新基因图谱揭示基因组交叉地带
据英国《新科学家》网站近日报道，美国科学家绘制出了目前世界上最先进的人类基因图谱，该图谱能帮助更准确地识别某些影响特定人群的遗传病根源。 这一基因图谱发现，西非人后裔的基因中有着欧洲人后裔所没有的基因重组的高发地带，这有可能是导致特定人种先天性疾病诸如贫血症的遗传学原因。当然，该基因图谱也在欧洲人后裔的遗传疾病研究中起了作用。 该基因图谱帮助识别遗传病根源的原理在于：人类单个正常受精卵中有两条同样的染色体，一条来自父方，一条来自母方。性细胞减数第一次分裂末期，亲本的这两条同源染色体分离，染色单体之间发生交叉互换。这一过程称为基因重组（此处指非等位基因自由组合，并且只发生在特定基因组的交叉地带）。基因重组过程中，有可能发生错误—基因序列的某个片段也许会异常缺失或错位。这样的错误往往会导致遗传病。 这一基因图谱由哈佛大学医学院的大卫·赖克和他的同事们通力完成。他们设计了新的基因演算法，通过对大约3......阅读全文
用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验（二）
二、正常男性中期染色体标本的制备1.准备一个封闭环境，其相对湿度约55%(可在50%〜60%变化），温度24〜26.5℃。2.将巴斯德吸管置于玻璃载片上方2〜4in处，让一滴细胞悬液滴在玻片的左侧。然后迅速将第二滴细胞悬液滴在玻片右侧（见注释7)3.在固定液全部蒸发前，将玻片浸入盛有新鲜固定液的染色
用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验（三）
六、中期染色体标本的变性1.在染色缸中加入大约50mL变性液，将染色缸放于75〜76℃水浴中。预热变性液使其温度达到（73±2)℃。2.从-20℃冰箱中取出实验所需的标本，室温下系列乙醇脱水，各2min。3.室温干燥片子（5min)，或在实验室抽风橱中微风吹过标本使标本干燥。4.在37〜40℃电热板
“六谷”丰登？——首个染色体水平基因组组装完成
中国菰 中国农科院供图 中国菰 （Zizania latifolia） 原产于中国，属于禾本科稻族菰属，主要分布于中国、韩国、日本和印度等国家。中国菰的颖果为菰米，在我国古代是重要的“六谷”之一。 近日，中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队与中国水稻研
象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展
中国科学院华南植物园海外知名学者John Seymour Heslop Harrison教授领导的研究团队，在象腿蕉染色体级别基因组组装研究方面取得新进展。相关研究发表于Gigascience。王梓维为该文第一作者，John Seymour Heslop Harrison和刘青副研究员为通讯作者，华
基因测序：开辟预防优于治疗的新时代
基因组测序：一切开始的地方 曾经，完成人类全基因组测序需要30亿美元，而今天，这个数字下降到了几千美元且还会继续下滑。基因组测序揭开了未知的基因秘密。那么它是如何做到的？从收集不到一茶匙的病人血液或唾液开始，应用化学物质将细胞膜打开并收集DNA，经过2-3个月的精密仪器分析，最后发现一些疾病本
美基因图谱研究将癌症重新“归类”
美国国家卫生研究院资助的科学家团队完成大规模癌症基因组图谱绘制，他们根据基因变异和表达的相似性，提出可以按照分子类型给癌症“归类”。研究人员认为，这将为癌症诊断和治疗提供新思路。5日发表在美国《细胞》杂志上的研究，对33种癌症、1万多个肿瘤病例的基因、表观遗传和蛋白质组学变化进行分析，确认约30
棉花“甲基化基因图谱”首次绘成
30日出版的《基因组生物学》杂志刊登了中美科学家合作的一项重要研究成果：他们首次绘制出棉花表观遗传基因的“甲基化基因图谱”，即野生棉和种植棉之间500多种表观遗传基因的差异，为生物技术公司通过表观修饰育种培育出高产优质棉花提供了重要线索。 几十年来，科学家们发现，许多动植物的表观特征，既可用基
恶性疟原虫的基因图谱的介绍
一份由哈佛公共卫生学院(HarvardSchoolofPublicHealth)与麻省理工学院Broad研究所(BroadInstitute)所主导的跨国研究计划，将造成疟疾(Malaria)恶性疟原虫Plasmodiumfalciparum的基因序列，完整的解析出来，据相关领域的科学家表示，这
