Science：开发出一种小到足以移动单链DNA的“分子料斗”
在一项新的研究中，来自英国牛津大学的研究人员构建出一种能够通过蛋白纳米管移动单链DNA的“分子料斗（molecular hopper）”。相关研究结果发表在2018年8月31日的Science期刊上，论文标题为“Directional control of a processive molecular hopper”。论文通信作者为牛津大学化学系教授Hagan Bayley。 这种小型分子料斗的工作原理是按顺序产生和破坏简单的连接到一个纳米级轨道上的化学键。这能够利用较小的电势加以打开、关闭或逆转，从而最终可能让它适合用于纳米孔DNA测序装置中。 Bayley说，“能够控制分子运动是构建纳米级机器的最高目标。能够在精确的化学控制下处理单个DNA分子可能用于替代DNA测序技术中使用的酶，从而提高这些技术的速度和能够并行分析的分子的数量。” 这些研究人员通过产生能够进行亚纳米级跳步（hopping step）的分子而显著推......阅读全文
基于数字PCR的单分子DNA定量技术研究进展（二）
2 qPCR与dPCR比较研究 qPCR是目前DNA定量研究的主要技术，该技术通过在PCR反应体系中加入荧光结合染料(SYBR green I) 或荧光标记的探针( 如TaqMan Probes) ，利用实时积累的荧光信号监测整个扩增过程，最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析，以此来评估
新技术！蛋白DNA交互作用在单分子水平迎来重要突破！
ChIP-seq、ATAC-seq等都是常见的研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具，但这些传统方法都无法获得每一个大片段DNA分子上蛋白结合的真实状态，无法进行DNA复杂结构域蛋白-DNA交互作用的分析，使得蛋白-DNA交互作用在单分子水平的研究受到限制。 近日，华大基因唐冲博士团队在bi
基于数字PCR的单分子DNA定量技术研究进展（一）
摘要 数字PCR是一项针对单分子目标DNA的绝对定量技术。该技术是将含有DNA模板的反应溶液分配到大量独立的反应室中并且发生扩增反应，通过统计反应室中的阳性信号来定量DNA的拷贝数。DNA样品在反应室中随机和独立分布是单分子成功扩增和准确定量D NA拷贝数的关键因素。本文综述了数字PCR的发展历
基于数字PCR的单分子DNA定量技术研究进展（三）
3.2 dPCR在转基因植物检测方面的研究 转基因植物及相关食品的定量分析主要测定转入基因的相对含量。目前常用qPCR作为核酸定量方法。dPCR可以不需要校准物而准确测量低拷贝的DNA分子。Corbisier 等用dPCR分析了提取于MON810玉米种子的外源检测基因和hmg基因的拷贝数，验证了dP
基于数字PCR的单分子DNA定量技术研究进展（四）
NGS 是一种识别和确认未知致病菌的前景广阔的技术，然而其在生物防御和公共健康应用等方面的时效性，却往往因为缺乏快速、有效、可靠的自动DNA样品制备方法而受到限制。为了突破这种限制，Kim 等设计了一种基于流体分布元件的数字微流体(DMF) 平台，使得多子系统模块能够进入自动NGS库样品
双链互补DNA的定义
中文名称双链互补DNA英文名称double-strand cDNA;dscDNA定 义以双链互补DNA为模板合成的双链DNA。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
双链DNA的结构特点
中文名称双链DNA英文名称double-stranded DNA;dsDNA定 义由两条DNA单链通过碱基互补作用而构成的DNA分子。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
DNA双链末端的概念
中文名称平端英文名称blunt end定 义DNA双链末端平齐而无突出单链。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
