Nature:揭示人体最为常见的DNA突变如何发生

变形器(shape-shifter)并不仅是科幻的东西,它们是真实的,而且它们存在于我们的DNA中。 在一项新的研究中,研究人员描述了人类DNA中的两个通常不匹配的碱基---鸟嘌呤(G)和胸腺嘧啶(T)---如何能够改变形状,从而在DNA螺旋“梯子”上形成一个不显眼的横档。这允许它们通过躲避身体对基因突变的天然防御而存活下来。相关研究结果于2018年1月31日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Dynamic basis for dG•dT misincorporation via tautomerization and ionization”。图片来自CC0 Public Domain 论文共同通信作者、俄亥俄州立大学化学与生物化学教授ZucaiSuo解释道,“当这两个碱基偶然形成氢键时,它们起初匹配得并不很好。它们从DNA螺旋上突出来,因此在正常情形下,用于复制DNA的酶很容易检测到它们并进行修复。但是有时,在......阅读全文

新发现!非编码DNA突变也可引发癌症-|-Nature子刊

  基因与癌症的关系远比人类已了解的更加复杂。近日,美国科学家在一项新研究中鉴定出了近200个在不同的癌症中发挥作用的非编码DNA突变。   image.png   图片来源:Nature Genetics(doi:10.1038/s41588-018-0091-2)   在人类基因组中,有9

DNA碱基编辑:基因编辑工具“升级版”

  美国哈佛大学14日宣布,将授予光束疗法(Beam Therapeutics,下称BT)公司全球专利许可,对可用于治疗人类疾病的一套革命性DNA碱基编辑技术进行开发和商业化。  BT公司同日宣布,已经筹集了高达8700万美元由F-Prime资本和ARCH风投牵头的A轮融资。BT公司由基因编辑技术领

DNA碱基编辑:基因编辑工具“升级版”

  美国哈佛大学14日宣布,将授予光束疗法(Beam Therapeutics,下称BT)公司全球专利许可,对可用于治疗人类疾病的一套革命性DNA碱基编辑技术进行开发和商业化。   BT公司同日宣布,已经筹集了高达8700万美元由F-Prime资本和ARCH风投牵头的A轮融资。BT公司由基因编辑技

DNA分子杂交技术的原理碱基互补配对

  怎么看出来是否杂交上,这个是要在探针上做标记(标记可以有很多种,生物的、荧光的、放射性的等等),杂交后是要洗脱的,只有这种特异性的杂交才被保留下来,再通过检测探针上的标记来看出是否杂交上。比如上面的“钥匙”,就像你用一串的“钥匙”去试,但你可以先在要的那个“钥匙”上做个标记,你不需要认识“钥匙”

组成DNA的四种碱基是什么?

组成DNA的四种碱基是腺嘌呤(A)、胞嘧啶(C)、鸟嘌呤(G)和胸腺嘧啶(T)。

新DNA测序方法每秒识别660亿碱基

美国国家标准与技术研究所(NIST)模拟了一个新型快速测序概念:通过将DNA从超薄的石墨片层结构的孔洞中拉动,通过测量石墨孔洞边缘产生的电位变化,从而实现高速、高精度、高效率的DNA测序,该方法每秒可识别660亿个碱基,准确度为90%且无假阳性。 DNA测序经历了Sanger测序、二代测序(高通

全新「碱基编辑器」:不用「切割」也能精准编辑基因

原标题:不用「切割」也能精准编辑基因了,华人学者开发全新「碱基编辑器」摘要:CRISPR 基因编辑技术之外的新工具。基因编辑技术有了重大进展。Broad 研究所的华人学者 David Liu 教授的团队开发出了一种「碱基编辑器」,可以让细胞内 DNA 的一种碱基通过简单的化学反应,变成另一种

细胞化学词汇DNA突变

突变是由于DNA复制(特别是减数分裂)出错或DNA损伤(如暴露于辐射或致癌物引起)后错误的修复造成的。

PacBio推出首款检测DNA碱基修饰的软件

  美国第三代测序公司Pacific Biosciences近日宣布推出一个独特的解决方案,可利用PacBio® RS测序仪检测与表观遗传学调控和DNA损伤相关的DNA碱基修饰。   DNA碱基修饰(如甲基化)在多个生物进程中扮演了重要角色,包括生长和衰老、免疫、细菌致病性以及疾病发展。Pac

