“六谷”丰登?——首个染色体水平基因组组装完成
中国菰 中国农科院供图 中国菰 (Zizania latifolia) 原产于中国,属于禾本科稻族菰属,主要分布于中国、韩国、日本和印度等国家。中国菰的颖果为菰米,在我国古代是重要的“六谷”之一。 近日,中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队与中国水稻研究所、深圳农业基因组研究所等单位联合,完成首个中国菰染色体水平基因组组装,并通过共线性分析和转录组测序鉴定到中国菰落粒性相关基因。该研究为中国菰落粒性基因编辑提供了候选靶点,有助于加速中国菰落粒性的定向驯化改良。相关研究成果发表于《通讯—生物学》(Communications Biology)。 论文通讯作者、烟草所副研究员闫宁介绍,中国菰具有生物量大、耐深水、灌浆成熟快、籽粒蛋白质含量高和抗稻瘟病等优良性状,由于未......阅读全文
“六谷”丰登?——首个染色体水平基因组组装完成
中国菰 中国农科院供图 中国菰 (Zizania latifolia) 原产于中国,属于禾本科稻族菰属,主要分布于中国、韩国、日本和印度等国家。中国菰的颖果为菰米,在我国古代是重要的“六谷”之一。 近日,中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队与中国水稻研
“六谷”之一菰米首个染色体水平基因组组装完成
中国菰 中国农科院供图 中国菰 (Zizania latifolia) 原产于中国,属于禾本科稻族菰属,主要分布于中国、韩国、日本和印度等国家。中国菰的颖果为菰米,在我国古代是重要的“六谷”之一。 近日,中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队与中国水
首个豆科绿肥作物染色体水平基因组组装完成
紫云英 中国农科院供图近日,中国农业科学院农业资源与农业区划研究所肥料及施肥技术团队完成了首个豆科绿肥作物——紫云英的染色体水平参考基因组组装,并利用比较基因组学解析了紫云英共生结瘤的遗传基础。该研究填补了豆科绿肥作物基因组学研究的空白,为豆科植物与根瘤菌共生提供了新的见解。相关研究成
首个种业大语言模型“丰登”发布
4月28日,中国农业大学生物学院教授王喜庆团队联合上海人工智能实验室、崖州湾国家实验室发布首个种业大语言模型“丰登”(SeedLLM)。种业大语言模型“丰登”。中国农业大学供图“丰登”集成了先进的人工智能技术(书生·浦语2.0)与大数据分析,通过深入学习我国迄今发布的科研文献、科技书籍、种企报告和历
Cell:染色体水平油松基因组组装和甲基化研究取得进展
近期,北京林业大学生物科学与技术学院联合安诺优达在国际知名期刊Cell(IF:41.582)在线发表了题为“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章,研究者对油松进行了
水稻近缘种北美沼生菰首个近完整基因组组装完成
近日,中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与生物合成创新团队联合院华东中心等单位,完成首个北美沼生菰接近完整基因组的组装,为菰属作物遗传改良、功能基因解析和关键生物过程研究提供了宝贵的资源。相关研究成果发表在《作物学报》(The Crop Journal)上。作为栽培稻的重要野生近缘种,北美沼生菰是
学者发表紫苞芭蕉和朝天蕉首个染色体水平基因组
近日,中国科学院华南植物园副研究员黄慧润、研究员王峥峰团队在国家自然科学基金项目的资助下,研究结合Oxford Nanopore和Hi-C测序技术成功组装并发表了紫苞芭蕉和朝天蕉的首个染色体水平基因组。相关成果在线发表于《园艺研究》(Horticulture Research)。紫苞芭蕉和朝天蕉的花
首个合成酵母基因组中最后一条染色体创建完成
据最新一期《自然·通讯》杂志报道,包括澳大利亚麦考瑞大学在内的国际科学家团队,在合成生物学领域取得了重大成就,成功完成了世界上首个合成酵母基因组中最后一条染色体的创建,拼上了最后一块“拼图”。酿酒酵母的彩色扫描电子显微照片。科学家从酿酒酵母中创建了世界上第一个合成真核基因组和一个新发现的tRNA新染
首个家鸡基因组图谱绘制完成
西南大学教授徐洛浩课题组以中国特有家鸡品系胡须鸡为材料,在国际上率先绘制出首个家鸡全基因组图谱。2月13日,相关研究成果以《家鸡基因组完成图的演化分析》为题,发表在美国《国家科学院院刊》上。这是继去年人类基因组完成图公布以来,首个发表的脊椎动物基因组完成图,也是基因组完成图谱绘制技术首次在经济动物中
