llumina宣布推出新型基因分型芯片|支持AllofUs研究计划
2018年12月6日,来自圣迭戈的消息——Illumina公司(纳斯达克股票代码:ILMN)今天宣布推出新型高密度基因分型芯片Infinium™ Global Diversity Array。这款芯片设计源于All of Us研究计划,专为其开发。All of Us研究计划是一个具有历史意义的项目,旨在收集生活在美国的100万或更多人的数据,加快人类疾病研究步伐并改善健康状况。All of Us研究计划是美国有史以来最雄心勃勃的生物医学研究项目之一,其目标在于建立一个至少有100万社会各界人士参与的全国性社群,包括历史上在研究中代表性不足的群体。 9月,All of Us研究计划向全国三个基因组中心共计拨出2860万美元的资金。三个中心将从计划参与者提供的生物样本中生成基因组数据。最终,这些信息将成为该计划精准医学研究平台的重要组成部分,该平台是一项国家资源,为各种重要健康问题的研究提供支持。All of Us研究计划由隶......阅读全文
SLAFseq技术:大规模基因分型高通量策略
大规模基因分型在遗传相关性研究中起着重要作用,尤其是和高通量测序技术结合后,它为基因挖掘带来了新的机遇。大规模基因分型的有效解决方法:SLAF-seq(specific-locus amplified fragment sequencing),该技术前期利用生物信息学方法,对目标物种的参考基因组(
法医基因分型鉴定分析遭质疑,亲属表示不满担忧
一项新的研究对法医分析中使用的基因区域不揭示医学信息的假设提出了质疑。 在美国,法医基因分型鉴定分析依赖于 20 个高度多态性短串联重复序列 (STR) 的基因分型,称为组合 DNA 索引系统 (CODIS) 核心基因座。 1998 年联邦调查局选择了这些 STR 中的 13 个,因为它们易于
利用Axiom基因分型方案开展人类遗传学研究
Affymetrix的Axiom® 基因分型方案是一个创新的基因分型技术平台,它通过灵活的芯片选择、可靠的分析和GeneTitan® 多通道仪器上无需动手的自动化芯片处理实现了优化的人类遗传学流程。 如今,科学家常常通过新一代测序来发现基因组中的新颖变异
SNP基因分型(SNP-genotyping)的几个常用数据库
做SNP genotyping应该常看的几个database:1. NCBI dbSNP从这里出发可以连到下面几个网站。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=snp2. International HapMap ProjectThe Int
紧凑型索特TD2250.1US超声波测厚仪测量步骤
1 测量准备将探头插头插入主机探头插座中,按ON键开机,全屏幕显示数秒后显示声速,如下图所示。此时可开始测量。2 校准在每次更换探头、更换电池及环境温度变化较大时应进行校准。此步骤对保证测量准确度十分关键。如有必要,可重复多次。按 ZERO 键,进入校准状态,屏幕显示:在随机试块上涂耦合剂,将探头与
基因芯片技术在肾移植组织配型中的应用
为了比较基因芯片和特异性聚合酶链反应(PCR-SSP)两种HLA-DR分型方法,探讨适用于肾移植供、受者分型的新方法。研究者对60份肾移植供、受者的DNA样本同时采用基因芯片和PCR-SSP进行HLA-DR分型,并进行分析比较。结果60例样本的两种分型方法结果完全一致56份,相同率达93%。结果不相
基因芯片-原理
基因芯片(gene chip)的原型是80年代中期提出的。基因芯片的测序原理是杂交测序方法,即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法,可以基因芯片的测序原理用图11-5-1来说明。在一块基片表面固定了序列已知的八核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG,与
基因芯片-简介
随着人类基因组(测序)计划( Human genome project )的逐步实施以及分子生物学相关学科的迅猛发展,越来越多的动植物、微生物基因组序列得以测定,基因序列数据正在以前所未有的速度迅速增长。然而 , 怎样去研究如此众多基因在生命过程中所担负的功能就成了全世界生命科学工作者共
基因芯片概念
基因芯片(又称 DNA 芯片、生物芯片)技术就是顺应这一科学发展要求的产物,它的出现为解决此类问题提供了光辉的前景。该技术系指将大量(通常每平方厘米点阵密度高于 400 )探针分子固定于支持物上后与标记的样品分子进行杂交,通过检测每个探针分子的杂交信号强度进而获取样品分子的数量和序列信息。通俗地说,
基因芯片简介
随着人类基因组(测序)计划(Human genome project)的逐步实施以及分子生物学相关学科的迅猛发展,越来越多的动植物、微生物基因组序列得以测定,基因序列数据正在以前所未有的速度迅速增长。然而,怎样去研究如此众多基因在生命过程中所担负的功能就成了全世界生命科学工作者共同的课题。为此,建立
HLA分型的方法
