昆明动物所马普小组为新基因起源绘制全基因组蓝图
新基因的不断出现是生物进化的重要基础。昆明动物所马普青年科学家小组在王文研究员的领导下与国际一些研究小组合作，已陆续报道了包括 “sphinx”、“猴王”、“Hun”、BSC4等等一系列新近产生的新基因。这些研究成果表明新基因的起源是一个重要的生物学现象。但在全基因组水平，具体有哪些重要的新基因起源机制，它们各自的角色是什么，却一直不清楚。 最近，马普小组的博士研究生周琦和张国捷等利用最新发表的12个果蝇种的全基因组序列，将新基因起源的研究提升到了阐明全基因组水平模式的高度。通过大规模的基因组比较，鉴定了300多个果蝇物种特异的年轻基因。对这些基因起源机制的分析发现，基因重复 (gene duplication)是产生新基因最主要的机制，80%的新生基因拷贝由串联重复产生，它们之后又可能转化成散在形式的基因重复。有趣的是，研究发现有12%左右的新基因是由非编码序列“变废为宝”而来。这一发现颠覆了该领域长期存在的“进化不可能从头......阅读全文
中科院昆明动物所家鸡矮小化研究获得系列进展
中科院昆明动物所在家鸡矮小化研究中获得系列进展，相关研究成果发表在《分子生物学与进化》杂志上。 人类的驯化和选育使得家鸡成为表型多样性最为丰富的动物之一。在体型大小方面，大型肉鸡或斗鸡（>5 kg）和小型观赏鸡（约0.5 kg）可达到10倍以上的悬殊差异。其中，家鸡的矮小化在蛋鸡和观赏鸡选育
昆明动物所放流牛栏江滇池金线鲃2.3万尾
9月28日下午，中国科学院昆明动物所杨君兴研究员课题组研究繁育的2.3万尾滇池金线鲃苗种在云南省沾益县德泽乡德泽水库库区放归牛栏江。 牛栏江—滇池补水工程是一项水资源综合利用工程，作为滇池流域水环境综合治理6大工程措施的关键性工程。根据国家环境保护部《关于牛栏江-滇池补水工程环境影响报告书
昆明动物所等在昆虫过敏原研究中取得进展
蟑螂是城市人居环境常见的有害昆虫，也是一类严重的过敏原，是诱发哮喘的重要因素。1964年第一次明确记录蟑螂过敏原的皮肤反应试验，1979年证实气喘病患者与吸入蟑螂过敏原二者之间的关系。据统计在气喘好发的城市中，40-60%的病患对蟑螂过敏原产生高量的IgE。蟑螂过敏原对气喘病患是一个重要的危险因
昆明动物所揭示自噬参与帕金森疾病发生的作用机制
帕金森疾病（Parkinson’s disease，PD）是一种常见的神经退行性疾病，患者主要表现出运动障碍，包括运动迟缓、肌强直、姿势异常与静止性震颤等。其病理特征表现为黑质致密区多巴胺神经元丢失和路易小体的形成。目前，全球有六百多万人正遭受帕金森病的折磨，随着我国人口老龄化的加剧，PD带来的
昆明动物所尘螨过敏原研究取得新进展
尘螨是导致过敏性哮喘、鼻炎等呼吸系统过敏性疾病最主要的过敏原来源。2004年WHO估计全球大约有3亿哮喘和鼻炎患者，并指出这类呼吸系统过敏性疾病是儿童最常见的慢性病，其在儿童中发病率超过2%，且这类过敏性疾病的发生率仍呈上升趋势，估计到2025年将会新增1亿患者。对于此类疾病目前认为最有效的治疗
昆明动物所揭示温泉菌群空间分布的特征参数
生物分布的空间异质性是生态学研究的核心问题之一；对于似乎无处不在的细菌来讲，这一问题的研究难度似乎更大。近日，中国科学院昆明动物研究所计算生物与医学生态学实验室博士生李连伟发表在Molecular Ecology上的论文揭示了温泉菌群分布的重要特征参数。这是作者继年初在Frontiers in
昆明动物所等揭示家犬适应欧洲牛奶饮食的遗传机制
家犬大约在1万五千年前到4万年前从欧亚大陆的灰狼驯化而来，现已遍布世界大部分有人类居住的地方。家犬与人类生活在相同的环境中，在很多方面存在趋同进化，家犬对环境的适应性进化遗传机制一直是进化生物学家的研究热点。经历长时间的人工选择和自然选择，欧亚大陆家犬分成欧洲家犬和东南亚两个群体，其背后的遗传机
德国马普进化人类学研究所李明锟博士访问昆明动物所
6月20日，“中国科学院第二届人才发展主题活动日”在北京拉开序幕。作为系列活动之一的“海外人才走进科学院活动周”当天同时启动。该活动旨在通过邀请海外优秀青年科技人才集中访问中科院有关研究所并进行学术交流，与海外人才建立起交流密切的联络机制，向海外人才宣传国家和中科院人才政策与举措，搭建
上海药物所周虎研究员到昆明动物所进行学术交流
