Science：开发出一种小到足以移动单链DNA的“分子料斗”
在一项新的研究中，来自英国牛津大学的研究人员构建出一种能够通过蛋白纳米管移动单链DNA的“分子料斗（molecular hopper）”。相关研究结果发表在2018年8月31日的Science期刊上，论文标题为“Directional control of a processive molecular hopper”。论文通信作者为牛津大学化学系教授Hagan Bayley。 这种小型分子料斗的工作原理是按顺序产生和破坏简单的连接到一个纳米级轨道上的化学键。这能够利用较小的电势加以打开、关闭或逆转，从而最终可能让它适合用于纳米孔DNA测序装置中。 Bayley说，“能够控制分子运动是构建纳米级机器的最高目标。能够在精确的化学控制下处理单个DNA分子可能用于替代DNA测序技术中使用的酶，从而提高这些技术的速度和能够并行分析的分子的数量。” 这些研究人员通过产生能够进行亚纳米级跳步（hopping step）的分子而显著推......阅读全文
我所提出面向糖链的纳米孔单分子分析方法
原文地址：http://www.dicp.cas.cn/xwdt/kyjz/202303/t20230331_6722610.html 近日，我所生物技术研究部生物分离与界面分子机制研究组（1824组）卿光焱研究员团队与本草物质科学研究室中药科学研究中心（2800组）梁鑫淼研究员团队合作，在糖链结
《科学》：新型单分子DNA测序仪研制成功
新发现朝1000美元/人的宏伟基因组测序计划迈近了坚实一步 美国Helicos BioSciences公司研究人员近日称，他们开发出了一种新型的测序设备——单分子DNA测序仪(single-molecule DNA sequencers)。该仪器能够“阅读”单分子DNA的单个碱基。相关研究文章发表
“DNA损伤单分子偏振成像检测装置研制”项目通过验收
12月9日，中国科学院计划财务局组织专家对生态环境研究中心汪海林研究员承担的“DNA损伤单分子偏振成像检测装置研制”项目进行现场验收。验收组专家听取了项目组的工作报告、使用报告、财务报告、测试组的测试报告，现场检查了实验装置的运行情况，审核了相关档案材料，经提问和讨论，验收专家组认
细菌Argonaute蛋白生成和加载DNA引导链的分子机制
近期，《分子细胞》（Molecular Cell）杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所王艳丽课题组及其合作者关于细菌Argonaute（Ago）蛋白独立生成和加载DNA引导链的最新研究成果，题为Autonomous Generation and Loading of DNA Guides by
单链DNA基因组结构揭示了真核病毒的祖先事件
海藻病毒（Marine algae viruses）是控制海洋生态系统中微生物群落的重要组成部分，在病毒进化的早期起着基础性作用。在这里，我们关注的是一个主要的海藻病毒群，单链DNA（ssDNA）病毒Bacilladnaviridae。我们提出了海藻病毒Chaetoceros tenuissimus
单链－cDNA－的合成实验
本方案利用的是总RNA，因为如果使用18SrRNA作内对照，在后续实验中就不能使用带poly(A)的RNA。并且必须用DNA酶处理RNA，以去除所有污染的基因组DNA。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10X
单链构象多态性
单链构象多态性（signle strand conformation polymorphism,SSCP）是指单链DNA由于碱基序列的不同可引起构象差异，这种差异将造成相同或相近长度的单链DNA电泳迁移率不同，从而可用于DNA中单个碱基的替代、微小的缺失或手稿的检测。用SSCP法检查基因突变时，通常
细胞化学词汇单链RNA
中文名称：单链RNA英文名称：single-stranded RNA;ssRNA定 义：只含有一条链的RNA分子。生物体中绝大部分RNA是单链RNA，形成二级结构时，是既有单链、又有双链结构域的RNA分子；只有某些RNA病毒是由两条链互补而成的双链RNA。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科）
单链－cDNA－的合成实验
