中国微生物组研究期待新突破
在这个广袤的世界上，存在无数各种各样的微生物，但我们对微生物了解很少，甚至不知道在我们周围有什么样的微生物。世界上所有的哺乳动物和鸟类，几乎已经全部被认知，而我们认知的微生物还不到1%。要知道，我们每个人体内都有大量微生物，一个100斤重的人，体内大约有1.5斤的微生物，它们在我们体内发挥着什么作用？如何发挥作用？是否能够成为人类健康的关键因子？是否能够超越生命体的生死，影响着生命体的未来……种种问题，指引着科学家前进的方向。微生物组是微生物学发展史上一个重要的概念性飞跃，是指一个特定环境或者生态系统中全部微生物及其遗传信息，包括其细胞群体和数量、全部遗传物质（基因组），涵盖微生物群及其全部遗传与生理功能，其内涵包括了微生物与其环境和宿主的相互作用。微生物组学是一个崭新的学科，微生物组研究取得的成果，必将为国家经济社会发展、人类生活质量改善提供源源不断的创新活力。因此，微生物组学也是一个世界各国争相发展的战略性科技领域。微生物组......阅读全文
专访3位微生物学家：中国微生物组研究如何自强
北京奥林匹克公园一条马路之隔的中科院微生物研究所把以上表述自豪地刻在楼前的石头上。从那里路过的人大都会不由自主地朝那块石头多看几眼，心中油然而生的除了敬意之外，还有对“微生物”的几分好奇。而近日，美国白宫以总统名义发布“国家微生物组计划”之举使得“微生物”在神秘之外，平添了攸关国家科技竞争力的更
中科院微生物组计划：研究中药与肠道微生物间作用机制
“项目执行期为两年，总投入三千万元人民币，14个研究单位、30个研究团队投身其中。 通过这一‘种子计划’的实施，为‘中国微生物组计划’做好预研工作。”在1月12日接受科技日报记者采访时，中国科学院微生物研究所所长刘双江研究员说，希望在人类代谢性疾病并发症和中草药调控肠道微生物方面有所突破，相关
只有基因组会决定你对药物的反应吗？微生物组也会
特殊微生物或酶的存在也许能够解释为什么某些治疗对特定人群不奏效。 在追寻个性化治疗的过程中，多数研究者关注的是个体的基因组如何控制机体对药物的应答。然而，越来越多的证据表明个体独特的微生物组，即存在于人体内的细菌及其他微生物种群，也许是决定药物在个体条件下能否起效的关键。 抗癌药对每个人的作
研究揭示荒漠生态系统应对气候变化的植物与微生物协同韧性机制
荒漠生态系统作为地球上脆弱但重要的生境之一，其稳定性与恢复力机制已成为当前生态学研究的焦点。此前研究从植物适应策略或土壤微生物过程等单一生物组分入手，不足以揭示植物与微生物如何作为一个整体协同响应和适应气候变化。二者之间的互馈机制及其对生态系统功能的长期影响，尤其在极端气候事件频发的条件下，仍是亟待
改变机体肠道微生物组真能逆转乳糖不耐受？
童年以后，全球大约三分之二的人群都会失去消化牛奶的能力，正如我们所知，断奶后100%的非人类哺乳动物也会失去这种能力，进入成年期，持续消化乳糖（牛奶中的主要糖类）的能力是一种生物学异常表现。 乳糖并不会被肠道直接吸收，相反，其必须被乳糖酶破碎成两种较小的糖类分子，正常情况下， 产生乳糖酶的基因
两篇Science发表微生物组研究重要成果
人类消化道中居住着大量的微生物，它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起到了重要的作用。许多人类疾病都与微生物组失衡有关。 Science杂志周五发表的两项大规模研究首次揭示了生活方式与肠道微生物组的关联。研究显示，生活中许多因素都能改变肠道微生物组的
微生物组影响的不仅是肠道，还有头发
为了让自己看上去美美哒，每个人每年都在头发上花了不少时间和金钱。不过，也许你还不知道，细菌和头发之间也存在着一种奇怪的共生关系。近日，加州大学旧金山分校的研究人员在《Cell Host & Microbe》上阐明了这种关系。 调节性T细胞（Treg）是一类让人体能够耐受共生微生物的免疫细胞，
如何利用微生物组来驱动精准医学的进展？
2016年11月20日 讯 /生物谷BIOON/ --日前，一项发表于国际杂志Trends in Pharmacological Sciences上的研究报告中，来自芝加哥大学的研究人员通过研究表示，对微生物组的研究对于未来精准医学的研究或许非常重要；机体的微生物组是由消化道中细菌、病毒、真菌及
研究发现塑料际微生物组可应对复合污染