美绘出DNA一修饰因子基因图谱
据美国物理学家组织网7月21日报道，美国科学家已经首次绘制出了人体胚胎干细胞内一个名为5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）的修饰因子的全基因图谱。科学家们表示，5hmC在一些被打开或激活的基因内出现的频率非常高，最新研究将有助于癌症的控制。研究论文发表在最新一期《基因组生物学》杂志上。
美基因图谱研究将癌症重新“归类”
美国国家卫生研究院资助的科学家团队完成大规模癌症基因组图谱绘制，他们根据基因变异和表达的相似性，提出可以按照分子类型给癌症“归类”。研究人员认为，这将为癌症诊断和治疗提供新思路。 ５日发表在美国《细胞》杂志上的研究，对３３种癌症、１万多个肿瘤病例的基因、表观遗传和蛋白质组学变化进行分析，确认约
中美科学家破解胎儿基因图谱
正在发育的胎儿的完整基因组，潜藏在它妈妈的血液里，这给准父母提供了一种潜在的非入侵方法，来检测婴儿是否患有某种先天疾病。 用羊膜腔穿刺术和其它入侵式方法，采集正在发育中胎儿的DNA会增加流产的风险。科学家发现，母亲的血浆能提供婴儿DNA片段。在此基础上，Sequenom公司目前
卢煜明小组破解胎儿基因图谱
据香港明报报道，一出《哈利波特——混血王子的背叛》，令香港中文大学化学病理学讲座教授及其研究小组，突破地从孕妇血浆中的DNA，破解到其胎儿基因图谱，日后医学界可用更安全的方法，凭抽血便可诊断胎儿是否带有多种严重遗传病，避免现行以针刺进子宫抽羊水或绒毛膜出现的1%流产风险，但此法的
多国合作编纂“小麦字典”：六倍体小麦基因测序完成
一本小麦基因组学“字典”就此诞生了。 8月17日，《科学》在线发布了一项历时13年的研究：完整版六倍体小麦“中国春”的基因组图谱。这一成果由国际小麦基因组测序联盟（IWGSC）牵头，署名作者来自20余个国家的70多家机构。 这本“字典”能干吗？小麦倒不倒伏、耐不耐旱、种子是大还是小、营养价值
首个豆科绿肥作物染色体水平基因组组装完成
紫云英 中国农科院供图近日，中国农业科学院农业资源与农业区划研究所肥料及施肥技术团队完成了首个豆科绿肥作物——紫云英的染色体水平参考基因组组装，并利用比较基因组学解析了紫云英共生结瘤的遗传基础。该研究填补了豆科绿肥作物基因组学研究的空白，为豆科植物与根瘤菌共生提供了新的见解。相关研究成
人类种了6000年的作物有了染色体级别基因组
大麻又名火麻、汉麻、线麻等，籽用大麻在食品、医药、纺织、造纸等多个领域被广泛使用，是一种重要的工业原料。 9月15日，福建农林大学麻类研究室联合该校基因组与生物技术中心在《植物通讯》（Plant Communications）上发表了首个染色体级别的籽用大麻参考基因组图谱。他们在此基础上解析了
破解染色体级别基因组密码解析栽培菠菜的“前世今生”
上海师范大学16日发布消息称，该校王全华研究团队在菠菜基因组研究领域又取得一项重大标志性研究成果。团队联合康奈尔大学Boyce Thompson研究所(BTI)费章君教授课题组等多家科研机构完成了新一代菠菜基因组精细图谱绘制、重要农艺性状遗传基础和菠菜驯化历史的解析。 该研究成果以“基因组解析
北京基因组所等揭示Y染色体表观信息遗传机制
表观遗传学是与传统遗传学相对应的概念。遗传学以基于DNA序列的中心法则来传递遗传信息，在人群中，遗传信息在世代之间稳定遗传，那么表观遗传信息是否像遗传信息一样可被子代继承，尚缺少相关有力证据。DNA甲基化是非常重要的表观遗传信息，是表观遗传学研究的重要内容。目前，鲜少有DNA甲基化在人群中的继承
杨焕明：像争夺国土一样争夺基因资源
北京基因组研究所所长杨焕明：像争夺国土一样争夺基因资源 我国科学家10月在深圳宣布，世界上第一个黄种人全基因组标准图绘制完成。承担该项目的华大基因研究中心称，这是我国在承担国际人类基因组计划1%任务、国际人类单体基因10%任务后，用新一代测序技术独立完成的100%黄种人基因组图谱。 从承接1%到
荷兰榆树病致病真菌基因图谱绘制完成
加拿大多伦多大学与病童医院研究所日前成功绘制出荷兰榆树病致病真菌基因图谱，研究论文在线刊登于《BMC基因组学》上。 荷兰榆树病起源于喜马拉雅山，19世纪末期从荷属东印度群岛传播到欧洲，第一次世界大战后不久便在荷兰出现。荷兰榆树病是北美最具破坏力的榆树病，一般大部分树木会在感染后两年内死亡。
微阵列中期分裂相染色体的比较基因组杂交（CGH）－实验