染色体水平冬瓜参考基因组发布
近日,广东省农业科学院蔬菜研究所发布了染色体水平冬瓜参考基因组。相关研究发表于Scientific Data,广东省农业科学院蔬菜研究所副研究员罗文龙和副研究员闫晋强为该论文共同第一作者,广东省农业科学院蔬菜研究所研究员江彪为通讯作者。广东省农业科学院蔬菜研究所于2019年对黑皮大冬瓜B227进行基
我国完成首个鱼类基因组测序项目
记者8月5日从深圳华大基因研究院获悉,中国水产科学研究院黄海水产研究所和深圳华大基因研究院已联合完成半滑舌鳎全基因组测序和组装,绘制了半滑舌鳎全基因组序列图谱。这是我国完成的第一个鱼类基因组测序项目和全基因组序列图谱,使半滑舌鳎成为世界上第一个测定了全基因组序列的鲽形目鱼类。 据了解
首个蕨类植物基因组测序完成
蕨类植物是地球上最多样化的植物种群之一,也是仅有的没有完成基因组测序的主要植物种群。2018年7月18日,美国康奈尔大学研究人员在《自然-植物》期刊上发表了其完成蕨类植物基因组测序的结果。 蕨类植物的基因组较大,可以拥有多达720对染色体,包含多达1480亿个碱基对的DNA序列(Gb)。相比之
研究发布首个高质量染色体水平的哀牢髭蟾参考基因组
哀牢髭蟾(Vibrissaphora ailaonica)[Amphibiaweb(2019),Frost(2019)和中国两栖类(2019)将其归为Leptobrachium ailaonicum的同物异名] 俗称“胡子蛙”、“深山角怪”,属两栖纲、无尾目、角蟾科,是中国特有种。该物种具有多个
研究发布碧凤蝶染色体水平基因组
蝴蝶因其丰富的形态多样性,自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一,近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型,已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。凤蝶科是具有重要进化地位的蝴蝶支系,其丰富的色彩和形态等多样性是昆虫生态与进
人类基因全测序完成!最后的Y染色体的组装和分析完成
《自然》23日发表的两篇论文公布了人类Y染色体的组装和分析,Y染色体也是最后完成全测序的人类染色体。这项全球100多名科学家参与的研究填补了当前Y染色体参考的诸多空白,带来了对不同人群演化和变异的见解。人类Y染色体由于结构复杂一直很难测序和组装。超过一半的Y染色体在当前的人类参考基因组组装中缺失,导
龙井茶树染色体级别基因组组装成功
龙井43 中国农科院供图 近日,《自然—通讯》在线发表了我国科学家在茶树全基因组组装和茶树起源演化研究上取得的重要突破。该项研究由中国农业科学院茶叶研究所(以下简称茶叶所)和中国农业科学院深圳农业基因组研究所(以下简称基因组所)主导并携手中国科学院昆明动物研究所(以下简称昆
我国科学家公布世界首个藏羚染色体水平高质量基因组
14日,记者从中国科学院西北高原生物研究所获悉,该研究所张同作研究员联合青海大学魏青副教授等团队,成功组装了藏羚染色体级别的基因组,首次获得藏羚染色体水平的高质量基因组和注释信息,为藏羚的适应进化遗传机制、保护遗传学研究及进一步探索物种迁徙行为的遗传机制提供了重要基因组资源。相关结果发表在《自然》旗
昆明动物所首个高质量染色体水平的哀牢髭蟾参考基因组
哀牢髭蟾(Vibrissaphora ailaonica)[Amphibiaweb(2019),Frost(2019)和中国两栖类(2019)将其归为Leptobrachium ailaonicum的同物异名] 俗称“胡子蛙”、“深山角怪”,属两栖纲、无尾目、角蟾科,是中国特有种。该物种具有多个
-首个越南人基因组图谱绘制完成
越南科学家日前首次成功绘制出一名越南人的基因组图谱。 越通社报道说,来自河内国家大学下属科技大学的研究小组1月16日公布了这份基因组图谱绘制与分析的初步结果。 该研究组主任黎士荣表示,2013年年底,研究小组收到一名越南人的基因组数据,在此基础上对其进行分析排序,成功绘制出基因组图谱
迄今最连续的人类基因组组装完成
英国《自然·生物技术》杂志29日在线发表了一项基因组学研究成果:英国科学家团队利用一个口袋大小的纳米孔测序装置,从头组装出人类基因组,这是迄今为止最连续的人类基因组组装,而且只用了单一测序技术。这项研究同时成功地分析了过去最先进的测序方法也分析不出的人类基因组区域。 理解和解读人类基因组是现代
