昆明动物所等在人类大脑进化遗传机制研究中取得进展
表观遗传修饰的重要性越来越被人所认识，但是表观遗传的变化如何对表型的进化产生影响，特别是表观遗传调控在人类大脑进化中的作用仍然不是很清楚。美国乔治亚理工大学教授Soojin V.Yi 曾经对人和黑猩猩大脑进行了全基因组甲基化测序，发现了很多物种间甲基化差异区域，但这些甲基化差异区域是否属于人类特异的甲基化变化仍然不是很清楚。中国科学院昆明动物研究所宿兵实验室之前对小头症基因CENPJ甲基化模式的比较研究表明，该基因在人类大脑中存在人类特异的低甲基化变化，但缺少对全基因组水平人类特异性甲基化变化的认识。 有鉴于此，宿兵实验室助理研究员石磊以及硕士生虎恩志、张哲与Soojin V.Yi开展合作，对人类、黑猩猩和猕猴3个物种的大脑前额叶进行了大脑全基因组甲基化测序，发现了85个人类特异的甲基化变化区域（DMR）。同时，他们通过对多个灵长类代表物种（人类、黑猩猩、长臂猿、猕猴和食蟹猴）大脑样本的甲基化重测序对发现的人类特异的DMR......阅读全文
甲基化测序捕捉三阴性乳腺癌表观遗传特性
近日，一篇刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中，来自澳大利亚悉尼加文医学研究所（Garvan Institute of Medical Research）的科学家们通过将乳腺癌患者机体的乳腺癌甲基化组同健康个体进行比较从而绘制出了一种新型的基因组图谱，其可以帮助
表观遗传之DNA甲基化（一）
俗话说，龙生龙，凤生凤，老鼠的儿子会打洞。 这句话什么意思呢？想必很多人有不同的看法~~ 从传统的社会认知角度看，就是“出生决定论”，一个人的出生是什么样的，以后就会有什么样的作为和成就，家庭决定着个人的前途和发展方向。龙凤阶层的人自出生以来便是龙凤，若是草根阶层，也很难上升到龙凤圈层，即使有这样的
表观遗传之DNA甲基化（二）
二 DNA甲基化 DNA甲基化：DNA甲基化是通过DNA甲基转移酶在胞嘧啶环的第5个碳原子上共价加成甲基而产生的，从而产生5-甲基胞嘧啶（5-mC），在体细胞中，几乎仅在二核苷酸CpG的对称甲基化配对中发现了5-mC，而在胚胎干（ES）细胞中，在非CpG中也观察到了大量的5-mC。5-mC作为表型和
表观遗传学关于DNA甲基化
表观遗传学是研究表观遗传变异的遗传学分支学科从目前的研究来看,X 染色体剂量补偿、DNA 甲基化、组蛋白密码、基因组印记、表观基因组学和人类表观基因组计划等问题都是表观遗传学研究的内容。其中甲基化是基因组DNA 的一种主要表观遗传修饰形式,是调节基因组功能的重要手段。在脊椎动物中,CpG二核
甲基化芯片在表观遗传学中的应用
表观遗传改变可以定义为基因的遗传性或获得性改变，但是这种改变和DNA序列改变无关。DNA甲基化是最为常见的表观遗传改变；启动子或第一外显子CpG岛中的甲基化改变将导致基因表达失活；组蛋白的化学修饰也可以作为表观遗传改变；组蛋白发生乙酰化改变的基因通常被开启。CpG岛的异常甲基化是导致基因沉默和过度表
甲基化芯片在表观遗传学中的应用
表观遗传改变可以定义为基因的遗传性或获得性改变，但是这种改变和DNA序列改变无关。DNA甲基化是最为常见的表观遗传改变；启动子或第一外显子CpG岛中的甲基化改变将导致基因表达失活；组蛋白的化学修饰也可以作为表观遗传改变；组蛋白发生乙酰化改变的基因通常被开启。 CpG岛的异常甲基化是导致基
表观遗传研究热点：RNA－甲基化（m6A）研究
随着表观遗传学研究的不断深入，组蛋白修饰（甲基化，乙酰化，磷酸化…）和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现，遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中，遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存
表观遗传研究热点：RNA－甲基化（m6A）研究
随着表观遗传学研究的不断深入，组蛋白修饰（甲基化，乙酰化，磷酸化…）和 DNA 甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现，遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中，遗传信息从 DNA、RNA 流向蛋白。基因组 DNA 和组蛋白上都存在可逆的表观遗
DNA甲基化参与调控大豆等表观遗传研究新进展
