上海应物所生物医学图像数据库检索研究取得重要进展
近日，中国科学院上海应用物理研究所李勇平研究组在医学图像检索方面的文章Bag-of-Features Based Medical Image Retrieval via Multiple Assignment and Visual Words Weighting (doi: 10.1109/TMI.2011.2161673)被医学成像领域期刊IEEE Transactions on Medical Imaging接收。不久之前，该研究小组在模式识别领域杂志Pattern Recognition上发表了在蛋白质数据库检索方面的文章Learning context-sensitive similarity by shortest path propagation (doi: 10.1016/j.patcog.2011.02.007)。 基于上海光源大科学装置的发展和使用，生命科学领域将产生大量的蛋白质和......阅读全文
全反射傅里叶变换红外(ATRFTIR－)－光谱仪的衰减全反射特点
1) 不破坏样品, 不需要象透射红外光谱那样要将样品进行分离和制样。对样品的大小, 形状没有特殊要求, 属于样品表面无损测量。 2) 可测量含水和潮湿的样品。 3) 检测灵敏度高, 测量区域小, 检测点可为数微米。 4) 能得到测量位置处物质分子的结构信息、某化合物或官能团空间分布的红外光
质谱分析
实验概要本实验在二维电泳图像获取和分析的基础上，利用质谱分析及数据库搜索鉴定部分蛋白质斑点。实验步骤1. 胶内酶切随机选择重复性好，差异显著，无明显变形、拖尾，与周围蛋白点分离明确的蛋白点作为质谱分析对象，进行胶内酶解。 1) 从胶上切取蛋白质凝胶颗粒置入96孔培养板内，用去离子水清洗数次。
Mass－Frontier碎片离子检索功能（FISh）在士的宁...（一）
Mass Frontier碎片离子检索功能（FISh）在士的宁代谢物鉴定中的应用1.引言 马钱子为马钱科植物马钱Strychnos nux-Vomical L.的干燥成熟种子, 其主要活性成分是生物碱，具有通经络、消肿痛、止痛的功效, 是中医临床常用药物。其中主要有效成分士的宁（strych
CICC《微生物新菌种名称英解汉译检索表》
近年来，微生物系统分类学研究迅猛发展，许多微生物的分类学地位发生变化和迁移，每年也会出现大量新的菌种分类单元。我们在1999年版《细菌名称英解汉译词典》与2011年版《细菌名称双解及分类词典》的基础上，收集自2010年3月之后合格发表的细菌与真菌名称，参照以往的汉译规范，给出中文名称，以《微生物新菌
Mass－Frontier碎片离子检索功能（FISh）在士的宁...（二）
3.3士的宁完整裂解机理LTQ Orbitrap XL的线性离子阱相比传统三维离子阱具有更高的离子容量，故具有优异的多级质谱能力，能够高效的捕获前级离子进行碎裂，并获得高灵敏度的碎片离子信息，在对士的宁母离子的采集过程中，获得了其四级有效质谱信息（MS4）。通过多级质谱解析，总结出士的宁完整裂解
RNAi技术专有名词(2)
21.Homologous Chromosome：同源染色体一对染色体，分别来自父本和母本，染色体上有着相同的线性基因序列。 22.Recombinant Clone：重组克隆将不同来源的DNA片段合成在一个DNA分子中，这种技术称为重组，得到的分子为重组克隆。 23.Ribonucleic
科研领域常用10大分析软件介绍
工欲善其事，必先利其器，这里小编给各位小伙伴们带来了材料领域常用的十大表征分析软件整理，简要介绍了各软件的应用领域及特点，文后还有免费软件资源福利，希望能为大家带来帮助。 1.DI Jade 软件介绍： MDIJade是业内最专业的XRD分析软件，它非常稳定，而且可以说能
凝胶成像分析系统的软件要求
不论何种计算机，它们都是由硬件和软件所组成，两者是不可分割的。人们把没有安装任何软件的计算机称为裸机。凝胶成像分析系统也不例外，硬件设备再好，如果不配上好的软件，也无法发挥它应有的功能。作为凝胶成像系统软件功能和用途都基本相似，这里我们介绍一下*关注的几个特点：A、软件的基本功能：可对不同样品，如条
布鲁克US－HUPO会议最新发布|－4D免疫肽组学、4D糖组学、血蛋白组学、实时数据库检索重大升级