海洋所首次完成仿刺参基因组测序和组装
日前,我国科学家在国际上首次完成仿刺参基因组测序和组装,对刺参生物学和遗传育种研究具有重要科学意义,将对我国刺参产业发展产生重要推动作用。 该成果由中国科学院海洋研究所研究员杨红生团队和相建海团队共同完成,在天津生物芯片技术公司的技术支撑下,突破了刺参复杂基因组测序和组装技术瓶颈,采用新一代测
我国科学家完成大蒜基因组测序和组装
近日,中国农业科学院麻类研究所南方蛋白饲料植物资源开发与利用团队联合有关高校和企业,历时4年完成了大蒜基因组的测序和组装工作。相关研究成果在线发表在《分子植物》上。 据课题组成员刘头明研究员介绍,大蒜是重要的蔬菜作物之一,我国大蒜的年播种面积达到1000万亩以上。大蒜具有膨大的鳞茎,富含大
象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展
象腿蕉(Ensete glaucum)是芭蕉科中耐寒的蕉类植物,原产于中国云南和东南亚地区,具有观赏、饲用和药用价值。中国科学院华南植物园教授John Seymour Heslop Harrison带领的研究团队,采用单分子纳米孔、Illumina测序策略,结合染色体构像捕获技术,发表了首个象腿蕉染
象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展
中国科学院华南植物园海外知名学者John Seymour Heslop Harrison教授领导的研究团队,在象腿蕉染色体级别基因组组装研究方面取得新进展。相关研究发表于Gigascience。王梓维为该文第一作者,John Seymour Heslop Harrison和刘青副研究员为通讯作者,华
首个石榴端粒到端粒参考基因组图完成
近日,中国农业科学院郑州果树研究所(以下简称郑果所)特色浆果与干果种质改良课题组在国际期刊《植物生物技术杂志》(Plant Biotechnology Journal)上发表研究论文,该研究组装了首个石榴端粒到端粒(T2T)参考基因组图,揭示了控制石榴果皮颜色和籽粒硬度等重要经济性状形成的遗传机
Nature:首个中国人基因组测序完成
11月6日最新一期《自然》杂志以封面文章形式发表了由深圳华大基因研究院完成的首个中国人基因组序列研究成果(定名“炎黄一号”)。 深圳华大基因研究院院长汪建介绍说,这一长达7页的长篇论文描绘了第一个亚洲人的全基因组图谱,测序数据总量达到1177亿碱基对,基因组平均测序深度达到36倍,有效覆盖率高
昆明动物所发布碧凤蝶染色体水平基因组
蝴蝶因其丰富的形态多样性,自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一,近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型,已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。凤蝶科是具有重要进化地位的蝴蝶支系,其丰富的色彩和形态等多样性是昆虫生态与进
ITER-TAC1项目首个超导接头完成组装连接
近日,随着12号纵场磁体线圈终端盒与过渡馈线间(TF12 CTB-CFT)超导接头第三次绝缘固化结束,由中国科学院合肥物质科学研究院等离子体物理研究所TAC1团队全面负责的ITER现场首个超导馈线接头的组装连接工作完成,这是ITER主机装配集成的又一重要节点。 超导接头是超导馈线、磁体的核心部
研究人员完成枣和酸枣单倍型基因组组装
近日,西北农林科技大学林学院红枣团队黄建研究员课题组以我国制干枣主栽品种‘骏枣’和著名“秦药”代表清涧酸枣为研究材料,整合了PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C等多种先进测序技术以及多种组装策略完成了枣和酸枣T2T gap-free和T2T gap-free单倍型基因组的组
我国自主完成首个果树作物基因组序列图谱
华中农业大学今天透露,该校科研人员经过一年多努力,已绘制完成甜橙的全基因组序列图谱。这是我国自主完成的第一个果树作物基因组序列图谱。这一农业科技基础研究成果,将对加快我国柑橘品种改良,改变柑橘品种大量依赖进口的状况,提升我国柑橘产业的核心竞争力起到重要作用。 据悉,柑橘是世界栽培面积