华南植物园发现构建植物ihpRNA的新方法

自从发现双链RNA能引发RNA干扰(RNA interference,RNAi)现象后,RNAi已经成为分析基因功能的重要工具之一。随着RNAi技术在植物基因功能分析上的广泛应用,迫切需要一种高通量构建发夹RNA(hpRNA)表达载体的方法。 中科院华南植物园华南农业植物遗传育种重点实验室博士生言普在导师段俊研究员的指导下,研究出了一种基于Golden Gate克隆技术构建含内含子发夹结构RNA(ihpRNA)表达载体的新方法。利用该方法,只需在扩增靶基因序列的同时,由引物在序列两端加上相应的BsaI识别和切割位点,经一步酶切/连接反应后,此靶基因片段能同时以正向和反向的位置克隆到pRNAi-GG,形成ihpRNA表达载体结构;整个构建过程只需在一管中通过一个反应完成,构建效率高,且无背景干扰,同时由于pRNAi-GG为植物双元表达载体,构建好的ihpRNA表达载体可直接用于农杆菌转化研究。 该载体构建方......阅读全文

Nature:跨越鸿沟的RNA结构信号

  科罗拉多大学的研究人员在Nature杂志上发表文章指出,一个以RNA结构为基础的信号,能够跨越不同生命类型数十亿年的进化趋异。这一发现改变了人们对生命(细菌和真核生物)起始蛋白质合成的基础认识。  长期以来,科学家们一直认为细菌和真核生物中的翻译起始信号是相互排斥的,这篇文章

核糖体RNA的结构介绍

测定rRNA的空间排列方式的方法主要有电镜法和交联法。其功能部位通过几种方法确定在70S核糖体图1中显示了rRNA分子的结合部位和方向。在电镜下,16SrRNA的排列呈V型,一个臂比一个臂稍厚和长。23S的大小和形状可与50S"皇冠"式样很好匹配。有结论认为,rRNA形成了核糖体亚基的骨架,蛋白质与

转运RNA的结构特征相关介绍

  tRNA的结构特征之一是含有较多的修饰成分,如上面提到的 D、T、 Ψ等;核酸中大部分修饰成分是在tRNA中发现的。修饰成分在tRNA分子中的分布是有规律的,但其功能不清楚。  1974年用X射线晶体衍射法测出第一个tRNA——酵母苯丙氨酸tRNA晶体的三维结构,分子全貌象倒写的英文字母L,呈扁

关于转运RNA的结构的概述

  转运RNA分子由一条长70~90个核苷酸并折叠成三叶草形的短链组成的。上图中有两种不同的分子,苯丙氨酸tRNA(4tna)和天冬氨酸tRNA(2tra)。tRNA链的两个末端在图上方指出的L形结构的末端互相接近。氨基酸在箭头示意的位置被连接。在这条链的中央形成了L形臂,如图下方所示,露出了形成反

核仁小RNA的结构和功能

核仁小RNA(small nucleolar RNA),是近来生物学研究的热点,由内含子编码,分布于真核生物细胞核仁的小分子非编码RNA,具有保守的结构元件。已证明有多种功能,主要参与rRNA的加工;反义snoRNA指导rRNA核糖甲基化。

卫星RNA的概念和结构特点

卫星RNA是一类小的非编码RNA,基因组大小为200-1500nt,通常不编码蛋白,是一类存在于某专一病毒粒即辅助病毒的衣壳内并完全依赖于辅助病毒来完成复制、包被、移动和传播才能复制自己的小分子的RNA病原因子,且和其辅助病毒的基因组不存在序列同源性。因后来又发现少数种类是DNA,故有人把卫星RNA

转移RNA的功能结构特点

转移RNA(tRNA)在蛋白质合成过程中负责转运氨基酸、解读mRNA遗传密码。tRNA占细胞总RNA的10%~15%,绝大多数位于细胞质中。tRNA由Crick于1955年提出其存在,Zamecnik和 Hoagland于1957年鉴定。1.tRNA一级结构具有以下特点:①是一类单链小分子RNA,长

转运RNA的结构和功能特点

转运RNA(Transfer RNA),又称传送核糖核酸、转移核糖核酸,通常简称为tRNA,是一种由76-90个核苷酸所组成的RNA,其3'端可以在氨酰-tRNA合成酶催化之下,接附特定种类的氨基酸。转译的过程中,tRNA可借由自身的反密码子识别mRNA上的密码子,将该密码子对应的氨基酸转运