实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10XRT-PCR 缓冲液（去除 RNA 酶的双蒸水，100 mmol/LTris-HCl、pH8.3，500 mmol/LKC1,15 mmol/LMgCl2)2. 酶和酶缓冲液
单链－cDNA－的合成实验
一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10XRT-PCR 缓冲液（去除 RNA 酶的双蒸水，100 mmol/LTris-HCl、pH8.3，500 mmol/LKC1,15 mmol/LMgCl2)2. 酶和酶缓冲液MMLV 逆转录酶（100~200U/ul)SUPERaseIN
单链RNA的结构特点
中文名称单链RNA英文名称single-stranded RNA;ssRNA定 义只含有一条链的RNA分子。生物体中绝大部分RNA是单链RNA，形成二级结构时，是既有单链、又有双链结构域的RNA分子；只有某些RNA病毒是由两条链互补而成的双链RNA。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与
DNA复制链的延伸
DNA新生链的合成由DNA聚合酶Ⅲ所催化，然而，DNA必须由螺旋酶在复制叉处边移动边解开双链。这样就产生了一种拓扑学上的问题：由于DNA的解链，在DNA双链区势必产生正超螺旋，在环状DNA中更为明显，当达到一定程度后就会造成复制叉难再继续前进，从而终止DNA复制。但是，在细胞内DNA复制不会因出
活化振动料斗的结构特点
活化振动料斗可以消除各种物料在料仓内的"起拱"、"架桥"等现象，是破拱、防闭塞设备。该机运转平稳、噪音低、结构简单、维修方便。 调整激振力可改变流量大小，停止电机振动，料流即停止。 共成系列振动料斗是一种新型的排料设备。它安装在料仓的下部。是避免各种物料在料仓内的“起拱”、
研究揭示Agos蛋白指导导向DNA链切割靶标DNA链的机制
2018年12月27日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志在线发表题为Two symmetric arginine residues play distinct roles in Thermus thermophilus Argonaute DNA guide strand-mediated
细胞用量大幅减少，新技术提升单分子DNA测序水平
美国格拉德斯通研究所团队开发了两种新的单分子分析工具，可将所需的DNA量减少90%至95%。该研究成果发表在最新一期《自然·遗传学》杂志上，展示了这些工具如何帮助科学家解决他们以前无法回答的生物学问题。 单分子分析的黄金标准方法通常需要至少150000个人类细胞，其中包含数百万个单个DNA分子
细胞用量大幅减少，新技术提升单分子DNA测序水平
美国格拉德斯通研究所团队开发了两种新的单分子分析工具，可将所需的DNA量减少90%至95%。该研究成果发表在最新一期《自然·遗传学》杂志上，展示了这些工具如何帮助科学家解决他们以前无法回答的生物学问题。单分子实时测序示意图。图片来源：《自然·遗传学》单分子分析的黄金标准方法通常需要至少150000个
PacBio单分子测序揭示丹参叶绿体DNA修饰的相互作用
2014年6月10日，中科院药用植物研究所（IMPLAD）刘昶团队在《PLOS ONE》杂志上发表了利用PacBio测序技术揭示丹参（Salvia miltiorrhiza）叶绿体DNA修饰之间复杂相互作用的相关文章，该文章报道了丹参叶绿体中编码及非编码RNA的表达情况。这也是国内PacBio第
单分子阀门－实现纳米通道中的单分子流动
科学界设想利用微小的分子作为构建物体的基础元素，类似于我们用机械部件组装东西的方式。然而，挑战在于分子非常小，大约是一个垒球大小的一亿分之一，而且它们在液体中会随机移动，使得控制和操纵它们成为一种单一的形式很困难。为了克服这一障碍，能够通过非常狭窄的通道（尺寸类似于百万分之一根吸管）输送分子的"纳米
抗单链DNA(ssDNA)抗体检测的参考值及临床意义
参考值 正常人：阴性，酶标法 临床意义 抗ssDNA的测定结果缺乏疾病特异性，除SLE患者有较高检出率（50%～60%）外，其他风湿病如混合性结缔组织病（mixel connective tissue disease，MCTD）、药物诱导的狼疮、硬皮病、皮肌炎、干燥综合征，类风湿性关节炎等
