如何利用CRISPRdCas9来研究基因调控
顺式调控元件(TRE)和反式调控元件(CRE)一直是人们感兴趣的对象,通常利用染色质免疫沉淀(ChIP)和染色质捕获技术来研究。不过,德克萨斯大学西南医学中心的研究人员最近开发出一种新方法,结合CRISPR的靶定能力以及生物素-链霉亲和素的互作优势来鉴定TRE和CRE。 这种名为CAPTURE的方法利用生物素标记的dCas9来分离与天然的染色质背景相互作用的调控元件(CRE和TRE)。CAPTURE包括三个关键的组分:1) 带有生物素接受位点的dCas9;2) 生物素连接酶BirA,它将生物素添加到接受位点;3) 将生物素化的dCas9引到目的位点的gRNA。靶定之后,通过甲醛交联来固定蛋白与DNA相互作用。之后就是个性化的实验方案了。 捕获TRE 如果目标是TRE,则将染色质打断成小片段,通过生物素-链霉亲和素免疫沉淀将与dCas9关联的片段拉出,并通过质谱开展分析。这个版本称为CAPTURE-Proteomics。......阅读全文
如何利用CRISPRdCas9来研究基因调控
顺式调控元件(TRE)和反式调控元件(CRE)一直是人们感兴趣的对象,通常利用染色质免疫沉淀(ChIP)和染色质捕获技术来研究。不过,德克萨斯大学西南医学中心的研究人员最近开发出一种新方法,结合CRISPR的靶定能力以及生物素-链霉亲和素的互作优势来鉴定TRE和CRE。 这种名为CAPTURE
TRESHZA-台式划痕仪
台式划痕仪型号:TRE-SHZ-A 用途:适用于石材文物实验室的划痕试验。它可对不同石材做划痕比较试验。也可以对同种石材在经过表面处理后,做划痕比较试验。 台式划痕仪技术参数:1、读数显微镜:a.放大倍数20倍 b.附带光源入射角大于60°c.读数指示套zui小读数0.01mm
ChIPChip-E.-coli
AbstractChIP-Chip stands for Chromatin Immunoprecipitation and chip in the sense of DNA microarray. It is a technique to determine the genome-wide bin
NISB发表:神经元稀疏标记方法实现全脑范围单细胞重构
脑连接图谱研究是神经生物学主要的研究课题之一。以往研究主要注重于描绘大脑中的不同脑区之间以及不同位置神经元类群之间的连接。虽然这些脑连接图谱揭示了神经系统的基本结构,但由于缺乏单细胞精度,脑区水平或神经元类群水平的连接图谱并不能准确反映神经系统的精细结构。目前,有两个因素限制了单神经元连接谱的研
TRESHZ-便携式划痕仪
便携式划痕仪 便携式划痕检测仪产品编号:TC-003551便携式划痕仪 便携式划痕检测仪一、 用途SHZ型划痕仪适用于石材文物现场划痕试验。它可对不同石材做划痕比较试验。也可以对同种石材在经过表面处理后,做划痕比较试验。二、 技术参数1. 读数显
ChIPChip技术的介绍与应用
人类基因组计划的完成开启了一个新的纪元——功能基因组时代来临,与基因信息相比较,人们更关注于基因的功能、调控网络与信号通路等信息。表观遗传学研究与核内蛋白因子的功能分析成为基因表达调控研究的重要组成部分。结合了染色质免疫共沉淀与基因芯片技术的ChIP-chip技术的浮现使得全基因组范围内DNA与蛋白
罗敏敏/龚辉合作组开发神经元稀疏标记方法
脑连接图谱研究是神经生物学主要的研究课题之一。以往研究主要注重于描绘大脑中的不同脑区之间以及不同位置神经元类群之间的连接。虽然这些脑连接图谱揭示了神经系统的基本结构,但由于缺乏单细胞精度,脑区水平或神经元类群水平的连接图谱并不能准确反映神经系统的精细结构。目前,有两个因素限制了单神经元连接谱的研
什么是Cre重组酶?