首个酶法检测DNA中dU碱基技术诞生

     单碱基水平精确定位dU在DNA乃至基因组位置示意图    迄今为止,人类还无法从单个碱基分辨率水平上检测到脱氧尿嘧啶(dU),这成为DNA序列检测的盲区和瓶颈之一,严重阻碍了对dU功能的认知和对DNA遗传密码的理解。    1月17日,中科院院士、同济大学教授陈义汉课题组和同济

《自然》:科学家发现DNA碱基合成新路径

  有助于开发出高选择性新型抗生素   胸腺嘧啶是四种DNA碱基之一,美国科学家在4月6日出版的《自然》(Nature)杂志上表示,他们发现了新的胸腺嘧啶的生物合成路径,该化学反应与其他已知的生成DNA碱基的反应的不同之处在于使用了一种独特的酶。该项研究有助于科学家开发出以这种酶为靶标的,具有高度

DNA合成仪试剂和碱基瓶组相关介绍

  DNA合成仪一般需碱基瓶组及试剂瓶组。试剂瓶组一般最少为6个,含脱保护剂(Deb)、活化剂(act)、盖帽试剂A(capA)、盖帽试剂B(capB)、氧化剂(OXI)及洗脱乙腈(ACN),每种仪器一般都多设置1-2个试剂瓶位,用于特殊产物的合成。碱基瓶组一般最少为4个标准碱基(A/C/G/T),

单碱基基因编辑技术之工具篇

前言今年5月,David R. Liu教授与张锋教授等人联合创立Beam Therapeutics公司,再一次将“单碱基编辑技术”送上了热搜榜,趁着热度还未散去,我们继上一期“单碱基编辑技术浅谈”后,又为大家准备了一篇超级实用性的深度分析,带你一起看看单碱基编辑的前世今生及如何一步步发展壮大的历程!

单碱基基因编辑技术之工具篇

  前言   今年5月,David R. Liu教授与张锋教授等人联合创立Beam Therapeutics公司,再一次将“单碱基编辑技术”送上了热搜榜,趁着热度还未散去,我们继上一期“单碱基编辑技术浅谈”后,又为大家准备了一篇超级实用性的深度分析,带你一起看看单碱基编辑的前世今生及如何一步步发展

Nature-Cancer:线粒体DNA突变增强免疫检查点疗法的癌症治疗效果

  几十年来,我们已经知道超过50%的癌症存在体细胞的线粒体DNA(mtDNA)突变。而生殖细胞中的线粒体DNA突变是人类遗传性代谢疾病最常见的原因,其影响已经得到证实。然而,线粒体DNA突变在癌症中的生物学和临床相关性仍存在争议。  2024年1月29日,格拉斯哥大学和纪念斯隆凯特琳癌症中心的研究

上海生科院发现DNA碱基编辑的新方法

  10月10日,国际学术期刊《自然-方法》(Nature Methods)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所常兴研究组题为Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic div

DNA修复技术碱基的直接插入过程介绍

DNA单链断裂是常见的损伤,其中一部分可仅由DNA连接酶(ligase)参与而完全修复。此酶在各类生物各种细胞中都普遍存在,修复反应容易进行。但双链断裂缺几乎不能修复。

关于DNA杂交的杂交原理碱基互补配对的介绍

  至于怎么看出来是否杂交上,这个是要在探针上做标记(标记可以有很多种,生物的、荧光的、放射性的等等),杂交后是要洗脱的,只有这种特异性的杂交才被保留下来,再通过检测探针上的标记来看出是否杂交上。比如上面的“钥匙”,就像你用一串的“钥匙”去试,但你可以先在要的那个“钥匙”上做个标记,你不需要认识“钥

新型双碱基编辑器助力基因饱和突变文库构建

近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员赖良学课题组在新型碱基编辑器开发方面取得重要进展,获得了可同时兼具当前多种单碱基编辑器及CRISPR/Cas9基因编辑功能的多功能碱基编辑器,可广泛地诱导产生多种模式的突变,对于饱和突变文库构建、基因突变功能研究等方面具有重要促进作用。相关研究在线发表于