染色体 CGH 的独特优点在于它的全基因筛查功能，与检测单一靶 DNA 剂量改变的低通量方法，如 Southern 分析、PCR 和荧光原位杂交（FISH) 相比，速度显著提高且省力。目前染色体 CGH 是一种比较完善的分子细胞遗传学方法，但是它的两个缺陷限制其作为一种综合性筛查工具的应用。来源：《
我国科学家发现黄花蒿首个染色体级别基因组图谱
疟疾至今仍威胁着人类的健康。黄花蒿是全球普遍使用的抗疟疾药物——青蒿素的主要天然资源，保障全球优质廉价的青蒿素原料供应对于全球疟疾防控有重要价值。但黄花蒿基因组杂合度和重复度很高，致使高质量的黄花蒿基因组组装成为该领域难题。 在重大新药创制科技重大专项、国家重点研发计划“中医药现代化研究”重点
学者发表紫苞芭蕉和朝天蕉首个染色体水平基因组
近日，中国科学院华南植物园副研究员黄慧润、研究员王峥峰团队在国家自然科学基金项目的资助下，研究结合Oxford Nanopore和Hi-C测序技术成功组装并发表了紫苞芭蕉和朝天蕉的首个染色体水平基因组。相关成果在线发表于《园艺研究》（Horticulture Research）。紫苞芭蕉和朝天蕉的花
基因组研究揭示复杂染色体重排或为子宫平滑肌瘤主因
子宫平滑肌瘤是一种良性肿瘤，但影响着数百万女性的健康。对其分子机理的深入理解可为这种肿瘤的预防和治疗提供线索。芬兰肿瘤学会的Miika Mehine等人对此进行了研究，他们发现，一种与染色体破碎重组(Chromothripsis)很类似的复杂染色体重排是许多子宫平滑肌瘤染色体异常的主要原因。
首个合成酵母基因组中最后一条染色体创建完成
据最新一期《自然·通讯》杂志报道，包括澳大利亚麦考瑞大学在内的国际科学家团队，在合成生物学领域取得了重大成就，成功完成了世界上首个合成酵母基因组中最后一条染色体的创建，拼上了最后一块“拼图”。酿酒酵母的彩色扫描电子显微照片。科学家从酿酒酵母中创建了世界上第一个合成真核基因组和一个新发现的tRNA新染
利用单拷贝基因组探针及染色体彩绘方法进行荧光原位...
利用单拷贝基因组探针及染色体彩绘方法进行荧光原位杂交（FISH）实验材料 SSCD-PBSA糖原RNase多聚甲醛甲酰胺试剂、试剂盒 固定液乙醇杂交缓冲液标记探针橡胶乳黏剂封固剂实验步骤 含有重复序列探针的沉淀：大分子量黏粒探针往往含有重复序列，如果在杂交前不能封闭这些序列，将导致严重的非特异性杂交
微阵列中期分裂相染色体的比较基因组杂交（CGH）－实验
实验方法原理 实验材料 高分子质量基因组DNA EcoR I 或 Dpn II试剂、试剂盒 SSCcDNA阵列dNTP 混合液 dCTP 酵母 tRNADNA 聚合酶 I仪器、耗材 Qiaquick PCR 纯化试剂盒 BioPrime 标记试剂盒Micrcon 30 滤器杂交炉Maxiprep D
“六谷”之一菰米首个染色体水平基因组组装完成
中国菰 中国农科院供图 中国菰 （Zizania latifolia） 原产于中国，属于禾本科稻族菰属，主要分布于中国、韩国、日本和印度等国家。中国菰的颖果为菰米，在我国古代是重要的“六谷”之一。 近日，中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队与中国水
小叶茶染色体级别基因组图谱联合研究成果首次完成
近日，生物学预印本服务器（www.biorxiv.org）在线发表了中美科学家联合研究团队的最新成果，该团队采用单分子实时测序（SMRT）和 Hi-C技术，在20多个代表性小叶茶品种中选用杂合度较低的小叶茶良种“碧云”，将组装获得的约2.85Gb 的基因组序列挂载到了15 条假染色体上，在国际上
卫星DNA的多态性和保守性
卫星DNA具有多态性和保守性,卫星位点由微卫星的核心序列与其两侧的侧翼序列构成,侧翼序列使某一卫星特异地定位于染色体的某一部位,而卫星本身的重复单位变异则是形成微卫星多态性的基础。在某一个体基因组中两条同源染色体的相对（侧翼序列相同）位置上如两侧翼序列间所包含的卫星重复单位数相同与不同,则分别表
表观遗传研究指南（二）
今年九月，对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份，因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在Nature，Genome Biology，Genome Research等杂志上公布了三十多份论文，还有在Science，Cell，以及the Journal of Bi