后微生物组时代首次发现人体特有的病毒组
我们人体中的病毒会影响微生物群体的结构和行为，但是关于身体许多区域的噬菌体，也就是感染细菌的病毒，科学家们所知甚少。近期一组研究人员发现，在膀胱中整合进细菌基因组的是噬菌体要比细菌本身多得多，这项出乎人意料的研究发现公布在1月29日的the Journal of Bacteriology杂志上。 “因为病毒组的研究很困难，因此我们对我们体内的病毒，以及它们与健康，疾病的关联知之甚少。为了填补这方面的知识空白，做这些研究是非常重要的，”英国曼彻斯特大学的医学微生物学家Chloe James（未参与该项研究）认为。 研究的开始 这项研究开始于芝加哥洛约拉大学（Loyola University）的生物信息学家Catherine Putonti，她为了帮助她的同事分析来自181位女性患者膀胱中收集到的序列数据，这些患者存在或不存在泌尿系统问题。她从中发现了了许多病毒，由此她觉得对这些病毒序列展开深入的探讨。 Putonti......阅读全文
武汉病毒所在芽孢杆菌噬菌体的相关研究中取得系列成果
芽孢杆菌属（Bacillus）细菌是一类广泛存在的革兰氏阳性菌，其中诸如炭疽芽孢杆菌（B. anthracis）、蜡样芽孢杆菌杆菌（B. cereus）、短小芽孢杆菌（B. pumilus）、苏云金芽孢杆菌（B. thuringiensis， Bt）等为人类、动物、植物或昆虫的病原菌。噬菌体为细
肠道病毒研究揭示噬菌体与炎性肠炎相关的主要变化
肠道微生物群体的功能紊乱与炎症性肠病（inflammatory bowel diseases，IBD）的产生有关。图片来源：H. Hendricks, NC State Phage Hunters, E. Miller, NC State University.过去试图探索微生物对IBD作用的研究主
通过噬菌体ELISA鉴定得到的噬菌体克隆
经过3～4轮的筛选后，应该能够富集到能与受体特异性结合的噬菌体群体。通常而言，在后几轮的筛选中，每次获得的噬菌体总量都会增加，但是单就这个现象并不一定能说明已经筛选到了受体特异性结合的肽段。能与靶分子非特异性结合或者能与筛选基质的噬菌体克隆也会造成这一现象。噬菌体ELISA可以说是最灵敏的鉴定所获取
后微生物组时代－首次发现人体特有的病毒组
我们人体中的病毒会影响微生物群体的结构和行为，但是关于身体许多区域的噬菌体，也就是感染细菌的病毒，科学家们所知甚少。近期一组研究人员发现，在膀胱中整合进细菌基因组的是噬菌体要比细菌本身多得多，这项出乎人意料的研究发现公布在1月29日的the Journal of Bacteriology杂志上。
测序技术在新型冠状病毒防治中的作用
人民日报报道当地时间1月30日晚，世界卫生组织（WHO）宣布，将新型冠状病毒疫情列为国际关注的突发公共卫生事件。世卫总干事谭德塞说，WHO 相信中国的疫情一定能得到遏制，由于病毒的传播仍有很多未知数，世卫组织担忧中国之外的疫情会有恶化，这无关感染数量，关系人的健康和生命。新型冠状病毒感染人数全球范围
深度测序揭示埃博拉病毒何以产生多样性
最近，研究人员发现，RNA编辑会导致埃博拉病毒的mRNA多样性，但是这对病毒来说意味着什么呢？了解更多…… 来自西奈山伊坎医学院、加尔维斯顿国家实验室和J. Craig Venter研究所的研究人员发现，线状病毒——包括埃博拉病毒和马尔堡病毒，在感染期间，会产生比以前预计的范围更广的基因产物。
新冠病毒变化多端，基因测序怎么跟节奏
在受到大规模全球紧急情况的挑战时，如何科学有效应对是全球面临的共同现实。新冠肺炎大流行为科学开启了巨大的机遇，并让科学在这之中充分发挥了作用。其中，以闪电般的速度开发疫苗就是核心技术能力的体现，基因组测序亦然。 1月11日，世界卫生组织举行新冠肺炎例行发布会，总干事谭德塞表示，病毒传播得越广
测序技术在新型冠状病毒防治中的作用
当地时间1月30日晚，世界卫生组织（WHO）宣布，将新型冠状病毒疫情列为国际关注的突发公共卫生事件。世卫总干事谭德塞说，WHO 相信中国的疫情一定能得到遏制，由于病毒的传播仍有很多未知数，世卫组织担忧中国之外的疫情会有恶化，这无关感染数量，关系人的健康和生命。新型冠状病毒感染人数全球范围不断攀升，疫
