如何选择技术方法来进行单细胞多组学研究

现阶段,科学家们已经开始以单细胞分辨率组合多层信息。这些“多组学”技术可以更仔细地观察细胞之间的可变性,更清楚地识别特定细胞及其功能。分析基因组DNA揭示了单细胞基因组,甲基化组织或染色质,而分析RNA和蛋白质则能分别产生转录组和蛋白质组数据。如何做出选择有了这么多种的检测方法可供选择,研究人员还需要根据他们提出的生物学问题,特定技术的成本,劳动密集程度和技术要求来决定使用哪些检测方法。“通常这需要技术专家团队,计算人员和了解实验系统的生物学家合作才能很好地完成这些类型项目的研究,”Bock说。如何制定技术方案,选择方法取决于很多因素,各种技术的实验指南存在的一大差异是如何从组织中分离单个细胞,口腔移液和连续稀释是相对快速,简便和低成本的方法,可以最大限度地降低RNA或蛋白质降解的风险,但它们通量也相对较低。FACS,机器人操作和微流体是高通量的,但它们很昂贵并且可能在细胞分离上没有那么精细。成本是另一个因素。基于指南和试剂的体......阅读全文

多组学手段揭示苦荞“不怕冷”的奥秘

苦荞       董玉梅摄低温胁迫是影响植物生化、分子、代谢调控的主要环境因素之一。长期在暴露于低温而引导植物胁迫耐受性的提高,即耐寒性或冷驯化。阐明植物对低温响应的分子机制对育种和基因发掘至关重要。有研究表明苦荞可以通过增加花色苷和原花青素的积累增强其耐寒性。苦荞的每个器官几乎都含有芦丁,包括种子

多组学研究助力玉米种质资源创新利用

近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联

多组学研究助力玉米种质资源创新利用

近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联

多组学研究助力玉米种质资源创新利用

  近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。   农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联分析(GWAS)是通过推断

空间多组学质谱技术研讨会(2023)

  空间多组学技术结合了组学技术(如基因组学、转录组学、蛋白质组学、金属组学等)和组织学技术,有助于更好地理解生物体内各种生物分子与金属元素在空间上的分布、相互作用及其对生理功能和疾病发生发展的影响。  质谱成像技术是近年来快速发展的空间多组学技术之一,可以在组织的空间层面上同时测定多种生物分子(如

P4-China-2016多组学与系统生物学论坛

  自从精准医学概念提出以来,它一直都是全球最热的研究领域,政府的大力支持也了推动精准医疗行业的蓬勃发展。对于任意一项划时代的大工程而言,基础科研永远是其第一驱动力。P4 China 2016 多组学与系统生物学论坛,从系统生物学出发,对生物信息学与生命组学技术进行了深入探讨,并分享了科研成果应用于

P4-China-2016多组学与系统生物学论坛

  P4 China 2016国际精准医疗大会将于2016年12月16-18日于北京召开,由中国生物工程学会,上海商图信息咨询有限公司(BMAP)等多家单位联合举办。峰会将会邀请近60位演讲嘉宾,预计近800位精准医疗行业与临床科研资深人士与会。  个体化精准诊疗医学是近年卫生保健领域发展最广泛、最

研究人员建立衰老生物学多组学数据库

  随着人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究成果的不断增多和高通量测序技术的日益发展,衰老相关多组学数据层出叠见。然而,目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。  中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组,与北京基因组研究所(

动物所等建立衰老生物学多组学数据库

  随着人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究成果的不断增多以及高通量测序技术的日益发展,衰老相关多组学数据层出叠见。然而,目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。  中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组,与北京基因组研

科学家合作构建再生生物学多组学数据库

  随着细胞重编程、基因编辑、合成生物学、高通量测序等技术的快速发展,再生生物学进入前所未有的蓬勃发展时期,助力解决组织替代、功能修复、衰老干预、疾病治疗等一系列生命医学领域的重要科学难题。面对科学数据的爆炸式增长,亟需建立以再生生物学为核心的开放数据库,以存储世界范围内的组学研究数据为基础,推动再

研究团队部合作建立衰老生物学多组学数据库

  随全球人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题.近年来,随衰老相关研究成果不断增多及高通量测序技术日益发展,衰老相关多组学数据逐渐增多.然而目前,尚缺乏一个综合性的、整合衰老生物学多组学数据的数据资源库.  中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)研究员鲍一明研

