Nature&Cell两大顶级杂志获表观遗传研究突破
来自美国宾州大学与西北大学的两个研究组，近期分别在Nature和Cell这两大顶级期刊上发表文章，分别取得了表观遗传学核小体研究方面的突破性进展，这两项的关键点都来自其重要的研究新技术――宾州大学的研究人员发展了超高分辨率ChIP-exo技术，而西北大学的研究人员则研发了一种基于改造后组蛋白的化学修饰，来直接绘制核小体中心的方法。 在“Genome-wide Nucleosome Specificity and Directionality of Chromatin Remodelers”文章中，宾州大学首席研究员B. Franklin Pugh教授领导的研究组利用了一种称为核酸外切酶的工具，来去除未有基因调控蛋白结合的DNA序列，从而确定具体的核苷酸序列。 染色体是细胞内携带基因信息的重要构成元件，染色体上特异性蛋白与核小体的结合方式，将能决定是形成大脑细胞，还是肝脏细胞，抑或是癌症细胞，十分重要。然而......阅读全文
单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络，尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin
单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络，尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin
我科学家－揭示哺乳动物胚胎染色体三维结构奥秘
人类DNA如果拉成一条直线，长度大约为2米，但普通细胞核的直径却仅有5微米至10微米。因此，基因组DNA如何合理的折叠存放到细胞核里，是一个非常重要的科学问题。现有研究表明，在细胞核指挥细胞发挥功能的过程中，基因组DNA的三维空间折叠对此起到关键作用。 对于大多数动物包括我们人类来讲，生命起始
北大汤富酬课题组发表单细胞表观多组学测序技术新成果
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
Cell－Res重点论文：单细胞表观多组学测序技术最新突破
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
Cell－Res重点论文：单细胞表观多组学测序技术最新突破
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
Y染色体的染色体结构
Y染色体（Y chromosome）是决定生物个体性别的性染色体的一种。男性的一对性染色体是一条x染色体和一条较小的y染色体。在雄性是异质型的性决定的生物中，雄性所具有的而雌性所没有的那条性染色体叫Y染色体。由于Y染色体传男不传女的特性，因此在Y染色体上留下了基因的族谱，Y-DNA分析现在已应用于家
x染色体的染色体结构
研究确认了X染色体上有1098个蛋白质编码基因，有趣的是，这1098个基因中只有54个在对应的Y染色体上有相应功能的等位基因，而且Y染色体比X染色体小得多。在2003年6月完成的详细分析研究报告中指出Y染色体上仅有大约78个基因，Y染色体甚至被戏称为X染色体的“错误版本”。X染色体中大约有10%的基
研究发布首个高质量染色体水平的哀牢髭蟾参考基因组
哀牢髭蟾（Vibrissaphora ailaonica）[Amphibiaweb（2019），Frost（2019）和中国两栖类（2019）将其归为Leptobrachium ailaonicum的同物异名] 俗称“胡子蛙”、“深山角怪”，属两栖纲、无尾目、角蟾科，是中国特有种。该物种具有多个
用血浆游离DNA全基因组测序对胎儿染色体异常的产前筛查
利用孕妇血浆游离DNA检测胎儿常见染色体非整倍体（21三体、18三体、13三体）的无创产前筛查具有较高的灵敏度和特异性，已经在临床检测中普遍应用。然而，在产前诊断发现的胎儿染色体异常中，21三体、18三体、13三体等常见的染色体非整倍体只是一部分，另外还存在一些相对罕见的胎儿染色体异常。例如，研
天津大学元英进团队首实现对人造环形染色体基因组重排
天津大学合成生物学元英进教授团队首次将自主设计合成的５号酿酒酵母环形染色体进行基因组重排，为探索环形染色体结构变异和功能提供了新的研究思路和模型。１７日，在最新一期上线的国际学术期刊《自然·通讯》上刊载了这一名为《环形５号染色体基因组重排》的论文。图片来源于网络染色体结构变异对生物性状多样性具
揭示麂属动物染色体融合的分子机制及基因组三维构象
麂属动物是鲸偶蹄目、反刍亚目、鹿科、麂亚科下的一类哺乳动物，属内各物种间差异巨大的染色体数目而受到生物学家关注，是研究哺乳动物成种机制和染色体演化的优异模型。小麂、黑麂是我国特有的物种，黑麂和贡山麂是我国重点保护野生动物。黑麂和贡山麂都有8条（雌性）和9条（雄性）染色体，它们的核型却不相同，而小
一个高质量的黄连染色体规模的基因组组装和注释
黄连 (Coptis chinensis Franch.) 是毛茛科的一员，代表了一个重要的早期分叉双子叶植物谱系，具有多种药用价值。 2021年6月2日，湖北省食品药品监督检验研究院聂晶，华中农业大学王学奎，中国中医科学院陈士林及湖北中医药大学Liu Yifei（湖北中医药大学为第一单位）共
解析肿瘤HiC多组学研究策略，IF≥10+文章不是梦！
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-Se
我国科学家揭示哺乳动物胚胎染色体3D结构重编程规律
