研究揭示TCR复合物胞内段的结构动态性

3月24日,国际学术期刊《细胞研究》(Cell Research)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员许琛琦研究组与南京大学教授曹毅合作完成的最新研究成果Lipid-dependent conformational dynamics underlie the functional versatility of T-cell receptor。该研究揭示了TCR复合物胞内段的结构动态性,为TCR复合物传导不同刺激信号提供了结构基础。 在获得性免疫系统中,T细胞能够清除病原体和感染病变的细胞。T细胞抗原受体(T-cell receptor, TCR)是T细胞识别“自我”和“非我”物质的主要受体,可以和抗原呈递细胞(APC)表面特定的peptide-MHC复合物(pMHC)结合来发挥作用。ab TCR复合物由TCRab异源二聚体、CD3eg、CD3ed和CD3zz 组成。TCR与pMHC结合后,......阅读全文

研究揭示TCR复合物胞内段的结构动态性

  3月24日,国际学术期刊《细胞研究》(Cell Research)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员许琛琦研究组与南京大学教授曹毅合作完成的最新研究成果Lipid-dependent conformational dynamics underlie the f

中科院,南京大学Cell-Res发文-解析TCR复合物新调控机制

  来自中科院生物化学与细胞生物学研究所的研究人员发表了题为“Lipid-dependent conformational dynamics underlie the functional versatility of T-cell receptor”的文章,揭示了TCR复合物胞内段的结构动态性,为

内质网膜修饰的杂化纳米复合物调控siRNA胞内命运

  权威国际期刊Nature Communications(IF="11.965)在线发表了北京大学中国天然药物及仿生药物国家重点实验室王坚成教授团队的最新研究成果“Regulating Intracellular Fate of siRNA by Endoplasmic Reticulum Mem

新质谱技术可获取完整蛋白复合物重要结构信息

本周的《自然―方法学》介绍了一种提高质谱仪分辨率和可用性的改进方法,科研人员可利用该方法获得完整蛋白复合物的重要结构信息。 关于大型蛋白复合物的详细结构信息包括可与之结合的分子有哪些、该复合物是如何组成的等,是可以通过使用能检测高分子量离子的质谱技术来获得的。迄今为止,这项技术的实现需要采用特殊定

TIRFM物镜简介

全内反射荧光显微镜(TIRFM)是一门非常复杂的光学技术,目前已经被细胞生物学家和神经科学家广泛应用,成为了细胞-基底接触区域内的丰富的细胞生命活动最强有力的探测方法。如细胞膜内蛋白质的动力学过程,基底附近的细胞骨架,细胞运动等。TIRFM技术依赖于斜射光线在两种不同折射率光学介质表面产生的极浅的消

著名学者解析如何利用质谱确定蛋白复合物的结构

  质谱技术已经成为了蛋白质组学研究的主力。这种技术方法能精确的检测多肽,从而帮助研究人员识别并测序多肽分子,分析它们的特征,了解它们如何进行化学修饰的。  但大多数蛋白质并不是单独行动的,一些关键的生物学过程,如DNA 复制、转录、翻译、细胞分裂和能量生成都依赖于大型蛋白复合物的行为,这些蛋白复合

大气细颗粒物在线质谱监测系统原理

    近年来,我国雾霾频发影响人们的日常生活和身心健康。针对严重的气溶胶颗粒污染状况,聚光科技与德国吉森大学合作,引进国际ling先的单颗粒气溶胶质谱技术,推出聚光科技LAMPAS-3.0大气细颗粒物在线质谱监测系统,其经历了二十多年发展,并在欧洲多个地方展开环境实地监测。该系统可广泛用于环境监测

中科院最新Nature文章

  来自中科院上海生命科学研究院、中科院合肥物质科学研究院和清华大学的研究人员在新研究中证实钙离子(Ca2+)通过调节脂质电荷调控了T细胞受体的激活。相关论文“Ca2+ regulates T-cell receptor activation by modulating the charge p

大气细颗粒物在线质谱监测系统的原理

    大气细颗粒物在线质谱监测系统可广泛用于环境监测站、气象局、科研院所等环境空气质量监测场所中气溶胶颗粒物粒径和化学成分在线监测及在线源解析。大气细颗粒物在线质谱监测系统由进样系统、测径系统、激光电离系统和飞行时间质谱仪(TOF-MS)组成,气溶胶颗粒通过差分真空透镜加速准直进入真空室;随后在测

