Orbitrap质谱蛋白质组沙龙在京举行

【导语】使用质谱仪器进行蛋白质组研究中有三个关键环节,第一个是样品的处理阶段,这是最简单,也是最重要的一个步骤。第二个阶段是仪器的操作部分,使用液相、质谱等仪器把蛋白质进行分离、分析。主要涉及仪器参数的优化调整。第三步是生物信息学分析部分,这也是最难的部分。本期沙龙中中科院生物物理所的薛鹏老师和医科院基础所的孙伟老师分别从样品制备环节和仪器参数调整两个方面介绍了工作中的一些经验。 2012年4月21日,由中国医学科学院基础医学研究所、赛默飞世尔科技、分析测试百科网共同发起、策划,组织的蛋白质组学沙龙在中国医学科学院基础医学研究所老楼外宾室举行。本次沙龙主要围绕蛋白质组领域,来自中国科学院系统、国家食品安全风险评估中心、北京出入境检验检疫局、军事医学科学院等一线科研人员、以及赛默飞世尔科技的技术工程师近30人参加了本次沙龙活动。 沙龙现场 中国医学科学院基础医学研究所中心实验室的孙伟老师首先介绍了本期沙......阅读全文

Orbitrap质谱蛋白质组沙龙在京举行

  【导语】使用质谱仪器进行蛋白质组研究中有三个关键环节,第一个是样品的处理阶段,这是最简单,也是最重要的一个步骤。第二个阶段是仪器的操作部分,使用液相、质谱等仪器把蛋白质进行分离、分析。主要涉及仪器参数的优化调整。第三步是生物信息学分析部分,这也是最难的部分。本期沙龙中中科院生物物理所的

赛默飞在ASMS发布Orbitrap-Eclipse质谱-激活高端蛋白质组研究

  分析测试百科网讯 2019年6月3日,赛默飞在ASMS 2019大会推出全新的Orbitrap Eclipse三合一超高分辨质谱仪,通过智能数据采集最大化获取研究信息并提高效率,其扩展的分析功能可重新激活高端蛋白质研究。Orbitrap Eclipse 三合一超高分辨质谱仪  面对日益复杂的学术

高分辨质谱Orbitrap直击靶标代谢组学新热点

在生命科学奇妙世界里,基因、核酸、蛋白和小分子代谢产物构成了细胞生命活动的基本要素,以这些物质为基础的诸多组学技术的发展,推动着生命科学研究不断向前。 基因-蛋白-代谢-表型之间的互动成为生命科学研究中研究的范式⁽¹⁾,研究成果可谓精妙纷呈、大放异彩。 图1:基因-蛋白-代谢-表型之间的互动成为生命

质谱那些事——Orbitrap的诞生

  Orbitrap始于一个物理学家离开他的舒适区。  舒适区,现在很流行的概念。  Alexander Alexeyevich Makarov(后面简称Makarov)(1966 -),俄罗斯人。  1988年,设计针对火花电离源的“multi-electrode TOF analyser wit

质谱和蛋白质组学:击中目标

Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008)   作者:Nathan Blow   分析测试百科  译     近年来,质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度,使研究者们在疾病生物标志物的发现和验证方面,更从容地面对挑战。     在2008年6月的美国质谱大会(ASMS)

华盈视角:蛋白质组学——质谱技术

蛋白质作为功能的直接执行者,在生物医学领域中有着重要意义,检测蛋白质表达、修饰、互作等有助于我们理解生命机体的各类机制和活动规律,为疾病的治疗、诊断,药物的开发、优化等提供有力的支持。质谱技术作为检测蛋白质组学的主流技术,有必要了解其核心原理,才能更好的服务于科学问题的解决。1.质谱的原理: 质谱是

Orbitrap在植物蛋白质组领域的应用

蛋白质组学技术已经成为植物科学研究中重要的工具,以Orbitrap为代表的高分辨质谱技术已在植物蛋白质研究领域产生重要的科研成果,发表在Nature Plant,Plant Cell 等核心期刊上。 利用Orbitrap质谱可针对植物样本描绘细胞和亚细胞蛋白定位,以及追踪蛋白之间的相互作用,鉴定不同

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(四)

