吉大校友《PNAS》文章解析蛋白折叠新理论
来自巴西圣保罗州立大学(UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA),美国纽约州立石溪大学(Stony Brook University),以及中科院长春应用化学研究所电分析化学国家重点实验室(State Key Laboratory of Electroanalytical Chemistry)的研究人员在之前研究的基础上发现了扩散diffusion在蛋白折叠动力学方面的重要作用,这修改了经典的转换状态理论,也为进一步了解折叠机制,更加完善定量经典转换状态理论提供了重要依据。这一研究成果公布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。 文章的通讯作者是来自以上三所机构的王进博士(Jin Wang,音译),其早年毕业于吉林大学,目前任吉林大学副教授(具体简介见后)。 原文检索:Published online before print September 5, 2007Proc. Natl. Acad. ......阅读全文
植物蛋白质氧化折叠研究中进展
二硫键的形成对于真核生物的分泌蛋白和质膜蛋白在内质网中的折叠十分重要。在动物和酵母中,内质网氧化还原蛋白oxidoreductin-1 (Ero1) 是二硫键的主要供体,将二硫键通过蛋白质二硫键异构酶(PDI)传递给底物蛋白。前期,中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心研究员吕东平研究
科学家揭示蛋白质折叠构象过程
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/5/523020.shtm据发表在20日《美国国家科学院院刊》上的一项最新研究,美国科学家通过将数据转换为声音,揭示了氢键是如何在极短时间内促成蛋白质构象,并将氨基酸转化为功能性折叠蛋白质的过程,为研究蛋白质从
科学家揭示蛋白质折叠构象过程
据发表在20日《美国国家科学院院刊》上的一项最新研究,美国科学家通过将数据转换为声音,揭示了氢键是如何在极短时间内促成蛋白质构象,并将氨基酸转化为功能性折叠蛋白质的过程,为研究蛋白质从未折叠状态到折叠状态时发生的氢键事件序列提供了独特视角。 为更好了解蛋白质折叠是如何进行的,科学家必须首先确定
蛋白质折叠的拼版模型的介绍
此模型[9]的中心思想就是多肽链可以沿多条不同的途径进行折叠,在沿每条途径折叠的过程中都是天然结构越来越多,最终都能形成天然构象,而且沿每条途径的折叠速度都较快,与单一途径折叠方式相比,多肽链速度较快,另一方面,外界生理生化环境的微小变化或突变等因素可能会给单一折叠途径造成较大的影响,而对具有多
包涵体蛋白溶解后的重折叠实验(三)
5. 高 分 辨 率 的 离 子 交 换 层 析蛋白质经过重折叠和过滤后,最后一步的高分辨率离子交换层析柱用于完成 下 面 5项重要工作。⑴ 浓 缩 蛋 白 质 ( 如 从 600 m L 浓 缩 到 4〜 8 m L )(2) 去除变性剂(在流穿液中)(3) 去除次要的杂质(在流穿液中,或是与
包涵体蛋白溶解后的重折叠实验(二)
二、对该常规操作流程的评论1. 大肠杆菌中重组蛋白的过表达获得高水平表达与重折叠是不同的主题,在此不会进一步讨论(可见本部分的第12章 )。许多系统可以获得占总细胞蛋白质1 0 % 〜4 0 % 的目标蛋白质表达水平(Mak r i d e s,1996; M u r b y et al.,
内质网的未折叠蛋白应答反应URP
哺乳动物细胞内有3种ER跨膜蛋白,它们分别是需要肌醇酶1(IRE1)、PKR类似的内质网激酶(PEKR)、活性转录因子6(ATF6),它们在URP途径中共同协作完成反应过程。它们在正常条件下均与调控蛋白Bip/GRP78(以下以Bip举例)形成稳定复合物,在内质网蛋白质异常过度堆积后,它们与Bi
科学家揭示蛋白质折叠构象过程
据发表在20日《美国国家科学院院刊》上的一项最新研究,美国科学家通过将数据转换为声音,揭示了氢键是如何在极短时间内促成蛋白质构象,并将氨基酸转化为功能性折叠蛋白质的过程,为研究蛋白质从未折叠状态到折叠状态时发生的氢键事件序列提供了独特视角。为更好了解蛋白质折叠是如何进行的,科学家必须首先确定一串氨基
