上海应物所生物医学图像数据库检索研究取得重要进展
近日，中国科学院上海应用物理研究所李勇平研究组在医学图像检索方面的文章Bag-of-Features Based Medical Image Retrieval via Multiple Assignment and Visual Words Weighting (doi: 10.1109/TMI.2011.2161673)被医学成像领域期刊IEEE Transactions on Medical Imaging接收。不久之前，该研究小组在模式识别领域杂志Pattern Recognition上发表了在蛋白质数据库检索方面的文章Learning context-sensitive similarity by shortest path propagation (doi: 10.1016/j.patcog.2011.02.007)。 基于上海光源大科学装置的发展和使用，生命科学领域将产生大量的蛋白质和......阅读全文
颗粒图像仪简介
颗粒图像仪拥有静态、动态两种测试方法。 静态方式使用改装的显微镜系统，配合高清晰摄像机，将颗粒样品的图像直观的反映到电脑屏幕上，配合相关的计算机软件可进行颗粒大小、形状、整体分布等属性的计算，并可以将测试结果输出为报告。 动态方式具有形貌和粒径分布双重分析能力。重建了全新循环分散系统和软件数
图像处理原理简介
所谓“图像”泛指所有实际存在含有某种消息的信号，如含有人、事、物等的照片，而红外线摄影所获得的信号，则表示某些物体的温度分布。所谓图像处理就是为了某种目的对图像的强度(灰度值)分布视为一连串整数值的集合，经由不断的运算执行某些特定的加工和分析。 图像处理涵盖的范围十分很广泛，但是，所采用的基本原理和
merge－图像的处理
在 merge 图像的处理过程中，位移问题可用许多软件包通过 panning 操作恢复原始记录。通过 panning 操作校正一系列不同颜色图的过程中，需要样品上有一个固定的参考点，这个参考点在每一层图上都有。如不存在多标的样品参考点，就将多色的荧光微球稀释后加入样品中，用盖玻片进行封装前，在每个视
Mass－Frontier碎片离子检索功能（FISh）在士的宁...（二）
3.3士的宁完整裂解机理LTQ Orbitrap XL的线性离子阱相比传统三维离子阱具有更高的离子容量，故具有优异的多级质谱能力，能够高效的捕获前级离子进行碎裂，并获得高灵敏度的碎片离子信息，在对士的宁母离子的采集过程中，获得了其四级有效质谱信息（MS4）。通过多级质谱解析，总结出士的宁完整裂解
Mass－Frontier碎片离子检索功能（FISh）在士的宁...（一）
Mass Frontier碎片离子检索功能（FISh）在士的宁代谢物鉴定中的应用1.引言 马钱子为马钱科植物马钱Strychnos nux-Vomical L.的干燥成熟种子, 其主要活性成分是生物碱，具有通经络、消肿痛、止痛的功效, 是中医临床常用药物。其中主要有效成分士的宁（strych
CICC《微生物新菌种名称英解汉译检索表》
近年来，微生物系统分类学研究迅猛发展，许多微生物的分类学地位发生变化和迁移，每年也会出现大量新的菌种分类单元。我们在1999年版《细菌名称英解汉译词典》与2011年版《细菌名称双解及分类词典》的基础上，收集自2010年3月之后合格发表的细菌与真菌名称，参照以往的汉译规范，给出中文名称，以《微生物新菌
RNAi技术专有名词(2)
21.Homologous Chromosome：同源染色体一对染色体，分别来自父本和母本，染色体上有着相同的线性基因序列。 22.Recombinant Clone：重组克隆将不同来源的DNA片段合成在一个DNA分子中，这种技术称为重组，得到的分子为重组克隆。 23.Ribonucleic
凝胶成像分析系统的软件要求
不论何种计算机，它们都是由硬件和软件所组成，两者是不可分割的。人们把没有安装任何软件的计算机称为裸机。凝胶成像分析系统也不例外，硬件设备再好，如果不配上好的软件，也无法发挥它应有的功能。作为凝胶成像系统软件功能和用途都基本相似，这里我们介绍一下*关注的几个特点：A、软件的基本功能：可对不同样品，如条
科研领域常用10大分析软件介绍