大豆胞囊线虫（Soybean cyst nematode, SCN； Heteroderaglycines）病是引起大豆减产的病害之一，研究大豆-线虫互作机制对提出新的病害防控策略、培育抗胞囊线虫病的大豆新品种具有重要意义。DNA甲基化（DNA methlation）是一种表观遗传标记，在植物生
多项表观遗传研究成果被质疑：甲基化的真实作用
本周来自瑞士和美国的研究人员指出，目前一般认为DNA甲基化之间的差异会决定社会性昆虫是成为繁殖蚁（也就是蚁后），还是工蚁的这种观点并不可靠，他们认为DNA甲基化作用并未得到已有数据的充分支持。这一研究成果公布在Current Biology杂志上。 “这一发现表明，并没有证据证明甲基化会造成两
新型纳米孔器件有望用于表观遗传学快捷测序
新华社布鲁塞尔５月９日电（记者潘革平）比利时校际微电子中心（ＩＭＥＣ）９日发表公报说，该中心成功开发出一种能直接读取单分子ＤＮＡ（脱氧核糖核酸）碱基的新型光学纳米孔器件，有望用于遗传学研究快捷测序。 据介绍，新型器件结合了表面增强拉曼光谱和纳米孔流体技术，能以超高分辨率，实现无标记检测ＤＮ
新型纳米孔器件有望用于表观遗传学快捷测序
比利时校际微电子中心（ＩＭＥＣ）９日发表公报说，该中心成功开发出一种能直接读取单分子ＤＮＡ（脱氧核糖核酸）碱基的新型光学纳米孔器件，有望用于遗传学研究快捷测序。 据介绍，新型器件结合了表面增强拉曼光谱和纳米孔流体技术，能以超高分辨率，实现无标记检测ＤＮＡ中的遗传编码以及表观遗传变异。研究近期发
RNA甲基化（m6A）研究：最前沿表观遗传研究热点（二）
那么如何检测RNA的甲基化水平呢？Epigentek推出市场上唯一一款RNA甲基化定量检测试剂盒：·EpiQuik M6A RNA Methylation Quantification Kit（比色法）是一组优化的、完整的的试剂组合，可以通过比色的方法定量RNA中N6-甲基腺嘌呤（m6A）。它可以直
RNA甲基化（m6A）研究：最前沿表观遗传研究热点（一）
随着表观遗传学研究的不断深入，组蛋白修饰（甲基化，乙酰化，磷酸化…）和DNA甲基化修饰相关的高水平研究成果如雨后春笋般涌现，遍布Nature, Cell和Science等期刊杂志。在分子生物学的中心法则中，遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰，这
什么是表观遗传？
表观遗传学是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下，基因表达的可遗传的变化的一门遗传学分支学科。表观遗传的现象很多，已知的有DNA甲基化（DNA methylation），基因组印记（genomic imprinting），母体效应（maternal effects），基因沉默（gene silen
PacBio三代单分子测序获表观遗传研究新发现
来自福建农林大学海峡联合研究院林学中心等处的研究人员发表了题为“Comprehensive profiling of rhizome-associated alternative splicing and alternative polyadenylation in moso bamboo (P
表观遗传学测序技术助力三阴性乳腺癌患者分层
一组澳大利亚的研究员使用甲基化特异性测序技术发现了三阴性乳腺癌中某些甲基化的差异，这些差异可能具有预后价值。 如果患者缺乏雌激素、孕激素受体，并且HER2基因没有过表达或者扩增，则认为乳腺癌是“三阴性”的。具有三阴性乳腺癌（或TNBC）的患者，可以分成两部分，即癌症进展非常迅速或者进展非常缓慢
RNA甲基化测序
1、NSUN2影响m5C在HEK293细胞中整体分布情况NSUN2被报道是RNA甲基转移酶，能使tRNAs和mRNA发生m5C甲基化修饰。为了探究NSUN2对HEK293细胞mRNA m5C甲基化修饰的影响。作者利用CRISP/Cas9技术敲减NSUN2（NSUN2-/-HEK293细胞）后进行
表观遗传研究指南（二）
今年九月，对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份，因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在Nature，Genome Biology，Genome Research等杂志上公布了三十多份论文，还有在Science，Cell，以及the Journal of Bi
表观遗传学修饰
组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节，这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映，这些表观遗传学因素相互作用以调节基因