广东省科学院生态环境与土壤研究所研究员孙蔚旻团队在国家自然科学基金、国家重点研发计划等项目的资助下，研究揭示了重金属污染塑料际微生物组对塑料矿化和重金属抗性的代谢多功能性。近日，相关成果发表于《水研究》（Water Research）。塑料与重金属作为常见环境污染物，在水生环境中常相互作用，这会使重
全球最大的海洋微生物组数据库建立
9月4日，《自然》在线发表中外科学家的合作成果，该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库，从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者，助理研究员刘琨为文章共同第一作者。该成果在《自然》报道 山东大学供图微生物已在生物制造、
全球微生物组大数据搜索引擎上线
日前，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心正式发布首个微生物组大数据搜索引擎——MSE（Microbiome Search Engine； http://mse.single-cell.cn），使得以整个微生物组为分析单元的智能搜索和大数据挖掘成为现实。 微生物组，又称“菌群”。
呼吸道微生物组决定机制研究获进展
近日，中山大学中山医学院教授丁涛团队与教授田国宝团队合作，研究揭示了口腔细菌对于肺部菌群和肺部健康的差异化塑造作用。相关研究在线发表于《先进科学》（Advanced Science）。 该研究团队发现，肺部菌群由口腔和鼻腔菌的输入共同塑造，而口腔菌输入占比越高所塑造的肺部菌群与肺部炎症因子的上
全球最大的海洋微生物组数据库建立
9月4日，《自然》在线发表中外科学家的合作成果，该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库，从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者，助理研究员刘琨为文章共同第一作者。 微生物已在生物制造、生物医药、生物农业、环境治理等
揭秘机体微生物组与人类健康之间的关联
人类机体中充满了能够帮助消化食物和对抗疾病的细菌，但由于饮食、居住地、爱好甚至病史的不同，两个人的体内可能会存在不同种类的细菌。长期以来科学家们一直在研究寻找哪种细菌与人类疾病有关，以及哪些细菌能帮助机体抵御疾病发生，研究人员对人类机体微生物组进行比较研究后得出的结论往往并不一致，因为他们分析的
Science新子刊：前所未知的别样微生物组
科学家们收集了来自亚马逊部落Yanomami族人的口腔、皮肤和粪便细菌样品，发现这些微生物群与我们所知的微生物大不同，这些原始部落的人从未与西方人群接触过，而他们体内存在的这些药物抗性基因也许未来能用于临床医疗。 这一研究成果公布在4月17日的Science Advances杂志上。 Sci
微生物做代谢组学分析的样品怎么处理
微生物代谢组学主要研究细胞生长或生长周期百某一时刻细胞内外所有低分子量代度谢物。分析技术的不断发展促进了微生物代谢组学研究的进展。本文结合微生物样品前处理方法,综述了目前研究中所采用内的各种分析技术的特点与应用,并展望微生物代谢组学研究中容分析技术的发展趋势。
华大基因完成肠道微生物基因组关联分析
从物种、功能及生态群落上展示肠道微生物与结直肠腺瘤及结直肠癌的关联特征，这是深圳华大基因研究院、奥地利因斯布鲁克医科大学、奥本多夫医院、丹麦哥本哈根大学、华南理工大学等多家单位最新的联合取得的科研进展。3月11日，国际学术期刊《自然通讯》杂志发表了这项研究成果。该研究对结直肠腺瘤、结直肠癌的早期
微生物组控制着我们？还是我们控制着它？
一项新的分析揭示了小鼠如何操控它们胃肠道的微生物，人类或许也是如此。 我们终究还是可以控制我们的肠道的。最近发表的一篇论文阐述了这一诱人的发现，它揭示了小鼠可以控制它们肠道微生物的组成和行为，而人类也有这样的潜能。这一发现颠覆了主流观念。主流观念认为存在于我们肠道中的复杂的生态系统实际上是我们
微生物组测序分析的一大问题
BMC Biology杂志上的一项研究指出，许多已发表的微生物组研究其实受到了污染，错误的报告了来自于环境的杂菌。研究人员认为，在临床样本中检测到出人意料的细菌时，不应过早将其于疾病联系在一起。 我们机体内生活着不计其数的微生物，它们组成的生态系统就是微生物组。微生物组参与了许多重要的机体功能
断奶、抗生素都会影响孩子的微生物组
