震惊！肾癌竟然可以从其他细胞偷基因帮助转移
癌症转移（也就是癌细胞从原发灶转移到远端器官）是导致癌症病人死亡的主要原因。由于很少发现转移特异性的驱动突变，因此异常的基因调节可能是转移的原因之一。但是研究人员并不知道转移相关基因调节是如何产生的。图片来源：Medical Research Council 为了解释这个问题，来自剑桥大学等单位的科学家们在Sakari Vanharanta教授的带领下使用肾癌的人源化转移模型，发现了促进转移性肿瘤进展的转录增强子。转移性癌细胞中的特殊增强子和增强子团簇被激活，相关的基因表达模式可以用于预测病人的预后状况。相关研究结果于近日发表在《Cancer Discovery》上，题为“NF-κB–Dependent Lymphoid Enhancer Co-option Promotes Renal Carcinoma Metastasis”。 研究人员发现肾癌转移灶相关的增强子组件由许多共同激活的远端组织特异性增强子模块组成。特别......阅读全文
曹雪涛院士Cancer－Cell揭示癌症转移机制
第二军医大学、中国医学科学院的研究人员证实，肿瘤外泌体RNAs通过激活肺泡上皮TLR3招募中性粒细胞促进了肺转移前微环境形成。这一研究发现发布在8月8日的《癌细胞》（Cancer Cell）杂志上。 我国著名的免疫学家曹雪涛（Xuetao Cao）院士是这篇论文的通讯作者。曹雪涛现任职浙江大学
eRNA与Super－Enhancer－RNA在转录调控中扮演的角色
增强子是真核生物中关键的顺式作用基因调控元件，能有效地促进基因表达。它们可以通过作为转录因子和辅助因子的结合平台来维持转录的精确控制。超级增强子是由一簇典型增强子串联组成的具有更强转录调控能力的顺式元件。而全基因组分析发现增强子和超级增强子可以普遍进行转录，产生eRNA和SE-lncRNA。它们都具
Nature专题：肾癌
肾癌（carcinoma of kidney）又称肾细胞癌，这种疾病无论体积大小，约80%的患者早期可无任何症状，只是在普查和因其他原因作体格检查或B超检查时才被发现其肾脏有占位病变或触摸到腹部包块，因此经常容易被人忽略。 但这种状况近期开始发生好转，研究人员从这种疾病的周遭挖掘到了一些答案，
Genes－－Devel：科学家揭示如何阻断癌细胞的转录？
阐明介导子如何与TFIID串扰促进启动子-增强子之间的交流沟通对于揭示增强子功能的机制非常重要；近日，一篇发表在国际杂志Genes & Development上题为“The Pol II preinitiation complex (PIC) influences Mediator bindin
前列腺癌中转录因子动态平衡机制研究获新成果
近日，山东大学第二医院检验医学中心研究员郭海洋等在Nature Communications发表了文章，报道了转录因子AR和MYC活性的相互平衡对前列腺癌发展的重要作用，并详细揭示了其具体作用机制。 据了解，世界范围内，前列腺癌在男性实体肿瘤中发生率居第二位。雄激
岳峰课题组揭示“增强子劫持/共扩增”在脂肪肉瘤中
脂肪肉瘤（Liposarcoma）是成年人中一种常见的软组织肿瘤， 常常出现在四肢、腹腔和胸腔等部位。这种癌症目前缺乏有效的治疗方法，因此寻找其病因和治疗靶点非常重要。近年来，研究发现脂肪肉瘤中存在巨大染色体以及大量拷贝数变异[1]。然而，这些基因组上的变异与失控的癌基因转录调控有何关联尚不清楚
同种异体活化树突状细胞一线治疗转移性肾癌现强劲疗效
瑞典生物技术公司Immunicum AB近日公布其同种异体树突状细胞（DC）疗法ilixadencel治疗转移性肾细胞癌（mRCC）的II期临床研究MERECA的顶线结果。结果显示，一线治疗中高危mRCC患者时，与肾切除术后服用辉瑞靶向抗癌药索坦（Sutent，通用名：sunitinib，舒尼替
基于八大基因组学数据库－构建迄今最完整的癌症eRNA图谱
增强子RNA（eRNA）是一种从增强子转录的非编码RNA。目前，科学家已经在人类细胞中鉴定出数以万计的eRNA，其中许多都在RNA转录过程中发挥重要作用，以介导靶基因的激活。在人类癌症中，癌基因或致癌信号通路的激活通常引起增强子的激活和eRNA的产生。例如，ESR1的激活可以整体上增加乳腺癌中e