双链DNA探针标记法
分子生物研究中，最常用的探针即为双链DNA探针，它广泛应用于基因的鉴定、临床诊断等方面。 双链DNA探针的合成方法主要有下列两种:切口平移法和随机引物合成法。 1.切口平移法(nick translation) 当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连
细胞化学词汇双链DNA
中文名称：双链DNA英文名称：double-stranded DNA;dsDNA定 义：由两条DNA单链通过碱基互补作用而构成的DNA分子。应用学科：遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
DNA母链的复制方式
①时期：有丝分裂间期和减数第一次分裂的间期。②场所：主要在细胞核中。③条件：a、模板：亲代DNA的两条母链；b、原料：四种脱氧核苷酸为；c、能量：（ATP）；d、一系列的酶。缺少其中任何一种，DNA复制都无法进行。④过程：a、解旋：首先DNA分子利用细胞提供的能量，在解旋酶的作用下，把两条扭成螺旋的
双链DNA的结构特点
中文名称双链DNA英文名称double-stranded DNA;dsDNA定 义由两条DNA单链通过碱基互补作用而构成的DNA分子。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
从M13噬菌体模板合成固定长度的单链DNA探针
实验材料大肠杆菌 DNA 聚合酶 I Klenow 片段限制性内切核酸酶模板 DNA寡核苷酸引物试剂、试剂盒乙酸铵DTTEDTA乙醇NaCl酚氯仿TBE 电泳缓冲液Tris-ClKlenow 基础缓冲液dNTP 溶液仪器、耗材变性聚丙烯酰胺凝胶或碱性琼脂糖凝胶黏性贴片或磷光黏性贴片Sephadex
从M13噬菌体模板合成固定长度的单链DNA探针
实验材料 大肠杆菌 DNA 聚合酶 I Klenow 片段 限制性内切核酸酶 模板 DNA 寡核苷酸引物 试剂、试
从M13噬菌体模板合成固定长度的单链DNA探针
实验材料 大肠杆菌 DNA 聚合酶 I Klenow 片段限制性内切核酸酶模板 DNA寡核苷酸引物试剂、试剂盒 乙酸铵DTTEDTA乙醇NaCl酚氯仿TBE 电泳缓冲液Tris-ClKlenow 基础缓冲液dNTP 溶液仪器、耗材 变性聚丙烯酰胺凝胶或碱性琼脂糖凝胶黏性贴片或磷光黏性贴片Sephad
抗双链DNA抗体(aniDNA)的简介
抗DNA抗体包括抗双链DNA抗体、抗单链DNA抗体和抗zDNA抗体。 检验中一般是指与双链DNA和单链DNA都反应的抗双链DNA抗体。 抗双链DNA抗体阳性是系统性红斑狼疮的标志，阳性率达90%以上，有较高的特异性，因而抗双链DNA抗体对系统性红斑狼疮的诊断和治疗监控极重要。抗双链DNA抗体在其
活化振动料斗的特点及适用
活化振动料斗可以消除各种物料在料仓内的"起拱"、"架桥"等现象，是破拱、防闭塞设备。 该机运转平稳、噪音低、结构简单、维修方便。 调整激振力可改变流量大小，停止电机振动，料流即停止。 共成系列振动料斗是一种新型的排料设备。 1.jpg 它安装在料仓的下
单原子分子包括哪些
单原子分子通常情况下只有稀有气体单质（目前只有氦（He）、氖（Ne）、氩（Ar）、氪（Kr）、氙（Xe）、氡（Rn），不考虑没有得到聚集形态的118号元素（Uuo），固态非金属及一般金属都不属于单原子分子，但一些金属蒸汽由于原子基本独立存在，可认为是单原子分子，金属是直接由原子构成的，由原子键相
单链构象多态性的应用
单链构象多态性可用于预筛选克隆文库。可对其中的某一个条带进行测序，并与数据库中已知序列比对。
单链构象多态性的原理
单链构象多态性（Single-strand conformation polymorphism，SSCP)分析可以检测DNA序列之间的不同。SSCP首先由Lee 等[9]用于研究自然微生物群体的多样性。在低温条件下，单链DNA呈现一种由内部分子相互作用形成的三维构象，它影响了DNA在非变性凝胶中的迁