无论是相对定量还是绝对定量方法,DIA很好地克服了DDA鸟枪法和SRM目标监测的种种不足, 在定量蛋白质组学中具有良好的应用前景。然而,目前DIA 方法的循环时间仍然较长,只能与纳流液相联用,并使用较长的梯度以获得足够的色谱峰宽,限制了DIA 的应用范围。这也是DIA 技术下一步需要解决

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(三)

然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同时监测最多10 ~15 个母离子,而SRM 能同时监测上百个离子对,因为高分辨质谱的有效扫描速度通常只有10 ~15 Hz,远慢于SRM 的有效扫描速度。但是这一问题正逐步得到解决,多重累积(Multiplexing, MSX)技术的发展和使用有

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(一)

摘要 质谱是定量蛋白组学的主要工具。近年来随着定量蛋白质组学研究的深入,传统质谱定量技术面临着复杂基质干扰、分析通量限制等诸多问题。而最近一系列质谱新技术的发展,包括同步母离子选择(SPS)、质量亏损标记、平行反应监测(PRM)、多重累积(MSX)和多种全新数据非依赖性采集(DIA)等,为解决目前蛋

蛋白质组质谱新方法一览

2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人激动

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(二)

同步母离子选择(Synchronous precursor selection, SPS)技术的出现彻底解决了MS3 响应弱的问题。SPS 技术利用多频切迹的选择波形电压(MultiNotch) [27] ,在线性离子阱中实现一次选择同时获得多个离子,最多可同时选择15 个(图2A)。利用这一原理,

静电场傅立叶变换质谱Orbitrap的优缺点

优点:高分辨,60k~120kFWHM,质量精度高相对FT-ICR而言,价格稍低(~450kUSD)缺点:不能单独做串级分辨力、灵敏度、质量稳定性等离FT-ICR还有距离

《自然》子刊专题:蛋白质组学中的质谱

涉及到蛋白质组学分析的研究人员都知道蛋白质组学研究的技术路线有两条,一条是以双向电泳加生物质谱的方法鉴定生物体系中各种蛋白的表达谱以及各蛋白表达程度的相对变化,另一条路线就是多维色谱与生物质谱相结合的称之为鸟枪法的技术路线。其中质谱分析技术(Mass spectrometry,MS)是蛋白质组学常用

质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法

2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人激动

蛋白质质谱测序

蛋白质谱一般来讲是用来对某个蛋白质进行鉴定的方法而蛋白质测序实际上就是检测蛋白质的多肽链数目,不一定要用到质谱技术简单说,蛋白质测序的方法有很多,一般是在构建完成后,通过测序来对比之前的预测的序列是否正确。而质谱检测一般是用在蛋白质表达纯化完成后,用来鉴定是否是最初设计的那个蛋白。

颠覆认知,“质”的飞跃:Orbitrap-Astral革新修饰组学研究

  翻译后修饰(Post-translational modifications,PTMs)是指对翻译后的蛋白质进行共价加工的过程,在一个或多个氨基酸残基加上修饰基团,可以改变蛋白质的理化性质,进而影响蛋白质的空间构像、活性状态、亚细胞定位、折叠及其稳定性以及蛋白互作。  随着对一些疾病逝行深入的研

质谱组学,引领精准

  8月,上海。炎炎夏日,骄阳似火,正值生机盎然的季节,一场造福行业发展的合作协议今日于上海签订。赛默飞世尔科技(中国)有限公司和上海中科新生命生物科技有限公司在多组学及精准医疗领域,建立战略合作伙伴关系。出席本次签订协议的嘉宾有赛默飞世尔科技(中国)有限公司商务运营副总裁冯时瀚先生、上海中科新生命

质谱盛宴AOMSC,-赛默飞Orbitrap技术大放异彩

  AOMSC(Asia-Oceania Mass Spectrometry Conference)作为亚太地区顶级质谱盛会之一,1月4-7日在澳门胜利举行。  此次大会汇集了来自多个国家(地区)的约400位质谱学者参加,议题覆盖质谱原理研究、质谱创新技术、组学研究、环境研究、中药及天然产物研究等多

台式Orbitrap-高分辨质谱Q-Exactive的特性及功能

  2011年9月20日,赛默飞世尔科技的质谱应用工程师马乐先生,通过分析测试百科网的网络讲座,为大家介绍了赛默飞世尔科技台式Orbitrap 高分辨质谱Q Exactive™ 的特性及功能。Q Exactive 是赛默飞世尔科技