Cre重组酶是细菌噬菌体P1的I型拓扑异构酶,催化loxP位点间的DNA进行位点特异性重组。本酶无需能量辅助因子,Cre-介导的重组很快在底物与反应产物之间达到平衡 [1] 。 Cre(Cyclization Recombination Enzyme,即环化重组酶)是来源于噬菌体P1的一种
染色质免疫沉淀芯片(ChipChip)
该技术能够快速在目标基因组的染色体中确定特异DNA结合蛋白的准确结合位点,ChIP芯片也可以在一个基因组的任何感兴趣的区域内寻找染色体的结构改变。一、ChIP-Chip的用途(1)在基因组范围内确定基因转录因子的DNA结合位点和其他DNA结合蛋白或蛋白复合体的DNA结合位点。(2)染色体活性状态的定
CreloxP-基因重组技术
re-loxP 是一种位点特异的基因重组技术,被广泛应用于特异位点的基因敲除、基因插入、基因翻转和基因易位,在真核生物和原核生物中均有广泛应用。Cre-loxP 的基本原理Cre 蛋白是一种重组酶,是causes recombination的缩写,于1981 年从 P1 噬菌体中被发现,属于 λIn
CreloxP-基因重组技术
re-loxP 是一种位点特异的基因重组技术,被广泛应用于特异位点的基因敲除、基因插入、基因翻转和基因易位,在真核生物和原核生物中均有广泛应用。Cre-loxP 的基本原理Cre 蛋白是一种重组酶,是causes recombination的缩写,于1981 年从 P1 噬菌体中被发现,属于 λIn
ChIP-using-plant-samples
实验概要 The immunoprecipitation (IP) of cross-linked chromatin with antibodies specific for certain histone modifications (chromatin immunoprecipitati
Tissue-preparation-protocol-for-ChIP
实验概要This protocol describes how chromatin is prepared from tissue, which can subsequently be used for chromatin immunoprecipitation (ChIP). It is re
ChIP-新手心得
最近有不少战友在做ChIP实验,希望我的一点经验对大家有帮助(本贴不谈实验步骤,最后我会附件一份说明书,有详细步骤,另外建议像我一样的新手用试剂盒,避免不必要的麻烦)一、原理转录从基因的启动子区开始,由一系列的转录因子结合到基因的启动子区,通用转录因子结合在基本启动子区起始转录,而这个过程对基因的转
Cre重组酶的基本信息
Cre重组酶是细菌噬菌体P1的I型拓扑异构酶,催化loxP位点间的DNA进行位点特异性重组。本酶无需能量辅助因子,Cre-介导的重组很快在底物与反应产物之间达到平衡 [1] 。Cre(Cyclization Recombination Enzyme,即环化重组酶)是来源于噬菌体P1的一种酶蛋白,分
CreloxP重组系统技术详解
Cre-loxP重组系统 一.Cre-loxP重组系统作用原理 1. Cre重组酶和loxP位点 Cre重组酶(Cyclization Recombination Enzyme)由大肠杆菌噬菌体P1的Cre基因编码,是由343个氨基酸组成的38kD的蛋白质。它不仅具有催化活性,
Cre重组酶的结构和来源
Cre重组酶是细菌噬菌体P1的I型拓扑异构酶,催化loxP位点间的DNA进行位点特异性重组。本酶无需能量辅助因子,Cre-介导的重组很快在底物与反应产物之间达到平衡 。Cre(Cyclization Recombination Enzyme,即环化重组酶)是来源于噬菌体P1的一种酶蛋白,分子量约
CreloxP重组系统技术详解
Cre-loxP重组系统一.Cre-loxP重组系统作用原理1. Cre重组酶和loxP位点Cre重组酶(Cyclization Recombination Enzyme)由大肠杆菌噬菌体P1的Cre基因编码,是由343个氨基酸组成的38kD的蛋白质。它不仅具有催化活性,而且与限制酶相似,能够特异性
熔点仪加热台/加热台-型号:TRERDY1
