武汉植物园在植物NAC蛋白进化研究中取得新进展
NAC蛋白是植物中最大的转录因子家族之一，广泛存在于陆生植物中。NAC蛋白参与植物生长发育和器官模式建成的许多特异方面。越来越多的研究表明，NAC蛋白在植物应答生物及非生物胁迫过程中发挥重要的作用。 中科院武汉植物园植物应用基因组学学科组博士研究生朱婷婷在彭俊华研究员的指导下，通过对9种陆生植物的全基因组序列检索发现，在苔藓和石松植物中NAC蛋白的数量小于30，而在被子植物中则多于100。系统发育分析表明，这些NAC蛋白由21个亚家族组成，在各亚家族中，NAC蛋白的转录激活区存在高度保守的基序，这些特异基序可能在NAC蛋白的进化过程中起着重要作用。研究还指出，NAC蛋白很有可能起源于4亿年前，并随着维管植物的分化而广泛扩张。 与前人局限于被子植物的研究相比，该研究对更广泛来源的植物全基因组数据进行分析，重新界定了NAC蛋白的亚家族以及各亚家族的特异性，并首次对NAC蛋白的进化史进行了探讨。 ......阅读全文
转录因子Nanog的双重作用
来自中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所的朱学良研究组发表了题为“Nanog suppresses cell migration by downregulating Thymosin β4 and Rnd3”的文章，发现干细胞转录因子Nanog可通过下调下游基因Thymosin
转化生长因子β信转录
磷酸化的RSMAD/coSMAD复合物进入细胞核，与转录启动子及转录辅助因子结合，引起DNA转录。成骨蛋白引起参与骨发生、神经形成及腹部中胚层分化的mRNA的转录。TGF-β引起参与细胞凋亡、细胞外基质再生及免疫抑制的mRNA的转录。它也与细胞周期中的G1期阻滞有关。激活素引起参与性腺生长、胚胎分化
转录因子定义和结合位点
定义人类金属巯基因调节区转录因子(transcription factor)是一群能与基因5`端上游特定序列专一性结合，从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子。结合位点转录因子的结合位点（transcription factor binding site，TFBS）是转录因子
分子遗传学词汇转录因子
真核生物转录起始过程十分复杂，往往需要多种蛋白因子的协助，转录因子与RNA聚合酶Ⅱ形成转录起始复合体，共同参与转录起始的过程。根据转录因子的作用特点可分为二类；第一类为普遍转录因子,它们与RNA聚合酶Ⅱ共同组成转录起始复合体时，转录才能在正确的位置开始。除TFⅡD以外，还发现TFⅡA，TFⅡB，TF
ArrayStar转录因子活性ELISA检测法
ArrayStarTM转录因子活性ELISA试剂盒可以快速、灵敏地检测细胞核提取物中转录因子的DNA结合活性。试剂盒采用96微孔板，标记探针是生物素标记的双链寡核甘酸片段，含有转录因子的特异性DNA结合序列。当标记探针与细胞核抽提物一起孵育时，核抽提物中活性形式的转录因子与探针特异性结合，形成转录因
转录因子的基本信息介绍
RNA的转录合成从化学角度来讲类似于DNA的复制，多核苷酸链的合成都是以5’→3’的方向，在3’-OH末端与加入的核苷酸形成磷酸二酯键，但是，由于复制和转录的目的不同，转录又具有其特点： （1）对于一个基因组来说，转录只发生在一部分基因，而且每个基因的转录都受到相对独立的控制； （2）转录是
通用转录因子的主要种类介绍
TFⅡD该通用转录因子识别TATA元件(大约在转录起始位点上游30个碱基对处)。像很多通用转录因子一样,TFⅡD实际上是一个多亚基复合体。TFⅡD中与TATA序列结合的成分称为TBP(TATA binding protein)。此复合体中的其他亚基称为TAF,即TBP关联因子(TBP-associa
精确转录因子结合位点绘图
“掌握转录因子活动控制高等生物发育的基本原理非常有用，”纽约大学生物学系教授Stephen Small说。“更具体地讲，这项机理的发现为由于转录因子受到干扰的突变基因导致胚胎发育深层破坏和一系列疾病提供了一个潜在的治疗途径。” 这项研究发表于《Genes & Development》，参与研究
关于通用转录因子的成员介绍
