Nature:揭示人体最为常见的DNA突变如何发生
变形器(shape-shifter)并不仅是科幻的东西,它们是真实的,而且它们存在于我们的DNA中。 在一项新的研究中,研究人员描述了人类DNA中的两个通常不匹配的碱基---鸟嘌呤(G)和胸腺嘧啶(T)---如何能够改变形状,从而在DNA螺旋“梯子”上形成一个不显眼的横档。这允许它们通过躲避身体对基因突变的天然防御而存活下来。相关研究结果于2018年1月31日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Dynamic basis for dG•dT misincorporation via tautomerization and ionization”。图片来自CC0 Public Domain 论文共同通信作者、俄亥俄州立大学化学与生物化学教授ZucaiSuo解释道,“当这两个碱基偶然形成氢键时,它们起初匹配得并不很好。它们从DNA螺旋上突出来,因此在正常情形下,用于复制DNA的酶很容易检测到它们并进行修复。但是有时,在......阅读全文
Nature子刊:DNA碱基编辑新方法
10月,国际知名学术期刊《自然-方法(Nature Methods)》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所常兴研究组题为“Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic diver
Nature子刊:DNA碱基编辑新方法
10月,国际知名学术期刊《自然-方法(Nature Methods)》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所常兴研究组题为“Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic div
DNA碱基编辑器或能诱导大量脱靶RNA突变!
DNA碱基编辑方法能够直接在基因组DNA中进行点突变的校正,同时并不会产生任何双链的断裂(DSBs,double-strand breaks),但潜在的脱靶效应常常限制了这些方法的应用,腺相关病毒(AAV)是DNA编辑基因疗法中最常用的传递系统,由于这些病毒能够在体内持续维持基因表达的功能,因此
-利用荧光DNA探测分子-单个碱基突变也能被发现
DNA序列中最轻微的变异也会影响深远,无论对研究还是医学应用,可靠识别这些序列都非常重要。据物理学家组织网近日报道,美国华盛顿大学和莱斯大学研究人员合作,开发出一种荧光DNA探测分子,能检查出一段目标DNA链中单个碱基的变化。而这些微小突变可能是造成某些疾病的根源,或耐抗生素细菌的原因。这一成果
Nature:可怕,单一DNA碱基就可让恶性脑癌觉醒
近日,来自费城儿童医院的科学家通过研究发现,对单个DNA碱基的关键性改变不仅可以使得儿童罹患恶性的脑癌—神经细胞瘤,而且还会使得该疾病进展迅速,相关研究刊登于国际杂志Nature上;研究者指出,名为LMO1基因的改变会形成一种超级增强子,从而引发该基因生物活性的异常增加,最终引发肿瘤形成且进展迅
基因突变碱基变化
基因突变可分为碱基置换突变和移码突变两大类。 碱基置换突变——也称为点突变,指DNA分子中一个碱基对被另一个不同的碱基对取代所引起的突变。点突变分转换和颠换两种形式。如果一种嘌呤被另一种嘌呤取代或一种嘧啶被另一种嘧啶取代则称为转换嘌呤取代嘧啶或嘧啶取代嘌呤的突变则称为颠换(transversi
点突变的碱基置换
可以分为转换(transitions)和颠换(transversions)两类 。转换:嘌呤和嘌呤之间的替换,或嘧啶和嘧啶之间的替换。颠换:嘌呤和嘧啶之间的替换。点突变的不同效应为:1、同义突变 ;2、错义突变;3、无义突变;4、终止密码突变
人造碱基能像天然碱基参与DNA复制
据物理学家组织网近日报道,新加坡科学家在最新一期《德国应用化学国际版》期刊上发表论文称,他们开发出一种遗传代码扩增技术,并合成出两种能够配对的人造碱基。通过X射线结晶技术分析表明,人造碱基对拥有与天然碱基对几乎完全相同的结构特征。使用新碱基对可以合成全新DNA片段,更好地检测病毒感染情况。