指尖“质谱”:纳米孔技术打造便携肽段质谱仪

  质谱仪对蛋白质研究来说可谓是无价之宝,但是它们通常体积庞大,价格昂贵,局限于专门的实验室。当下,生物医学领域的下一个革命直指蛋白质组学——对不同细胞类型中表达的蛋白质进行大规模分析。尽管你的身体里每一个细胞似乎都携带相同的DNA,但不同细胞类型的蛋白质表达差异很大。此外,蛋白质生产出来后会被修饰

用质谱数据对肽段从头测序实验

方案一 方案二 方案三             实验方法原理 单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列,即相邻肽段间相差一个氨基酸残基,用质谱分析肽阶梯,通常用 MALD

用质谱数据对肽段从头测序实验

实验方法原理 单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列,即相邻肽段间相差一个氨基酸残基,用质谱分析肽阶梯,通常用 MALDI-TOF,MS 分析。 MS/MS 测序用的是上文所述用于数据库检索的 CID 谱,但碎片离子由人工完全解析。用于MS 序列分析的肽阶梯是由化学或酶法降解肽段产生,由 C 未端或N未端

黄超兰Cell发文-绝对定量质谱揭示CD3ε的多重信号转导功能

2020年7月29日,北京大学医学部精准医疗多组学研究中心黄超兰团队,中科院上海生化与细胞所许琛琦团队、美国加州大学圣地亚哥分校惠恩夫团队,联手在Cell上发表了题为“Multiple signaling roles of CD3ε and its application in CAR-T cell

抗原呈递细胞的抗原呈递作用

  细胞在其表面以能被T细胞受体(TcR)特异性识别的方式表达抗原的过程称为抗原呈递。APC以MHC-Ⅱ分子限制的方式将抗原递给辅助性T细胞(TH);各种靶细胞心以MHC-Ⅰ限制的方式将抗原呈递给细胞毒性T细胞(TC)。APC的抗原呈递作用是一个涉及抗原摄取、处理与呈递的复杂过程。各类APC呈递抗原

我所发表功能蛋白质复合物发现和结构表征质谱策略综述

  近日,我所生物技术研究部生物分子结构表征新方法研究组(1822组)王方军研究员团队与南方科技大学田瑞军教授团队合作,发表了功能蛋白质复合物发现和结构表征质谱策略的综述文章。  功能蛋白复合物的发现和结构—功能表征研究在理解和干预生物学过程中发挥着至关重要的作用。亲和纯化质谱(AP-MS)是发现功

胞质面

中文名称胞质面英文名称cytosolic face定  义质膜朝向细胞质的一面。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞结构与细胞外基质(二级学科)

胞质分裂

胞质分裂是在二个新的子核之间形成新细胞壁,把一个母细胞(mother cell)分隔成二个子细胞(daughter cell)的过程。在一般情况下,核分裂和胞质分裂在时间上是紧接着的,但是在有些情况下,核分裂后不一定立即进行胞质分裂,而是延迟到核经过多次重复分裂后再形成细胞壁,例如经常在

最新!哈工大黄志伟教授团队《自然》发文

  8月28日,哈尔滨工业大学生命学院黄志伟教授团队在《自然》(Nature)上在线发表题为《人T细胞受体-共受体复合物组装的结构基础》(Structural basis of assembly of the human TCR-CD3 complex)的研究文章(Article)。该研究首次解析了

用质谱数据对肽段从头测序实验(一)

实验方法原理单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列,即相邻肽段间相差一个氨基酸残基,用质谱分析肽阶梯,通常用 MALDI-TOF,MS 分析。 MS/MS 测序用的是上文所述用于数据库检索的 CID 谱,但碎片离子由人工完全解析。用于MS 序列分析的肽阶梯是由化学或酶法降解肽段产生,由 C 未端或N未端断

用质谱数据对肽段从头测序实验(三)

实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤另外一种便于人工解析 CID 谱及从头测序的化学方法是对肽段的羧基实行甲酯化。这个反应使肽段每一个羧基质量增加 14u, 包括未修饰的(末端、 Asp 和 Glu上的羧基。如果肽段中没有酸性残基,同时C未端没有被修饰,那么只有 y 系列离子及其中性丢失离子会表