我们肠道中的共生菌能够与正常细胞过程相互作用，生产人体所必需的物质（比如氨基酸）。理解肠道菌对代谢、免疫和行为的影响，一直是科学家们的研究热点。 本期《Cell Host & Microbe》推出了“The Host-Microbiota Balance”特刊，通过一系列文章探讨了宿主与共生菌
母乳喂养对乳汁中微生物组的影响
一项针对人类的大规模分析显示，与直接母乳喂养相比，使用抽乳的间接母乳喂养会导致口腔细菌的减少以及更多的潜在病原体的出现。 2月13日在Cell Host＆Microbe杂志上发表的研究结果表明，牛奶微生物群受到来自婴儿口腔和来自环境来源（如吸乳器）的细菌的影响，尽管未来的研究将需要评估具体的变化
研究发现肿瘤内微生物组可预测肝癌预后
近日，Clinical and Translational Medicine以论著形式发表了北京协和医院肝脏外科主任医师毛一雷、副研究员杨华瑜团队关于肝细胞癌肿瘤内微生物组相关研究。研究显示，肝细胞癌肿瘤内微生物组显著不同于癌旁组织，不同患者之间、同一患者的不同病灶之间均存在明显异质性。这表明肝
全球微生物模式基因组测序计划获进展
近日，《核酸研究》（Nucleic AcidsResearch）在线发表了国家微生物科学数据中心（中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心）关于全球模式微生物基因组数据库gcType的论文。gcType是由我国牵头的全球模式微生物基因组测序计划的重要成果。 模式菌株（t
Nat－Commun：通过整合细胞形态学和空间转录组学深度剖析肿瘤生态系统
埃默里大学（Emory University）的胡健团队与得克萨斯大学MD Anderson肿瘤医院的王凌华团队在Nature Communications上发表论文METI: Deep profiling of tumor ecosystems by integrating cell morp
英国建成首个粮食作物微生物组低温库
英国宣布建成全球首个公开资源的主要粮食作物微生物组低温库（UK-CMCB），将致力于保存栽培在英国土壤中的6种主要粮食作物的重要微生物组样本，包括活性微生物、作物根部环境的基因组和DNA序列。 UK-CMCB由国际应用生物科学中心（CABI）、英国洛桑研究所（Rothamsted Resear
人类微生物组整合计划（iHMP）研究成果发布
英国《自然》《自然·医学》杂志5月29日同时发表了人类微生物组整合计划（iHMP）的三篇论文及两篇相关评论，向人们深刻揭示了宿主和微生物组之间的互作是如何影响人类身体健康的。此次获得的发现，不但代表了某些疾病中宿主和微生物关系的迄今最全面描述，还有助于科学家表征多种疾病，预测病人转归，进而在未来
英国建成首个粮食作物微生物组低温库
英国宣布建成全球首个公开资源的主要粮食作物微生物组低温库（UK-CMCB），将致力于保存栽培在英国土壤中的6种主要粮食作物的重要微生物组样本，包括活性微生物、作物根部环境的基因组和DNA序列。 UK-CMCB由国际应用生物科学中心（CABI）、英国洛桑研究所（Rothamsted Resear
口腔、肠道微生物菌群元基因组关联分析
2015年7月28日，北京协和医院和华大基因等机构的研究人员共同合作完成了类风湿关节炎（RA）口腔和肠道微生物元基因组研究。本项研究揭示口腔和肠道微生物菌群异常是RA病理生理和疾控的重要环节，并且为元基因组学辅助的RA个性化诊疗方案提供基础。研究成果于今日发表在《自然医学》杂志。 RA是一种致
Nature子刊：低谷蛋白饮食改变人类微生物组
一项新研究发现，采用低谷蛋白饮食可适度改变人体肠道中细菌种类的成分。这一结果表明，低谷蛋白饮食带来的一些积极效果，例如饭后腹胀减少，可能是饮食引起的肠道微生物组变化的结果。 这一研究成果公布在Nature Communications杂志上，这一项随机对照试验指出肠道细菌丰度的变化，可能并不是
基于微生物组大数据的疾病检测方法来了
微生物组具有服务疾病诊治与生态监控的巨大潜力，但是其影响因素错综复杂。如何通过菌群检测实现快速精准的疾病诊断呢？中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心发明了基于菌群大数据搜索的疾病检测方法，为此共性问题提供了原创的解决方案。该工作于3月17日在线发表于mSystems（美国微生物学会会刊）