线粒体DNA突变与母亲年龄

  一项研究探索了与诸如癌症和糖尿病等疾病有联系的遗传突变的母亲到子女的传播。细胞的代谢动力工厂线粒体拥有自己的从母亲遗传来的基因组,有时候在一个人身上可能含有多个线粒体DNA(mtDNA)类型,这种现象被称为异质性。Kateryna D. Makova及其同事探索了异质性在一个人类人群中的普遍

DNA基因突变的类别

按照基因结构改变分类小规模突变小规模突变影响基因中的一个或几个核苷酸 (只影响到一个核苷酸的突变称为点突变)。小规模突变包括:插入:将一个或多个额外的核苷酸添加到DNA中。它们通常由转座因子引起,或由重复元件错误复制所致。位于基因编码区的插入可改变mRNA的剪接(剪接位点突变)或引起阅读框架的移位(

细胞化学词汇DNA点突变

点突变指只有一个碱基对发生改变。广义点突变可以是碱基替换,单碱基插入或碱基缺失;狭义点突变也称作单碱基替换(base substitution)。碱基替换又分为转换(transitions)和颠换(transversions)两类。点突变具有很高的回复突变率。

DNA突变的概念和原因

突变是由于DNA复制(特别是减数分裂)出错或DNA损伤(如暴露于辐射或致癌物引起)后错误的修复造成的。

华东师大科研团队填补碱基编辑领域最后一块拼图

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503069.shtm华东师范大学生命科学学院李大力教授团队继2022年10月在国际著名学术期刊 Nature Chemical Biology 报道新一代精准安全的腺嘌呤碱基编辑器ABE9以及11月在国际

Nature:通过分析外显子发现与糖尿病相关的罕见DNA突变

  近日,Nature上发表了一篇有关于2型糖尿病的大规模调查研究。该研究是目前为止最大规模的外显子测序。最终,研究人员确定了四个影响糖尿病风险的罕见变异基因。这些数据表明,未来可能还会发现数百个基因。  本次研究团队——牛津大学糖尿病医学教授、麻省总医院糖尿病科主任、哈佛医学院医学教授、及罗德研究

Nature揭示膀胱肿瘤基因组突变中DNA修复及损伤的关键角色

  在过去几十年里,全世界的科学家们都在对癌细胞的基因组进行全方位解析,试图揭开驱动肿瘤生长的基因密码;随着对成千上万个在肿瘤细胞DNA中积累的基因突变进行精确分析,研究人员如今发现的致癌基因的数量越来越多了;近日科学家们就将研究目光转移到了其它关键问题上,即什么样的生物学过程会引发DNA发生突变?

Nature子刊:解密DNA的X档案

  DNA复制和DNA修复是所有生命的基本程序,也是生命科学领域的重要谜题。现在,Sheffield大学的研究团队揭开了这个谜题的关键部分。他们捕捉到了前所未有的细节,阐明了细胞分裂之后从DNA双链中去除分支DNA的分子机制。这项研究于六月六日发表在Nature Structural & Molec

张锋等“大神”创办新公司,获8700万美元A轮融资

  碱基编辑技术  近几年,CRISPR/Cas9基因编辑技术被全球科学家们广泛使用。然而,尽管很容易用它改变基因的功能,但修复点突变(指由单个碱基改变引发的突变)一直是个未解的难题。  A——腺嘌呤;T——胸腺嘧啶;C——胞嘧啶;G——鸟瞟呤;根据碱基互补配对原则,A与T配对、C与G配对。(图片来

Nature:“摇晃”的碱基对决定tRNA的保真度

  tRNA合成酶必须将合适的氨基酸附着到合适的、同源的tRNA上来维持遗传代码向蛋白质的正确翻译。丙氨酸的tRNA中一个“非华生-克里克碱基对”G3-U70确保被合成酶(AlaRS)正确氨酰化。  Shigeyuki Yokoyama及同事报告了来自古菌Archaeoglobus fulgidus

基因编辑大牛Nature子刊发文:CRISPR单碱基编辑准确!

  来自韩国基础科学研究所IBS的研究人员发表了题为“Genome-wide target specificities of CRISPR RNA-guided programmable deaminases”的文章,证实了最近研发的基因编辑方法的准确性。这一研究成果公布在4月10日的Nature