Nature:酒精竟会破坏干细胞DNA-诱发大量突变
都说“小酌怡情,大饮伤身”。在全球,饮酒与癌症病发以及死亡有着脱不开的干系。科学家们相信,这和酒精在人体内的代谢产物乙醛有关——这类物质会影响DNA,从而诱发突变。本研究的通讯作者Ketan Patel教授(图片来源:MRC Laboratory of Molecular Biology) 这
互补碱基的DNA和RNA的主要碱基的差别
胸腺嘧啶是DNA的主要嘧啶碱,在RNA中极少见;相反,尿嘧啶是RNA的主要嘧啶碱,在DNA中则是稀有的。在DNA分子结构中,由于碱基之间的氢键具有固定的数目和DNA两条链之间的距离保持不变,使得碱基配对必须遵循一定的规律,这就是Adenine(A,腺嘌呤)一定与Thymine(T,胸腺嘧啶)配对,G
基因突变的诱变机制碱基置换突变
可以通过两个途径即碱基结构类似物的参入和诱变剂或射线引起的化学变化来进行。① 类似物的参入 5-溴尿嘧啶(BU)是胸腺嘧啶的结构类似物。它只是在第5位碳原子上以溴原子代替了胸腺嘧啶的甲基(─GH3),并且因此更易以烯醇式出现。大肠杆菌在含有BU的培养基中培养后,细菌的 DNA中的一部分胸腺嘧啶被BU
碱基置换的突变类型介绍
DNA分子中某一个碱基为另一种碱基置换,导致DNA碱基序列异常,是基因突变的一种类型。可分为转换和颠换两类。转换是同类碱基的置换(AT→GC及GC→AT),颠换是不同类碱基的置换(AT→TA或CG,GC→CG或TA)。碱基置换的后果可能是:①同义突变(slientmutation),位于密码子第三碱
Nature:揭示人体最为常见的DNA突变如何发生
变形器(shape-shifter)并不仅是科幻的东西,它们是真实的,而且它们存在于我们的DNA中。 在一项新的研究中,研究人员描述了人类DNA中的两个通常不匹配的碱基---鸟嘌呤(G)和胸腺嘧啶(T)---如何能够改变形状,从而在DNA螺旋“梯子”上形成一个不显眼的横档。这允许它们通过躲避身
Nature子刊:基因外的DNA突变会引起癌症
随着对癌症机理认识的不断加深,我们已经找到了许多会导致癌症的基因突变,为患者带来了生命的希望。但在一个人的基因组里,只有2%的DNA是编码蛋白质信息的“基因”。剩下98%的DNA对癌症究竟有没有作用,有怎样的作用,至今依然没有一个定论。 今日,加州大学圣地亚哥分校(UCSD)的研究人员在《自然
基因检测新突破:-单碱基突变检测
DNA序列中稍有变异就会对身体产生深远的影响。现代基因组学研究已经表明,只要一个突变就占领了决定是否成功治愈一种疾病还是使该病猖獗地蔓延到全身各部位的制高点。 研究人员通过一种新的方法检测特定DNA片段,找出单一突变位点,从而帮助疾病(如癌症、肺结核)的诊断和治疗。DNA序列中这
“Helicase-AID”实现多位点单碱基突变
近日,大连理工大学、中科院天津工业生物技术研究所研究团队在《Metabolic Engineering》上发表题为“Helicase-AID: A novel molecular device for base editing at randomgenomic loci”的研究论文,将DNA解旋
含8个碱基的DNA首次合成
地球生命的DNA包含4个碱基,现在,美国科学家将生命“字母表”的数量增加了一倍,首次合成出包含8个碱基的DNA。实验表明,合成DNA似乎能像天然DNA一样存储和转录信息。发表于《科学》杂志的最新研究成果表明,宇宙中或许存在其他生命形式,这对于外星生命搜寻非常重要。 本研究中,应用分子进化基金会
DNA碱基序列决定其光敏性
DNA分子在所有生命形态中扮演着遗传信息载体的角色,对紫外光的修改具有高度的抵抗性,但要理解其光稳定性的机制还存在一些令人费解的问题,一个重要方面是构成DNA分子的4种碱基之间的相互作用。德国基尔大学的研究人员成功地证明,DNA链因其碱基序列而有不同的光敏感性。相关研究结果刊登在最近出版的《科学》(
人造碱基能像天然DNA那样连接