罗氏GSJunior测序帮助确认新型冠状病毒出现
今年世界卫生组织确认了一个由新型冠状病毒引起的急性呼吸系统感染事件。第一个病人在中东地区发病后回到英国后被确诊，第二起病人在沙特阿拉伯确诊。世界卫生组织因此对全球发出警报，要求监控是否还有其他由这一新型冠状病毒引起的其他病例。 科学家对从病例中分离出了的冠状病毒株，利
我们皮肤上存在大量病毒“暗物质”
近年来，科学家们在微生物组研究中已经取得了较大的进展。现在，宾夕法尼亚大学的研究人员又将目光转向了病毒组研究。他们发表在mBio杂志上的研究显示，健康人类皮肤上的绝大多数DNA病毒是前所未见的，属于病毒“暗物质”。 我们体内居住的细菌（微生物组）对身体健康和疾病发展起到了至关重要的影
Nature子刊：突破性测序技术绘制甲基化图谱
通过一种新的DNA测序技术，研究人员首次绘制了致病菌全基因组甲基化标记图谱。通过比较相关菌株之间的甲基化模式，他们发现了称作噬菌体的病毒感染细菌显著改变宿主的一种方式。 布莱根妇女医院(Brigham and Women"s Hospital)、霍华德休斯医学研究所研究员Matthew K
病毒与细菌在太空进化模式与地球不同
美国威斯康星大学麦迪逊分校科学家开展的一项最新研究发现：在太空微重力环境中，病毒与细菌之间“生死较量”依然存在，但却呈现出与地球不同的模式。这些发现有助于科学家设计出更高效的噬菌体疗法，对抗日益严峻的耐药菌感染。相关成果发表于最新一期《公共科学图书馆·生物学》杂志。 噬菌体是专门感染细菌的病毒
2月王牌聚焦：人体内微生物研究推陈出新
近年来人体肠道微生物组成为了研究“新宠”，这方面研究主要聚焦于细菌，那么人体内的病毒，噬菌体呢？2月的系列进展也许能给出部分答案。 芝加哥洛约拉大学的一组研究人员分析来自181位女性患者膀胱中收集到的序列数据，从他们研究的200个细菌基因组中鉴定出大部分细菌都有的450多种可能的噬菌体序列。超
烈性噬菌体（virulent－phage）和温和噬菌体（temperate－phage）
噬菌体(bacteriaphage or phage)是病毒的一类，结构很简单，基本上由一个蛋白质外壳包裹着一些核酸组成的。噬菌体的多样性来自于组成其外壳的蛋白质的种类，以及其染色体的类型和结构的不同。（一）烈性噬菌体（ virulent phage）遗传学上应用最广泛的烈性噬菌体是大肠杆菌（ E.
特殊噬菌体衣壳可使流感病毒“窒息”而亡－为新冠提供参考
一种新方法为抑制季节性流感和禽流感带来了新的治疗选择的希望。在空的（因此无传染性）噬菌体外壳的基础上，柏林的研究人员开发了一种化学修饰的噬菌体衣壳，从而使流感病毒“窒息”而亡。 完美匹配的结合位点会导致流感病毒被噬菌体衣壳包裹，从而实际上不再可能感染肺细胞。这种现象已在临床前试验中得到证实，也
Nature－|－云计算助力发现新型病毒
病毒给人类的健康带来了巨大的威胁，比如1918年的西班牙流感、AIDS、埃博拉、SARS、新冠病毒等。据估计，能够造成人群传染病的病毒有3x105之多，然而可惜的是人们只认识其中的很少一部分。因此，在全球范围内对病毒进行监测是预测和预防未来病毒传播的最有效手段之一。借助于新技术，比如高通量测序，人类
研究表明病毒可与蜘蛛分享DNA
一项新研究发现，一种感染细菌的病毒会与包括黑寡妇蜘蛛在内的动物分享DNA序列。相关成果10月11日在线发表于《自然—通讯》。 感染细菌的病毒不会影响真核生物（如动物、植物、真菌和原生生物）。病毒虽然常常会与宿主交换遗传物质，但它们吸收与宿主属于不同生物的基因还是前所未见的。 美国田纳西州范德
Nature重大成果：揭示125000个病毒基因组
在地球的内部、地球之上以及地球的周围，微生物的数量达到了10^30，估计超过了银河系中的星星。微生物已知在调控碳固定，维持全球氮、硫、磷和其他营养素的循环中起至关重要的作用，但目前大多数的微生物仍然是无法培养和未知的。美国能源部正以这一“微生物暗物质”作为目标，更好地了解地球微生物的多样性，收集
Nature重大成果：揭示125000个病毒基因组
在地球的内部、地球之上以及地球的周围，微生物的数量达到了10^30，估计超过了银河系中的星星。微生物已知在调控碳固定，维持全球氮、硫、磷和其他营养素的循环中起至关重要的作用，但目前大多数的微生物仍然是无法培养和未知的。美国能源部正以这一“微生物暗物质”作为目标，更好地了解地球微生物的多样性，收集