什么是表观遗传调节？
中文名称表观遗传调节英文名称epigenetic regulation定 义与DNA排列顺序的变化无关的,调节基因表达的频率、速度或者表达度的过程。如DNA甲基化、组蛋白修饰等。这种调节不能通过种系或生殖细胞传递,但可通过细胞分裂传给子代,在静止细胞的细胞质中也能稳定地自我繁殖。这种调节的失误或减
甲基化与lncRNA：表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么？circRNA，lncRNA，外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外，现在很多小伙伴们开始了新的玩法，通过多平台联用，将不同层面的东西结合起来，比如，表观遗传与非编码RNA的结合，就是一个很好的例证。 研究背景 肺癌是一种常见的恶性肿瘤，特别在中国，
甲基化与lncRNA：表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么？circRNA，lncRNA，外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外，现在很多小伙伴们开始了新的玩法，通过多平台联用，将不同层面的东西结合起来，比如，表观遗传与非编码RNA的结合，就是一个很好的例证。研究背景肺癌是一种常见的恶性肿瘤，特别在中国，由于环境的污染，肺癌
表观遗传学分子生物学软件——DNA甲基化分析工具
第一类：基于引物设计功能的软件。此类软件主要是针对重亚硫酸盐序列进行甲基化特异性PCR（methylation-specific PCR, MS-PCR or MSP）和重亚硫酸盐测序（bisulfite sequencing, BS）引物的设计。由于重亚酸盐修饰的特殊性，使常规的分子生物学
罗氏甲基化捕获试剂创新甲基化研究方法
自2004年美国批准Vidaza (azacitidine)可用于血液疾病( 如MDS)的治疗以来，通过改变致病基因的表观遗传学特征进行疾病治疗的方法，为人们带来了疾病的新治疗策略。然而，由于表观遗传检测方法的局限，要确定基因的碱基在何处以何种程度被甲基化一直以来困扰着研究者，从而难以确定基
Nature发表表观遗传学重要发现－决定性别的RNA甲基化
N6-methyladenosine（m6A）是真核生物mRNA和长非编码RNA上最普遍的一种RNA修饰，介导了超过80%的RNA碱基甲基化。人们已经陆续鉴定了m6A所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白，但对其生物学功能还知之甚少。 伯明翰大学的科学家们在Nature杂志上发表文章，揭示了m6A
Nature发表表观遗传学重要发现决定性别的RNA甲基化
N6-methyladenosine（m6A）是真核生物mRNA和长非编码RNA上最普遍的一种RNA修饰，介导了超过80%的RNA碱基甲基化。人们已经陆续鉴定了m6A所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白，但对其生物学功能还知之甚少。伯明翰大学的科学家们在Nature杂志上发表文章，揭示了m6A在Sxl
Nature－Methods发表单细胞重亚硫酸盐测序技术
Babraham研究所和Wellcome Trust Sanger研究所的科学家们开发了一个单细胞表观遗传学检测技术，并将其发表在七月二十日的Nature Methods杂志上。这一成果可以帮助人们解读，环境怎样影响人类的发育和遗传性状。 “表观遗传学标志”是指DNA上的化学或蛋白标签，它们在
揭示全基因组DNA甲基化、半甲基化与遗传突变的新方法
5月31日，中国科学院北京生命科学研究院研究员孙中生团队与北京大学肿瘤医院合作，在Briefings in Bioinformatics上，发表了题为A new approach to decode DNA methylome and genomic variants simultaneousl
Nature发布表观遗传重要发现
营养繁殖是无性繁殖的一种形式，常用于商业化大规模生产园林植物和树，因为它能够实现高性能、基因相同个体的快速繁殖。然而对于某些物种，营养繁殖有着严苛的要求，需要技术先进的无菌培养来生成可以发育为苗木的克隆胚胎。而有一部分以这种方式繁殖的植物会因遗传变异或表观遗传改变显示出发育异常。 在9月9日的