新型RNA标记技术颠覆以往干细胞研究
干细胞研究大多是在实验室的培养皿中开展的。然而，斯坦福大学的研究人员近日在《Cell Reports》上发表文章称，体内的干细胞和培养皿中的干细胞在基因表达谱上大相径庭。 研究人员认为，若人们对分离后的干细胞开展研究，并得出干细胞功能的结论，那么这些结论需要重新考虑，因为细胞在分离过程中发生了变化。他们发现，当干细胞被分离出来时，某些RNA分子的水平升高，而其他许多RNA分子的水平降低。 文章的通讯作者、斯坦福大学医学院的Thomas Rando教授认为：“动物中的细胞与分离出的细胞明显不同。这些显著的差异可能会歪曲我们对于许多成体干细胞的静息状态的看法。现在，大家需要重新思考如何分析干细胞，才能准确反映其体内状态。” 肌肉干细胞（MuSC）处于静息状态，在受到特定的刺激时活化。然而，过往的干细胞研究需要将细胞从天然环境中分离，并通过荧光活化细胞分选（FACS）来纯化。然后他们研究分离后细胞的功能、性质和RNA含量。其......阅读全文
微型RNA调控眼睛干细胞生物过程
据物理学家组织网28日报道，美国科学家研究发现，微型RNA-103/107家族（miRs-103/107）在调控眼角膜边缘上皮细胞内干细胞的生物过程中扮演着重要角色。发表在《细胞生物学杂志》上的最新研究首次在自噬和巨胞饮这两种重要的细胞过程间建立了关联。 细胞自噬是细胞应对生存压力而降解其内
RNA是决定干细胞命运的关键吗？
深入观察我们的细胞，你会发现每个细胞都有一个完全相同的基因组——一套完整的基因，但是如果每个蓝图都是相同的，为什么眼睛细胞的外观和行为与皮肤细胞或脑细胞不同呢？干细胞——我们器官和组织细胞的原材料——怎么知道会变成什么样？在7月8日发表的一项研究中，科罗拉多大学博尔德分校的研究人员离回答这个基本问题
新型RNA标记技术颠覆以往干细胞研究
干细胞研究大多是在实验室的培养皿中开展的。然而，斯坦福大学的研究人员近日在《Cell Reports》上发表文章称，体内的干细胞和培养皿中的干细胞在基因表达谱上大相径庭。 研究人员认为，若人们对分离后的干细胞开展研究，并得出干细胞功能的结论，那么这些结论需要重新考虑，因为细胞在分离过程中发生了
干细胞先驱发表单细胞RNA测序新成果
人多能干细胞是研究人类胚胎发育的理想模型，可以揭示谱系分化背后的细胞和分子机制。不过，人们还不清楚单个干细胞如何退出多能状态并转化为相应的前体细胞。 Morgridge研究院的科学家们使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，对来自人胚胎干细胞的谱系特异性前体细胞进行了转录组分析，揭示了
中大学子与学术牛人解析RNA修饰与癌症干细胞
N6-methyladenosine（m6A）是真核生物mRNA上最常见的一种转录后修饰，这种可逆的RNA甲基化修饰与人类疾病有关。研究者们已经陆续定位了哺乳动物转录组中的m6A，鉴定了这种动态修饰所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白。不过，人们还对m6A起到的具体作用还知之甚少。 约翰霍普金斯
环状RNA在肠道干细胞自我更新中的重要作用
肠道是食物消化和吸收的主要场所，由单层上皮细胞形成肠上皮屏障。除了上皮细胞，肠道中还有大量的免疫细胞。即使在成体稳态（homeostasis）条件下，肠上皮仍经历着快速的自我更新，在小鼠中大约5天可以更新一次【1】。定位于肠道隐窝中的干细胞可以分化为肠道中所有的上皮细胞类型【2】。肠干细胞的自我
单细胞RNAseq发现调节干细胞发育的新基因
最近，Wellcome Genome Campus的一项新研究演示了单细胞基因组学的力量，揭示了它如何能帮助科学家了解细胞的早期发育。这项研究发现了参与干细胞调控网络的新基因，以及新 的细胞亚群，可让我们深入了解干细胞多能性——成为几乎所有不同类型细胞的能力。研究人员还为干细胞群落开发了新的资源
研究揭示白血病干细胞RNA表观遗传新机制
中山大学肿瘤防治中心研究员黄慧琳团队联合广州实验室研究员翁桁游团队，研究揭示了RNA乙酰化及其修饰酶N-乙酰基转移酶10（NAT10）通过重塑丝氨酸代谢驱动急性髓系白血病发生及干性维持的重要机制。相关成果近日在线发表于《自然-细胞生物学》（Nature Cell Biology）。论文共同通讯作者黄
RNA表观修饰在造血干细胞发育中的关键作用
血液是生命的源泉。不断流动的血细胞既可以运输营养物质，又是重要的免疫保护屏障。其中，所有的血细胞都来源于造血干细胞。这群干细胞不仅可以维持血液系统的长期稳定，也是骨髓移植治疗恶性血液疾病的核心组分。目前，造血干细胞来源仍是制约临床恶性血液疾病治疗的瓶颈。因此，造血干细胞的体内发育和体外诱导扩增已
