Science重要成果：人类癌症反转录转座子图谱
在人类基因组中，称为反转录转座子(retrotransposon)的小DNA元件通过自我复制和重新插入到基因组的多个位点从而具有造成突变性破坏的潜力。正常的成人细胞通过抑制机制阻止这些元件四处跳跃，然而根据发表在6月28日《科学》(Science)杂志上的一篇研究报道，这些机制在某些癌症中可能发生了故障，在某些情况下跳跃基因有可能甚至会导致癌症或促进其进程。 俄亥俄州立大学分子遗传学家Keith Slotkin (未参与该研究)说“这篇论文非常的重要。长期以来癌症与转座因子之间存在着薄弱的联系，新论文现在明确地证实了转座因子激活是癌细胞中新突变的来源。” 反转录转座子常见于真核生物基因组中，由于在进化过程中反复多轮的自我复制和插入，它们广泛构成了物种DNA的一个重要组成部分。事实上，它们组成了高达45%的人类基因组。 密歇根大学医学院人类遗传学家John Moran(未参与该研究)说：“大部分都是分......阅读全文
Cell子刊：生殖细胞的piRNA通路大名单
转座子广泛存在于生物的基因组中，能够自我复制，并随机插入到染色体上，因此又被称为跳跃基因。转座子在生殖细胞中特别危险，可能导致不孕或对后代发育产生严重影响。在进化过程中，复杂生物形成了一套生殖细胞基因组的防御机制，这一机制被称为piRNA通路。 冷泉港实验室(CSHL)Gregory
动物中DNA转座子通过两种机制介导基因重复
转座子被认为是宿主基因组演化的重要推动力。其类型众多，包含non-LTR（Long Terminal Repeat）型逆转座子、LTR型逆转座子、Helitron型DNA转座子、TIR（Terminal Inverted Repeat）型DNA转座子等，可引起包含基因重复（gene duplic
科学家发现Tau蛋白诱发AD等疾病神经炎症的新机制
神经退行性疾病的发生伴随神经炎症激活。有研究者认为，神经炎症可能直接参与诱导疾病的发生，因此探究诱导神经炎症的因素对神经退行性疾病早期筛查和防治有重要意义。 此前有研究表明，致病形式的Tau蛋白能够激活反转录转座子，并且发现反转录转座子能够在人类疾病发生过程中驱动炎症[1]。然而，Tau蛋白诱
首次发现类泛素蛋白SUMO修饰在ZGA过程中有潜在重要功能
6月21日，北京大学分子医学研究所汪阳明研究组与胡新立以及清华大学那洁实验室合作在PLOS Biology在线发表最新研究成果“DPPA2/4 and SUMO E3 ligase PIAS4 opposingly regulate zygotic transcriptional program
凭借一个突变，小菜蛾进化出稳定抗药性
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497511.shtm苏云金芽胞杆菌（Bt）能产生多种杀虫蛋白，高效特异的杀死多种宿主昆虫。然而目前，全世界已经有9种重要的农业害虫对Bt生物杀虫剂或转Bt基因抗虫作物产生了抗药性。 ?小菜蛾。
X射线辐照在候选放射抗性基因下面的作用有哪些？
本研究旨在利用该技术鉴定食管鳞状细胞癌中的候选放射抗性基因。 转座子是一种碱基序列，可以随机转换到基因组中的另一个位置。通过在转座子中插入巨细胞病毒启动子作为转录激活因子，新位置的下列基因变得过表达，位于转座子插入位点的基因被下调。因此，可以获得使用转座子方法具有差异过表达或下调基因的各
Nat－Genet：通过表观遗传疗法激发转座子新抗原，推进癌症免疫治疗
近年来，免疫疗法已在多种癌症的治疗中取得了突破性的进展。这种疗法通过利用肿瘤中特异性表达的新抗原（neoantigen），使免疫细胞能够精准地锁定并消灭癌细胞【1】。传统上，人们认为这些新抗原主要源于编码基因的突变。然而，近年研究表明，基因组中非编码区域在肿瘤中的异常表达也可能导致新抗原的产生，
关于转座酶基因的作用的介绍
在基因组进化过程中，转座酶基因的作用在许多方面起作用。最明显的效应是转座子能够启动重组，最后导致基因组重排。这种作用与这些转座因子的转座活性无关，而只是由于染色体上有某一转座因子的几份拷贝，于是在同一染色体或不同染色体上有着相同转座因子序列的部位之间发生重组。重组的结果可能会缺失若干个有重要功能
X射线辐照在候选放射抗性基因的作用