你比你想象中携带更多的病毒
细菌学家最近对皮肤里的细菌群（肠道菌群）进行了广泛的研究，对我们的健康和疾病有很好的启示。病毒学家们对这些与“病毒组”相关的发现产生浓厚的兴趣，因为他们的研究不再局限于皮肤表面病毒了。 来自宾夕法尼亚大学医学院的一项新研究发现人体皮肤上大部分的DNA病毒从来没有被发现过，是病毒的“暗物质”。
研究发现人类肠道病毒因人而异
已知人类肠道中存在的大多数病毒是噬菌体，但它们如何与定植在体内的细菌相互作用一直是个悬而未决的问题。虽然微生物组近年来成了研究热点，但科学家们仍然有很多关于肠道菌群的未解之谜，尤其是涉及到肠道中的病毒。 近日，发表在Cell Host & Microbe上的一项研究中，来自爱尔兰科克大学的研究
浙江大学最新评述：深度测序技术发掘植物病毒资源
科学通报，中国科学C辑:生命科学，这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的，我国学术期刊中的知名品牌，被国内外各主要检索系统收录，如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等；美国的SCI、CA、EI，英国的SA，日本的《科技文献
Nature－子刊：用高通量免疫测序诊断病毒感染
药明康德合作伙伴 Adaptive Biotechnologies 宣布在《自然》子刊《Nature Genetics》上发表创新型研究论文，结果证明可提供一种潜在的新颖方法诊断慢性病毒感染。 Adaptive Biotechnologies 是高通量测序领域的先驱性公司和领军企业之一，其专长
中国疾控中心已完成测序MERS病毒基因组
中国疾控中心近日透露，该中心病毒病所与广东省及惠州市疾控中心合作，已完成我国首例MERS病例的病毒全基因组序列测定。 6月10日信息显示，韩国目前中东呼吸综合征（MERS）确诊病例为108人，死亡9人，死亡率在7%左右。韩国病例数仅次于沙特，列世界第二。近期MERS在韩国连续报告多例病例，被隔
单分子测序揭示艾滋病毒可变剪切新模式
最新一期Nucleic Acids Research上发表了一篇利用PacBio单分子测序方法对HIV-1病毒转录组可变剪切模式的研究。HIV-1病毒是一种典型的RNA病毒，其基因组比目前已知的任何一种病毒基因组都复杂。HIV-1只有一个转录起始位点，却有多种剪切异构体，是研究可变剪切的一种
噬菌体的生长
Preparing Lawn Cells for M13 Cloning (Life Technologies)Lawn cells require the F' episome for M13 infection and may be prepared Streaking Lambda
噬菌体如何培养
用大肠杆菌来培养。先制备培养大肠杆菌的培养基，培养大肠杆菌。然后用噬菌体再感染大肠杆菌。噬菌体就是细菌病毒，他是严格的活细胞寄生生物，所以要用活细胞来培养。
噬菌体的概述
噬菌体(bacteriophage, phage)是感染细菌、真菌、藻类 、放线菌或螺旋体等微生物的病毒的总称，因部分能引起宿主菌的裂解，故称为噬菌体。本世纪初在葡萄球菌和志贺菌中首先发现。作为病毒的一种，噬菌体具有病毒的一些特性：个体微小；不具有完整细胞结构；只含有单一核酸。可视为一种“捕食”
噬菌体展示技术
1985年，Smith G P第一次将外源基因插入丝状噬菌体f1的基因Ⅲ，使目的基因编码的多肽以融合蛋白的形式展示在噬菌体表面，从而创建了噬菌体展示技术。该技术的主要特点是将特定分子的基因型和表型统一在同一病毒颗粒内，即在噬菌体表面展示特定蛋白质，而在噬菌体核心DNA中则含有该蛋白的结构基因。另
噬菌体的介绍
噬菌体(bacteriophage, phage)是感染细菌、真菌、藻类 、放线菌或螺旋体等微生物的病毒的总称，因部分能引起宿主菌的裂解，故称为噬菌体。本世纪初在葡萄球菌和志贺菌中首先发现。作为病毒的一种，噬菌体具有病毒的一些特性：个体微小；不具有完整细胞结构；只含有单一核酸。可视为一种“捕食”