包涵体蛋白溶解后的重折叠实验(一)
一、常规操作方案下面这个典型流程对许多蛋白质都有很好的效果。本 操 作 方 案 是 根 据 N g u y e n 等(1993)首先开发的方案改编而成,并用于冷泉港蛋白质纯化与鉴定课程的不溶性重组蛋白纯化部分(Burgess and K n u t h , 1996)。其他类似的流程也
未折叠蛋白反应对健康和疾病的控制
过筛选工具、现有治疗手段和可能的药物开发途径积累信息是实施临床研究和临床试验设计的基础。2017年8月号《SLAS Discovery》(原《生物分子筛选杂志》)发表的一篇最新综述中,法国国家健康与医学研究院U1242(法国雷恩)的Eric Chevet博士等人撰文分析了最近的文献,并回顾了未折
关于促进扩散的通道蛋白的介绍
通道蛋白(channel protein)是横跨质膜的亲水性通道,允许适当大小的离子顺浓度梯度通过,故又称离子通道。有些通道蛋白形成的通道通常处于开放状态,如钾泄漏通道,允许钾离子不断外流。有些通道蛋白平时处于关闭状态,即“门”不是连续开放的,仅在特定刺激下才打开,而且是瞬时开放瞬时关闭,在几毫
建机制应诉求-湖南依托“校友圈”撬动“校友经济”
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/511113.shtm10月26日,湖南省商务厅在长沙召开“汇聚校友资源 助推湖南经济发展”座谈会,湖南省商务厅厅长沈裕谋表示,为更好汇聚校友资源,发挥校友会在助推现代化新湖南建设中的作用,省商务厅将成立
PNAS:新型RNA纳米颗粒疗法或能阻断人类多发骨髓瘤扩散
多发性骨髓瘤是一种无法治愈的骨髓癌症,其每年会引发超过10万人发生死亡,这种疾病以其快速和致命的扩散而闻名,其是目前科学家们所面临的最具挑战性的疾病之一;当癌细胞在机体不同的部位发生移动时,其就会发生变异,从而超越可能的治疗方法,被诊断为对化疗耐受的严重多发性骨髓瘤患者通常仅能存活3-6个月,目前科
《PNAS》八大热点关注文章
《PNAS》(美国国家科学院院刊)是与Nature、Science齐名,被引用次数最多的综合学科文献之一,PNAS收录的文献涵盖生物、物理和社会科学,主要内容包括具有高水平的前沿研究报告、学术评论、学科回顾及前瞻、学术论文以及美国国家科学学会学术动态的报道和出版。近期其最受关注的文章(生物类)如
PNAS:解析触发阿尔茨海默症的分子过程
科学家们确定了触发阿尔茨海默症的分子机制,他们发现当一种蛋白分子的基本结构发生改变时,会引起连锁反应,最终导致大脑神经元死亡。 剑桥大学教授Christopher Dobson及其同事长期从事阿尔茨海默症研究,主要研究发生异常的β淀粉样蛋白,这种蛋白被认为是阿尔茨海默症等神经退行性疾病
PNAS:蛋白错误定位导致溶酶体缺陷
为了保持健康,机体中的细胞必须正确经营自己的废料回收中心——溶酶体。人们发现,溶酶体出现问题与多种疾病有关。 华盛顿大学医学院的科学家们发现,磷酸转移酶的错误定位会导致一种溶酶体贮积病(粘脂贮积症III型),文章发表在美国国家科学院院刊PNAS杂志上。这种罕见的疾病会引起骨骼和心脏异常,缩
PNAS:解析形成记忆的热点蛋白
纽约大学与加州大学的神经科学家发现了在短期、中期和长期记忆形成过程中分子活性的时空差异,文章将发表在美国国家科学院院刊PNAS杂志上。该研究增加了人们对记忆形成过程分子机制的理解,并为治疗相关疾病提供了路线图。 “我们的研究能够帮助人们更深入的了解记忆的形成,”领导该研究团队的纽约大学神经
PNAS:细胞纤毛生长的关键蛋白
细胞表面存在微小而关键的毛发状结构,这一结构被称为纤毛(cilia)。日前,宾州大学和加州大学的研究团队鉴定了纤毛生长所需的关键蛋白,文章于一月二十七日发表在美国国家科学院院刊PNAS杂志上。这一发现对人类健康有重要的启示,因为缺乏纤毛会导致严重的疾病,例如多囊肾病、失明和神经学疾病。 “
华裔博士PNAS解析重要表面蛋白