用转座子进行全面的基因筛选是系统鉴定抗性基因的新方法。本研究旨在利用该技术鉴定食管鳞状细胞癌中的候选放射抗性基因。转座子是一种碱基序列，可以随机转换到基因组中的另一个位置。通过在转座子中插入巨细胞病毒启动子作为转录激活因子，新位置的下列基因变得过表达，位于转座子插入位点的基因被下调。因此，可以获得使
植物叶绿体基因组可以全部转录的新机制
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能、供给地球上的其它生物能量来源的重要细胞器，对叶绿体的功能和叶绿体基因组转录机制的研究一直以来是全球细胞生物学家、遗传学家和分子生物学家孜孜以求的研究热点。中国科学院昆明植物研究所研究员高立志带领的研究团队，历时五年，通过对三种高等植物（水稻、玉米和拟南芥
研究揭示内源性逆转录病毒序列和功能在物种间的差异进化
近日，中国科学院上海药物研究所研究员陈勋团队联合日本京都大学、加拿大麦吉尔大学科研人员，通过开发基于进化的转座子注释新方法，并结合系统发育分析、大规模平行报告系统及多组学等技术，在单碱基水平上揭示了内源性逆转录病毒序列和功能在不同物种间的差异进化。人体内病毒组包括感染性病毒、整合到人基因组中的外源病
PNAS：sRNA测序揭示杂种优势之谜
Illinois大学的功能基因组学副教授Steve Moose及其团队发现了玉米杂种优势的新因素，即20至25个核苷酸长的双链小RNA分子sRNA。文章发表在6月26日的Proceedings of the National Academy of Science杂志上。 “杂种优势
著名分子遗传学家洪孟民逝世－享年82岁
著名分子遗传学家，中国科学院院士，中国共产党优秀党员，全国先进工作者，中国科学院第六、七届生物学部副主任，中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所研究员洪孟民因病医治无效，于2012年11月13日16时25分在上海市第六人民医院逝世，享年82岁。 洪孟民，1931年1
报道转座子的定义
中文名称报道转座子英文名称reporter transposon定 义在转座子处插入报道基因，如某种抗性基因和酶基因等，作为这段序列是否发生转座的标记。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
报道转座子的定义
中文名称报道转座子英文名称reporter transposon定 义在转座子处插入报道基因,如某种抗性基因和酶基因等,作为这段序列是否发生转座的标记。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
PNAS：衰老过程的罪魁祸首――转座子
多年来，科学家们一直在研究遗传因素对衰老的贡献，但是成果甚少。最近，一项新的研究阐明了转座子在加速衰老过程中的作用。在过去的十年中，科学家们已经开始认识到非编码序列在我们基因组中所起的重要生物作用。一种特别“狡猾”的非编码元件――高度重复的转座子，能将自己插入到我们基因组中任何可访问的部分，从而有可
PNAS发文：多倍体农作物为何具有广泛适应能力
近日，南京农业大学在PNAS上发表了最新研究文章，从DNA甲基化和转录水平揭示了基因组多倍化如何增强水稻在盐胁迫环境中的适应能力。 基因组多倍化（全基因组加倍）在植物的进化过程中普遍发生。许多植物包括重要农作物都是多倍体，如六倍体小麦、四倍体棉花和马铃薯等。虽然水稻、大豆和玉米等作物是二倍体
酵母菌基因组转座子的诱变实验—－小载体聚合酶链反应
实验材料诱变转座子基因组文库质粒DNA试剂、试剂盒锚定囊泡引物1和2 、1 mol L MgCl2、普通小载体（UV)和mTn引物、转座子诱变酵母菌株、合适的限制性内切核酸酶（如AZmI或DraI)和缓冲液、10×T4 DNA连接酶缓冲液、5 mmol L ATP、400 U μL T4 DNA连接
基因组中“暗物质”关键调控机制
中国科学院广州生物医药与健康研究院陈捷凯课题组与南方科技大学Andrew P. Hutchins课题组合作，以小鼠胚胎干细胞为模型，揭示了基因组中转座元件的关键表观遗传调控机制，相关成果以Transposable elements are regulated by context-specif
全基因组扩增实现百分之九十七覆盖率