2025蛋白质组学大会之蛋白质组学与多组学的融合

  本次分论坛以“Proteomics Marries Other Omics(蛋白质组学与多组学的融合)”为主题,围绕蛋白质组学在疾病机制研究、代谢重编程、肿瘤学与免疫学中的最新应用展开。会议旨在探讨蛋白质组学与代谢组学、转录组学等多组学技术的深度融合与交叉创新,为精准医学与系统生物学的发展提供新

犬科动物多组学资源库iDog-2.0建立

近日,国家生物信息中心研究员赵文明团队与昆明动物研究所副研究员柳延虎团队合作,发布犬科动物多组学资源库iDog 2.0,提供了更加全面的多组学数据资源及更加丰富的在线分析工具,为全球犬类研究者提供更高质量的数据服务。家犬是自然界中种内遗传多样性最为丰富的物种之一,也是研究人类遗传性疾病的重要动物模型

多组学大数据与医学发展论坛在南宁召开

7月2-3日,多组学大数据与医学发展论坛在广西南宁召开,主题为“多组学大数据促进生物医药创新发展”。论坛围绕基因等多组学大数据整合与标准化、新药靶点挖掘、数据安全与隐私保护,数据可视化与交互、基因大数据伦理与法律问题、医药产业转化等领域的现状与未来发展,展开跨学科学术研讨。论坛坚持学术为本的原则,组

科学家开发出新型空间多组学技术

  5月25日,中国科学院广州生物医药与健康研究院彭广敦课题组在《自然-方法》(Nature methods)上,发表了题为Simultaneous profiling of spatial gene expression and chromatin accessibility during mou

布鲁克质谱:拓展多组学研究边界-推动临床转化

  --布鲁克中国区经理何磊先生专访  分析测试百科网讯,自2017年推出timsTOF以来,布鲁克每年都在为科学家们带来创新的产品,今年六月就推出了第二代timsTOF Pro 2和单细胞蛋白质组研究平台timsTOF SCP。布鲁克质谱中国区业务快速增长,不仅来源于创新的产品,也同中国团队的努力

多组学数据库“齐聚荟”-助力油菜“全能”竞技

油菜产业集观赏、蜜源、生态、经济作物等多种功能于一身,是新兴的“全能选手”。围绕油菜,我国科学家近年来实现了从理论、技术、产品到转化的链式创新,推动了我国油菜基础研究与应用步入世界第一方阵。 然而,如何将基础研究中长期积累的资源和多组学数据优势转化成育种优势,仍是当前乃至未来很长一段时期油

单细胞生物的生物学特征

  第一个单细胞生物出现在35亿年前。单细胞生物在整个动物界中属最低等最原始的动物。包括所有古细菌和真细菌和很多原生生物。根据旧的分类法有很多动物,植物和真菌多是多细胞生物。变形虫算作单细胞动物,它的一些种类却算作粘菌,带鞭毛的鞭毛虫如眼虫有时被归为单细胞藻类或者是单细胞动物。新的分类法中,所有的真

首届单细胞多组学分析技术及应用会议第二轮通知

由北京市科学技术研究院分析测试研究所(北京市理化分析测试中心)、创新方法研究会科学工具专业委员会、分析测试百科网(安特百科(北京)技术发展有限公司)联合主办的“首届单细胞多组学分析技术及应用会议”将于2024年11月27日至30日在北京召开。一、组织机构主办单位北京市科学技术研究院分析测试研究所(北

源星智造获数千万融资,打造单细胞空间多组学工具

  近日,苏州源星智造科技有限公司(简称“源星智造”)宣布完成由险峰旗云领投,尚势资本和长安私人资本跟投的天使轮数千万元融资。本轮融资将助力推进公司终端产品的研发、生产和商业化落地。源星智造落户于苏州工业园区,致力于打造国际领先、国内首创,且拥有自主知识产权的单细胞空间多组学端到端的通用解决方案,以