· Novor V2.0软件采用了一种针对HLA肽段优化的先进机器学习算法，能从从头测序的多肽中发掘免疫肽段信息，并进一步提升鉴定水平 · TwinScapeTM结合iRTTM标准多肽的数字化监测技术智能反馈功能确保 timsTOF最高性能 – 远远超出“正常运行时间” · 新型glyco-
GCMS定性分析
目前，色质联用仪数据库中，一般贮存有近30万个化合物标准质谱图。因此，GC-MS最主要的定性方式是库检索。由总离子色谱图可以得到任一组分的质谱图，由质谱图可以利用计算机在数据库中检索。检索结果，可以给出几种最可能的化合物。包括：化合物名称、分子式、分子量、基峰及可靠程度。表4是由计算机给出的某未知物
GenBank数据库概述（一）
1. GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织，包括EMBL和DDBJ。是NIH遗传序列数据库，一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。唯一人类基因序列集合（UniGene），人类基因组基因图
GenBank数据库概述（三）
结构： 1、 结构主页 — 关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划，另外也可以访问分子模型数据库（MMDB）和用来搜索和显示结构的相关工具。 2、 MMDB：分子模型数据库 — 一个关于三维生物分子结构的数据库，结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。MMDB是来源于Brook
GenBank数据库概述（四）
NCBI站点地图---其他基因组数据介绍：1、 小鼠基因组 1) 小鼠基因组资源向导 ：把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起，包括序列，图谱，和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。 2) 小鼠基因组测序：小鼠基因组计划的测序进展，HTG序列contigs（可以用大小和染色体号来浏览）由
GenBank数据库概述（二）
FTP GenBank and Daily Updates：1. GenBank普通文件格式 — 参见GenBank记录样本和在GenBank公布通知中的详细描述，下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。 2. ASN.1格式 — 摘要句法记号1，国际标准组织（ISO）数据表示格式，下载
核酸数据库的概念
中文名称核酸数据库英文名称nucleic acid data bank定 义DNA、RNA序列的资料库，主要包括已知序列名称、DNA或RNA全序列及其特性，如启动区、起始和终止密码的位置、编码区、限制酶切位点以及推导的翻译产物蛋白质序列等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（二级
水德浮游生物大数据平台的使用与数据分析方法
水德浮游生物大数据平台 目前，绝大多数海洋和淡水生态领域的研究机构和业务监测单位，对浮游生物的研究手段还停留在人工镜检及手工测定的阶段，这样经常导致操作过程繁琐、工作量巨大、分析结果滞后，而且需要资深专业技术人员。此平台用于对浮游生物样品进行快速安全清洗、扫描成像、种类鉴定、数量统计、大小测量、生物
AB－SCIEX与GeneBio合作提高质谱库互动检索能力
SmileMS软件增强了 LC/MS/MS 系统对小分子的识别能力 生命科学分析技术的全球领先者——AB Sciex公司与Geneva Bioinformatics (GeneBio) SA 公司在今天宣布，他们将联手开发解决方案，以提高科学家快速筛选大量分子的能力。GeneBio公
中国科协支持建设的PCST文献检索系统上线
4月21日，国际公众科技传播组织（Public Communication Science and Technology Network）发布消息，宣告国际科学普及与传播研究领域内最大的文献数据检索系统（http://pcst.co/archive/）正式面向公众提供开放获取和文献检索服务。目前
2024深圳高校知识产权大数据检索知识竞赛启动