刘澎涛博士：单细胞RNAseq解析干细胞异质性
最近，在国际著名学术期刊《Genome Biology》发表的一项研究中，来自英国威康信托基金会桑格研究所、剑桥大学、上海交通大学等处的研究人员，采用单细胞转录组分析来解析造血干细胞（HSCs）的分子异质性。这项研究论证了单细胞转录学用于解析干细胞区室中的细胞过程和谱系异构性的效用。 英国威康
揭示哺乳动物干细胞利用抗病毒Dicer抵御多种RNA病毒入侵
在一项新的研究中，来自英国弗朗西斯-克里克研究所的研究人员发现了一种以前认为随着哺乳动物的进化而消失的重要机制有助于保护哺乳动物的干细胞免受SARS-CoV-2和寨卡病毒等RNA病毒的侵害。他们认为，这一发现有朝一日可能在开发新的抗病毒治疗方法中得到利用。相关研究结果发表在2021年7月9日的S
神经干细胞为RNA提供高速通道－其机制或决定脑细胞总数
美国杜克大学官网1日发布公告称，该校科学家利用显微成像技术首次发现，神经干细胞为许多RNA（核糖核酸）分子和其他蛋白分子提供高速通道，帮助这些分子快速移动到大脑外层。他们在可视化这一过程中还发现，一种与脆性X染色体综合征有关的蛋白质缺失与这些分子移动具有重要关联。相关研究在线发表于美国《当代生物
揭示特殊的非编码RNA或是联系干细胞和癌症的标志物
近日，刊登在国际杂志Genome Biology上的一篇研究论文中，来自圣劳伦学院的研究者阐述了其在疾病系统生物学方面的研究成果。研究者在文中发现，一种名为vlincRNAs(较长基因间非编码RNAs，very long intergenic， non-coding RNAs)的人类
RNA干扰技术(RNA－interference，RNAi)
1995年，康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫（C. elegans）中的par-1基因时，发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达，而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA（sense RNA）以期观察到基因表达的增强。但得到的结果
RNA干涉(RNA－Interference，RNAi)（2）
早期的 RNAi 技术可用在研究与胚胎发育相关基因的功能上，但是由于细胞分裂造成 dsRNA 的稀释，使得这种方法在研究成体的基因功能时有一定的局限性。为弥补早期 RNAi 技术的不足，Tavernarakis 等将 RNAi 技术做了一些改进及更动，将目的基因之标的序列以反向重复的方式，由
RNA干涉(RNA－Interference，RNAi)（1）
基因沉默（gene silencing）是生物体内特定基因由于种种原因不表达的遗传现象。一方面，基因沉默是生物遗传操作创造新的遗传修饰生物（genetically modified organisms）的障碍，另一方面，它又是植物抵抗外来核酸入侵（如病毒）的一种反应，为植物抗病毒的遗传育
RNA提取时RNA降解原因
1 ) 新鲜细胞： 裂解液的量不足，使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织： 某些含有内源性核酸酶的样品，很难避免RNA酶的降解，建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎，并且，匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品： 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放，然后转移到-70℃冰箱存
RNA提取心得（组织RNA提取和培养细胞的RNA提取）
一.组织RNA提取 1.最好新鲜组织，这样RNA提取的效果比较好，这是肯定的。 2. 如果不是新鲜的（最好在半年之内，-80℃或者液氮中冻存的）组织，注意不要反复冻融，从冰冻状态拿到0-4℃，注意不要拿到常温，待组织解冻后，用 DEPC泡过的剪刀剪一小块组织，称重后，放到预冷的匀浆器中，然后
反义技术——RNA干扰（RNA－interference，RNAi）
最近由于RNA干扰（RNA interference，RNAi）的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的（1），是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在RNAi领域取得的进步，已经有许多这方面的综述发表（2-4）。RNA干扰是由长的双链 RNA