信使RNA的结构功能相关介绍

  原核生物mRNA一般5′端有一段不翻译区,称前导区,3′端有一段不翻译区,中间是蛋白质的编码区,一般编码几种蛋白质。真核生物mRNA(细胞质中的)一般由5′端帽子结构、5′端不翻译区、翻译区(编码区)、3′端不翻译区和3′端聚腺苷酸尾巴构成。分子中除m7G构成帽子外,常含有其他修饰核苷酸,如m6

关于小干扰RNA的结构介绍

  siRNA具有明确定义的结构:具有磷酸化5'末端的短(通常20至24bp)双链RNA(dsRNA)和具有两个突出核苷酸的羟基化3'末端。该切酶酶催化生产的siRNA由长的dsRNA和小发夹RNA。siRNA也可以通过转染引入细胞。由于原则上任何基因都可以被具有互补序列的合成siR

植物细胞的基本结构

洋葱(Alliumcepa)鳞茎的鳞片表皮细胞是观察植物细胞的理想材料,不仅是由于洋葱鳞茎一年四季都能得到,取材容易,而且制片方法简单,易于成功。 (一)制片方法 在光学显微镜下观察植物细胞的结构时,必须将植物的细胞、组织或器官做成薄的制片,才能观察。这些薄片不能过厚(

植物细胞的基本结构

洋葱(Alliumcepa)鳞茎的鳞片表皮细胞是观察植物细胞的理想材料,不仅是由于洋葱鳞茎一年四季都能得到,取材容易,而且制片方法简单,易于成功。 (一)制片方法 在光学显微镜下观察植物细胞的结构时,必须将植物的细胞、组织或器官做成薄的制片,才能观察。这些薄片不能过厚(一般以一层细胞的厚

RNA为模板-首次实现植物同源重组修复

  中国农业科学院作物科学研究所作物转基因技术与应用创新团队与美国加州大学圣地亚哥分校合作,使用核糖核苷酸(RNA)作为同源重组修复(HDR)的模板,成功获得后代无转基因成分的抗ALS抑制剂类除草剂水稻植株。这是在植物中首次成功利用RNA作为脱氧核糖核酸(DNA)同源重组修复模板。相关研究论文北京时

利用-Trizol-从植物组织中制备-RNA-实验

            实验材料 植物组织 试剂、试剂盒 Trizol 氯仿 异丙醇 乙醇

利用-Trizol-从植物组织中制备-RNA-实验

实验材料 植物组织试剂、试剂盒 Trizol氯仿异丙醇乙醇DEPC处理过的水液态N2NaCl柠檬酸钠仪器、耗材 转子-定子均化器研钵和杵圆锥形管实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂Trizol(Invitrogen)氯仿异丙醇乙醇,70%,用焦碳酸二乙酯(DEPC) 处理过的水配制DEPC 处

利用-ConcertPlant-试剂从植物组织中纯化-RNA

            实验材料 植物组织 试剂、试剂盒 Concert Plant RNA试剂 NaCl 氯仿

利用-Trizol-从植物组织中制备-RNA-实验

下述方案是经修改过的 Trizol 方案,用于从植物组织中分离 RNA,其中增加了一个高盐异丙酵沉淀步骤,以选择性地沉淀 RNA,而将多聚糖和蛋白多糖留在溶液里。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。实验材料植物组织试剂、试剂盒Trizol氯仿异丙醇乙醇DEPC处理过的水液态

2.2.3-绿色叶片植物叶线粒体RNA的分离

实验方法原理利用差速离心,将线粒体从其他亚细胞结构中分离出来,再用蔗糖梯度离心进一步纯化得到线粒体。用核糖核酸酶 A 处理从中去除叶绿体 RNA,然后加入高浓度硫氰酸胍灭活核糖核酸酶 A,硫氰酸胍作为一种蛋白变性剂可非常有效的灭活核糖核酸酶 A。通过 CsCl 梯度离心,线粒体 RNA 沉淀下来。最

多糖多酚植物RNA快速提取的方法

操作步骤:提示:(1) 第一次使用前请先在漂洗液RW瓶加入指定量无水乙醇!(2) 操作前在裂解液RLT中加入β-巯基乙醇至终浓度1%,如1 ml RLT 中加入10μl β-巯基乙醇。此裂解液最好现用现配。配好的RLT 4℃可放置一个月。1. 直接研磨法(推荐):a.  新鲜植物组织称重后取100m

