基因组所合作研究揭开两种家养水稻起源进化“篇章”
6月9日，在最新一期的PLOS Genetics上，来自中国科学院北京基因组研究所的吴仲义研究员和中山大学施苏华教授发表了合作研究文章《水稻基因组两种进化历史：驯化基因的角色》(Two Evolutionary Histories in the Genome of Rice: the Roles of Domestication Genes)，揭开了两种家养稻起源进化的重要篇章。 水稻是最重要的粮食作物之一，供养着超过三分之一的世界人口。在我国及周边很多亚洲国家，水稻是关乎国家民生大计的重要命脉。而目前，家养稻共分为粳稻和籼稻两种品系。粳稻主要生长分布于中国北部、日本、韩国等高纬度地区。而籼稻主要生长分布在中国南部、东南亚、印度等低纬度地区。水稻是人类从打猎采集的生活状态转到农业栽种的过程中，被人类驯化培育的重要植物物种。两种家养水稻的起源和演化，一直是进化生物学家、历史学家和考古学家所关心的热点问题。 ......阅读全文
基因组所合作研究揭开两种家养水稻起源进化“篇章”
6月9日，在最新一期的PLOS Genetics上，来自中国科学院北京基因组研究所的吴仲义研究员和中山大学施苏华教授发表了合作研究文章《水稻基因组两种进化历史：驯化基因的角色》(Two Evolutionary Histories in the Genome of Rice: the R
分子进化的起源
在漫长的进化过程中生物的 DNA经历了各种各样的变化。包括基因突变、基因重组、染色体易位等。碱基置换突变常导致蛋白质中一个氨基酸的改变。例如正常血红蛋白第 6位的谷氨酸改变为缬氨酸便成为镰形细胞贫血症的血红蛋白 HbS，为赖氨酸替代则成为HbC，前者的碱基是从GAA（谷氨酸）→GUA（缬氨酸），后者
肠道的进化起源
消化系统、皮肤、肌肉组织是如何进化的呢？这个问题困扰了科学家一个多世纪。维也纳大学的研究人员对海葵（一种非常古老的动物）胚胎发育的研究结果质疑了150年前提出的形成所有器官和组织的胚层具有同源性的假说。 该假说认为，身体中所有的器官和组织都来源于三个胚层之一，这些胚层在胚胎形成早期出现。这
浙大教授Nature子刊：水稻基因组重测序及群体遗传学研究
浙江大学农业与生物技术学院作物科学研究所，中国水稻研究所的研究人员发表了题为“Genomic variation associated with local adaptation of weedy rice during de-domestication” 的文章，以杂草稻群体为材料，通过基因组
全球水稻去驯化、趋同野化的证据找到了
近日，开放获取期刊《基因组生物学》（Genome Biology）在线发表了全球首次杂草稻调查研究结果。浙江大学教授樊龙江领导的一个国际研究团队，通过对全球稻区杂草稻（俗称鬼稻）材料采集与分析发现，水稻在世界各稻区均存在野化或去驯化的现象，并描绘了野化水稻的基因组特征。该成果对水稻进化、资源利用
鱿鱼进化起源难题终于有解了
案例详情：鱿鱼和墨鱼是海洋中最引人入胜的生物，它们拥有变色皮肤和喷射推进的运动方式。然而，这些奇异生物的进化起源一直笼罩在迷雾之中——化石记录稀少，基因组结构复杂。如今，冲绳科学技术大学院大学团队在《自然·生态与进化》发表的研究提供了突破性答案。研究团队将大规模基因组数据集与三个新测序的鱿鱼基因组相
PNAS：miRNA揭示脊椎动物进化起源
美英科学家的一项最新研究表明，脊椎动物这种复杂生命形式的出现源于miRNA。调控基因表达的miRNA的不断进化是早期脊椎动物出现的背后原因。相关论文近日在线发表于美国《国家科学院院刊》（PNAS）上。 论文高级作者、美国达特茅斯学院的Kevin Peterson表示，“新的研究不仅为认识人类自身的进
Y染色体的起源与进化
许多属于变温动物的脊椎动物是没有性染色体的。它们的性别由外界环境因素而不是个体基因型决定。这种动物中的一部分（例如爬行动物）的性别可能取决于孵化时的温度；其他则是雌雄同体的（亦即它们每个个体中同时能产生雄性和雌性的配子）。 某个远古哺乳动物的祖先发生了等位基因的变异（即所谓的“性别基因座”）—
上海生科所Nature基因组研究新成果