RNA干扰相关知识RNARISC
RNA-induced silencing complex（RISC）：一种RNA-蛋白质复合物，通过与目标mRNA完全或者部分的互补配对来实施切割或者翻译抑制功能。SiRNA组装siRISC，miRNA组装miRISC。RISCs（无论siRISC还是miRISC）包括两种类型：切割型和不切割型。
RNA分离与分析实验_分离RNA
实验材料标记细胞试剂、试剂盒乙酸缓冲液仪器、耗材漩涡器实验步骤1. 收获标记细胞。2. 小心处置上清液，用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸缓冲液悬浮细胞沉淀，每 1 ml 压积细胞用 10 ml 缓冲液。3. 于室温用漩涡器振荡裂解细胞。4. 加等体积的水饱和酚，充分混匀，于 60
RNA干扰相关知识RNARITS）
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing（RITS）：是一种组织染色质变型的复合物。RITS复合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白质，通过结合到异染色质的基因池上来促使异染色质上基因的沉默。
RNA提取
RNA提取（主要内容如下）Tips for Handing RNA Total RNA IsolationmRNA IsolationrRNA IsolationOthersQ & A posted in the Method Forum Basic Procedures for Handing
RNA降解
新鲜细胞：如果试剂没有问题，且外源性污染也可以排除，那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。如 果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞，一定要使裂解液能覆盖住细胞。 2. 新鲜组织：某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏，胸腺等)，即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是：在液氮条件下将组织
指导RNA
中文名称指导RNA英文名称guide RNA;gRNA定 义一种小分子RNA，约含60～80个核苷酸，在RNA编辑中起模板作用。其功能是提供核苷酸插入或删除的信息。由小环DNA及大环DNA编码的指导RNA均带有编辑区的序列信息，可介导编辑过程。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调
RNA电泳
· RNA Gel (Crawford Lab)· Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis. · Northern
RNA－Electrophoresis
Electrophoresis through agarose or polyacrylamide gels is the standard way to separate, identify and purify nucleic acid fragments. The location of th
RNA电泳
RNA Gel (Crawford Lab)Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis.Northern Gel and TransferUsing glyoxal
RNA－电泳
①电泳RNA 所用器械如制胶的模具、梳子、电泳槽等用肥皂粉洗干净后用双蒸水冲洗二遍后在室温晾干备用。②用新的1XTBE 配制1. 2 %琼脂糖凝胶,倒胶时溴化乙锭(E直接加入凝胶中。③制备好的琼脂糖凝胶板放入电泳槽后再加入经高压灭菌过的1XTBE ,液面只能刚好同胶面平齐,缓冲液不要淹过胶面。④点样
RNA－剪接
中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定 义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子，连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞遗传（二级学科）