美国印第安纳大学和应用分子进化基金会等机构科学家证明,他们造出的两种人造DNA“字母”Z和P,能像天然DNA那样组合连接在一起,将来有望把这两个新成员纳入到活细胞中。相关论文发表在最近的《美国化学协会会刊》(JACS)上。 合成生物学家一直在竞相研究遗传基本单位的人造版。美国应用分子进化基金
DNA和RNA的主要碱基区别
DNA和RNA的主要碱基略有不同,其重要区别是:胸腺嘧啶是DNA的主要嘧啶碱,在RNA中极少见;
DNA和RNA的主要碱基区别
DNA和RNA的主要碱基略有不同,其重要区别是:胸腺嘧啶是DNA的主要嘧啶碱,在RNA中极少见;
DNA突变的过程和突变结果
突变是指生物体、病毒或染色体外DNA基因组核苷酸序列的改变。包括哪怕是只有一个碱基变化的碱基替换、DNA插入、DNA缺失或DNA重复引起的序列的改变 。一些突变是可遗传的,生殖细胞发生的突变可以遗传给后代。发生在非生殖细胞即体细胞的突变,称为体细胞突变,是非遗传的突变。DNA复制过程出错可以导致突变
DNA碱基中产生靶向变化的碱基编辑器-诱导广泛的脱靶
在一项新的研究中,来自美国麻省总医院、哈佛医学院和哈佛大学陈曾熙公共卫生学院的研究人员报道近期开发的几种在单个DNA碱基中产生靶向变化的碱基编辑器能够在RNA中诱导广泛的脱靶效应。他们还描述了对碱基编辑器变体进行基因改造可显著降低RNA编辑的发生率,这同时也会增加在靶DNA编辑的精确度。相关研究
DNA碱基家族迎新成员-甲基腺嘌呤碱基成新表观遗传标记
西班牙科学家在最新出版的《细胞》杂志上撰文指出,或许存在着第六种碱基——甲基腺嘌呤(mA),其主要作用是确定表观基因组的性质,并因此在细胞的生命过程中发挥重要作用。 脱氧核糖核酸(DNA)是遗传物质的主要组成成分,一般认为,它由A(腺嘌呤)、C(胞嘧啶)、G(鸟嘌呤)和T(胸腺嘧啶)四种碱基结
DNA定点突变实验
DNA定点突变实验 实验方法原理 定点突变是指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法向目的DNA片段(可以是基因组,也可以是质粒)中引入所需变化(通常是表征有利方
DNA突变的特性
不论是真核生物还是原核生物的突变,也不论是什么类型的突变,都具有随机性、稀有性和可逆性等共同的特性。 ①随机性。指基因突变的发生在时间上、在发生这一突变的个体上、在发生突变的基因上,都是随机的。在高等植物中所发现的无数突变都说明基因突变的随机性。在细菌中则情况远为复杂。 ②稀有性。突变是极为
DNA定点突变实验
DNA定点突变可用于:(1)研究蛋白质相互作用位点的结构、改造酶的不同活性或者动力学特性;(2)改造启动子或者DNA作用元件;(3)提高蛋白的抗原性或者是稳定性、活性、研究蛋白的晶体结构,以及药物研发、基因治疗等等方面。实验方法原理定点突变是指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法向目的DNA片段(可以
DNA定点突变实验
实验方法原理 定点突变是指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法向目的DNA片段(可以是基因组,也可以是质粒)中引入所需变化(通常是表征有利方向的变化),包括碱基的添加、删除、点突变等。单点突变的原理是从常规E.coli中经纯化试剂盒(Miniprep)或者氯化铯纯化抽提得到质粒。设计一对包含突变位点的
DNA突变的种类
基因突变可以是自发的也可以是诱发的。自发产生的基因突变型和诱发产生的基因突变型之间没有本质上的不同,基因突变诱变剂的作用也只是提高了基因的突变率。 按照表型效应,突变型可以区分为形态突变型、生化突变型以及致死突变型等。这样的区分并不涉及突变的本质,而且也不严格。因为形态的突变和致死的突变必然有
Nature子刊|碱基编辑器新拓展
作为Cas9核酸酶的进化祖先,IscB蛋白作为紧凑RNA引导的DNA内切酶和缺口酶,使其成为碱基编辑的强有力候选者。然而,目标范围狭窄限制了IscB系统的应用;因此,有必要找到更多识别不同靶邻基序(TAMs)的IscB。2024年8月15日,辉大基因张海南、李彤、复旦大学黄锦海、中科院脑科学与智能技