以谱求质-引领创新,ASMS2020赛默飞推出2款Orbitrap质谱新品

  6月1-12日,全球质谱界盛会—第68届美国质谱年会(68th ASMS,以下简称ASMS)在线上盛大举行,赛默飞重磅发布两款革命性智能化LCMS系统!全新一代Orbitrap Exploris 120质谱仪  赛默飞发布了新一代四极杆-静电场轨道阱台式质谱仪Orbitrap Exploris

基于质谱的空间蛋白质组学系统研究方法

  蛋白质亚细胞定位及其动态变化过程对于蛋白质功能至关重要。随着鸟枪法蛋白质组学的发展,通过亚细胞分离及质谱技术同时测定数千个蛋白质稳态定位的“蛋白质组学显微镜(proteomic microscope)”出现了。然而,表征因扰动导致的亚细胞定位变化的工具却一直局限在光学显微镜,每次仅能成像一个或几

质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法介绍

  2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人

AB-SCIEX三大质谱平台支撑蛋白质组学研究

  2010年10月18~19日,由国家自然科学基金委、中国化学会分析化学委员会主办,复旦大学、上海交通大学承办的2010年微纳尺度分离和分析技术学术会议暨第六届全国微全分析学术会议在上海复旦大学复宣大酒店隆重召开。来自全国高等院校、科研机构、企事业单位的300余名专家学者出席了本次会议。

赛默飞Orbitrap十周年-推出两款Orbitrap系列质谱新品

  分析测试百科网讯 2015年10月13日,科学服务领域的世界领导者赛默飞世尔科技(以下简称:赛默飞)Orbitrap十周年客户会议在北京北辰洲际酒店隆重召开,此次会议邀请320余位赛默飞用户参加,旨在感谢新

“组学国标”项目结硕果:最精准的mRNA测序与蛋白质组质谱

  二代测序、蛋白质组质谱,这些“高大上”的组学手段早已不是稀罕事,使人们对生命和疾病的理解进入了一个崭新的时代。这些组学技术大量用于科研的同时,在应用领域却陷入了巨大的困境。  蛋白质组质谱技术和RNA测序目前几乎没有任何值得一提的临床应用,即便是在临床应用得相对较多的DNA测序,也饱受重复性差、

Orbitrap质谱助医院识别儿童急性阑尾炎的Biomarker

赛默飞世尔科技质谱技术帮助波士顿儿童医院识别儿童急性阑尾炎的生物标志物   儿童医院的研究团队相信该发现将带来更为准确和有效的诊断   圣何塞,加州 (2009年12月14日) – 世界领先的科学服务商赛默飞世尔科技公司今天宣布,波士顿儿童医院的研究人员识别出一种称作LRG的生物标志物,他们认为

质谱技术帮助科学家发现蛋白质组学重要成果

最近,来自瑞士和荷兰的科学家,对在22种不同生长条件下大肠杆菌表达的蛋白质,进行了定量和定性分析。确定了超过2300个蛋白质,其中一些处于每个细胞一个副本的平均水平。由此产生的数据集描述了细胞中大多数(> 90%)的蛋白质量,对细胞生物学家来说这将是一个宝藏。相关研究结果发表在十二月出版的《Na

AB-SCIEX推出创新的蛋白质组学质谱应用新技术

  将与苏黎世联邦理工学院通力合作,专注发展 TripleTOF 5600 系统上的 SWATH™ 采集方式,来研究全面的系统蛋白质组学  马萨诸塞州弗雷明汉市2011年6月7日电 /美通社亚洲/  --苏黎世联邦理工学院及 AB SCIEX(全球领

综述:基于质谱技术的糖蛋白质组学与糖组学研究进展

   糖是组成生命体的四大类重要分子之一,糖蛋白质是由糖链与肽链中的特定氨基酸残基以糖苷键共价连接而成的蛋白质。糖蛋白质普遍存在于生物体内,在很多生命过程中起着重要作用,如蛋白质的折叠、细胞之间的相互识别、炎症反应等。同时,糖基化修饰在疾病中,特别是肿瘤的发生、发展和转移过程中也起到重要作用,许多疾