6月19日，2024年度“深圳高校知识产权大数据检索知识竞赛”与专利信息检索利用系列培训活动在深圳大学丽湖校区举行。来自深圳地区多所高校的近百名师生齐聚一堂，共同见证赛事启动。本次活动由深圳大学图书馆、深圳图书情报学会、深圳大学知识产权学院（国际知识产权学院）联合主办。赛前培训一共设置四场，包括知识
被子植物花图式与花程式及检索表的使用
一、 实验目的 1．通过解剖植物的花、果，掌握花图式的绘制及花程式的编写。 2．了解植物检索表的制定原则，并掌握其使用方法。 二、实验器具 解剖镜、扩大镜、镊子、解剖针等。 三、实验材料 根据季节采集3～5种带花、果的植物新鲜标本
实验室光学仪器X射线衍射仪检索样品分类
视情况样品可以分成三大类:第一类是天然矿物,第二类是人工合成,第三类就是合金。按经验来说,天然矿物是最好分析的,因为种类不多且天然矿物的数据库特别地全,所有已知矿物都能找到相应的卡片,不存在“新相”的问题。数据库中的数据最成熟。 但是,天然矿物也是最容易出现“错判”的样品,特别是粘土类样品,更是这样
国家天文台北京亚利桑那巡天发布DR3版本数据
近日，中国科学院国家天文台北京-亚利桑那巡天（BASS）团队向全世界发布第三版数据，这是BASS项目组发布的最终版本数据。该版本包括了所有的观测数据并使用了最新的数据处理软件。BASS是由国家天文台BATC课题组主导的国际合作图像巡天项目。项目负责人为国家天文台研究员周旭、副研究员邹虎以及亚利桑
天津工生所举行TotalPatentZL数据库培训
为提高TotalPatent数据库在科研中的实际使用效果，7月13日，中科院天津工业生物技术研究所信息资源中心特邀LexisNexis北方区培训讲师岳亭为职工和研究生进行TotalPatent数据库培训。 岳亭介绍了TotalPatent数据库的内容、功能及检索方法，从
图像传感器简介
图像传感器是利用光电器件的光电转换功能。将感光面上的光像转换为与光像成相应比例关系的电信号。与光敏二极管，光敏三极管等“点”光源的光敏元件相比，图像传感器是将其受光面上的光像，分成许多小单元，将其转换成可用的电信号的一种功能器件。图像传感器分为光导摄像管和固态图像传感器。与光导摄像管相比，固态图
荧光图像的记录方法
荧光显微镜所看到的荧光图像，一是具有形态学特征，二是具有荧光的颜色和亮度，在判断结果时，必须将二者结合起来综合判断。结果记录根据主观指标，即凭工作者目力观察。作为一般定性观察，基本上可靠的。随着技术科学的发展，在不同程度上采用客观指标记录判断结果，如用细胞分光光度计，图像分析仪等仪器。但这些仪器记录
图像处理器简介
图像处理器是一类、合成等处理的软件。即指通过取样和量化过程将一个以自然形式存在的图像变换为适合计算机处理的数字形式，包括图片直方图、灰度图等的显示，图片修复，即指通过图像增强或复原，改进图片的质量。 包括去除噪点，修正数码照片的广角畸变，提高图片对比度，消除红眼等等，图片合成，即指将多张图片进
荧光图像的记录方法
荧光显微镜观察到的荧光图像具有形态特征，具有荧光颜色和亮度。在判断结果时，必须结合起来作出的判断。结果是根据主观指标，即工人的眼睛来记录的。作为一般的定性观测，它基本上是的。随着科技的发展，客观指标被用来记录判断结果，如使用细胞分光光度计、图像分析仪等仪器。但是，这些文书所记录的结果也必须与主观判断
荧光图像的记录方法
荧光显微镜所看到的荧光图像，一是具有形态学特征，二是具有荧光的颜色和亮度，在判断结果时，必须将二者结合起来综合判断。结果记录根据主观指标，即凭工作者目力观察。作为一般定性观察，基本上可靠的。随着技术科学的发展，在不同程度上采用客观指标记录判断结果，如用细胞分光光度计，图像分析仪等仪器。但这些仪器记录
扫描电镜图像处理
当在观察某个深孔内部细节时，孔内是黑的，而周边衬度合适。起因是内孔产生的大量信号电子被孔壁吸收，只有小部分跑出达到探测器，这个弱信号按常规放大，人眼看不见。提高图象衬度和亮度，孔内细节如果能看清，其周边就过亮了、人眼对图像衬度的察觉是有限的。图象处理的目的就是在探测器的后续阶段、通过各种图象处理技术
CCD图像传感器
CCD图像传感器文章来源：本站编译 CCD主要有以下几种类型： 面阵CCD：允许拍摄者在任何快门速度下一次曝光拍摄移动物体。 线阵CCD：用一排像素扫描过图片，做三次曝光——分别对应于红、绿、蓝 三色滤镜，正如名称所表示的，线性传感器是捕捉一维图像。初期应用于广告界