水生所完成模式硅藻的蛋白质组精细图谱

硅藻是一类重要的单细胞光合真核生物,分布广泛,提供了地球上约20%的初级生产力,对整个地球生物圈意义重大。三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)是海洋硅藻的模式生物,其基因组序列于2008年公布,但目前基因组的注释仍很不完善。蛋白基因组学(Proteogenomics)是利用蛋白质组学数据,尤其是高精度的串联质谱数据,结合基因组和转录组数据对基因组进行深度注释。中国科学院水生生物研究所研究员葛峰学科组前期采用蛋白基因组学的研究策略和方法,完成了模式蓝细菌的基因组深度解析 (PNAS,2014,111(52):E5633-E5642)并开发了针对原核生物的蛋白基因组学专业分析软件GAPP(Molecular & Cellular Proteomics. 2016;15(11):3529-3539)。在这些工作的基础上,葛峰学科组对三角褐指藻的基因组进行了深度解析并构建了蛋白质组精细图谱。 该......阅读全文

蛋白质组和蛋白质组学分析

 随着人类基因 组计划研究成果的公布,人们对基因的认识逐渐清晰,但基因数量的有限性和基因结构的相对稳定性,与生命现象的复杂性和多样性之间存在巨大反差。如何了解众多的基因与危害人类身心健康的疾病之间的关系,对生命科学研究者来说仍是一项长期而艰巨的任务。因此,作为生命活动的直接承担者――蛋白质,成为后基

蛋白质乙酰化修饰的精细调控

近期,国际著名学术期刊《美国国家科学院院刊》在线发表了中国科学技术大学生命科学学院施蕴渝教授与姚雪彪教授研究组的合作成果,文章标题为EB1 acetylation by P300/CBP-associated factor (PCAF) ensures accurate kinetochore -m

“我国环境放射性水平精细图谱建设”项目规划会召开

  近日,科技部公布了《关于科技基础性工作专项2015年度项目立项的通知》(国科发基〔2015〕123号),中国科学院地球环境研究所研究员侯小琳主持的“我国环境放射性水平精细图谱建设”项目(2015FY110800)获准立项。该项目由地球环境所牵头,合作单位有中国辐射防护研究院、西北核技术研究所和环

蛋白质组与蛋白质组学简介2

3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合,然后将DNA从被修饰的碱基处切割,电泳分离,结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰,不能切断,可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白

蛋白质组与蛋白质组学简介1

一、蛋白质组概念:一个细胞、一个组织或一个机体全部基因所表达的全部蛋白质。 二、蛋白质组学研究范畴 1.蛋白质和蛋白质间 2.蛋白质和核酸之间 3.蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定 4.蛋白质结构分析 5.生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表

全新猕猴脑网络组图谱绘成

作为研究人类认知功能机制和模拟人类脑部疾病的理想模型,猕猴在遗传学、生理学和脑结构上与人类高度相似。记者9日从中国科学院自动化研究所获悉,该所科研人员在猕猴脑部空间组织架构研究方面取得重要突破,绘制出全新的猕猴脑网络组图谱。相关研究成果在线发表于《科学通报》杂志。目前,大量脑科学研究将猕猴等非人灵长

Nature公布大麦基因组图谱

  大麦是世界上最重要的粮食作物之一,17日Nature公布了目前为止最完善的大麦基因组测序图谱。这项由美国农业部主导的大工程,在德国、日本、芬兰、澳大利亚、英国、美国和中国科学家们的共同努力下,历经六年终于取得了重大进展。大麦基因组图谱将成为人们提高大麦产量、增强大麦抗虫抗病能力、增加大麦营养价值

我国学者绘制全球首张精细普通菜豆单倍型图谱

  近日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外6家科研单位对来自19个国家的683份普通菜豆资源的全基因组进行重测序,并在纬度跨度、光照时间长短差异明显的四地(黑龙江哈尔滨、河南南阳、贵州毕节和海南三亚)开展了三年的主要农艺性状的表型鉴定,明确了普通菜豆

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

2025蛋白质组学大会之农业蛋白质组

  2025年10月14日10:10-12:10,由AOHUPO, AOAPO, π-HuB和CNHUPO四会联办的农业蛋白质组分论坛在广州成功举办。论坛由CNHUPO植物蛋白质组工作组和中国遗传学会农业蛋白质组分会负责召集。来自日本福井工业大学、美国密西西比大学、奥地利维也纳大学、武汉大学、中国科

