华南植物园发现构建植物ihpRNA的新方法
自从发现双链RNA能引发RNA干扰(RNA interference,RNAi)现象后,RNAi已经成为分析基因功能的重要工具之一。随着RNAi技术在植物基因功能分析上的广泛应用,迫切需要一种高通量构建发夹RNA(hpRNA)表达载体的方法。 中科院华南植物园华南农业植物遗传育种重点实验室博士生言普在导师段俊研究员的指导下,研究出了一种基于Golden Gate克隆技术构建含内含子发夹结构RNA(ihpRNA)表达载体的新方法。利用该方法,只需在扩增靶基因序列的同时,由引物在序列两端加上相应的BsaI识别和切割位点,经一步酶切/连接反应后,此靶基因片段能同时以正向和反向的位置克隆到pRNAi-GG,形成ihpRNA表达载体结构;整个构建过程只需在一管中通过一个反应完成,构建效率高,且无背景干扰,同时由于pRNAi-GG为植物双元表达载体,构建好的ihpRNA表达载体可直接用于农杆菌转化研究。 该载体构建方......阅读全文
植物RNA提取实验——液氮研磨法
实验方法原理独特的裂解液/β-巯基乙醇迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶,植物RNA助提剂PLANTaid帮助结合多糖多酚并通过离心去除,然后用乙醇调节结合条件后,RNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,去蛋白液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除, 最后
植物RNA的分离(总RNA的分离和mRNA的分离)
1. 总RNA的分离总RNA分离的方法很多,常采用的是异硫氰酸胍和b-巯基乙醇这两种RNase 抑制剂来抑制RNase的活性,同时,异硫氰酸胍与十二烷基肌氨酸钠(sarcosyl)共同作用可以破坏核蛋白复合体,使RNA顺利地解脱出来溶进缓冲液。由于RNA在碱性条件下不稳定,因而在整个提取过程中体
植物细胞结构与植物徒手切片
[目的要求] 1.掌握植物徒手切片技术。 2.观察认识植物细胞的基本结构,质体的形态。 3.认识和鉴定植物细胞内常见的后含物。 [材料用品] 材料:洋葱鳞茎或番茄果实、葫芦藓叶、红辣椒、鸭跖草叶片、马铃薯块茎、蓖麻种子、花生种子。
分支RNA的的结构特点
中文名称分支RNA英文名称branched RNA定 义通过直链RNA中特定部位的2′-羟基与另一直链RNA(或同一RNA分子)的末端5′-磷酸基形成磷酸酯键而得到的RNA,见于Ⅱ型内含子自剪接和真核信使核糖核酸(mRNA)内含子剪接的中间体。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(
简述转运RNA的结构特征
tRNA的结构特征之一是含有较多的修饰成分,如上面提到的 D、T、 Ψ等;核酸中大部分修饰成分是在tRNA中发现的。修饰成分在tRNA分子中的分布是有规律的,但其功能不清楚。 1974年用X射线晶体衍射法测出第一个tRNA——酵母苯丙氨酸tRNA晶体的三维结构,分子全貌象倒写的英文字母L,呈扁
信使RNA的结构功能特点
信使RNA(mRNA)最早发现于1960年,在蛋白质合成过程中负责传递遗传信息、直接指导蛋白质合成,具有以下特点。1.含量低,占细胞总RNA的1%~5%。 2.种类多,可达105种。不同基因表达不同的mRNA。 3.寿命短,不同mRNA指导合成不同的蛋白质,完成使命后即被降解。细菌mRNA的平均半衰
核糖体RNA的结构
测定rRNA的空间排列方式的方法主要有电镜法和交联法。其功能部位通过几种方法确定在70S核糖体图中显示了rRNA分子的结合部位和方向。在电镜下,16SrRNA的排列呈V型,一个臂比一个臂稍厚和长。23S的大小和形状可与50S"皇冠"式样很好匹配。有结论认为,rRNA形成了核糖体亚基的骨架,蛋白质
核小RNA的基本结构
细胞内有核小RNA(small nuclearRNA,snRNA)。它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。其长度在哺乳动物中约为100-215个核苷酸,共分为7类,由于含U丰富,故编号为U1~U7。snRNA只存在于细胞核中,其中U