利用CRISPR筛查人类基因组“垃圾”DNA
在几个研究小组正致力将CRISPR/Cas9系统应用于临床的同时，另一些研究团队则在利用这一工具来解决有关生物学的基础问题。近期，荷兰癌症研究所遗传学教授Reuven Agami与和同事们应用CRISPR搜寻了整个基因组中的调控增强子元件。 他们将Cas9核酸酶靶向了从前鉴别出的两个转录因子p
两篇Nature提出癌症干细胞概念新质疑：干细胞与癌症转移
科学家们认为干细胞分裂是肿瘤生长所必需的，癌症干细胞能驱动肿瘤生长与转移，由此提出了将去除癌症干细胞作为癌症治疗的靶标之一。然而这在许多类型的癌症中都还没有找到确凿的实验证据。最新一期（3月29日）Nature杂志中，来自日本和美国的科学家通过靶向去除特殊的干细胞群体，发现了这些干细胞在肿瘤发展
The－scientist为你解读神秘的eRNA
近年来科学家们发现，增强子也常常转录成RNA，不过他们还不能确定这些eRNA有何功能。日前，The scientist杂志刊发文章对这种神秘的eRNA进行了解读。 增强子大约发现于三十五年前，关于这一元件还有许多的未解之谜。与启动子不同的是，增强子能够上调较远距离的基因，这一距离并不一定，不过
生物物理所揭示基因组重复序列Alu调控转录新机制
7月12日，中国科学院生物物理研究所薛愿超团队在《自然》（Nature）上，在线发表了题为Complementary Alu sequences mediate enhancer-promoter selectivity的研究论文。 转录调控在维持细胞功能和正常发育过程中起着关键作用。其中，增
中美科学家用CRISPR制备肾癌模型
转移性肾细胞癌（mRCC）几乎是无法治愈的，是RCC有关的高死亡率的主要原因。Von Hippel Lindau (VHL)是一个肿瘤抑制基因，在大多数的透明细胞RCC（ccRCC）病例中是缺失的。然而，它对于缺氧诱导因子-1α(HIF-1α) 和 -2α (HIF-2α)的调控发挥了什么作用，
Nature：新发现一种食品添加剂会促进癌症恶化
延胡索酸在食品行业中用作酸味剂。而最新在线发表在Nature上的研究却对延胡索酸的使用亮起了警灯。剑桥大学的研究人员证明，在当延胡索酸的代谢产物在遗传形式的肾癌中积累会导致表观基因重编程，驱动癌症。 延胡索酸也称富马酸，在食品行业中用作酸味剂，可用于饮料、水果罐头、腌菜、冰淇淋中。而最新在线发
积极锻炼可降低患肝癌肾癌与乳腺癌等十三种癌症风险
这是我们需要加强锻炼的又一个理由。《美国医学会杂志·内科学卷》16日发表的一项大型研究显示，积极锻炼有可能降低罹患13种癌症的风险，如肝癌、肾癌与乳腺癌。 此前数百项研究已显示，锻炼可以降低结肠癌、乳腺癌、子宫内膜癌的风险。但由于许多研究中的参与人数较少，一直无法得出确定性结论。 在新研究中
重大新进！Sicence：肾癌驱动的一种新蛋展白
在一项新的研究中，来自中国同济大学、复旦大学、美国北卡罗来纳大学、哈佛医学院、德克萨斯大学MD安德森癌症中心、范德堡大学医学中心、新加坡基因组研究所、新加坡细胞与分子生物学研究所、新加坡国立癌症中心和杜克-新加坡国立大学医学院的研究人员发现了一种针对具有一种相同遗传变异的肾癌的潜在治疗靶点。科学
乳腺细胞发育中细胞状态特异性转录因子和细胞谱系关系
乳腺癌是全世界妇女中最常见的癌症，大约每年两百多万女性受其困扰。根据WHO 估计，在所有的女性癌症者中，约15%的死亡与乳腺癌相关。乳腺癌中某些类型至今仍然没有有效治疗方案。乳腺癌中癌细胞的可塑性和组织的异质性是治疗失败的一大原因。不论是乳腺发育过程中的正常乳腺细胞，还是乳腺癌发展过程中的癌细胞
动物棕色脂肪产热研究取得新进展
近日，四川农业大学动物科技学院教授王林杰课题组在Nature旗下期刊《通讯—生物学》（Communications Biology）上发表研究论文。动物棕色脂肪组织（BAT）通过非颤栗性产热调节体温，解偶联蛋白1（UCP1）在这一过程中起着核心作用。但Ucp1上游是否存在功能性增强子，进而调控Ucp
动物棕色脂肪产热研究取得新进展
近日，四川农业大学动物科技学院教授王林杰课题组在Nature旗下期刊《通讯—生物学》（Communications Biology）上发表研究论文。 动物棕色脂肪组织（BAT）通过非颤栗性产热调节体温，解偶联蛋白1（UCP1）在这一过程中起着核心作用。但Ucp1上游是否存在功能性增强子，进而调