工欲善其事，必先利其器，这里小编给各位小伙伴们带来了材料领域常用的十大表征分析软件整理，简要介绍了各软件的应用领域及特点，文后还有免费软件资源福利，希望能为大家带来帮助。 1.DI Jade 软件介绍： MDIJade是业内最专业的XRD分析软件，它非常稳定，而且可以说能
布鲁克US－HUPO会议最新发布|－4D免疫肽组学、4D糖组学、血蛋白组学、实时数据库检索重大升级
· Novor V2.0软件采用了一种针对HLA肽段优化的先进机器学习算法，能从从头测序的多肽中发掘免疫肽段信息，并进一步提升鉴定水平 · TwinScapeTM结合iRTTM标准多肽的数字化监测技术智能反馈功能确保 timsTOF最高性能 – 远远超出“正常运行时间” · 新型glyco-
GCMS定性分析
目前，色质联用仪数据库中，一般贮存有近30万个化合物标准质谱图。因此，GC-MS最主要的定性方式是库检索。由总离子色谱图可以得到任一组分的质谱图，由质谱图可以利用计算机在数据库中检索。检索结果，可以给出几种最可能的化合物。包括：化合物名称、分子式、分子量、基峰及可靠程度。表4是由计算机给出的某未知物
GenBank数据库概述（三）
结构： 1、 结构主页 — 关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划，另外也可以访问分子模型数据库（MMDB）和用来搜索和显示结构的相关工具。 2、 MMDB：分子模型数据库 — 一个关于三维生物分子结构的数据库，结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。MMDB是来源于Brook
GenBank数据库概述（四）
NCBI站点地图---其他基因组数据介绍：1、 小鼠基因组 1) 小鼠基因组资源向导 ：把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起，包括序列，图谱，和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。 2) 小鼠基因组测序：小鼠基因组计划的测序进展，HTG序列contigs（可以用大小和染色体号来浏览）由
核酸数据库的概念
中文名称核酸数据库英文名称nucleic acid data bank定 义DNA、RNA序列的资料库，主要包括已知序列名称、DNA或RNA全序列及其特性，如启动区、起始和终止密码的位置、编码区、限制酶切位点以及推导的翻译产物蛋白质序列等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（二级
GenBank数据库概述（一）
1. GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织，包括EMBL和DDBJ。是NIH遗传序列数据库，一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。唯一人类基因序列集合（UniGene），人类基因组基因图
GenBank数据库概述（二）
FTP GenBank and Daily Updates：1. GenBank普通文件格式 — 参见GenBank记录样本和在GenBank公布通知中的详细描述，下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。 2. ASN.1格式 — 摘要句法记号1，国际标准组织（ISO）数据表示格式，下载
天津工生所举行TotalPatentZL数据库培训
为提高TotalPatent数据库在科研中的实际使用效果，7月13日，中科院天津工业生物技术研究所信息资源中心特邀LexisNexis北方区培训讲师岳亭为职工和研究生进行TotalPatent数据库培训。 岳亭介绍了TotalPatent数据库的内容、功能及检索方法，从
水德浮游生物大数据平台的使用与数据分析方法
水德浮游生物大数据平台 目前，绝大多数海洋和淡水生态领域的研究机构和业务监测单位，对浮游生物的研究手段还停留在人工镜检及手工测定的阶段，这样经常导致操作过程繁琐、工作量巨大、分析结果滞后，而且需要资深专业技术人员。此平台用于对浮游生物样品进行快速安全清洗、扫描成像、种类鉴定、数量统计、大小测量、生物
中国科协支持建设的PCST文献检索系统上线