1、TFⅡD 该通用转录因子识别TATA元件（大约在转录起始位点上游30个碱基对处）。像很多通用转录因子一样，TFⅡD实际上是一个多亚基复合体。TFⅡD中与TATA序列结合的成分称为TBP（TATA binding protein）。此复合体中的其他亚基称为TAF，即TBP关联因子（TBP-a
高通量的转录因子活性检测
转录因子(transcription factor，TF)在真核生物的基因表达过程中发挥着重要作用，或调节基因表达的强度，或控制目的基因的时空特异性表达，或应答外界刺激和环境胁迫。近年来，随着干细胞研究的不断升温，人们对转录因子的兴趣也日益浓厚。同一个基因组，为何最终分化成不
转录起始因子的功能介绍
中文名称转录起始因子英文名称transcription initiation factor定 义参与转录起始作用的因子。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
Cell丨程时锋团队揭示现存陆地植物的共同祖先起源类群
光合真核生命起源于大约15亿年前的海洋，繁盛于有光和水的地方；大约5-6亿年前，发生了绿藻陆地化事件，祖先绿色植物开始了从简单到复杂、从水生向陆地的迈进。植物陆地化是一个漫长而复杂的演化过程，在潮起潮落、沧海桑田的跌宕变迁中，一些地理生境出现周期性干涸的现象，如形成小水坑、河床、近海泥沼等，开始
玉米转录因子ZmMADS47和籽粒转录因子Opaque2互作可协同调...
玉米转录因子ZmMADS47和籽粒转录因子Opaque2互作可协同调控醇溶蛋白的表达玉米（Zea mays）原产于墨西哥和中美洲地区，是一种由古印第安人（Indians）在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍（Euchlaenamexicana）（现存在于墨西哥和尼加拉瓜）杂交而来的品种。但是，作为一类
测量任一细胞因子转录因子的其他技术
虽然其他技术可以测量任一细胞因子，转录因子，或另外的磷酸化蛋白质，细胞内流式细胞仪可以测量多个细胞内标记同时上面的singlecell电平。这种方法提供了数据信号反应，分化状态，和其他细胞活动。特定的细胞表面和细胞内标记物的荧光抗体的结合使用使高分辨率的样本之间的多种细胞类型内的表型和功能的差异比较
研究发现调控植物抗铝毒转录因子STOP1稳定性的机制
12月17日，国际学术期刊《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心黄朝锋研究组完成的题为F-box protein RAE1 regulates the stability of the aluminum-res
研究发现调控植物抗铝毒转录因子STOP1稳定性的机制
12月17日，国际学术期刊《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心黄朝锋研究组完成的题为F-box protein RAE1 regulates the stability of the aluminum-res
发现bHLH121与bHLH－IVc转录因子共同调控植物缺铁响应信号
铁作为植物生长发育所必需的微量元素之一，在植物的生命活动中发挥了重要的生理功能。铁是过渡态金属离子，通过Fe2+与Fe3+的转换参与电子传递链中的氧化还原反应。铁也是许多酶的辅助因子，参与植物的光合作用、呼吸作用、叶绿素的生物合成、DNA的合成、植物固氮及植物激素合成等过程。植物从土壤中获得矿质
揭示新小鼠巨细胞病毒转录激活因子病毒晚期蛋白表达
2020年1月2日，病毒学期刊Journal of Virology 在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所钱志康课题组的最新研究“Murine Cytomegalovirus Protein pM49 Interacts with pM95 and Is Critical for Vira
细胞内的流式细胞术方式转录因子和相关蛋白的
细胞内的流式细胞术方式于异质性的细胞群的转录因子和相关蛋白的检测。同时分析多个标记允许沿着一个特定的分化途径的细胞的关键时间点，标记，和频率的确定。转录因子是DNA和其他蛋白质结合，调节基因表达的蛋白质。他们发挥关键作用，在细胞发育和分化。例子包括FOXP3 Treg细胞分化为明确的内胚层和Sox1
肖锐教授揭示RNA结合蛋白与转录因子具有广泛的关联作用