单链RNA的基本信息介绍
一般来说生物学家是根据RNA能否直接起mRNA作用而分成正链ssRNA病毒与负链ssRNA病毒两种。 (1)正链RNA病毒（如脊髓灰质炎病毒）的ssRNA可直接起mRNA作用，转译早期蛋白质，包括RNA多聚酶和抑制宿主细胞合成代谢的调控蛋白。然后在RNA多聚酶的作用下，以ssRNA（正链）为模板
PCR单链构象多态性分析
PCR -单链构象多态性分析(PCR -single strand conformation analysis,PCR -SSCP) 是近年来在基因突变检测中运用最广泛的方法之一。PCR -SSCP 技术凭借突变可引起单链DNA三级构象改变,通过观察单链DNA在非变性聚丙烯酰胺凝胶中的迁移率漂移
半制备规模单链RNA纯化（一）
Sean M. McCarthy and Martin GilarWaters Corporation, Milford, MA, U.S.引言寡核苷酸合成是非常高效和高产率的过程。在固相载体上进行寡核苷酸反应的典型产率为每耦合阶98～99.5%。在典型的多阶寡核苷酸合成中，杂质聚集在一起，即使是一
单链构象多态性的原理
单链构象多态性（Single-strand conformation polymorphism，SSCP)分析可以检测DNA序列之间的不同。SSCP首先由Lee 等[9]用于研究自然微生物群体的多样性。在低温条件下，单链DNA呈现一种由内部分子相互作用形成的三维构象，它影响了DNA在非变性凝胶中的迁
半制备规模单链RNA纯化（二）
图2中所示被选中的馏份收集窗表示不同的质量负荷。峰值采集后，样品可以根据需要对等分和干燥，以便长期储存。TEAA的挥发性使离子对缓冲组分的去除非常容易。溶剂蒸发后被纯化的寡核苷酸实际上是不含盐的。 UPLC条件纯化RNA寡核苷酸的纯度通过ACQUITY UPLC系统来验证。如图3所示，我们的纯化方法
PLOS－Genet：单分子测序技术助力原核生物DNA甲基化研究
近日，刊登在国际杂志PLoS Genetics上的一项研究论文中，来自美国能源部联合基因组研究院的研究人员对230种古细菌和细菌基因组进行了测序，旨在研究DNA甲基化在原核生物中所扮演的关键角色。 细胞的表观基因组是基因组DNA特殊剪辑发生改变的一个特殊集合，这些表观基因组的改变会影响基因组的
科学家绘制细胞游离DNA单分子全基因组突变图谱
体细胞突变是肿瘤发生的标志，可用于癌症的无创诊断。美国约翰·霍普金斯大学医学院绘制细胞游离DNA单分子全基因组突变图谱，用于癌症无创检测。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》杂志上，题为：Single-molecule genome-wide mutation profile
我国利用单分子荧光技术揭示DNA三联体两种结构
DNA是生物遗传信息的重要载体，除了经典双螺旋结构外，在真核生物染色体基因调控序列以及端粒中还广泛存在一种G四联体结构。G四联体结构在调控基因表达和维持基因组稳定性等生物学过程中扮演着重要角色。单分子荧光技术是观察与测量生物大分子构象变化的重要手段，非常适合观察G四联体结构的折叠过程。中科院物理
微量热泳动仪MST分析幽门螺杆菌DprA－结合单链DNA结构模型
细菌间的自然转化（NT）是一个复杂的过程，包括结合，吸收，运输和将外源DNA重组到染色体中，因此产生了基因多样性并推进了进化。DNA加工蛋白 A（DprA）几乎存在于所有细菌种类中，其主要参与结合内部单链DNA和在NTs期间促进RecA结合到ssDNA上。这篇文章分别介绍了幽门螺杆菌 DprA蛋白
从M13噬菌体模板合成非固定长度的单链DNA探针
实验方法原理 在合成过程中，低浓度的放射性标记的 dNTP 使探针的长度限制为 200~300 个核苷酸。但是新合成的 DNA 可通过改变投入的模板量和 dNTP 的浓度使其长度为 100~1000 个核苷酸，如此长度范围内的探针适用于大多数杂交实验。实验材料 大肠杆菌 DNA 聚合酶 I Klen