来自哈佛医学院,波士顿儿童医院的研究人员发表了题为“Shape change in the receptor for gliding motility in Plasmodium sporozoites”的文章,完成了疟疾发生的重要表面蛋白的结构测定,并从中获得了功能启示。这项研究发表在
《科学》:机械应力成为打开蛋白折叠的新方法
在一项最新的研究中,美国科学家利用机械应力,成功打开了细胞骨架蛋白(Cytoskeletal proteins)的折叠(protein folding,简单说来,蛋白折叠就是肽链形成各种空间蛋白结构的过程)结构。这一结果加深了科学家对细胞行为的理解,并有望为药物开发提供新的标靶。相关论文发表在8月3
关于蛋白质折叠的格点模型的介绍
格点模型(也简称HP模型),最早是由Dill等人1989年提出的。格点模型可分为二维模型和三维模型两类。二维格点模型就是在平面空间中产生正交的单位长度的网格,每个氨基酸分子按在序列中排序的先后顺序依次放置到这些网格交叉点上,在序列中相邻的氨基酸分子放置在格点中时也必须相邻,即相邻氨基酸分子在格点
JBC:分子伴侣帮助蛋白质折叠的分子机理
分子伴侣是一种协助蛋白质进行折叠的分子助手,其中一种伴侣分子是所谓的热激蛋白60(Hsp60),这种蛋白可以在线粒体中形成一种类似于“桶状”的结构,从而便于蛋白折叠过程的发生,近日刊登于the Journal of Biological Chemistry上的一篇研究论文中,来自弗莱堡大学的研究
“阿尔法折叠”首次大规模纳入蛋白结构预测数据
人工智能(AI)蛋白质结构预测工具“阿尔法折叠”迎来重要升级。17日最新发布的“阿尔法折叠”数据集首次大规模纳入蛋白质复合物结构预测数据,数百万个由AI预测的蛋白质复合物结构向全球科研人员开放。这一成果由欧洲分子生物学实验室的欧洲生物信息学研究所、谷歌旗下“深度思维”公司、英伟达和韩国首尔大学四方合
滕吉文院士:地震预测存在三大困难
中国科学与人文论坛聚焦汶川大地震 中国科学与人文论坛第71~74场主题报告会于5月24日~25日在人民大会堂举行。本次论坛由中国科学院研究生院、高等教育出版社共同主办。报告会聚焦汶川大地震,中国科学院滕吉文、崔鹏、葛全胜、倪四道4位专家从不同角度对地震发生的成因、地震灾害的预警及快速评估进行了深入
吉大·小天鹅积极支援青海玉树抗震救灾
2010年4月14日7时49分,一场突如其来的大地震袭击了青海省玉树藏族自治州,瞬间,州政府所在地90%的房屋倒塌、全州上千人遇难。人们刚刚从汶川地震中平复的心又再一次被唤醒,军队及社会各界、各族群众纷纷采取各种方式投入到抗震救灾的斗争中。地震牵动者全国人民的心,更牵动着长春吉大•小天
β折叠的定义
在β折叠中,两条以上氨基酸链(肽链),或同一条肽链之间的不同部分形成平行或反平行排列,成为“股”。
β折叠的作用
能形成β折叠的氨基酸残基一般不大,而且不带同种电荷,这样有利于多肽链的伸展,如甘氨酸、丙氨酸在β折叠中出现的几率最高。免疫球蛋白有大量的β折叠层。另一种常见的蛋白质模序是α螺旋和三种不同的β转角。不属于一个模序的蛋白质一级结构部分被称之为不规则螺旋。这些部分对蛋白质的空间构象非常重要。
链折叠性质
链折叠现象对结晶聚合物的行为非常重要,因而必须仔细考察链折叠结晶的情况。首先,一般认为,在许多聚合物中,链折叠没有多大的困难。对聚合物分予模型的麦察表明,大多数聚合物分子都会折叠起来,比较容易形成一种很致密的足以嵌砌到晶体表面的折叠,但是,化学结构比较复杂的聚合物,如主链上有庞大侧基或环以及分子链为
β折叠的结构
肽平面之间呈手风琴状折叠,股与股之间会通过氢键固定,但氢键主要在股间而不是股内。氨基酸残基的R侧链分布在片层的上下。β折叠层并不是平的,因为侧链的存在使得它看上去像手风琴一样波纹起伏。这样每一股会更紧密排列,氢键更容易建立。氢键的距离为7埃。在蛋白质结构中β折叠通常会用箭头表示。肽链的氮端在同侧为顺
β折叠的结构
肽平面之间呈手风琴状折叠,股与股之间会通过氢键固定,但氢键主要在股间而不是股内。氨基酸残基的R侧链分布在片层的上下。β折叠层并不是平的,因为侧链的存在使得它看上去像手风琴一样波纹起伏。(英语pleated)这样每一股会更紧密排列,氢键更容易建立。氢键的距离为7埃。在蛋白质结构中β折叠通常会用箭头表示