RNA复杂性如何产生的？揭示一个转录本多样性产生新机制
转录本多样性在有机体功能多样性方面扮演着重要角色，但目前对于其产生机制及生物意义仍不清楚。近日，中国科学院动物研究所詹祥江实验室通过分析猎隼的血液转录组和甲基化组、家鸡以及小鼠多组织转录组，揭示了一个转录本多样性产生的新机制。 这项研究发现表达量越高的基因越倾向于拥有更多的转录本。对猎隼血液中表达量最高的4个血红蛋白基因的分析结果显示，尽管它们的外显子数目不超过三个，却能通过可变剪切产生上百个不同的转录本，并且大部分剪切并不是发生在已有的基因组剪切位点（authentic splice site）上，而是与新产生的剪切位点（de novo splice site）有关。 进一步研究表明，这些新的剪切位点是通过转录过程中DNA的突变（transcription-associated mutation, TAM）引起的。这一结果改变了业界普遍认为的“RNA编辑（RNA editing）是新剪切位点产生的主要方式”这一观点。 ......阅读全文
关于DNA解旋酶转录的介绍
1、 不需要： DNA复制需要解旋酶，可是与DNA复制相类似的转录过程并不需要解旋酶，基因的转录是由RNA聚合酶催化进行的。基因的上游具有结合RNA聚合酶的区域，叫做启动子。启动子是一段具有特定序列的DNA，具有和RNA聚合酶特异性结合的位点，决定了基因转录的起始位点。RNA聚合酶与启动子结合后
《科学》：DNA绕个圈转录转向
在玩具赛车轨道游戏里，出老千的玩家会扳动开关，让他们对手的车辆进入一个循环轨道，从而赢取比赛。细胞也会这一招――改变“轨道”布局，影响细胞功能，来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)和牛津大学的科学家们发现通过形成或撤销基因环结构(gene loops)，细胞能调控转录机器，控制它是沿着遗传物
研究发现DNA损伤修复与DNA转录的协同作用
最近，来自挪威科学技术大学的Barbara van Loon博士等人在遗传信息修复方面有了新发现，该发现发表在最近的《Nature Communications》杂志上。 Van Loon的研究小组发现，阅读DNA的分子元件和纠正DNA错误的分子元件可以协同工作。（图片来源：NTNU） Va
细菌DNA转录偶联修复的结构基础
活跃的转录基因中的DNA损伤修复比基因组中不活跃的区域更迅速。在细菌中，这个过程被转录修复偶联因子（transcription repair coupling factor , TRCF）介导。TRCF破坏DNA损伤位点的处的RNA聚合酶，并重新启动DNA切除修复机制（DNA excisi
Nature：DNA修复新模式解答转录争议
紫外线和其他环境因素不多对我们的DNA造成破坏，可以说我们的健康在很大程度上依赖于细胞发现和修复DNA损伤的能力。纽约大学医学院的一项新研究展示，RNA聚合酶负责在基因组中搜寻DNA损伤，并招募盟友对其进行修复。这一机制能够有效减少突变，帮助人体控制癌症和其他疾病。这项研究由Evgeny N
DNA转录“控制器”的关键结构被破译
中介体是一种复杂的分子机器，在DNA（脱氧核糖核酸）的转录过程中扮演重要角色，被称为“真核转录调控中的中央控制器”。据美国物理学家组织网7月3日报道，美国印第安纳大学研究人员破译了中介体最关键的部分——其头部的蛋白组成结构，为研究中介体增加了重要的砝码，使人们能更深入理解细胞中基因
激活的热稳定－DNA－聚合酶进行反转录和－DNA－扩增实验
试剂、试剂盒 RNA寡核苷酸引物 脱氧核苷三磷酸 RT RNA PCR 酶 AccuRT 缓冲液 UNG 琼脂糖 溴化乙锭
激活的热稳定－DNA－聚合酶进行反转录和－DNA－扩增实验
试剂、试剂盒 RNA寡核苷酸引物脱氧核苷三磷酸RT RNA PCR 酶AccuRT 缓冲液UNG琼脂糖溴化乙锭二甲基亚砜乙酸镁去除 RNA 酶的水SYBRGreen I Dye仪器、耗材 琼脂糖凝胶的电泳设备实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂琼脂糖二甲基亚砜（见注释 1)(DMSO)溴化乙锭
激活的热稳定－DNA－聚合酶进行反转录和－DNA－扩增实验
本实验介绍激活的热稳定 DNA 聚合酶进行反转录和 DNA 扩增。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。试剂、试剂盒RNA寡核苷酸引物脱氧核苷三磷酸RT RNA PCR 酶AccuRT 缓冲液UNG琼脂糖溴化乙锭二甲基亚砜乙酸镁去除 RNA 酶的水SYBRGreen I Dy
