计算生物学所等建立检测混合人群自然选择的新方法
11月29日，国际著名学术期刊Genome Research在线发表了中科院上海生命科学研究院计算生物学所的最新研究成果Genome-Wide Detection of Natural Selection in African Americans Pre-and Post-Admixture。该研究充分利用混合人群的群体基因组结构特征，建立了检测现代人群经历大规模基因交流前后受到环境压力下的自然选择信号的分析方法。研究结果对于认识现代人类与环境因素相互作用、适应生存环境以及基因组进化机制具有重要意义。 生物的进化不是完美的，朝任何一个方向的发展都会付出代价。从某种程度上讲，发生在今天人们身上的各种疾病就是进化过程中人类适应生存环境的一些副产物或者必然产物。研究现代人类的环境适应（或者自然对人类的选择），有助于了解基因对性状的影响，建立遗传变异与表型变异之间的相互关系，阐明复杂性状（疾病）的分子与遗传基础，从而对深入了解......阅读全文
自然选择的强大力量：霍乱正在改变人类基因组
霍乱每年夺去成千上万人的生命，但是一项新研究表明，人体也开始对其进行反击了。研究人员已经找到证据：在孟加拉这一霍乱正流行的国家，当地人们的基因组已经进化出多种不同的方式来应对这种疾病。这是人类进化发生于现代社会的一个引人注目的案例。 霍乱已经蔓延到全球，甚至在2010年跟随联合国维和部队进
自然选择的定义
自然选择（Natural selection ）指生物在生存斗争中适者生存、不适者被淘汰的现象，最初由C·R·达尔文提出。达尔文从生物与环境相互作用的观点出发，认为生物的变异、遗传和自然选择作用能导致生物的适应性改变。自然选择由于有充分的科学事实作根据，所以能经受住时间的考验，百余年来在学术界产生了
计算生物学所等建立检测混合人群自然选择的新方法
11月29日，国际著名学术期刊Genome Research在线发表了中科院上海生命科学研究院计算生物学所的最新研究成果Genome-Wide Detection of Natural Selection in African Americans Pre-and Post-Admixture。该
自然选择代价的定义
中文名称自然选择代价英文名称cost of natural selection定 义一个等位基因取代另一个等位基因时，付出被取代基因消亡的代价。应用学科遗传学（一级学科），进化遗传学（二级学科）
生物学术语基因组当量的概念
基因组当量是基因组文库容量的度量单位。基因组文库容量的度量单位，指文库中所有载体的插入片段总长度相当于基因组的总长度。
生物学术语基因组扫描的概念
中文名称基因组扫描英文名称genome scanning定 义从全基因组的遗传标记中寻找与特定性状或基因紧密连锁的标记，并在染色体上定位相关基因的方法。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
自然选择影响癌症发病率
恶性肿瘤更常袭击一些器官，例如结肠或乳房。在近日刊登于《癌症学趋势》期刊的文章中，研究人员认为一些器官的这种脆弱性可能归因于自然选择。与心脏等小型重要器官相比，人类更容易忍受大型或成对器官肿瘤。因此，更大器官可能进化出更少的机制防御癌细胞。 “在其他条件相同的情况下，心脏、大脑和子宫等那些保证
Nature：自然选择？蜥蜴没在怕的！
近日，一项新研究指出，枝干抓握能力较强的蜥蜴更有可能在飓风后幸存，这是一起正在发生的自然选择事件。图片来源：《自然》 飓风等自然灾害会对生态系统造成毁灭性打击，并导致大量生物死亡。不过，人们尚不清楚飓风导致的死亡是随机性的还是自然对某些物理特性的优先选择，如抗强风能力。 在飓风厄玛和玛利亚毫
自然选择的主要类型及特点
稳定性选择（stabilizing selection）稳定性选择指的是指向变异曲线两个尾部的选择，即中间表型为选择所厚，而极端表型为选择所薄，结果一切偏离“正常的”、与共同的表型不一致的类型都被排斥，仅保留中间类型的个体，使生物类型保持相对稳定。这种选择多见于生境相对稳定的居群中，选择的结果将使性