单分子荧光检测
单分子检测被称为分析化学的极限，近年来取得了重要进展。其中，单分子荧光分析是实现单分子检测最灵敏的光分析技术。单分子荧光检测的关键在于确保被照射的体积中只有一个分子与激光发生作用以及消除杂质荧光的背景干扰。通常采用高效滤光片，利用共焦、近场合消失波激发，可以达到此目的。单分子荧光检测可提供单分子水平
我国学者揭示Agos蛋白指导导向DNA链切割靶标DNA链机制
近日，《Proceedings of the National Academy of the Sciences of the United States of America，PNAS》杂志在线发表题为“Two symmetric arginine residues play distinct
单链RNA的基本信息
中文名称单链RNA英文名称single-stranded RNA;ssRNA定 义只含有一条链的RNA分子。生物体中绝大部分RNA是单链RNA，形成二级结构时，是既有单链、又有双链结构域的RNA分子；只有某些RNA病毒是由两条链互补而成的双链RNA。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与
单链构象多态性简介
单链构象多态性，在一定条件下， 单链DNA可形成特有的二级结构。不同 DNA链上单个碱基的改变可引起其二级结 构的改变，从而改变DNA链在非变性胶中 的电泳迁移率形成的多态性称作单链构象多 态性。单链DNA片段呈复杂的空间折叠构 象。这种立体结构主要是由其内部碱基配对 等分子内相互作用力来维持的
单链丝状噬菌体展示系统
一、单链丝状噬茁体展示系统 1、pIII展示系统及噬苗体抗体 丝状噬茵体是单链DNA病毒，pIII是病毒的次要外完蛋白（minor coatprotein）、位于病毒颗粒的一端，每个病毒颗粒都有3—5个拷贝pIII蛋白，pIII有两个位点可供外源序列插入，即N端和近N端可伸屈胃内。当抗体片段或蛋
半制备规模单链RNA纯化
寡核苷酸合成是非常高效和高产率的过程。在固相载体上进行寡核苷酸反应的典型产率为每耦合阶98～99.5%。在典型的多阶寡核苷酸合成中，杂质聚集在一起，即使是一般大小的21基体寡核苷酸的总产率也达到67～90%，较长链的寡核苷酸的产率相应较低。研究人员通常需要使用纯度高于初步合成混合物的材料。因此，
半制备规模单链RNA纯化
引言寡核苷酸合成是非常高效和高产率的过程。在固相载体上进行寡核苷酸反应的典型产率为每耦合阶98～99.5%。在典型的多阶寡核苷酸合成中，杂质聚集在一起，即使是一般大小的21基体寡核苷酸的总产率也达到67～90%，较长链的寡核苷酸的产率相应较低。研究人员通常需要使用纯度高于初步合成混合物的材料。因此，
单链突出端的定义
中文名称单链突出端英文名称overhang定 义双链核酸末端带有一个或多个未配对核苷酸的单链部分。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（二级学科）
细菌Argonaute蛋白生成和加载DNA引导链的分子机制被发现
3月2日，《分子细胞》（Molecular Cell）杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所王艳丽课题组及其合作者关于细菌Argonaute（Ago）蛋白独立生成和加载DNA引导链的最新研究成果，题为Autonomous Generation and Loading of DNA Guides
Nature发文：揭秘PARP酶修复癌细胞断裂DNA双链的分子机制
近日，一项刊登在国际杂志Nature上的研究报告中，来自圣犹大儿童医院等机构的科学家们通过研究揭示了PARP酶对双链DNA进行断裂修复的结构，相关研究结果表明，PARP2能填补这一缺口并将两条断裂的DNA端连接在一起。此外，本文研究也深入阐明了PARP激活和催化循环背后的分子机制，这对于后期科学
基于数字PCR的单分子DNA定量技术研究进展（三）
3.2 dPCR在转基因植物检测方面的研究 转基因植物及相关食品的定量分析主要测定转入基因的相对含量。目前常用qPCR作为核酸定量方法。dPCR可以不需要校准物而准确测量低拷贝的DNA分子。Corbisier 等用dPCR分析了提取于MON810玉米种子的外源检测基因和hmg基因的拷贝数，验证了dP