4月27日上午，受中国科学院昆明动物研究所肿瘤生物学实验室陈策实研究员的邀请，中国科学院上海药物研究所周虎研究员到研究所为大家做了题为“蛋白质组学及其在药物作用机制研究中的应用 ”的精彩报告。 首先，周虎研究员简单介绍了基于质谱的蛋白质组学的科研进展及研究目标。随后具体讲解了
昆明动物所在家犬行为相关基因研究中取得进展
马里努阿犬是一种高兴奋型工作犬，在局促环境中常表现出转圈行为。其中表现一定转圈行为的个体较无转圈行为个体具有更高的兴奋性和工作欲望，较极度转圈个体具有更好的行为控制力。值得注意的极度转圈行为已经被定义为强迫症，且之前的研究已经发现了一些与之相关的一些基因，神经钙粘蛋白基因（Cadherin 2：
昆明动物所在三代基因测序领域取得进展
近日，中国科学院昆明动物研究所研究员张亚平和马占山领导的团队发布了以“10x Genomics测序”辅助“三代测序”的混合组装策略和软件技术。研究人员采用美国加州大学Jain等人2018年发表在Nature Biotechnology上（doi: 10.1038/nbt.4060.）的人类基因组
昆明动物所首个高质量染色体水平的哀牢髭蟾参考基因组
哀牢髭蟾（Vibrissaphora ailaonica）[Amphibiaweb（2019），Frost（2019）和中国两栖类（2019）将其归为Leptobrachium ailaonicum的同物异名] 俗称“胡子蛙”、“深山角怪”，属两栖纲、无尾目、角蟾科，是中国特有种。该物种具有多个
昆明动物所等开发完成犬类SNP数据库DoGSD
家犬作为人类生活和工作中的伙伴，其进化研究一直是遗传学研究中的一个热点。然而目前使用的家犬参考SNP数据集，不仅数量少，采样地不够广泛，而且测序覆盖度差异大，SNP数据主要只来源于两个品种的两个犬只，并不利于家犬的群体遗传研究。 目前，二代测序产生了大量高质量的家犬和其祖先物种灰狼的全基因数据
昆明动物所等识别出镇痛活性的神经毒素多肽家族
2005年，欧洲正式批准蛭类疗法为合法的治疗手段。每年仅在德国就有35万条水蛭用于医疗，从治疗效果来看，水蛭疗法效果比临床上常规疗法效果好很多。很多文献报道蛭类疗法具有镇痛作用，长期的临床实践证明蛭类疗法对多种疼痛具有良好疗效。近日，由中国科学院昆明动物研究所研究员赖仞团队识别出镇痛活性的神经
昆明动物所研究揭示新的肾损伤血清候选标志物
脊椎动物三叶因子(trefoil factors, TFFs)广泛表达和分布在上皮系统中，与上皮粘膜保护、损伤修复和肿瘤密切相关。自三叶因子发现三十多年来，揭示其生理病理功能、分子作用机制是相关领域科学家致力解决的关键问题。特别值得关注的是，近年来国内外许多科研人员的工作希望以血清三叶因子作
昆明动物所证实植物也会使用胡萝卜加大棒的策略
对于任何一个合作系统而言，总是存在投机的、不合作的行为或个体。这些投机行为或投机个体的在合作系统中的扩散将会导致合作系统的解体。然而，是什么机制能够阻止这种投机行为，从而避免合作系统的解体至今仍是一个争议很大的科学问题。 经典的、基于均衡和对称性思想发展而来的理论认为：合作系统的投机个体在
昆明动物研究所关于东亚人群源流研究取得新进展
随着大量线粒体DNA（mtDNA）全基因组信息的积累，科学家对东亚人群的母系遗传结构已经有较为清晰的认识。然而，研究中仍发现有一些mtDNA类型无法识别。虽然这些未定类型的分布频率很低，但其系统发育地位究竟如何迄今仍不得而知。与此同时，由于东亚具有丰富且较为连续的古人类（the a
昆明动物所昆虫天然药物功能蛋白质合作研究再获进展
牛虻(中药材名虻虫)为专性吸血昆虫，也是传统的抗血栓中药材，在多种抗血栓中成药生产中被用作原料。近年来，中国科学院昆明动物研究所赖仞研究员领导的课题组围绕牛虻成功吸血的分子机制和发挥抗血栓的物质基础等问题对其开展了较为系统的研究，从牛虻唾液腺中识别了多种功能活性蛋白或多肽(MCP 2008,
昆明动物所揭示家鸡视觉退化的无意识选择作用机制
经过长期的驯化和人工选择作用，家鸡与其野生祖先红原鸡除了在行为、体型、生殖周期和生长速度等存在显著差异外，其视觉功能也显著衰退。目前研究理论认为这种视觉退化是由于选择压力放松导致，但是至今这种视觉退化的遗传机制并不清楚。 中国科学院昆明动物研究所张亚平研究团队基于家鸡和红原鸡的群体基因组数据，
昆明动物所等在尘螨过敏原研究方面取得进展