2025蛋白质组学大会之蛋白质组动态

  2025年10月14日14点在广州白云国际会议中心国际会堂珠水厅,第12届AOHUPO大会暨第8届AOAPO大会暨π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会“Proteome Dynamics”分论坛顺利拉开帷幕。本论坛由中国科学院大连化学物理研究所张丽华研究员、南京大学刘

2025蛋白质组学大会之体液蛋白质组

  2025年10月14日,由AOHUPO, AOAPO, π-HuB和CNHUPO四会联办的体液蛋白质组分论坛在广州成功举办。来自北京师范大学、复旦大学、南方医科大学中国医学科学院基础医学研究所、深圳湾实验室、首都医科大学附属北京地坛医院、北京青莲百奥生物科技有限公司、香港科技大学、Nationa

世界首个杜仲全基因组精细图绘出

  记者从位于郑州的中国林科院经济林研究开发中心了解到,该研究中心副主任杜红岩研究员主持的项目“杜仲育种群体建立与综合利用技术研究”取得重大突破,日前通过国家林业局验收。项目选育出的10个杜仲良种通过国家林木良种审定,获得国家发明ZL14项,荣获国家和省部级科技进步奖5项;绘制完成杜仲全基因组精细图

基因组图谱的方法和意义

中文名称基因组图谱英文名称genomic map定  义展示一种生物全基因组结构的图谱。按建立图谱的研究目的方法和精细程度,可以有不同的形式,包括以遗传学方法建立的遗传连锁图谱,按距离绘出基因位置分布的物理图谱,经测定核酸序列建立的核苷酸序列图谱,以及标记出可表达序列的转录图谱等。应用学科生物化学与

首次绘制小麦表观基因组图谱

  最近,英国利物浦大学的科学家们,对小麦中调节基因活性的遗传性分子变化,进行了首次全基因组范围的调查,这可能成为提高作物育种技术的一种新工具。相关研究结果发表在最新一期的《Genome Biology》。延伸阅读:权威期刊发布首个小麦单体型图谱。  表观遗传标记是一种化学标签,将自己附着在DNA上

首个家鸡基因组图谱绘制完成

西南大学教授徐洛浩课题组以中国特有家鸡品系胡须鸡为材料,在国际上率先绘制出首个家鸡全基因组图谱。2月13日,相关研究成果以《家鸡基因组完成图的演化分析》为题,发表在美国《国家科学院院刊》上。这是继去年人类基因组完成图公布以来,首个发表的脊椎动物基因组完成图,也是基因组完成图谱绘制技术首次在经济动物中

揭秘:帝王蟹的基因组图谱

  科学家成功获得高质量帝王蟹基因组图谱   帝王蟹 唐伯平供图  帝王蟹基因组染色体图谱 唐伯平供图  帝王蟹和其他泛甲壳动物的系统演化关系 唐伯平供图  近日,《分子生态资源》发表了首个歪尾类螃蟹的高质量基因组图谱,即一种重要经济蟹类蓝帝王蟹(Paralithodes platypus)的基因组

2025蛋白质组学大会之模式生物蛋白质组

2025年10月13日14:00-16:00,模式生物蛋白质组分论坛成功举办。论坛云集圣保罗大学、中国科学院昆明动物研究所、国家蛋白质科学中心(北京)、中国科学院大连化学物理研究所、湖南师范大学、东北林业大学、南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)、湖北工业大学等10余家国内外高校及科研机构的顶尖专

陈士林课题组完成紫芝基因组精细图-灵芝基因面纱揭开

  灵芝是传统药物中的“四大仙草”之一。2日,记者从中国中医科学院获悉,教育部长江学者创新团队负责人陈士林领导的课题组完成了紫芝基因组精细图,该精细图含有12条染色体,序列总长度达到48.86兆碱基,编码大约1.5万个基因。相关研究成果已发表在自然出版集团旗下期刊《科学报道》上。  课题组研究表明,

2025蛋白质组学大会之蛋白质组学新技术

2025年10月13日上午,蛋白质组学新技术(Emerging proteomics technologies)专题分论坛顺利召开。本场会议由本领域学者陆豪杰教授、王初教授、谭敏佳教授、秦伟捷教授和Yasushi Ishihama教授共同召集和组织。来自海内外的多位知名学者围绕该领域的前沿进展,分享

硅藻为啥擅长“捕光”?