Nature子刊表观遗传与癌症存活的关联－5hmC的又一关键作用
――研究人员发现了胶质母细胞瘤基因组中的一种DNA缺陷，这种缺陷与癌症患者存活率密切相关。美国达特茅斯学院Norris Cotton癌症中心的研究人员利用先进的分子生物学和统计学方法，发现了两种不同DNA修饰在胶质母细胞瘤（GBM）组织中重要作用，其中一种特殊的修饰形式：5hmC，与癌症患者存活率密
－3月27日《自然》杂志精选
REST 蛋白可抗神经退化 年龄是神经退化疾病的最大风险因素。但为什么有些人在衰老时认知功能没有变化，而其他人的认知功能则会下降并患阿尔茨海默氏症?在这项研究中，Bruce Yankner及同事发现，在衰老过程中，一种被称为REST (亦称为NRSF)的蛋白在人的皮层和海马体神经元
肿瘤细胞中ecDNA新机制在斯坦福大学致癌基因研究应用1
文章导读eccDNA是染色体外的一种特殊的环状DNA，从它的出现至今已长达数年，但在起初的很长一段时间里并未得到人们的重视。随着高通量技术的发展，eccDNA(extrachromosomal circular DNAs，eccDNAs)作为染色体外的环状DNA的研究也进一步深入。在国际学术
关于增强子的分类介绍
增强子可分为细胞专一性增强子和诱导性增强子两类： ①组织和细胞专一性增强子。许多增强子的增强效应有很高的组织细胞专一性，只有在特定的转录因子(蛋白质)参与下，才能发挥其功能。 ②诱导性增强子。这种增强子的活性通常要有特定的启动子参与。例如，金属硫蛋白基因可以在多种组织细胞中转录，又可受类固醇
概述增强子的特点作用
① 具有远距离效应。 ② 无方向性。 ③ 顺式调节。 ④ 无物种和基因的特异性。 ⑤ 具有组织特异性。 ⑥ 有相位性。 ⑦ 某些增强子可以应答外部信号。 增强子能大大增强启动子的活性。增强子有别于启动子处有两点:[1]增强子对于启动子的位置不固定,而能有很大的变动；[2]它能在两个
增强子捕获的方法特点
中文名称增强子捕获英文名称enhancer trapping定 义用于确定DNA序列中是否包含增强子功能的一项技术。用做检测的载体含有启动子和报道基因可作表达的标记，但缺乏增强子，将拟检测的DNA序列克隆入这种载体的适当位置，导入细胞或个体，从报道基因表达的程度可分析出增强子的存在与否及其强弱。应
增强子的基本分类
增强子可分为细胞专一性增强子和诱导性增强子两类：①组织和细胞专一性增强子。许多增强子的增强效应有很高的组织细胞专一性，只有在特定的转录因子(蛋白质)参与下，才能发挥其功能。②诱导性增强子。这种增强子的活性通常要有特定的启动子参与。例如，金属硫蛋白基因可以在多种组织细胞中转录，又可受类固醇激素、锌、镉
关于增强子的分类介绍
增强子可分为细胞专一性增强子和诱导性增强子两类： ①组织和细胞专一性增强子。许多增强子的增强效应有很高的组织细胞专一性,只有在特定的转录因子(蛋白质)参与下,才能发挥其功能。 ②诱导性增强子。这种增强子的活性通常要有特定的启动子参与。例如,金属硫蛋白基因可以在多种组织细胞中转录,又可受类固醇
关于增强子的作用介绍
增强子具有组织特异性，例如免疫球蛋白基因的增强子只有在B淋巴胞内，活性才最高。除此以外，在胰岛素基因和胰凝乳蛋白酶基因的增强子中都发现了有很强的组织特异性。此外，所有的增强子中均有一段由交替的嘧啶-嘌呤残基组成的DNA，这种DNA极易形成Z-DNA型；故有人认为在形成一小段Z-DNA后，增强子才
关于增强子的特点介绍
① 具有远距离效应。 ② 无方向性。 ③ 顺式调节。 ④ 无物种和基因的特异性。 ⑤ 具有组织特异性。 ⑥ 有相位性。 ⑦ 某些增强子可以应答外部信号。 增强子能大大增强启动子的活性。增强子有别于启动子处有两点:[1]增强子对于启动子的位置不固定，而能有很大的变动；[2]它能在两个
关于增强子序列的简介
增强子是指能使和它连锁的基因转录频率明显增加的DNA序列。作为基因表达的重要调节元件，增强子序列大多为重复序列，一般长约50bp，适合与某些蛋白因子结合。其内部常含有一个核心序列：（G）TGGA/TA/TA/T（G），是产生增强效应时所必需的。 1981年Benerji在SV40DNA中发现一