植物内源激素油菜素内酯负调控miRNA靶基因的翻译抑制

植物体内非常重要的小分子非编码RNA——miRNA在翻译水平介导的靶标基因抑制是一种非常保守的基因沉默机制。在模式植物拟南芥中,miRNA被装载到其效应分子ARGONAUTE1(AGO1)蛋白上,以碱基互补配对的方式与其靶标mRNA结合,最终诱导细胞质中靶基因mRNA的切割,或者在内质网中抑制靶基因mRNA的翻译。与此一致的是,AGO1蛋白在细胞质、内质网、以及细胞核中均有分布。然而,AGO1在不同亚细胞区间的分布和定位模式与其介导靶基因沉默的方式和效率是否有关尚不清楚。 JIPB近日在线发表了复旦大学生命科学学院郑丙莲课题组题为“Brassinosteroids inhibit miRNA-mediated translational repression by decreasing AGO1 on the endoplasmic reticulum”的研究论文(https://doi.org/10.1111/jipb.......阅读全文

植物内源激素油菜素内酯负调控miRNA靶基因的翻译抑制

  植物体内非常重要的小分子非编码RNA——miRNA在翻译水平介导的靶标基因抑制是一种非常保守的基因沉默机制。在模式植物拟南芥中,miRNA被装载到其效应分子ARGONAUTE1(AGO1)蛋白上,以碱基互补配对的方式与其靶标mRNA结合,最终诱导细胞质中靶基因mRNA的切割,或者在内质网中抑制靶

高通量快速验证miRNA靶基因

尽管现在人们可以越来越准确地预测microRNA的沉默效果,但还是需要高通量而且准确的直接验证技术来验证microRNA的沉默效果。microRNA 这个在生物科学史上具有重要意义的小分子,在2008年又一次成为了世人瞩目的焦点。microRNA通过与目标mRNA的3’UTR区域结合来阻止其翻译

如何预测和鉴定miRNA的靶基因

免疫沉淀当然,确定miRNA与mRNA之间的互作,我们还有更直接的方法,那就是从实验上寻找物理相互作用。我们可以利用RNA诱导沉默复合物(RISC)中的Argonaut(AGO)蛋白的抗体进行免疫共沉淀(co-IP)。目前更先进的方法是通过紫外线照射以交联复合物,然后开展深度测序以鉴定发现的RNA,

研究发现HYL1蛋白调控miRNA介导的翻译抑制过程

  中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所研究员何玉科研究组在The Plant Cell上,发表了题为Cytoplasmic HYL1 modulates miRNA-mediated translational repression的研究论文。该研究组发现,HYL1蛋白除了介导m

miRNA海绵—长效抑制miRNA

miRNA海绵随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困

miRNA海绵—长效抑制miRNA

随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困难得多。为什么

双荧光素酶报告基因检测(二)

双荧光素酶报告基因检测(二)双荧光素酶实验通常被用来评估miRNA是否与其潜在的靶基因发生相互作用。实验中,预测的miRNA靶标基因的3’-UTR序列被克隆到含有萤火虫荧光素酶的报告基因载体的3’-UTR位置。如果miRNA与插入到质粒中的目标序列发生结合,miRNA将通过抑制该序列的翻译来降低萤火

关于小分子RNA的作用方式介绍

  microRNA-RISC对靶基因mRNA的作用主要取决于它与靶基因转录体序列互补的程度,有三种方式。  第一种是切断靶基因的mRNA分子——miRNA与靶基因完全互补结合,作用方式和功能与siRNA非常相似,最后切割靶mRNA。在植物中,大部分miRNA都以这种方式,靶基因mRNA断裂后,无p

陈雪梅教授Cell揭示基因沉默新机制

  提及RNA分子,最广为人知的作用就是参与蛋白质的合成。然而MicroRNA (miRNA),这类被发现广泛存在于植物和动物中,长度约为22个核苷酸的小分子RNA,却并不编码蛋白,而是在基因调控中发挥作用,其影响了从发育、生理到应激反应几乎所有的生物学过程。   microRNAs几乎存在于

什么是小分子RNA?

  MicroRNA (miRNA) 是一类由内源基因编码的长度约为22 个核苷酸的非编码单链RNA分子,它们在动植物中参与转录后基因表达调控。在动植物以及病毒中已经发现有28645个miRNA 分子(Release 21: June 2014) 。大多数miRNA 基因以单拷贝、多拷贝或基因簇(c

miRNA的特征、功能及识别方法等详解(三)

2) miRNA的靶基因预测方法 miRNA的研究意义之重大是毋庸置疑的。然而,与新的miRNA的频频发现相比,miRNA的功能研究相对缓慢。到目前为止,在发现的4449多个miRNA中,确定功能的miRNA仅有几十个。导致miRNA功能研究进展缓慢的非常重要的原因是miRNA的作用靶标难以确定。事

micro-RNA(miRNA)综述2

miRNA的作用方式最早被发现的两个miRNAs――lin-4 and let-7被认为是通过不完全互补结合到目标靶mRNA3'非编码区端,以一种未知方式诱发蛋白质翻译抑制,进而抑制蛋白质合成,阻断mRNA的翻译。多个果蝇miRNAs也被发现和他们的目标靶mRNAs的3'非编码区

miRNA和siRNA简介及区别

1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室

miRNA和siRNA的基本介绍及区别

1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室中是

microRNAs(miRNAs)简介(1)

microRNAs(miRNAs)是一种小的,类似于siRNA的分子,由高等真核生物基因组编码,miRNA通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体(RISC)降解mRNA或阻碍其翻译。miRNAs在物种进 化中相当保守,在植物、动物和真菌中发现的miRNAs只在特定的组织和发育阶段表达,m

《cell》:miRNA是逆境的捍卫者?