RNA聚合酶的结构
为什么细菌的RNA聚合酶需要这么大和复杂的分子结构呢?而某些噬菌体特有的RNA聚合酶则要小得多,仅由一条多肽链组成。这证明RNA合成所需的机构可以远比宿主的酶小。这种情况说明,噬菌体内的转录仅需一条"最小"的机构。然而这种酶只能识别噬菌体本身所有的少数几个启动子;它们不能识别其他启动子。例如噬菌
转移信使RNA的结构特点
中文名称转移-信使RNA英文名称transfer-messenger RNA;tmRNA定 义一类兼有接受(携带)氨基酸和编码氨基酸的双功能RNA分子。其主要功能是在特定情况下可提前终止蛋白质的生物合成,以免产生不良产物。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
核小RNA的基本结构
细胞内有核小RNA(small nuclearRNA,snRNA)。它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。其长度在哺乳动物中约为100-215个核苷酸,共分为7类,由于含U丰富,故编号为U1~U7。snRNA只存在于细胞核中,其中U
单链RNA的结构特点
中文名称单链RNA英文名称single-stranded RNA;ssRNA定 义只含有一条链的RNA分子。生物体中绝大部分RNA是单链RNA,形成二级结构时,是既有单链、又有双链结构域的RNA分子;只有某些RNA病毒是由两条链互补而成的双链RNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与
核糖体RNA的结构
测定rRNA的空间排列方式的方法主要有电镜法和交联法。其功能部位通过几种方法确定在70S核糖体图1中显示了rRNA分子的结合部位和方向。在电镜下,16SrRNA的排列呈V型,一个臂比一个臂稍厚和长。23S的大小和形状可与50S"皇冠"式样很好匹配。有结论认为,rRNA形成了核糖体亚基的骨架,蛋白质与
植物细胞结构介绍
植物细胞结构:ⓐ胞间连丝 ⓑ细胞膜 ⓒ细胞壁 ①叶绿体:ⓓ类囊体膜、ⓔ淀粉粒 ②液泡:ⓕ液泡、ⓖ液泡膜 ⓗ线粒体 ⓘ过氧化物酶体 ⓙ细胞质 ⓚ小囊泡 ⓛ粗面内质网 ③细胞核:ⓜ核孔、ⓝ核膜、ⓞ核仁 ⓟ核糖体 ⓠ光面内质网
植物RNA的制备实验——酚/SDS法
由于RNA的种类来源很多,因而提取制备方法各异,一般有苯酚法,去污剂法和盐酸胍法,其中苯酚法实验室最常用。组织匀浆后用苯酚处理离心,RNA即溶于上层被酚饱和的水相中,向水相加冷乙醇后, RNA即以白色絮状沉淀析出。此法较好除去DNA和蛋白质,且获得生物活性的RNA。实验材料RNA试剂、试剂盒TELi
RNAplant植物RNA提取试剂使用说明
简介:RNAplant试剂可从植物组织,特别是富含多酚或淀粉的植物组织中(如马铃薯块茎,白松松针或嫩苗,和西红柿叶等)提取高纯度的总RNA。每100 ml可处理100 mg组织200次。保存条件:室温运输,4℃保存,可保存6-12个月。 准备试剂:液氮,研钵,无RNase离心管,5 M NaCl(无
植物总RNA的快速提取与纯化
一、原理RNA包括rRNA、tRNA和mRNA等,大部分通常是以核蛋白复合物的形式存在的。通过SDS、苯酚处理使蛋白质变性并沉淀。利用LiCl溶解双链DNA的特性去除DNA,经乙醇沉淀得到总RNA。纯度高、完整性好的RNA,即可用于Northern杂交、纯化mRNA、cDNA合成和体外翻译等进一步的
学者首次发现植物环状RNA编码蛋白
华南农业大学植物保护学院周国辉教授/杨新副研究员团队在国家自然科学基金等项目的资助下,首次发现植物环状RNA编码多肽的功能,并揭示该多肽赋予水稻对多种病原物的广谱抗性。2月25日,相关成果发表于《新植物学家》(New Phytologist)。水稻条纹花叶病毒的感染促进水稻植株中circ-WRKY9
植物组织RNA提取的要点与技巧
从植物组织中提取RNA 是进行植物分子生物学方面研究的必要前提。要进行Northern杂交分析,纯化mRNA 以用于体外翻译或建立cDNA文库,RT-PCR及差示分析等分子生物学研究,都需要高质量的RNA 。因此,从植物组织中提取纯度高、完整性好的RNA 是顺利进行上述研究的关键所在。从文献报道上看