植物细胞结构与植物徒手切片观察试验

实验方法原理1.  了解植物细胞形态的多样性;简易染色技术。 2.  掌握植物细胞的结构和植物徒手切片技术。 3.  识别和鉴定植物细胞中常见的后含物。  实验材料洋葱                                                                

植物细胞结构与植物徒手切片观察试验

实验方法原理1.  了解植物细胞形态的多样性;简易染色技术。2.  掌握植物细胞的结构和植物徒手切片技术。3.  识别和鉴定植物细胞中常见的后含物。 实验材料洋葱青辣椒红辣椒马铃薯块茎鸭跖草菠菜叶山楂番茄麦粒蓖麻扁豆花苹果种子根试剂、试剂盒甲基蓝碱性紫间苯三酚酒精氢氟酸蒸馏水仪器、耗材显微镜解剖镜刀

多糖多酚植物总RNA快速提取试剂提取水稻胚乳总RNA

实验概要采用TAKARA的试剂提取水稻胚乳,主要是后期的胚乳RNA量偏少,不易提取!实验步骤1. 称量100mg的新鲜或者超低温冻结的植物RNA提取样品,迅速转移至用液氮预冷的研钵中,用研杵研磨组织,其间不断加入液氮,直至研磨成粉末状。2. 向研钵中加入1000μL RNAiso-mate for

植物细胞结构与植物徒手切片观察试验(一)

实验方法原理 1.  了解植物细胞形态的多样性;简易染色技术。2.  掌握植物细胞的结构和植物徒手切片技术。3.  识别和鉴定植物细胞中常见的后含物。实验材料 洋葱青辣椒红辣椒马铃薯块茎鸭跖草菠菜叶山楂番茄麦粒蓖麻扁豆花苹果种子根试剂、试剂盒 甲基蓝碱性紫间苯三酚酒精氢氟酸蒸馏水仪器、耗材 显微镜解

植物细胞结构与植物徒手切片观察试验(二)

5.  植物细胞的内含物观察(1)淀粉粒 取马铃薯块茎做徒手切片,先在低倍镜下观察,可见到其薄壁细胞中含有许多白色 的颗粒即淀粉粒。换高倍镜观察,可以看到淀粉粒的轮纹,并可找到具有两个脐的淀粉粒。 (2)贮藏蛋白质取蓖麻种子,剥去种皮,用肥厚的胚乳做徒手切片。先把切片放入盛有纯酒精的培养皿中洗涤数分

关于核糖体RNA的结构介绍

  测定rRNA的空间排列方式的方法主要有电镜法和交联法。其功能部位通过几种方法确定在70S核糖体图1中显示了rRNA分子的结合部位和方向。在电镜下,16SrRNA的排列呈V型,一个臂比一个臂稍厚和长。23S的大小和形状可与50S"皇冠"式样很好匹配。有结论认为,rRNA形成了核糖体亚基的骨架,蛋白

非编码小RNA的结构和功能

中文名称非编码小RNA英文名称small non-messenger RNA;snmRNA定  义细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科生物化学与分子生

核糖体RNA的结构及功能

  结构  测定rRNA的空间排列方式的方法主要有电镜法和交联法。其功能部位通过几种方法确定在70S核糖体图中显示了rRNA分子的结合部位和方向。在电镜下,16SrRNA的排列呈V型,一个臂比一个臂稍厚和长。23S的大小和形状可与50S"皇冠"式样很好匹配。有结论认为,rRNA形成了核糖体亚基的骨架

核糖体RNA的组成及结构

  组成  rRNA一般与 核糖体蛋白质结合在一起,形成 核糖体(ribosome),如果把rRNA从核糖体上除掉,核糖体的结构就会发生塌陷。 原核生物的核糖体所含的rRNA有5S、16S及23S三种。S为 沉降系数(sedimentation coefficient),当用 超速离心测定一个粒子的

细胞内核小RNA的基本结构

细胞内有核小RNA(small nuclearRNA,snRNA)。它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。其长度在哺乳动物中约为100-215个核苷酸,共分为7类,由于含U丰富,故编号为U1~U7。snRNA只存在于细胞核中,其中U