4月21日，国际公众科技传播组织（Public Communication Science and Technology Network）发布消息，宣告国际科学普及与传播研究领域内最大的文献数据检索系统（http://pcst.co/archive/）正式面向公众提供开放获取和文献检索服务。目前
AB－SCIEX与GeneBio合作提高质谱库互动检索能力
SmileMS软件增强了 LC/MS/MS 系统对小分子的识别能力 生命科学分析技术的全球领先者——AB Sciex公司与Geneva Bioinformatics (GeneBio) SA 公司在今天宣布，他们将联手开发解决方案，以提高科学家快速筛选大量分子的能力。GeneBio公
2024深圳高校知识产权大数据检索知识竞赛启动
6月19日，2024年度“深圳高校知识产权大数据检索知识竞赛”与专利信息检索利用系列培训活动在深圳大学丽湖校区举行。来自深圳地区多所高校的近百名师生齐聚一堂，共同见证赛事启动。本次活动由深圳大学图书馆、深圳图书情报学会、深圳大学知识产权学院（国际知识产权学院）联合主办。赛前培训一共设置四场，包括知识
实验室光学仪器X射线衍射仪检索样品分类
视情况样品可以分成三大类:第一类是天然矿物,第二类是人工合成,第三类就是合金。按经验来说,天然矿物是最好分析的,因为种类不多且天然矿物的数据库特别地全,所有已知矿物都能找到相应的卡片,不存在“新相”的问题。数据库中的数据最成熟。 但是,天然矿物也是最容易出现“错判”的样品,特别是粘土类样品,更是这样
被子植物花图式与花程式及检索表的使用
一、 实验目的 1．通过解剖植物的花、果，掌握花图式的绘制及花程式的编写。 2．了解植物检索表的制定原则，并掌握其使用方法。 二、实验器具 解剖镜、扩大镜、镊子、解剖针等。 三、实验材料 根据季节采集3～5种带花、果的植物新鲜标本
国家天文台北京亚利桑那巡天发布DR3版本数据
近日，中国科学院国家天文台北京-亚利桑那巡天（BASS）团队向全世界发布第三版数据，这是BASS项目组发布的最终版本数据。该版本包括了所有的观测数据并使用了最新的数据处理软件。BASS是由国家天文台BATC课题组主导的国际合作图像巡天项目。项目负责人为国家天文台研究员周旭、副研究员邹虎以及亚利桑
国内首个向量数据库标准发布
11月15日，中国信通院联合腾讯云计算（北京）有限责任公司、中移（苏州）软件技术有限公司等多家企业共同编制的、国内首个向量数据库标准正式发布，将为我国向量数据库研发、测试及选型提供重要参考，推动我国人工智能产业高质量发展。 向量数据能够从多个维度记录事物特征，是人工智能时代的基础数据形式。人工
TEM电子衍射图像
电子衍射图像l 选区衍射（Selected area diffraction, SAD）: 微米级微小区域结构特征。l 会聚束衍射（Convergent beam electron diffraction, CBED）: 纳米级微小区域结构特征。l 微束衍射（Microbeam electron d
高分辨TEM（HRTEM）图像
高分辨TEM（HRTEM）图像HRTEM可以获得晶格条纹像（反映晶面间距信息）；结构像及单个原子像（反映晶体结构中原子或原子团配置情况）等分辨率更高的图像信息。但是要求样品厚度小于1纳米。 ▽ HRTEM光路示意图 ▽ 硅纳米线的HRTEM图像
荧光图像的记录方法
荧光显微镜所看到的荧光图像，一是具有形态学特征，二是具有荧光的颜色和亮度，在判断结果时，必须将二者结合起来综合判断。结果记录根据主观指标，即凭工作者目力观察。作为一般定性观察，基本上可靠的。随着技术科学的发展，在不同程度上采用客观指标记录判断结果，如用细胞分光光度计，图像分析仪等仪器。但这些仪器记录
图像像素强度值无关
S1(average)和S2(average)分别是第一个通道和第二个通道平均像素强度值。在 Pearson′s 系数里，原始像素强度值减去平均像素强度值。结果，系数值范围从-1到 1， -1 表示图像的像素之间完全没有重叠，而 1 表示完美的图像重叠。Pearson′s相关系数只解释了两个图像之间
高光谱图像成像原理
光源相机（成像光谱仪+ccd）装备有图像采集卡的计算机是高光谱成像技术的硬件组成，其光谱的覆盖范围为200-400nm，400-1000nm，900-1700nm，1000-2500nm。其中光谱相机的主要组成部分为准直镜，光栅光谱仪，聚焦透镜以及面阵ccd。 其扫描过程是当ccd探测器在光学