越来越多的证据表明，转录控制和染色质活性在很大程度上涉及调节类的RNA，这可能会产生特定的RNA结合蛋白（RBPs）。尽管多个RBP与转录控制有关，但目前尚不清楚RBP如何直接作用于染色质。 2019年6月27日，加州大学圣地亚哥分校付向东及武汉大学医学研究院肖锐共同通讯在Cell 在线发表题
小小角苔－会“借”基因——首个高质量角苔参考基因组发布
中国科学院植物研究所研究员陈之端团队通过一系列精细设计的去污染流程，得到了119 Mb的芽胞角苔基因组组装结果，获得了第一个高质量的角苔参考基因组，填补了苔藓类植物相关研究的空白。相关成果2月10日作为封面文章在线发表于国际学术期刊《自然—植物》（Nature Plants）上。图片来源于网络
植物多组学数据驱动的上下游调控因子挖掘平台发布
9月8日，The Plant Journal 期刊在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组搭建的挖掘植物基因及基因组位点上下游调控因子的网络平台，论文题为Plant Regulomics: A Data‐driven Interface for Retrievi
植物所在植物光形态建成转录调控方面取得进展
转录调控是生物体内由转录因子和其他调节蛋白协同或拮抗调控基因表达的重要生化机制。光信号是高等植物早期生长发育中光形态建成的决定性因素，其信号通路中光敏色素互作因子PIF为负向调控因子，HY5为正向调控因子。PIF和HY5分别是bHLH型和bZIP型转录因子，在植物生长发育及环境响应中具有广泛的功
植物所在植物光形态建成转录调控方面取得进展
转录调控是生物体内由转录因子和其他调节蛋白协同或拮抗调控基因表达的重要生化机制。光信号是高等植物早期生长发育中光形态建成的决定性因素，其信号通路中光敏色素互作因子PIF为负向调控因子，HY5为正向调控因子。PIF和HY5分别是bHLH型和bZIP型转录因子，在植物生长发育及环境响应中具有广泛的功
独脚金内酯与karrikin信号途径起源研究获进展
独脚金内酯（strigolactones，SLs）最初作为寄生植物种子萌发的刺激物被发现，近些年被确认为一类新型的植物激素。独脚金内酯影响植物生长发育的较多方面（如调控分枝和根系形态等），并能作为植物与根际微生物之间的交流信号。Karrikins（KARs）是植物燃烧产生的小分子，包含一个类似于
科学家发现水藻“上岸”因有基因基础
一个国际科研团队新近绘制出一种淡水藻类的基因组图谱，发现其中有些特征与陆生植物相似，可能正是类似的基因最终使水生植物得以进化成陆生植物。 最早的植物和动物都生活在水里。大约5亿年前，第一批植物在陆地上扎根，使地球面貌发生巨大变化，并为动物上岸打下基础。 目前学术界一般认为，陆生植物起源于绿藻
华南植物园关于植物转录起始调控机制的研究获进展
转录复合体将DNA转录为RNA，是遗传信息由细胞核向细胞质转递的基础。由于核小体与基因组的紧密结合，转录复合体需克服核小体障碍进而确保功能基因的表达。染色质重塑复合体（Chromatin Remodeler）被认为在转录过程中发挥了重要作用。这类蛋白复合体能通过水解ATP来调控核小体的组成和分布
植物转录起始调控机制研究获进展
在国家自然科学基金面上项目和青年项目的资助下，中国科学院华南植物园研究员陈琛团队联合广东省农业科学院研究员刘军、加拿大农业部伦敦研发中心研究员崔玉海在植物转录起始调控机制研究方面取得新进展。相关研究近日发表于《核酸研究》（Nucleic Acids Research）。 转录复合体将DNA转录
类转录化学药物诱导型基因组编辑和转录激活系统
生物学变化多受到高度动态的分子事件调控，为了更精确的理解并研究这些过程，应用条件性可诱导的技术手段是十分必要的。此前，得到广泛应用的药物诱导技术之一是通过配体结合激发雌激素受体蛋白（ER）从细胞质到细胞核的转运。在没有激素配体的情况下，ER与热激蛋白（hsp90）结合定位于细胞质中；一旦与配体结
中国农业大学PNAS解析植物重要光系统
来自中国农业大学、加州大学伯克利分校的研究人员证实，在拟南芥中光系统II ( Photosystem II，PSII)反应中心蛋白D1的C端加工对PSII装配及发挥功能至关重要。这一研究发现在线发表在9月16日的《美国科学院院刊》(PNAS)杂志上。 中国农业大学食品科学与营养工程学院