近日来自中科院上海生命科学研究院、日本国立遗传学研究所和中国农业科学院的研究人员通过绘制水稻基因组变异图谱揭示栽培稻(cultivated rice)的起源，相关论文“A map of rice genome variation reveals the origin of cultivate
基因组所与昆明动物所在家犬起源进化研究中取得新进展
5月14日，中科院北京基因组研究所与中科院昆明动物研究所在家犬起源进化合作研究中取得重要进展，相关论文在最新一期《自然·通讯》在线发表。该研究成果从全基因组层面上阐述了狗的起源进化，并首次将其进化历史和人类的近期演化联系了起来。 在昆明动物所张亚平教授和基因组所吴仲义教授的带领下，昆明动物
什么是基因组进化？
基因组不仅仅是生物体基因的总和，基因组还含有其它可以考虑特定基因及其产物的特征。复制在基因组的塑造过程中起了重要作用。复制的范围包括短串联重复序列的延伸、基因簇的复制、整个染色体甚至整个基因组的复制。这种复制可能是创造遗传新性状的基础。
基因组的进化特征
基因组不仅仅是生物体基因的总和，基因组还含有其它可以考虑特定基因及其产物的特征。复制在基因组的塑造过程中起了重要作用。复制的范围包括短串联重复序列的延伸、基因簇的复制、整个染色体甚至整个基因组的复制。这种复制可能是创造遗传新性状的基础。
作物基因组学研究进展（一）
作物基因组学研究进展农作物基因组学研究的发展，对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展，已经实现对重要农作物，如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序，在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了２０１8年度主要农
浙大科学家揭秘“鬼稻”身世
在科学界，“鬼稻”叫杂草稻，它们直接导致稻田减产，品质下降，并被定性为田间的恶性杂草。浙江大学农业与生物技术学院作物科学研究所樊龙江教授团队联合中国水稻研究所科研人员通过基因组重测序及其群体遗传学分析，揭示了其中最基本的问题，鬼稻从何而来，它们“鬼”在何处。 相关成果论文《杂草稻通过基因组变异
绵羊基因组揭示中国游牧民族发展史
近日，中国科学院动物研究所李孟华研究组在《分子生物学与进化》杂志在线发表了一篇研究中国绵羊的起源、分化、扩张和混合，以及早期游牧民族发展史的文章。 绵羊作为最早的驯化动物之一，与人类生活，尤其是游牧民族的生活息息相关。通过解析绵羊的种群历史，如迁徙、扩散、品种选育历史，在一定程度上揭示了早期人
植物所证实水稻是多次起源的产物
亚洲稻又称水稻（Oryza sativa L.）。亚洲稻包括粳稻（Japonica）和籼稻（Indica）两个亚种，不仅是最重要的粮食作物之一，也是理论研究中日益受到重视的模式生物。尽管迄今针对水稻开展了大量研究，但关于水稻起源/驯化的历史已争论了半个多世纪，存在各种推论和观点。目前存在两种主流假说
细胞焦亡进化起源研究获新进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508150.shtm近日，华东理工大学生物工程学院、生物反应器工程国家重点实验室教授刘琴课题组在细胞焦亡进化起源方面取得重要进展，首次在模式动物水螅中解析了动物界中祖先细胞焦亡信号通路并揭示其保守的抗感染
病毒与细胞在起源与进化中的关系
（1）基本观点目前存在 3 种主要观点：（2）观点的比较①由于病毒彻底的寄生性，第一种观点缺乏支持；②由于尚不能发现病毒的化石，第二种观点缺乏充足的证据；③第三种观点得到了更多的实验结果的支持，例如：a．在原核细胞中，环形 DNA 分子的附加体可以以质粒的形式在细胞中复制，也可以整合在细菌的染色体中
麻风病病原体的起源与进化
麻风分枝杆菌(Mycobacterium leprae)长久以来一直被认为是麻风病唯一的病原体(神秘的地球配图) (神秘的地球报道)据EurekAlert!：科研人员报告了第二种导致麻风病的生物体的基因组序列，并且揭示出了这些病原体的起源与进化史。麻风分枝杆菌(Mycobacterium le
中科院Science公布最新基因组