熔点仪加热台/加热台 型号:TRE-RDY1可选配任何体视显微镜而组成显微镜熔点仪。用于制药、化工、纺织、橡胶、燃料等行业的生产检验及科研单位、大专院校、化学专业,对晶体熔点,相态转化的测定、分析、研究。特点:1、 加热台采用国内ling先的埋入式陶瓷远红外辐射发热技术,具有发热均匀,耐腐浊性强,使
ChIP-using-plant-samples-–-Arabidopsis
实验概要This protocol describes how chromatin is prepared from Arabidopsis, which can subsequently be used for chromatin immunoprecipitation (ChIP). T
ChIP实验技术经验分享
染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,简称ChIP)是研究活体内蛋白质与DNA相互作用的一种技术。它利用抗原抗体反应的特异性,可以真实地反映体内蛋白因子与基因组DNA结合的状况。随着对基因功能研究的不断深入,这项技术正越来越多的被应用于科研的各个领域
ChIP实验技术经验分享
染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,简称ChIP)是研究活体内蛋白质与DNA相互作用的一种技术。它利用抗原抗体反应的特异性,可以真实地反映体内蛋白因子与基因组DNA结合的状况。随着对基因功能研究的不断深入,这项技术正越来越多的被应用于科研的各个领域。
Cre重组酶的基本信息介绍
Cre重组酶是细菌噬菌体P1的I型拓扑异构酶,催化loxP位点间的DNA进行位点特异性重组。本酶无需能量辅助因子,Cre-介导的重组很快在底物与反应产物之间达到平衡。 Cre(Cyclization Recombination Enzyme,即环化重组酶)是来源于噬菌体P1的一种酶蛋白,分子量
免疫学技术专题:染色质免疫沉淀芯片(ChipChip)
该技术能够快速在目标基因组的染色体中确定特异DNA结合蛋白的准确结合位点,ChIP芯片也可以在一个基因组的任何感兴趣的区域内寻找染色体的结构改变。一、ChIP-Chip的用途(1)在基因组范围内确定基因转录因子的DNA结合位点和其他DNA结合蛋白或蛋白复合体的DNA结合位点。(2)染色体活性状态的定
技术推荐-|-ChIP的新玩法
如果研究者们想知道蛋白在做什么,他们通常会采取直接的方式:免疫共沉淀能知道蛋白A和蛋白B有没有在一起,ChIP能确定蛋白A是否与核酸序列B结合。 染色质免疫共沉淀ChIP可以鉴定与指定蛋白结合的DNA序列,其基础理念能追溯到几十年前。如今ChIP已经成为了表观基因组学的一个基本工具,与新一代测
神经元芯片(Neuron-Chip)
为了经济地、标准化地实现LonWorks技术的应用,Echelon公司设计了神经元芯片。神经元这一名称是为了表明正确的网络控制机制和人脑是极为相似的。人脑中是没有控制中心的。几百万个神经元连接在一起,每个神经元都能通过位数众多的路径向其他的神经元发送信息。每个神经元通常专注于某一种特殊功能,但是任何
血清肌酐(CRE)测定的临床意义
升高:常见于严重肾功能不全、各种肾障碍、肢端肥大症等。降低:常见于肌肉量减少(如营养不良、高龄者)、多尿。
条件基因剔除转基因动物
实验概要本文介绍了条件基因剔除转基因动物技术。条件基因剔除转基因动物技术把靶基因的灭活限定于特定时间和某一特定组织细胞内,这将使基因剔除技术具有更大的应用价值。实验步骤1. 条件基因剔除技术 1) 重组酶真核系统所广泛用的4种位点特异重组系统包括: a. P1噬菌体的Cre/Lox
染色质免疫共沉淀(ChIP)
实验方法原理 在保持组蛋白和DNA联合的同时,通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体,染色质被切成很小的片断,并沉淀下来。IP是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“prorein A”特异性地结合到免疫球蛋白的FC片段的现象活用开发出来的方法。目前多用精制的prorein A预先结
简化ChIP分析的新方法
最近,美国普渡大学的研究人员开发出一种方法,称为ZipChip,可大大降低ChIP分析的时间和成本,同时还能提高灵敏度。 染色质免疫沉淀(ChIP)研究,对于染色质相关蛋白和组蛋白修饰在基因组中的定位,提供了深入的见解。然而,标准的ChIP方法耗时、昂贵、费力,由于涉及大量的步骤,易受实验误差