用质谱数据对肽段从头测序实验(二)

实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤第二种方法,也称为"nested peptide secquendng", 是在一个 Edman 降解循环中多次加入多肽/蛋白质底物心在此法中加入过量易挥发的 Edman 试剂以使反应完全,每一循环中的过显试剂可通过蒸发被除去。经 MALDI-MS 分析得到肽

一种基于物联网技术的氦质谱检漏系统

针对现有氦质谱检漏系统的技术缺陷,提出了一种基于物联网技术的氦质谱检漏系统的设计与实现方案。该系统综合了嵌入式与ZigBee、WiFi等物联网技术,由主控模块、采集模块、执行模块等组成;主控模块可实时整合氦质谱检漏仪与采集模块的数据信息,控制执行模块自动完成检漏流程,并利用灰度算法预测检漏信号的稳定

基于糖苷键质谱可碎裂交联剂的蛋白质复合物原位解析

近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员张丽华团队,研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂,显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度,同时具有良好的两亲性和生物兼容性,实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和规模化精准解析。作为生命活动的执行者,蛋白质通过相

质谱仪质谱透镜系统的清洗

质谱透镜系统的清洗清洗质谱传输透镜首先需要将质谱仪彻底关机,整个过程需要穿戴干净的无粉手套,按照仪器的操作规程小心地将质谱透镜取出,用蘸润甲醇(色谱纯)的无尘纸轻轻将透镜擦拭,注意同时需要对透镜孔的内部进行清洗。与清洗ESI离子源类似,将透镜置于干净的烧杯中,根据透镜的污染情况选用相应的溶剂超声清洗

流式胞内染色protocol

一、surface marker染色1、收获细胞,0.5-1x10e6/tube,用FACS Buffer 2ml洗涤一次,倾倒后滤纸吸干管口液体。2、加入预先配置好的你需要染的surface marker的抗体混合液(即CD3,CD4,CD8抗体mixture),充分混匀,室温下孵育20分钟。3、

什么是胞内运输?

胞内运输(intracellular transport)是真核生物细胞内膜结合细胞器与细胞内环境进行的物质交换。包括细胞核、线粒体、叶绿体、溶酶体、过氧化物酶体、高尔基体和内质网等与细胞内的物质交换。

多年磨一剑!西湖大学周强/宿强最新Nature

  γδT细胞是一种独特的T细胞亚群,在各种免疫反应和免疫病理中起着至关重要的作用。γδ T细胞受体(TCR)由γδ T 细胞产生,能够独立于主要的组织相容性复合体识别多种抗原。γδ TCR与CD3亚基结合,启动T细胞活化,在免疫治疗中具有很大的潜力。  2024年4月24日,西湖大学周强及宿强共同

液质联用中的质谱——真空系统篇

  真空是质谱仪运作的必要条件之一,也是操作质谱仪前首先要准备的工作。真空度越高,代表气体压力越低。压力常用的单位有帕斯卡(Pascal)、巴(Bar)、毫巴(mbar)、托(Torr)等(1mbar=0.01 Pa=0.75 Torr)。mbar和Torr之间的换算在低压时通常可以忽略。商业TOF

质谱质谱联用为什么可以直接检测混合有机物

质谱连用是因为先有色谱分离,然后经过质谱才可以从混合物中检测有机物的。质谱对不同分子量的化合物本身具有选择性。质谱的原理是根据质核比来判断分子离子或碎片离子的相对质量,质量数不同的有机物一级质谱不同、质量数相同的不同有机物二级质谱不同,所以MS-MS联用可直接检测混合有机物。质谱分析是一种测量离子质

膜生物学国家重点实验室在人T细胞受体上取得新进展

  T细胞是脊椎动物适应性免疫系统的关键细胞,在病毒感染、癌症以及自体免疫疾病中起着关键作用。T细胞受体(TCR)与分化簇 3(CD3)在T细胞表面形成复合物才能实现信号转导的功能,最终引发免疫应答,抵御病原的入侵。然而,过去的20年,尽管人们对TCR胞外可变区如何识别各种抗原进行了很深入的研究,但