如何选择技术方法来进行单细胞多组学研究

现阶段,科学家们已经开始以单细胞分辨率组合多层信息。这些“多组学”技术可以更仔细地观察细胞之间的可变性,更清楚地识别特定细胞及其功能。分析基因组DNA揭示了单细胞基因组,甲基化组织或染色质,而分析RNA和蛋白质则能分别产生转录组和蛋白质组数据。如何做出选择有了这么多种的检测方法可供选择,研究人员还需要根据他们提出的生物学问题,特定技术的成本,劳动密集程度和技术要求来决定使用哪些检测方法。“通常这需要技术专家团队,计算人员和了解实验系统的生物学家合作才能很好地完成这些类型项目的研究,”Bock说。如何制定技术方案,选择方法取决于很多因素,各种技术的实验指南存在的一大差异是如何从组织中分离单个细胞,口腔移液和连续稀释是相对快速,简便和低成本的方法,可以最大限度地降低RNA或蛋白质降解的风险,但它们通量也相对较低。FACS,机器人操作和微流体是高通量的,但它们很昂贵并且可能在细胞分离上没有那么精细。成本是另一个因素。基于指南和试剂的体......阅读全文

科学家发布生物进化与多组学综合分析软件

  随着二代测序成本的不断降低以及三代、四代测序技术的快速发展,越来越多生物物种的全基因组序列被解读出来,多组学数据呈现爆发性增长的态势。然而,数据的高效挖掘和深度解析却是生物学家面临的又一难题。为了解决这一难题,中国科学院上海营养与健康研究所隶属的中科院计算生物学重点实验室和中科院北京基因组研究所

AB-SCIEX携手Illumina创建世界首个多组学云计算平台

  摘要 : 2014年10月13日,中国北京  -生命科学分析仪器技术发展的全球领导者AB SCIEX和Illumina(纳斯达克:ILMN)今天联合宣布双方将针对OneOmics™项目开展独家合作,将基于SWATH™的新一代蛋白质组学(NGP)和新一代测序(NGS)工具在云计算环

总裁视角:见所未见-布鲁克推动多组学和质谱成像革新

——布鲁克生命科学质谱总裁 Rohan Thakur博士专访  多组学是生命科学、转化医学等领域的前沿学科,布鲁克timsTOF自发布以来持续创新,开创了4D-组学、空间定位组学、单细胞蛋白组学等研究领域,获得全球用户的广泛好评,取得了令人瞩目的研究成果。在第70届ASMS大会上,布鲁克隆重发布了t

timsTOF-Pro和PASEF一双慧眼-探究更多组学奥秘

  离子淌度技术发展几十年,布鲁克这个致力于挑战极限的公司,2016年一出手就推出业界最高淌度分辨的timsTOF质谱,在完成硬件的挑战后,布鲁克同德国马普研究所的Matthias Mann合作PASEF技术,于去年HUPO推出了timsTOF Pro,在蛋白质组学领域刷新了“鸟枪”法鉴定的速度、灵

多组学技术整合新进展,聚焦慢病诊疗技术突破

 ——功能代谢组学在慢病中的转化应用国际研讨会为深化功能代谢组学与脂质组学技术研究前沿的学术对话,推进多组学技术整合在慢性疾病领域的创新转化,中国科学院大连化学物理研究所于2025年4月25日-27日举办“功能代谢组学在慢病中的转化应用国际研讨会”。会议以“功能代谢组学的技术革新与慢病诊疗转化”为主

大咖面对面丨金属组学为空间多组学注入元素成像新维度

——专访中国科学院高能物理研究所王萌研究员导语  在生物医学研究领域,“空间组学”如同一把钥匙,正从新的视角揭示生命的奥秘。从基因组、蛋白质组到代谢组,科学家们不断拓展多组学的边界。而中国科学院高能物理研究所王萌研究员及团队,将“空间金属组”作为空间组学的新维度,凭借高灵敏的质谱成像技术,为癌症诊疗

推动学术交流-共话领域未来|首届单细胞多组学分析技术及应用会议通知

  单细胞多组学是指利用高通量测序技术,从基因组、转录组、表观遗传组、蛋白质组、代谢组等多个层面,对单个细胞进行全面的分析,揭示细胞的异质性、功能和相互作用。单细胞多组学技术在癌症、免疫、神经、发育、微生物等领域具有广泛的应用前景,是生命科学研究的前沿领域之一。  为了促进单细胞多组学领域的学术交流