我国科学家发明新近发生自然选择检测新方法－解20年难题
如何可靠地检测新近发生的自然选择？新华社记者8月31日从中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所了解到，李海鹏研究员的最新研究成果，圆了这个理论群体遗传学界20年来的梦想。 研究人员介绍说，在生命的进化过程中，达尔文的自然选择是一种重要的进化力量，它使得携带某个突变的个体相对于不
推进后基因组时代物理生物学探索
5月7日~8日，科学与技术前沿论坛在中科院学术会堂召开，此次论坛的主题为“后基因组时代的物理生物学”。欧阳钟灿、郝柏林、陈润生、欧阳颀等多名来自全国各大高校和科研院所的院士和学者出席了此次论坛，并发表了主题演讲。 本次论坛召集人中科院院士杨玉良表示，上世纪末以来，生命科学获得了飞速发展，积累了
于军：从基因组生物学到精准医学
今年是“人类基因组计划”宣布完成10周年。选择2003年结束这个计划是为了纪念美国沃森和英国克里克两位生物学家发现DNA双螺旋结构50周年，而沃森博士正是这个宏大计划早期的实际推动者之一。 科学界往往以重要人物和他们的重要科学发现及技术发明为里程碑。基因组学应属于分子生物学范畴，其学科的真
于军：从基因组生物学到精准医学
今年是“人类基因组计划”宣布完成10周年。选择2003年结束这个计划是为了纪念美国沃森和英国克里克两位生物学家发现DNA双螺旋结构50周年，而沃森博士正是这个宏大计划早期的实际推动者之一。 科学界往往以重要人物和他们的重要科学发现及技术发明为里程碑。基因组学应属于分子生物学范畴，其学科的真
《基因组生物学》：一种超级细菌的基因组测序完成
最近，英国桑格研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）和布里斯托尔大学的研究者们共同完成了一种名为Steno的超级细菌的基因测序工作，研究结果显示，这是一种具有显著抗药性的生物体。对这种细菌基因组的了解将有助于研究者们发现如何应对这种具有独特抗药性的生物体。这一研究论
北京基因组所开发出比较群体基因组学新算法
随着基因组测序技术的发展，物种和群体水平基因组数据呈指数增长。这些数据为在基因组水平鉴定和解析自然选择机制提供了机遇。然而，目前的分析方法面临着技术瓶颈和挑战。其中，关键问题是如何高效准确地检测作用于非编码区的自然选择效应。同时，能够高效、高性能地分析多物种大样本数据，成为方法学方面的迫切要求。
基因组数据显示现代人类进化细节
据物理学家组织网报道，发表在5日出版的《公共科学图书馆·生物学》杂志上的研究论文显示，对英美两国21万人基因组数据分析发现，在长寿人群中，较少发生与阿尔茨海默症和重度吸烟相关的遗传变异，这表明自然选择一直在“努力”消除这些不利种群的变异。 进一步研究发现，与心脏病、高胆固醇、肥胖和哮喘相关的遗
科学家开发比较基因组学进化分析新方法
比较基因组学是从进化角度分析不同物种的基因组数据，解析基因功能和疾病、表型的遗传学机制。通过同源基因编码区序列的进化比较是其中最常见的分析方法之一，如PAML等方法，都在物种序列比较分析中被广泛应用。但这些方法仅分析多个物种的单一序列和分歧位点信息。随着二代、三代测序技术的发展，众多物种的基因组
自然选择才是最挑剔的科学评论家
2003年，人类基因组计划向世界宣布“人类DNA中有30亿个化学单位”。从那时起，科学家们便开始设计许多方法来组织和评估这些极为庞大的储存信息。如今，冷泉港实验室（CSHL）的科学家认为，自然选择进化才是解析基因组的看家法宝。 我们已经知道，人类基因组中仅有1%由基因构成，这些基因生产组成我们
基因分裂揭示自然选择的详细过程
据physorg网站2007年10月10日报道，美国威斯康辛大学麦迪逊分校研究人员发现了分子所具有的一项绝技，他们在基因层面上详细阐述了自然选择的过程。 霍华德.休医学研究所研究员肖恩.B.卡罗尔和前美国威斯康辛大学麦迪逊分校研究生克里斯.托德.黑亭基尔在《自然》杂志上撰写了一篇论文，详细阐述了
