪接的新观点！
细胞通常产生区室来控制重要的生物功能。细胞核就是一个很好的例子；它被核膜包围着，容纳着基因组。然而，细胞还含有未被膜包围的较为短暂存在的封闭室，就像水中的油滴。在过去两年中，这些称为液滴状“凝聚物（condensates）”的封闭室已越来越多地被认为是控制基因的主要参与者。如今，在一项新的研究中
简述RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析，所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析，来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必
上海生科院科研人员研发了－premRNA可变剪接分析软件CASH
4 月 6 日，国际著名生物信息学期刊 Briefings in Bioinformatics 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）冯英组和浙江农林大学吴文武博士，上海列冰生物科技有限公司宗杰博士的最新研究进展“CASH： a constructing comprehensiv
营养所在RNA剪接调控研究中取得新进展
近日，PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展：Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing rep
上海生科院揭示反向剪接RNA成环与RNA转录的偶联机制
4月19日，国际学术期刊Cell Reports 发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组与计算生物学研究所杨力研究组最新合作研究论文。此工作深入研究了环形RNA生成与RNA转录的偶联机制，揭示了环形RNA在神经分化过程中表达上调原理。 环形RNA是一类通过反向
METTL16介导通过阻碍对剪接位点的识别从而抑制RNA剪接
RNA m6A修饰是目前RNA表观遗传领域研究的热点，对于m6A的甲基化酶和去甲基化酶，相信大家也是耳熟能详。事实上，大名鼎鼎的METTL3仅能结合约22%的m6A位点，这提示还有其他m6A甲基化酶。确实，在METTL3之后，METTL16也被鉴定为m6A甲基化酶，但是它的底物远不如METTL3
北京生科院在环形RNA研究领域取得新进展
6月28日，国际学术期刊Nature Communications 在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组实验室赵方庆团队题为Comprehensive identification of internal structure and alternative splicing even
研究揭示甘蔗花叶病毒干扰RNA剪接促进侵染
近日，中国农业大学植物保护学院教授周涛课题组在甘蔗花叶病毒（SCMV）相关研究上获得了新进展。研究发现，SCMV侵染改变了玉米八氢番茄红素合成酶基因（ZmPSY1）的转录本可变剪接模式，因此促进病毒侵染。相关成果发表于《植物生理学报》。 SCMV是我国和非洲玉米生产上的一种主要病原，广泛分布于世