GCMS+多组学软件包高效开展合成生物学代谢途径分析

 合成生物学领域是备受关注的新兴领域。通过设计和构建新的生物系统,或者改造现有的生物系统,合成生物技术能够实现生物体的功能改造和新功能的创造。合成生物学在医药领域具有巨大的应用潜力。通过合成基因组和基因编辑技术,设计特定的药物合成途径,并改造微生物,使其能够高效地生产药物及中间体。这对于药物开发和生

单链DNA测序技术助力获取游离核酸多组学数据

游离DNA(cfDNA)是指游离在细胞外的DNA,存在于血浆、血清或尿液等体液中。cfDNA的片段组学特征可用于微创、实时、动态地监测生理和病理状态,在肿瘤早筛与复发监测、母婴健康、器官移植、感染疾病等领域具有广阔的应用前景。高通量测序技术是表征cfDNA片段组学特征的主要手段,其中,双链DNA文库

布鲁克公司(BRKR)收购-Biocrates-以扩展多组学解决方案

布鲁克公司(Bruker Corporation,股票代码:BRKR)近日宣布收购总部位于奥地利因斯布鲁克的代谢组学定量分析全球领导者——Biocrates Life Sciences AG。此次交易的财务条款未予披露。这一进展彰显了两家公司对多组学技术的共同热忱。Biocrates长期致力于支持并

中海油田多组学测序分析检测采办计划公告

  中海油田服务股份有限公司多组学测序分析检测采办计划公告,为便于供应商及时了解项目采办信息,现将(多组学测序分析检测)的采办计划公开如下:  本次公开的采办计划是本项目采办工作的初步安排,实际采购应以相关采购公告和采购文件为准,所有提供和反馈的信息只作为项目采办参考。  本次公告有效期是(2023

帕金森病食蟹猴多组学研究获重要进展

广东省科学院动物研究所研究员饶军华团队与江南大学教授陈建欢团队及其合作者,在国家自然科学基金、广东省非人灵长类研究重点实验室等项目的资助下,开展的帕金森病食蟹猴多组学研究取得重要进展。相关成果近日在线发表于《npj 生物膜和微生物组》(npj Biofilms and Microbiomes)。帕金

空间多组学质谱技术-让微观世界更“清晰”

  2023年4月26-27日,由中国科学院高能物理研究所主办,中国科学院高能物理研究所测试中心、中国科学院纳米生物效应与安全性重点实验室、中国科学院-香港大学金属组学与健康和环境联合实验室承办的“空间多组学质谱技术研讨会”及“AFADESI空间代谢组学高级研修班“成功举办。  此次研讨会及研修班邀

空间多组学质谱技术-让微观世界更“清晰”

2023年4月26日,由中国科学院高能物理研究所主办,中国科学院高能物理研究所测试中心、中国科学院纳米生物效应与安全性重点实验室、中国科学院-香港大学金属组学与健康和环境联合实验室承办的“空间多组学质谱技术研讨会”成功举办。此次研讨会邀请了国内外相关领域的专家学者和企业代表共同探讨空间多组学质谱技术

单细胞表观组学:单细胞ChIPseq解码细胞命运决定机制

  在国家重点研发计划“干细胞及转化”重点专项(批准号:2017YFA0103402)等资助下,北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬课题组近期突破单细胞表观遗传研究的瓶颈,开发了两种具有普适性、操作简单、风格迥异的单细胞ChIP-seq技术,可适应于不同课题研究需要,解析发育与疾

机器学习遇到单细胞组学:Perturbation-Modeling

       细胞生物学的相关研究一直受限于数据的完整性和表型的完整性,对应激状态和稳态下的细胞区别观察不够充分。过去五年中,计算机视觉和语音识别领域通过对大量的无标签数据进行学习、建模,很好的解决了数据不足的问题。同样在最近的研究中,机器学习方法使用单细胞数据进行扰动建模也推动了细胞生物领域前进。

多组学技术整合新进展,聚焦慢病诊疗技术突破

 ——功能代谢组学在慢病中的转化应用国际研讨会为深化功能代谢组学与脂质组学技术研究前沿的学术对话,推进多组学技术整合在慢性疾病领域的创新转化,中国科学院大连化学物理研究所于2025年4月25日-27日举办“功能代谢组学在慢病中的转化应用国际研讨会”。会议以“功能代谢组学的技术革新与慢病诊疗转化”为主