  被称为自然界“奇葩”光合物种的硅藻为什么特别擅长“捕光”?日前,中国科学院植物研究所沈建仁和匡廷云研究团队一项最新研究发现揭示了硅藻的“秘密”——它有高效地捕获和利用光能的独特结构。国际知名学术期刊《科学》在线发表了这一成果。基于该研究,科学家未来有望设计出可以高效“捕光”的新型作物。  几十亿

中科院绘制246个精细亚区的全新人类脑图谱

  中国科学院日前发布消息,该院自动化研究所脑网络组研究中心蒋田仔团队联合国内外其他团队经过6年的努力,成功绘制出全新的人类脑图谱,即脑网络组图谱。  该项研究的最新成果——全脑精细分区图谱及其全脑连接图谱在国际学术期刊《大脑皮层》上在线发表。  中科院自动化所团队突破了100多年来传统脑图谱绘制的

家蚕丝腺单细胞转录组图谱绘成

中新网重庆6月15日电 (记者 钟旖)记者15日从家蚕基因组生物学国家重点实验室(西南大学)获悉,我国家蚕研究又有新进展。该实验室徐汉福教授课题组近日在国际知名期刊Nature Communications《自然通讯》上发表相关主题研究论文,以单细胞分辨率揭示了家蚕丝腺的全细胞异质性及其基因转

玉米基因组更详细图谱出炉

  美国研究人员12日在《自然》杂志网络版上发表论文称,他们利用新一代测序技术对玉米自交系B73进行测序,得到了新的、更详细的基因组图谱。研究显示,玉米具有良好的表型可塑性,不同品系玉米的基因组差异明显。这意味着在全球气候环境变化不断加剧的情况下,玉米仍有巨大的发展空间。  玉米是生物学研究中的重要

小须鲸全基因组图谱获破译

  11月25日,韩国海洋科学技术研究所、深圳华大基因研究院等宣布成功破译了小须鲸全基因组图谱,并对鲸类独特生理习性的遗传学机制进行了分析。相关成果在线发表于《自然—遗传学》杂志。 人们一直痴迷于海洋生物是如何演化为陆生生物的。鲸类的进化却反其道而行之,由陆生向水生演化,和陆生偶蹄动物如牛、猪等

玉米基因组更详细图谱出炉

  美国研究人员12日在《自然》杂志网络版上发表论文称,他们利用新一代测序技术对玉米自交系B73进行测序,得到了新的、更详细的基因组图谱。研究显示,玉米具有良好的表型可塑性,不同品系玉米的基因组差异明显。这意味着在全球气候环境变化不断加剧的情况下,玉米仍有巨大的发展空间。  玉米是生物学研究中的重要

老鼠基因组单体型图谱出炉

美国的研究人员希望通过对15只常用于生物医药研究的小鼠的DNA进行研究来帮助科研人员确定出与环境疾病敏感性相关的基因。目前这些数据被存放在了基因变异数据目录之下,即小鼠基因组单体型图谱(将染色体分隔成许多小的片段),从而帮助研究人员找出小鼠中影响健康和疾病的基因和遗传变异。这个单体型图谱公布在7月2

世界首张人类全面分泌miRNA组图谱

  在一项精心设计的研究中,卢森堡大学的生物学家发现与人们的希望相违,称作为microRNAs的小分子不适合在血液样本中用于早期诊断皮肤癌,并且可能也不适用于其他的癌症类型。他们第一次分析了健康人群血清中所有的microRNAs,提供了第一张全面的人类血液样本“miRNA组”( miRNome)图谱

铁树“开花”:苏铁喜获完整基因组图谱

苏铁基因组图谱研究由来自22个科研机构的65位科学家联合完成。  苏铁目系统发育树支持现存苏铁是在经历大量灭绝以后,几次辐射演化的后代。如今苏铁有2科10属。(刘阳供图)  也许你不熟悉苏铁类植物,但你一定听说过“铁树开花”这个成语,比喻事情很难实现。相传因受苏东坡青睐,铁树得名“苏铁”。作为现存最