现有许多数据说明microRNAs (miRNAs) 除了在发育方面的重要作用以外,在许多逆境应答(stress responses)中也扮演了重要角色。让人惊讶的是miRNAs这一通常抑制靶基因转录表达的小分子,也许在逆境中成为了表达的激活因子,其中的机制也许就是通过逆境中,miRNA/Argon

《细胞》:三效合一的新型基因表达调控技术

研究人员研制出一种分子开关,能够可逆控制哺乳动物基因的开启和关闭,控制基因的表达水平,将对生物学过程和疾病相关基因的研究的精确度提高到一个更高的水平。详细内容刊登于上周《Cell》。 作者对这项研究“允诺了很多,”明尼苏达大学Perry Hackett(未参与研究)说,“他们兑现了允诺。” 研究

科研中的“新星”技术——MicroRNA荧光定量PCR

Micro RNA简介微小RNA(microRNA,简称miRNA)是生物体内源长度约为20-23个核苷酸的非编码单链小分子RNA,通过与靶mRNA的互补配对而在转录后水平上对基因的表达进行负调控,导致mRNA的降解或翻译抑制。是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶

揭示miRNA在肿瘤细胞糖代谢中的功能及调控机制

  5月17日,国际学术期刊Journal of Biological Chemistry在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所季红斌研究组与刘新垣研究组合作的研究论文miR-143 regulates cancer glycolysis via targeting hexok

厦大韩家淮院士权威期刊发布miRNA研究重要发现

  来自厦门大学、日本东京大学的研究人员证实,ROCK抑制剂可通过提高PAIP2表达促进靶mRNAs脱腺苷化来增强microRNA的功能。这一研究发现发布在7月17日的Nucl. Acids Res期刊上。 中科院院士、厦门大学的韩家淮(Jiahuai Han)教授及东京大学的助理教授Motoyuk

基因翻译的终止

本过程细胞主要需完成以下目标:(1)使翻译停止,不再有新的氨基酸掺入;(2)释放合成的多肽链;(3)释放结合在mRNA上的各组分;(4)确保核糖体大小亚基以及重要因子的重复利用。原核细胞和真核细胞在此过程的处理上有明显不同,下面将分开介绍。 (一)原核细胞A.肽链的释放(1)释放因子RF1/2 (t

基因翻译的延伸​

此过程在真核细胞和原核细胞中高度类似,下面只以原核细胞为例进行讨论。涉及到的因子主要有EF·Tu和EF·G,在真核细胞中对应的名称分别是是eEF1和eEF2。A. tRNA的转运和入位(1)非起始AA·tRNA结合EF·Tu·GTP形成一个三元复合物;(2)该三元复合物结合至核糖体P位点,tRNA反

二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因

  野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱,碱,盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究,将有助于栽培大豆的遗传改良。近日,华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代

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野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱,碱,盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究,将有助于栽培大豆的遗传改良。近日,华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通量测

BMC-Plant-Biology测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因

  野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱,碱,盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究,将有助于栽培大豆的遗传改良。近日,华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通

诺贝尔生理学或医学奖揭晓-获奖者揭开基因调控之谜

  当地时间10月7日,瑞典卡罗琳医学院宣布,将2024年诺贝尔生理学或医学奖授予科学家维克托·安布罗斯(Victor Ambros)和加里·鲁夫昆(GaryRuvkun)。  生理学或医学奖是2024年诺贝尔奖公布的第一个奖项,这一荣誉不仅是对科学家卓越贡献的认可,更是人类智慧与探索精神的体现。伴

Cell:揭示miRNA调控黑色素瘤发展的新机理

  黑色素瘤(Melanoma)是一种高度恶性肿瘤,常见于皮肤,近年来随着发病率明显上升,逐渐成为常见恶性肿瘤。其进展迅速,极易转移,临床预后极差,严重危害人类健康。MicroRNA是一类非编码小分子RNAs(18-25 nt),其通过与靶mRNA特异性结合,降解mR

人类基因组“primiRNA”剪切位点图谱绘制

  人体的基因表达是一个复杂的过程,那么多的基因不可能都总是持续表达。指挥基因表达的功臣之中就包括几种RNA分子。MicroRNA(miRNA)是一类真核生物内源性的小分子单链RNA,它是一种古老的、生死攸关的基因调节因素,30-60%的哺乳动物蛋白质编码基因都受miRNA的调控(主要是基因沉默调控

Cell:揭示miRNA调控黑色素瘤发展的新机理

黑色素瘤(Melanoma)是一种高度恶性肿瘤,常见于皮肤,近年来随着发病率明显上升,逐渐成为常见恶性肿瘤。其进展迅速,极易转移,临床预后极差,严重危害人类健康。MicroRNA是一类非编码小分子RNAs(18-25   nt),其通过与靶mRNA特异性结合,降解mRNA或抑制蛋白翻译,从而在转录后

四军医大:miR21调控骨质疏松症发生

  骨质疏松症(Osteoporosis)是一种系统性骨病,其特征是骨量下降和骨的微细结构破坏,表现为骨的脆性增加,因而骨折的危险性大为增加,即使是轻微的创伤或无外伤的情况下也容易发生骨折。MicroRNA是一类非编码小分子RNAs(18-25 nt),其通过与靶mR