记者从中国科学院获悉，我国科学家近日在染色体3D结构以及在早期胚胎发育过程中染色体结构的重编程变化方面取得重大科学突破，相关成果于2017年7月13日发表在国际著名期刊《CELL》上。 记者了解到，人类DNA如果拉成一条直线，长度大约是2米，但一般的细胞核的直径却仅有5～10微米左右。因此基因
中科院、上科大：受精卵如何发育成多功能个体
来自中科院北京基因组研究所，上海科技大学的研究人员发表了题为“3D Chromatin Structures of Mature Gametes and Structural Reprogramming during Mammalian Embryogenesis”的文章，揭示了哺乳动物成熟精子
科学家提出深度学习框架用于发现癌症中的新突变
全基因组染色质构象捕获技术（Hi-C技术）已被证明是检测人类基因组中结构变异（SVs）的一种有效方法。然而，目前能够使用Hi-C数据进行全范围检测SVs的算法一直缺乏。目前的方法只能在不太理想的分辨率下，识别染色体间易位和长距离染色体内SVs（>1 Mb）。美国西北大学范伯格医学院研究人员基于深
解析肿瘤HiC多组学研究策略
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S
什么是分辨率,分辨率的发小取决什么
分辨率的定义是：“可疑区分和辨别清的两条直线间的最小距离”，自然，人与设备（例如，显微镜等）的眼睛的分辨率是不同的。人的眼睛的分辨率只有几十微米，而电子显微镜（例如透射电镜）的分辨率可以达到几个纳米，好的可以达到几十个埃。分辨率的大小主要取决于“光”的波长；电子显微镜所用的加速电子的波长（得布罗依波
我国科学家公布世界首个藏羚染色体水平高质量基因组
14日，记者从中国科学院西北高原生物研究所获悉，该研究所张同作研究员联合青海大学魏青副教授等团队，成功组装了藏羚染色体级别的基因组，首次获得藏羚染色体水平的高质量基因组和注释信息，为藏羚的适应进化遗传机制、保护遗传学研究及进一步探索物种迁徙行为的遗传机制提供了重要基因组资源。相关结果发表在《自然》旗
破译农业害虫粘虫染色体级基因组密码：为害虫防治策略升级提供关键助力
研究背景在广袤的农田里，有一种害虫正悄无声息地威胁着农作物的生长，它就是粘虫（Mythimna separata）。粘虫堪称农业界的 “破坏大王”，凭借着强大的迁飞能力和不挑食的习性，所到之处，水稻、玉米、小麦等众多农作物都难逃厄运。在亚洲和澳大利亚的大片农田中，常常能看到它肆虐的身影，给农业生产带
佘群新：真核生物3D基因组揭示更高级的染色体结构
iNature 2019年9月19号，山东大学生物技术研究院佘群新团队在Cell发表了题为Crenarchaeal 3D Genome: A Prototypical Chromosome Architecture for Eukaryotes的评论性文章。在本期Cell中，Takemata等
我国获得国际首个染色体级别的橡胶树GT1参考基因组图谱
记者16日从中国科学院昆明植物研究所获悉，由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队，历经6年，利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术，在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列，并揭示大戟植物基因组的
科学家获取染色体级别的高质量橡胶树参考基因组图谱。
橡胶树（Hevea brasiliensis (Willd. ex A. Juss.) Muell. Arg. ）是大戟科（Euphorbiaceae）植物。在植物界大约2,500种产胶植物中（如杜仲Eucommia ulmoides Oliver和橡胶草 Taraxacum kok-sagh
昆明动物所首个高质量染色体水平的哀牢髭蟾参考基因组
哀牢髭蟾（Vibrissaphora ailaonica）[Amphibiaweb（2019），Frost（2019）和中国两栖类（2019）将其归为Leptobrachium ailaonicum的同物异名] 俗称“胡子蛙”、“深山角怪”，属两栖纲、无尾目、角蟾科，是中国特有种。该物种具有多个
染色体核型分析和基因芯片检查的关系
色体核型分析常规染色体核型分析就是检测人类“生命的天书”中是否存在某些章节“漏印”、“多印”或“错印”，即染色体的数量或结构是否发生改变，从而排除染色体疾病。常见的染色体疾病包括：21三体综合征（即唐氏综合征），18三体综合征，13三体综合征，Turner综合征，Klifelter综合征，染色体易位
荧光原位杂交技术详解
1974年Evans首次将染色体显带技术和染色体原位杂交联合应用，提高了定位的准确性。20世纪70年代后期人们开始探讨荧光标记的原位杂交，即FISH技术。1981年Harper成功地将单拷贝的DNA序列定位到G显带标本上，标志着染色体定位技术取得了重要进展。20世纪90年代，随着人类基因组计划的
分辨率的概念
分辨率，又称解析度、解像度，可以细分为显示分辨率、图像分辨率、打印分辨率和扫描分辨率等。
质谱分辨率
质谱分辨率的定义◇质谱分辨率的物理意义◇单位质量分辨率
Science：中美科学家联手从结构上揭示RSC复合物作用机制
控制染色体结构的细胞机器，比如RSC复合物，在大约五分之一的人类癌症中发生突变。如今，在一项新的研究中，来自中国清华大学、北京大学和美国犹他大学医学院的研究人员首次构建出RSC复合物的高分辨率视觉图，阐明了这种多蛋白机器的工作原理及其在健康细胞和癌细胞中的作用。论文通讯作者为清华大学生命科学学院