植物组织RNA提取的难点及对策
植物组织RNA提取的难点及对策 从植物组织中提取RNA是进行植物分子生物学方面研究的必要前提。要进行Northern杂交分析,纯化mRNA以用于体外翻译或建立cDNA文库,RT-PCR及差示分析等分子生物学研究,都需要高质量的RNA。因此,从植物组织中提取纯度高、完整性好的RNA是顺利进行上述研究
植物总RNA的提取实验_研磨法
在液氮中研磨植物材料, 使部分细胞破碎, 进一步使植物细胞在裂解液中裂解, 用醋酸钠和氯仿沉淀蛋白质, 异丙醇沉淀核酸, 溶解后经氯化锂沉淀总RNA, 洗涤后得到高质量的RNA。本实验旨在了解和掌握植物总RNA 的分离和纯化方法。实验方法原理在液氮中研磨植物材料, 使部分细胞破碎, 进一步使植物细胞
植物材料RNA的3种提取方法
1. 利用RNeasy Plant Mini Kit提取总RNA1) 于1.5 ml离心管中加入0.5 ml RLT缓冲液和5ul β-巯基乙醇;2) 称取约100 mg材料,液氮研磨后转移到提取液中,涡旋混匀,56℃,2 min;3) 加入紫色柱子,23℃, 12000 rpm,离心2 min;4
绿色叶片植物叶线粒体RNA的分离
实验方法原理 利用差速离心,将线粒体从其他亚细胞结构中分离出来,再用蔗糖梯度离心进一步纯化得到线粒体。用核糖核酸酶 A 处理从中去除叶绿体 RNA,然后加入高浓度硫氰酸胍灭活核糖核酸酶 A,硫氰酸胍作为一种蛋白变性剂可非常有效的灭活核糖核
多糖多酚植物RNA提取的利器
众多文献报道,许多植物由于未能有效地分离纯化出其组织中的RNA, 而阻碍了其分子生物学方面的研究进展。比如Northern杂交分析,体外翻译分析或建cDNA文库,RT-PCR及差异显示分析等研究,都需要高质量的RNA。因此,提取纯度高、完整性好的RNA是顺利进行上述研究的关键所在。RNA提取的常见难
植物总RNA提取方法及过程介绍
目的:用于 Northern 杂交、纯化 mRNA、RT-PCR 及 DDRT-PCR 等。材料:植物油嫩组织器官或种子萌发的幼苗。1、异硫氰酸胍法(1)试剂①异硫氰酸胍溶液:4mol/L 二异硫氰酸胍,25mmol/L 柠檬酸钠(pH7.0),0.5%十二烷基肌氨酸钠,0.1mol/L 巯基乙醇。
植物材料RNA的3种提取方法
实验概要本实验介绍了3种提取植物材料RNA的方法,分别是:RNeasy Plant Mini Kit,TRIZOL试剂盒及CTAB法。实验步骤1. 利用RNeasy Plant Mini Kit提取总RNA 1) 于1.5 ml离心管中加入0.5 ml RLT缓冲液和5ul β-巯基乙醇;
绿色叶片植物叶线粒体RNA的分离
实验方法原理 利用差速离心,将线粒体从其他亚细胞结构中分离出来,再用蔗糖梯度离心进一步纯化得到线粒体。用核糖核酸酶 A 处理从中去除叶绿体 RNA,然后加入高浓度硫氰酸胍灭活核糖核酸酶 A,硫氰酸胍作为一种蛋白变性剂可非常有效的灭活核糖核酸酶 A。通过 CsCl 梯度离心,线粒体 RNA 沉
植物徒手切片与植物细胞结构观察
[目的要求] 1.掌握植物 徒手切片技术。 2.观察认识植物细胞的基本结构,质体的形态。 3.认识和鉴定植物细胞内常见的后含物。 [材料用品] 材料:洋葱鳞茎或番茄果实、葫芦藓叶、红辣椒、鸭跖草叶片、马铃薯块茎、蓖麻种子、花生种子。 用品:I-KI溶液、苏丹溶液、显微镜
植物徒手切片与植物细胞结构观察
[目的要求] 1.掌握植物 徒手切片技术。 2.观察认识植物细胞的基本结构,质体的形态。 3.认识和鉴定植物细胞内常见的后含物。 [材料用品] 材料:洋葱鳞茎或番茄果实、葫芦藓叶、红辣椒、鸭跖草叶片、马铃薯块茎、蓖麻种子、花生种子。 用品:I-KI溶液、苏丹溶液、显微镜
Nature:跨越鸿沟的RNA结构信号
科罗拉多大学的研究人员在Nature杂志上发表文章指出,一个以RNA结构为基础的信号,能够跨越不同生命类型数十亿年的进化趋异。这一发现改变了人们对生命(细菌和真核生物)起始蛋白质合成的基础认识。 长期以来,科学家们一直认为细菌和真核生物中的翻译起始信号是相互排斥的,这篇文章的通讯作者Jeffr