PNAS打开基因组生物学的黑盒子
最近，美国佛罗里达州立大学、贝勒医学院和哈佛大学-麻省理工学院Broad研究所的科学家们，开辟了人类遗传学中一个鲜为人知的领域。相关研究结果发表在7月18日的《PNAS》杂志。 在这项研究中，研究人员表明，一条不活跃的X染色体上的一段不寻常的DNA重复序列，实际上对于这种女性特有的遗传现象的整
《PLoS生物学》：老鼠全基因组测序图公布
最新一期的开放存取的《公共科学图书馆·生物学》(PLoS Biology)杂志上，美国、英国和瑞典的研究人员公布了老鼠的全基因组测序图。老鼠成为继人类之后第二个完成全基因组测序的哺乳动物。 在对人类和老鼠的基因测序图进行综合性比较后，研究人员发现两者之间的遗传差异要比人们预想的大得多。老鼠
Biological Reviews:探明IgY基因组成和生物学功能
近日，西北农林科技大学张小莺教授领衔，与英国伦敦大学国王学院Sutton教授团队的一项国际合作成果《IgY： a key isotype in antibody evolution》在Biological Reviews期刊（IF=10.75）发表。 IgY，由两条重链（H）和轻链（L）组成，
生物学术语基因组复杂度的概念
中文名称基因组复杂度英文名称genome complexity定 义衡量基因组所含信息量的参数，由单一序列的核苷酸数目表示。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
《PLoS生物学》：乳齿象线粒体基因组测定完成
这的确有些不可思议。德国科学家利用一颗远古牙齿化石，成功确定了乳齿象完整的线粒体基因组，这也是迄今为止科学家得到的最古老的线粒体基因组。该研究成果有望加深科学家对于象类分化的理解。相关论文发表在的7月24日的《PLoS生物学》上。 2800万年前出现的乳齿象是现代大象的近亲，它们大约有3米高，有和猛
《基因组生物学》：孤独是一个分子
已经知道一个人的社交环境能够影响他的健康。与社会隔离的人往往死亡率较高。在最新一期的《Genome Biology》杂志上发表的首项此类研究中，来自美国加州大学洛杉矶分校的研究人员从慢性、严重孤独者的免疫细胞中发现了一种不同的基因表达模式。 这些发现揭示出社会孤立感与驱动炎症的基因活性改变有关。
攻克基因组测序难题－探究茶树生物学奥秘
我国现存最早的中医医药典籍《本草经》记载：“神农尝百草，日遇七十二毒，得荼（茶）而解之。”这说明了茶的神奇功效。茶树起源于我国的云南、四川等地，在从中国向世界各地数千年漫长传播历程里，与全球多元文化邂逅交融，发展形成了今天地球上复杂而美妙的茶文化。茶之所以广受欢迎，除了有迷人的香气和令人愉悦的滋
PNAS重要成果：最详细的DNA突变进程图谱
来自印第安那大学的生物学家和信息学家们构建出了有史以来最广泛的生物体DNA序列突变进程图谱，阐明了关于突变的分子特性和这些可遗传的改变发生的速度等重要的新进化信息。 通过分析无自然选择压力条件下经历超过20万代的模型原核生物大肠杆菌(Escherichia coli)中精确的基因组改变，由
人类机体不断发展的自然选择往往能够有效抵御诱发损...
长期以来，人类得以生存往往会面临高水平的基因突变，而这也是人类进化过程中所面对的一个重要问题，当突变为我们带来新型物种的同时，大部分的遗传改变也都会被损伤，一个新生儿出生后其机体就会携带大约70个新型突变，而这些突变是新生儿父母机体中所没有的。日前，一项刊登在国际杂志Science上的研究报告
达尔文的自然选择学说的主要内容
达尔文的自然选择学说的主要包括：过度繁殖，生存斗争（也叫生存竞争），遗传和变异，适者生存。
基因证据揭示人类仍存在自然选择
近日，刊登在美国《国家科学院院刊》上的一项研究提供的分子遗传证据表明，自然选择仍持续驱动着人类进化。 有观点认为，人类在大约4万年前停止了进化，但是近来研究提出，诸如对疟疾的耐受性和高海拔适应的进化相对较晚。 针对该问题，美国哈佛大学的Jonathan Beauchamp和同事，使用统计模型