尘螨是导致人类室内过敏的最主要过敏原来源。目前过敏治疗的标准方法是脱敏治疗（多次微量注射过敏原于过敏病人），因此，高纯度过敏原的获得及其基本生化特征的认知是决定脱敏治疗效果和副作用强弱的关键。目前在尘螨过敏脱敏治疗过程中使用的过敏原还有相当大的比例是尘螨提取物。这些提取物是含有多种
昆明动物所等在藏族高原适应遗传机制研究中取得进展
近日，中国科学院昆明动物研究所宿兵课题组与西藏大学、青海省高原医学科学研究院开展合作，在藏族高原适应遗传机制研究中取得进展。相关研究成果发表在《分子生物学与进化》（Molecular Biology and Evolution）上，昆明动物所副研究员彭忆，西藏大学教授崔超英，昆明动物所博士生和耀
昆明动物所揭示线粒体DNA种系突变对肿瘤易感性的影响
线粒体DNA（mtDNA）在肿瘤发生发展中的作用多年来备受关注。前期研究揭示，大部分肿瘤细胞mtDNA体细胞突变很可能都是由于其线粒体氧化磷酸化功能限制降低而产生的副产品。而mtDNA种系突变不仅存在于肿瘤组织，同样也存在于正常组织中。但是目前仍不清楚肿瘤细胞mtDNA种系突变是否和体细胞突变的
昆明动物所等研究发现环境选择压力增加或导致性别失调
自然界的大多数物种的性比都是1:1，然而少数物种在进化过程出现偏雌或偏雄的性别比例。究竟什么机制或原因决定、影响一个物种的性别比例，一直是学术界未曾有效解决的科学问题。1930年发表的著名的Fisher定理认为，性别的进化就是两性合子随机结合的过程，其后代出现雄性或雌性的几率就像随机投掷硬币所出
昆明动物所从能量代谢角度揭示蝙蝠飞行起源的机制
蝙蝠是翼手目动物的通称，是唯一演化出具有真正飞行能力的哺乳动物。跟鸟类进化出飞行能力一样，蝙蝠飞行能力的进化需要一系列十分复杂的形态和生理变化，因此达尔文在《物种起源》中感叹“从不能飞的原始哺乳动物进化为能飞的蝙蝠是不可思议的”。 中国科学院昆明动物研究所张亚平院士及其指导的博士生沈永
昆明动物所天然药物功能蛋白质研究取得新进展
地鳖虫在传统中药中是重要的抗血栓药物，且被报道用于血栓治疗具有低出血风险，因而应用于多个抗血栓药物处方中。我国有大规模的地鳖虫人工养殖，但其发挥抗血栓功能的物质基础和作用机制尚不清楚。 中国科学院昆明动物研究所赖仞研究员领导的课题组采用蛋白质组学结合药理学手段，从地鳖虫中识别
昆明动物所揭示星云湖大头鲤及其它鲤鱼种质现状
星云湖是云南九大高原湖泊之一，属富营养化湖泊，其分布有很多云南特有的鲤科物种。其中大头鲤Cyprinus pellegrini由于其特有性及珍贵性，已被列为国家II级保护动物。近年来，星云湖外来物种入侵较为严重，了解目前星云湖土著鲤鱼种群构成和生存状态，可对星云湖土著鲤鱼种群保护提
昆明动物所等在人类大脑进化遗传机制研究中取得进展
表观遗传修饰的重要性越来越被人所认识，但是表观遗传的变化如何对表型的进化产生影响，特别是表观遗传调控在人类大脑进化中的作用仍然不是很清楚。美国乔治亚理工大学教授Soojin V.Yi 曾经对人和黑猩猩大脑进行了全基因组甲基化测序，发现了很多物种间甲基化差异区域，但这些甲基化差异区域是否属于人类特
汕头大学教授到昆明动物所进行学术交流
5月31日，应中国科学院昆明动物研究所孔庆鹏研究员的邀请，汕头大学许丽艳教授和李恩民教授到研究所进行学术交流。当天下午，许丽艳教授和李恩民教授给所内师生们分别做了题为“fascin基因在食管癌中的功能、表达调控及其细胞信号传导通路”以及“桥粒糖蛋白DSC2负性调控食管癌细胞侵袭迁移的分子机制”的
中科院昆明动物所成功揭示实验大鼠起源驯化遗传机制
近日，中国科学院昆明动物研究所张亚平课题组与吴东东课题组合作，通过比较野生褐家鼠和实验大鼠的基因组和转录组数据，解析了实验大鼠的起源和驯化遗传机制。相关研究成果发表在Molecular Biology and Evolution上。 实验大鼠作为一种广泛使用的模式动物，由野生褐家鼠驯化而来
昆明动物所等发现新的健康衰老促进因子ATF7
慢性低度炎症是衰老的主要特征之一，而这种炎症与诸多衰老有关疾病密切相关，如神经退行性疾病、代谢综合征、癌症、心血管疾病等。长寿老人可规避或延缓一些重大的老年疾病，这种生存优势是否与其炎症状态有关迄今并不清楚。因此，以健康长寿人群为研究对象，探索其炎症调控的机制，或能为延长生物体的健康寿命，实现健