继2012年中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院等单位合作完成了首个山羊全基因组图谱之后，6月昆明动物研究所，华大基因等处的研究人员又公布了绵羊基因组序列，并且将这一基因组与其它哺乳动物基因组进行了比对，构建了相关的系统发育树。这一研究成果公布在6月6日Science杂志上。 参与这项
昆明动物所一项成果被评为2012年度云南十大科技进展
2月26日，2012年云南十大科技进展评选结果揭晓。中科院昆明动物研究所王文研究员团队主持完成的项目“年轻新基因起源和遗传进化的机制研究”成果喜获该荣誉。 该项目首次在全基因组水平系统揭示了新基因起源的一般模式和各种分子机制的贡献；首次实证了基因可以从头起源；开创性地系统研究
基因组测序揭示家鸽起源史
2月1日，由美国犹他大学、深圳华大基因研究院等单位合作完成的鸽子基因组研究成果在《科学》杂志在线发表。该研究从分子层面揭示了家鸽的起源历史，并发现了鸽子羽冠多样性的遗传基础。 据悉，鸽子是目前为数不多的已完成测序的鸟类之一，其基因组与家鸡、火鸡、斑马雀及虎皮鹦鹉的基因组一起，将为鸟类的群体
基因组测序揭示家鸽起源史
2月1日，由美国犹他大学、深圳华大基因研究院等单位合作完成的鸽子基因组研究成果在《科学》杂志在线发表。该研究从分子层面揭示了家鸽的起源历史，并发现了鸽子羽冠多样性的遗传基础。 据悉，鸽子是目前为数不多的已完成测序的鸟类之一，其基因组与家鸡、火鸡、斑马雀及虎皮鹦鹉的基因组一起，
研究揭示结构变异和新基因在家犬驯化中的作用
近日，中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室、动物进化与遗传前沿交叉卓越创新中心张亚平团队与中国农业科学院农业基因组研究所开展合作，第一次系统地构建了家犬在驯化中的结构变异（Structural Variations）图谱、探讨了新基因在驯化中的作用、并指出了大尺度基因组变异在驯化
上海交大张大兵Cell子刊：新基因从何而来？
来自上海交通大学、马克斯普朗克分子植物生理学研究所以及莱斯特大学的研究人员报告称，他们在拟南芥和水稻中追溯了一些蛋白质编码基因的起源，基于研究发现他们提出了一个进化模型来解释一些新基因从雄性生殖细胞中出现的机制。这项研究发表在6月1日Cell出版社旗下的《分子植物》（Molecular Plan
浙大樊龙江团队如何从基因组学角度证实作物拟态的存在
稗草（Echinochloa crus-galli）是田间头号杂草，为了除掉它，人类已经努力了几千年。浙江大学农业生物与技术学院樊龙江教授团队与中国水稻所等单位合作研究最新发现，为了避免人类的“驱逐”，田间的稗草们竟学会了“伪装”。几千年来，它们与水稻越长越像，从原来松垮贴地的懒样子，进化出了今
双“稻”傍地走，安能便我是“雄雌”
稗草（Echinochloa crus-galli ）是田间头号杂草，为了除掉它，人类已经努力了几千年。浙江大学农业生物与技术学院樊龙江教授团队与中国水稻所等单位合作研究最新发现，为了避免人类的“驱逐”，田间的稗草们竟学会了“伪装”。几千年来，它们与水稻越长越像，从原来松垮贴地的懒样子，进化出了
迄今分辨率最高的野生稻栽培稻泛基因组图谱绘就
亚洲栽培稻驯化历史可追溯至一万年前的普通野生稻。 面对全球人口增长和气候变化加剧的双重压力，如何将野生稻历经万年锤炼的“生存智慧”注入现代品种，培育出兼具高产潜力与抗病抗逆特性的“超级水稻”已成为重要研究课题。然而，传统依赖单一参考基因组的研究模式譬如以管窥天，仅能捕捉水稻遗传多样性的冰山一角。
除不尽的杂草：我进化千年，越来越有“稻”样
稗草（Echinochloa crus-galli ）是田间头号杂草，为了除掉它，人类已经努力了几千年。浙江大学农业生物与技术学院樊龙江教授团队与中国水稻所等单位合作研究最新发现，为了避免人类的“驱逐”，田间的稗草们竟学会了“伪装”。几千年来，它们与水稻越长越像，从原来松垮贴地的懒样子，进化出了
科研人员首次深度解析全球瘤牛起源和进化
11月28日，西北农林科技大学动物科技学院雷初朝教授团队继2018年在解析东亚家牛祖先的基础上，对全球瘤牛起源和进化深度解析，通过分析全球57个主要瘤牛品种354个样本，从全基因组水平揭示全球瘤牛常染色体、父系和母系遗传特征，系统阐述了全球瘤牛的起源迁移扩散路线。该研究成果最近在线发表于《自然-