应晓敏/伯晓晨团队开发基于生成式人工智能的新算法MIDAS,实现单细胞多组学数据的马赛克整合

  研究提出了一种用于单细胞多组学数据马赛克整合及知识迁移的计算工具——MIDAS,首次实现了通用的单细胞多组学马赛克数据的模态对齐、数据补全、批次校正等整合功能。  军事医学研究院应晓敏团队和伯晓晨团队在 Nature Biotechnology 期刊发表了题为:Mosaic integratio

Nature最新特刊:关于单细胞生物学

  细胞理论是细胞作为生命基本单位的概念,是生物学的基石。但是,尽管在生物学家的显微镜下观察了近180年,细胞仍然是谜一般的。7月5日的Nature推出了一期关于单细胞生物学的特刊:通过观察细胞,研究人员如何试图了解它们的性质——有多少种不同的存在,它们做什么,以及它们如何随着时间的推移改变。  

当代谢组学技术遇到单细胞测序技术

代谢组的状态是对遗传因素、外部环境和治疗干预等信息的综合反映,因此是一个跟踪和了解上述因素对表型影响的理想研究目标。代谢组可做多种样品类型、结果富含各种信息、可作为连接其他组学数据与表型之间的桥梁。过去20年,组学研究飞速发展,处于中心法则末端的代谢组学虽然起步较晚但是发展很快。很多组学研究目前已进

单细胞分析技术在肿瘤学中的应用

肿瘤异质性研究:通过分析肿瘤组织中的单个癌细胞,揭示不同癌细胞之间的基因表达、突变和蛋白水平的差异,为理解肿瘤的发生、发展和耐药机制提供关键信息。例如,在乳腺癌中,发现某些肿瘤细胞具有特定的基因突变,导致对特定治疗药物产生抗性。肿瘤微环境分析:了解肿瘤细胞与免疫细胞、基质细胞等微环境成分之间的相互作

全球最大规模结直肠癌多组学研究成果发布

肠癌多组学研究成果发布 结直肠癌被称为“沉默杀手”,全球每年结直肠癌新增病例约190万例,发病率居所有癌症第三位。更可怕的是,约20%的患者在确诊时已发生转移,其死亡率更是高居各类癌症第二位。面对这一严重威胁人类生命健康的重大疾病,科学界近期传来好消息——8月7日,中国科学院杭州医学研究所组学与智慧

解析肿瘤HiC多组学研究策略,IF≥10+文章不是梦!

   Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-Se

全球最大规模结直肠癌多组学研究成果发布

  结直肠癌被称为“沉默杀手”,全球每年结直肠癌新增病例约190万例,发病率居所有癌症第三位。更可怕的是,约20%的患者在确诊时已发生转移,其死亡率更是高居各类癌症第二位。  面对这一严重威胁人类生命健康的重大疾病,科学界近期传来好消息——8月7日,中国科学院杭州医学研究所组学与智慧医疗中心联合瑞典

植物多组学数据驱动的上下游调控因子挖掘平台发布

  9月8日,The Plant Journal 期刊在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组搭建的挖掘植物基因及基因组位点上下游调控因子的网络平台,论文题为Plant Regulomics: A Data‐driven Interface for Retrievi

精准医疗大会—聚焦大队列、大数据、多组学技术研究突破

  导读:2018年12月1-2日,北京朗丽兹西山花园酒店,P4 China 第三届国际精准医疗大会将隆重召开!有美中院士领衔的主旨论坛+队列与多组学转化研究论坛+肿瘤精准诊断与用药研究论坛+精准医疗产业技术开发论坛四大细分论坛分别围绕科研转化、应用探索及技术开发进行深入分享与探讨。  届时Illu

多组学挖掘进食DNA硫修饰细菌对线虫寿命的影响

  近日,Nature系列刊物Communications biology在线发表了上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室赵一雷教授研究团队的文章“Phosphorothioate-DNA bacterial diet reduces the ROS levels in C. ele

申小涛等人开发基于微量血样多组学精准健康监测平台

  静脉穿刺取血的成本较高并具有高侵入性,因此在临床或研究中研究血液生物标志物仍然具有很大的挑战性。此外,现有的医疗实践大多是“被动”的,仅基于有限的生理和临床信息,且通常很难做到高频率连续收集,往往只能数月或数年才收集一次。  近日,来自斯坦福大学的研究团队建立了一种从微量取血并从其中采集多组学数

我国科学家利用多组学解析小麦穗器官发育调控网络

近日,中国科学院植物研究所研究员郭自峰团队与合作者,通过多组学整合系统揭示了小麦穗器官发育的关键遗传与代谢调控网络。相关研究成果发表于《植物细胞》(Plant Cell)。小麦穗部的发育是决定籽粒大小和数目等产量性状,其发育调控机制涉及复杂的遗传与代谢过程。长期以来,穗发育过程中基因表达动态、代谢变