最新一期《科学》杂志刊登了哈佛大学华人科学家陈崇毅课题组的突破性研究成果：一种名叫“转座子插入线性扩增”（LIANTI）的技术，首次实现了全基因组的线性扩增。陈崇毅博士接受科技日报记者邮件采访时表示，这一全新技术能实现高达 97% 的单细胞基因组覆盖率，准确度超越了目前在用的所有扩增技术。
全基因组扩增实现百分之九十七覆盖率
最新一期《科学》杂志刊登了哈佛大学华人科学家陈崇毅课题组的突破性研究成果：一种名叫“转座子插入线性扩增”（LIANTI）的技术，首次实现了全基因组的线性扩增。陈崇毅博士接受科技日报记者邮件采访时表示，这一全新技术能实现高达97%的单细胞基因组覆盖率，准确度超越了目前在用的所有扩增技术。 多次
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最新一期《科学》杂志刊登了哈佛大学华人科学家陈崇毅课题组的突破性研究成果：一种名叫“转座子插入线性扩增”（LIANTI）的技术，首次实现了全基因组的线性扩增。陈崇毅博士接受科技日报记者邮件采访时表示，这一全新技术能实现高达97%的单细胞基因组覆盖率，准确度超越了目前在用的所有扩增技术。 多次退
中国首发纳米孔RNA直接测序揭示其在全长转录本中的作用
近日发表在RNA Biology上的研究中，来自中国科学院北京生命科学研究院、动物研究所及中国科学院大学等多家单位的科学家们首次通过5’-Cap捕获法对蝗虫的 RNA直接测序，揭示了Piwi 外显子化模式的广泛建立以及蝗虫转录组中的转座子（TEs）对RNA剪接的重要作用。 转座子（TEs）在后
新衰老机制：自私基因加剧炎症以及和衰老相关疾病
衰老影响着每一个生物，但是导致衰老的分子过程仍然是一个有争议的话题。虽然许多因素都促进衰老过程，但动物衰老的一个共同主题是炎症——这可能被一类自私的遗传因子放大。 人类的基因组中到处都是自私的遗传基因，这些重复的基因似乎对宿主没有好处，反而只想通过在宿主基因组中插入新的拷贝来扩增自己。一类被称
Science重磅：全新mRNA递送SEND，开辟分子疗法递送新方法
2020 年初，新冠疫情肆虐全球，各国药企均大力投入疫苗研发，希望及时研发出有效疫苗以阻止疫情扩散，这也让原本还远离大众视线的 RNA 疗法，广为人知。 相比于传统疫苗，RNA 疫苗仿佛是专门为新冠疫情准备的。美国疫苗生产企业 Moderna 在得到新冠病毒基因组序列后，仅用了 4 天，就获得
在生命之初，胚胎中最早的转录因何触发
在一段生命旅程开始之初，精子细胞刺穿卵细胞，它们的遗传物质融合。然而，在之后的一段时间，所获得的DNA一直保持沉默：受精卵或早期胚胎中的基因不被转录。科学家也不清楚，是什么最终启动了这一过程。 最近发表在《Nature Genetics》上的三项研究深入探索了这一过程。研究人员报告了一个基因D
Cell：“垃圾”RNA不垃圾，帮助细胞应对压力
非编码RNA通常因不能编码蛋白质的RNA而被称为“垃圾RNA” ，包括小RNA以及长链RNA。近期，来自于哈佛大学医学院附属麻省总医院（MGH）的研究团队却发现，“垃圾”RNA并不垃圾，它通过与一种负责基因沉默的酶互作，确保应激基因的表达，促使细胞对抗胁迫。 研究人员发现的“垃圾”RNA是B2
单分子测序推动复杂动植物的研究
Pacific Biosciences公司近日风光无限，发布了新系统，带动股价大涨。同时，它的单分子实时（SMRT）测序技术也助力了多个植物和动物基因组的研究。这些成果近期发表在多个期刊上，展现了SMRT测序的独特魅力。 最新一期的《Nature》杂志发表了Oropetium thomaeum
－Nature等三篇论文发布SMRT测序技术新应用成果
Pacific Biosciences公司近日风光无限，发布了新系统，带动股价大涨。同时，它的单分子实时（SMRT）测序技术也助力了多个植物和动物基因组的研究。这些成果近期发表在多个期刊上，展现了SMRT测序的独特魅力。 最新一期的《Nature》杂志发表了Oropetium thomaeum
2023年张锋团队发表4篇Nature，Science及Cell
RNA引导系统利用引导RNA和靶核酸序列之间的互补性来识别遗传元件，在原核生物和真核生物的生物过程中都起着核心作用。例如，原核CRISPR-Cas系统为细菌和古细菌提供了对外来遗传因子的适应性免疫。Cas效应物，如Cas9和Cas12，执行引导RNA依赖的DNA切割。虽然目前已经研究了一些真核生