Nature：新研究发现确保DNA正确转录方向的机制
麻省理工学院的生物学家发现了人体细胞确保其DNA向正确方向进行阅读、阻止“垃圾DNA”拷贝的机制。 人类基因组中大约有15%是蛋白质编码基因，但是近年来科学家发现有相当多的垃圾DNA，或者说基因间DNA可转录为RNA。科学家们一直在试图了解这些RNA的作用。在2008 年，MIT的科学
脱氧核糖核酸DNA的转录和翻译的介绍
基因是含有能够影响生物体表型特征的遗传信息的DNA序列。基因内的DNA碱基序列作为模板可以合成RNA分子，在大多数情况下，RNA分子被翻译成多肽，最终称为蛋白质。 将基因的核苷酸序列复制到RNA链中的过程称为转录，由RNA聚合酶催化发生。 RNA链有不同的命运：一些RNA分子实际上具有结构（例如
史上最详细人DNA转录前起始复合体结构出炉！
作为所有生命必不可少的一个过程，基因表达分两步：DNA转录为RNA，然后RNA翻译为蛋白。 在一项新的研究中，来自美国佐治亚州立大学、加州大学伯克利分校和西北大学等多家机构的研究人员将低温电镜技术（Cryo-EM）和最新的计算建模方法结合在一起，史无前例地详细解析出近原子分辨率下的人转录前起始
新型冠状病毒的遗传物质会逆转录成DNA
新型冠状病毒是什么？2019新型冠状病毒，即“2019-nCoV”，因2019年武汉病毒性肺炎病例而被发现，2020年1月12日被世界卫生组织命名。冠状病毒是一个大型病毒家族，已知可引起感冒以及中东呼吸综合征（MERS）和严重急性呼吸综合征（SARS）等较严重疾病。新型冠状病毒是以前从未在人体中发现
转录图谱的转录图谱的意义
在于它能有效地反应在正常或受控条件中表达的全基因的时空图。通过这张图可以了解某一基因在不同时间不同组织、不同水平的表达；也可以了解一种组织中不同时间、不同基因中不同水平的表达，还可以了解某一特定时间、不同组织中的不同基因不同水平的表达。人类基因组是一个国际合作项目：表征人类基因组，选择的模式生物的D
关于基因转录的转录因子介绍
转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态，RNA聚合酶自身无法启动基因转录，只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后，基因才开始表达。转录因子的结合位点
RNA的转录和逆转录
转录是以DNA为模板合成RNA的过程，经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中，再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的，以RNA分子中的一条链为模板，在逆转录酶的作用下，以四种脱氧核苷酸为原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
RNA复制、转录与逆转录
转录是以DNA为模板合成RNA的过程，经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中，再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的，以RNA分子中的一条链为模板，在逆转录酶的作用下，以四种脱氧核苷酸为原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
动物所发现转录能够远程诱导DNA产生G四链体结构
含有连续鸟嘌呤碱基的核苷酸能够形成G-四链体结构，倾向形成G-四链体结构的序列(PQS)广泛分布在原核生物和真核生物的基因组中，G-四链体结构参与一些重要的生理和病理过程，如DNA的复制，转录和癌症的发生等。然而对于G-四链体结构如何在基因组中产生这一问题仍然不清楚。 中科院动物研究所端粒
首次发现不通过DNA转录翻译过程制造产生的蛋白质
翻开任何一本生物学教科书，首先我们要学习的就是机体的DNA可以给出制造蛋白质的指令，而蛋白质在机体多种功能的发挥中扮演着重要的角色；近日，一项刊登于国际杂志Science上的研究论文中，来自犹他州大学的研究人员通过研究首次揭示，制造蛋白质的氨基酸可以在没有DNA指令及信使RNA信息存在的情况下进