全球最大规模结直肠癌多组学研究成果发布

  结直肠癌被称为“沉默杀手”,全球每年结直肠癌新增病例约190万例,发病率居所有癌症第三位。更可怕的是,约20%的患者在确诊时已发生转移,其死亡率更是高居各类癌症第二位。  面对这一严重威胁人类生命健康的重大疾病,科学界近期传来好消息——8月7日,中国科学院杭州医学研究所组学与智慧医疗中心联合瑞典

中国科学家绘制全球最“毒”乳腺癌多组学图谱

  3月8日,国际妇女节。  当天凌晨,国际肿瘤学顶尖期刊《癌细胞》发表了中国科学家完成的一项重要研究成果。  由复旦大学附属肿瘤医院大外科主任兼乳腺外科主任、复旦大学肿瘤研究所所长邵志敏教授领衔的,包括复旦大学附属肿瘤医院精准肿瘤中心执行主任、上海科学院国家人类基因组南方研究中心黄薇研究员团队、复

SCIEX“携手”中科新生命-布局精准医疗和创新多组学合作

  分析测试百科网讯 2019年12月3日,SCIEX中国和上海中科新生命生物科技有限公司(以下简称“中科新生命”)“精准医疗及创新多组学战略合作”签约仪式在上海举办。本次战略合作是基于中科新生命在蛋白组学、代谢组学等多组学领域的多年项目服务经验和SCIEX中国在质谱技术、产品、研发优势相结合,加速

中科新生命—多组学质谱解决方案领航者

  上海中科新生命是一家以质谱技术为核心的技术服务提供商,业务部门涵盖生物医学、科研服务、临床检测三大方向。在本次细胞生物学年会展会上,中科新生命紧跟会议的主题,包括细胞代谢与疾病,细胞组学数据与人工智能等,围绕这些研究热点,本次展会推出的重磅新品,以系统生物学为主题的多组学联合分析解决策略,代表性

质谱前沿技术与多组学交叉研讨会-会议通知

  基于质谱技术的蛋白组学、代谢组学及脂质组学飞速发展,广泛应用于生命科学研究领域的各个方面,包括生命过程解析、疾病机理、药物研发、食品安全、环境暴露等。近些年,以高通量、高灵敏度、高重现性等为特点的多组学新技术、新方法、新装备层出不穷,推动组学研究进入“工业化”和“规模化”,为生命过程的解析、模拟

头脑风暴-NCASI-2024“质谱多组学和空间成像”分享科研前沿

  2024年11月9日-11日,由中国分析测试协会主办,四川大学承办,四川省分析测试学会协办的“首届分析科学与仪器大会(NCASI 2024)”在成都举办。本届大会的主题是“分析科学,创造未来”,聚焦产业发展、协同创新和技术革新三大篇章,围绕分析科学与仪器领域的发展,针对多个热点问题设置大会报告、

大规模设备更新专题系列研讨会-|-探索多组学的奥义

从 2012 年以来,含有多组学数据的文献数量逐年高双位数增长,彰显了多组学领域的研究正在迅速增加。多组学在生命科学研究领域的应用不仅推动了生物研究的深入发展,也为医学诊断和治疗提供了重要支持。随着技术的不断进步和应用的不断拓展,多组学将在未来生命科学研究中发挥更加重要的作用。同时细胞分析技术的不断

Urimarker-2020线上会议第二弹:探讨多组学方法与应用

  2020年5月15日-17日,第二届尿液生物标志物网络研讨会(Urimarker 2020)线上直播召开。Urimarker 2020由北京师范大学与分析测试百科网联合主办,基因工程药物及生物技术北京市重点实验室、中国医学科学院基础医学研究所协办,北京师范大学生命科学学院承办。分析测试百科网全程

空间多组学技术对阐明药用植物合成途径起推进作用

陕西省西安植物园资源植物功能基因挖掘与应用团队探讨了空间多组学技术的应用对进一步阐明红豆杉、长春花等药用植物天然产物合成途径的推进作用,并系统阐明了细胞水平合成通路的解析作为合成生物学的蓝图扮演的重要角色以及未来工业化进程中面临的挑战,近日相关研究内容受邀发表在Trends in Plant Sci

中科生信云平台发布-全国多组学技术应用高端论坛召开

  分析测试百科网讯 2019年8月8日,由上海中科新生命生物科技有限公司主办的“第一届全国多组学技术及应用高端论坛暨中科新生命生信培训班”在上海举行。本次论坛展示了蛋白质组和代谢组在多组学和生命大数据背景下的最新研究进展,促进行业内各研究领域的交流与合作,加强行业信息资源的共享与成果转化,邀请了各