在DNA转录成RNA时两种方法的碱基互补配对原则
另外，在DNA转录成RNA时，有两种方法根据碱基互补配对原则判断：1）将模板链根据原则得出一条链，再将得出的链中的T改为U（尿嘧啶）即可；2）将非模板链的T改为U即可。如：DNA：ATCGAATCG （将此为非模板链）；UAGCUUAGC（将此为模板链）；转录出的mRNA：AUCGAAUCG（可看出
关于体外转录的转录条件介绍
转录模板必须满足： 1. 在基因组全长克隆过程中，在正向引物5‘末端添加T7启动子序列； 2. 以T7启动子作为体外转录启动子，在启动子后面靶位序列连续带有3个G,转录效率最 高； 3. 在正向引物5/端添加一个帽子G,有利于提高体外转录RNA分子的侵染活性。
转录因子的转录调控区的介绍
同一家族的转录因子之间的区别主要在转录调控区。 转录调控区包括转录激活区（transcription activation domain）和转录抑制区（transcription repression domain）二种。近年来，转录的激活区被深入研究。它们一般包含DNA结合区之外的30-10
转录中介体MED23亚基在色素合成和DNA修复的调控机制
近日，中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王纲研究组的研究成果以Mediator MED23 Links Pigmentation and DNA Repair through the Transcription Factor MITF为题在线发表在Cell Reports上。
逆转录元件发生反向剪接插入DNA过程的原理与结构基础
逆转录元件是一种以RNA为媒介，通过“copyand paste”的方式在基因组中不断扩增的基因元件【1,2】。在哺乳动物基因组中有超过45%的遗传成分都是逆转录元件，因此逆转录转座事件如果在不恰当的地方发生就会导致基因紊乱或者基因疾病等严重后果【3】。 II组内含子（Group II int
北京基因组所转录因子TALE和DNA相互作用研究获进展
近日，中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室雷红星研究组，在其开展的转录因子TALE(transcription activator-like effector)和DNA相互作用研究方面取得阶段性进展，该研究对TALE蛋白的构象可塑性以及特异性识别DNA的机制进行了深入的计
研究阐明Hippo通路关键转录因子TEAD4特异性结合DNA机制
4月5日，国际学术期刊Oncogene在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所/分子细胞科学卓越创新中心周兆才研究组的最新研究成果DNA-binding mechanism of the Hippo pathway transcription factor TEAD4。该
关于转录因子的转录抑制区的介绍
也是转录因子调控表达的重要位点，但是对其作用机理研究尚不深入。可能的作用方式有三种：1）与启动子的调控位点结合，阻止其它转录因子的结合；2）作用于其它转录因子，抑制其它因子的作用；3）通过改变DNA的高级结构阻止转录的发生。 转录因子必须在核内作用，才能起到调控表达的目的。因此，转录因子上的核
上海生科院阐明Hippo通路关键转录因子TEAD4特异性结合DNA
4月5日，国际学术期刊Oncogene在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所/分子细胞科学卓越创新中心周兆才研究组的最新研究成果DNA-binding mechanism of the Hippo pathway transcription factor TEAD4。该
张余研究组等揭示不依赖DNA相互作用的转录激活机制
12月18日，eLife 杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张余研究组、赵国屏研究组，上海科技大学杨贝研究组和浙江大学冯钰研究组合作的题为Crl activates transcription by stabilizing active conformation
核转录分析
实验材料 cDNA 0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA 试剂、试剂盒 PBS