①淋巴细胞毒试验:为HLA抗原分型常用方法。原理:淋巴细胞膜上的HLA抗原与相应抗体结合后,在补体作用下,细胞膜损伤,细胞溶解破裂被染色,计算显微镜下观察着色细胞的百分率(>20%为阳性反应)。Ⅰ类抗原分型时可用T淋巴细胞或外周血淋巴细胞;进行Ⅱ类抗原分型时需用B淋巴细胞。②混合淋巴细胞培养试验:多
痤疮分型论治
痤疮是一种毛囊、皮脂腺的慢性炎症,好发于面部,前胸,背部,可形成黑头粉刺,丘疹,脓疱,结节,囊肿等为特点的损害,中医认为本病病机为肺经血热,属于中医“肺风粉刺”范畴。根据临床症状可以分为肺胃血热、湿阻血瘀、湿热内毒、冲任失调四型,笔者分型论治取得良好的效果。 肺胃血热型 症见
HLA的分型方法
HLA的分型方法是检验主管技师考试要求掌握的内容,医学教育网搜集整理相关内容供大家参考。 1.淋巴细胞毒试验:为HLA抗原分型常用方法。原理:淋巴细胞膜上的HLA抗原与相应抗体结合后,在补体作用下,细胞膜损伤,细胞溶解破裂被染色,计算显微镜下观察着色细胞的百分率(>20%为阳性反应)。Ⅰ类抗原
辨证分型诊治崩漏
妇女不在行经期间,阴道突然大量出血,或淋漓下血不断者,称为“崩漏”,前者称为“崩中”,后者称为“漏下”。 一、崩漏的中医辨证分型诊断: 1.肾虚型: 主症:经血非时而下,出血量多,淋漓不尽,色淡质稀,腰痛如折,畏寒肢冷,小便清长,大便溏薄,面色晦暗,舌淡黯,苔薄白,脉沉弱;病位
布鲁氏菌的细菌分型
1985年,世界卫生组织(WHO)布鲁氏菌病专家委员会,把布鲁氏菌属分为6个种19个型,即羊种布鲁氏杆菌(3个型)、牛种布鲁氏杆菌(8个型)、猪种布鲁氏杆菌(5个型)、绵羊附睾种布鲁氏杆菌(1个型)、沙漠森林野鼠种布鲁氏杆菌(1个型)和狗种布鲁氏杆菌(1个型)。对人致病的是猪、牛、羊、狗4个种,
支原体分型试验
1、材料Dienes染色液,1.5%毛地黄皂苷液。2、方法(1)Dienes菌落染色:Dienes染色液是将2.5g亚甲蓝、1.5g天青II、10g麦芽糖、0.5g碳酸钠溶于100ml蒸馏水中。染色时直接吸入染色液覆盖菌落上1min左右,用生理盐水洗去染色液后,在低倍显微镜下可见支原体菌落成蓝色,其
HLA分型技术(二)
(二)PCR/SSO技术 此法乃用人工合成的HLA型别特异的寡核苷酸序列作为探针,与待检细胞经PCR扩增的HLA基因片段杂交,从而确定HLA型别,PCR技术可将HLA复合体上指定基因片段特异性地扩增5~6个数量级;而专门设计的SSO(序列特异的寡核苷酸sequencedpecific ol
HLA分型技术(一)
HLA分型并不只是一种应用性的临床检测指标,免疫遗传学研究的发展,很大程度上依赖于以分型为主要手段的HLA多态性分析。60年代建立的并不断完善的血清学及细胞学分型技术主要侧重于分析HLA产物特异性;80年代起建立的DNA分型方法则侧重于基因的分型。 一、血清学分型技术 (一)HLA-Ⅰ类抗原
分型治疗胃下垂
胃下垂是指站立时胃的下缘及胃小弯切迹低于正常位置,其临床表现类属中医学“痞满”、“胃脘痛”、“胃缓”等范畴,分型治疗有良好效果。 脾虚气陷:症见素体体弱,脘腹坠胀,食后、站立或劳累后加重,纳差食少,面色萎黄,倦怠乏力, 舌淡或有齿痕,苔薄白,脉细或缓。治宜补气升陷,健脾和胃,方选补中益
乳癌的分型治疗
乳癌是女性常见的恶性肿瘤,发病机理为与性激素紊乱有关。本病属中医学 “乳岩”范畴,现将乳癌的分型治疗介绍如下。 热毒瘀结型 症见乳房肿块增大迅速,红、肿、热、痛,甚至溃烂翻花,渗液恶臭,大便秘结,小便短赤;或伴有发热;舌质红(或暗红)、苔黄、脉滑数(或弦数)。 治则:清肝泻
巨噬细胞的分型
巨噬细胞作为一种具有可塑性和多能性的细胞群体,在体内外不同的微环境影响下,表现出明显的功能差异。根据活化状态和发挥功能的不同,巨噬细胞主要可分为M1型即经典活化的巨噬细胞(classically activated macrophage),和M2型即替代性活化的巨噬细胞(alternatively
2分钟记住狼疮肾分型
狼疮(Lupus)是一种可以累及全身脏器的自身免疫性疾病。累及到肾脏就会出现已血尿、蛋白尿等为表现的狼疮性肾炎(lupus nephritis, LN)。2003年国际肾脏病学会(ISN)和肾脏病理学会(PRS)结合多年的临床和病理经验修订了狼疮肾炎的病理组织学分类,针对以往病理学分类的不足
llumina高通量测序平台的应用(二)
3、可逆化学阻断技术测序 利用边合成边测序(Sequencing by synthesis)的原理,加入改造过的DNA聚合酶和带有4种荧光标记的dNTP。这些核苷酸是“可逆终止子”,因为3’羟基末端带有可化学切割的部分,每个循环它只容许掺入单个碱基。去除其他多余的dNTP后,用激光扫描
llumina高通量测序平台的应用(一)
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收购了
关于磷酸二酯酶的基因分型的介绍
分子克隆技术揭示磷酸二酯酶(phosphodiesterases,PDEs)是一个多基因大家族,开发选择性的磷酸二酯酶抑制剂将为多种疾病的治疗开辟新的思路。PDEs是一个多基因的大家族,它包括11型共30余种具有不同底物专一性、酶动力学特征、调控特点以及细胞与亚细胞分布区域不同的磷酸二酯酶同功酶
基因分型检测可准确检测特定的生物标志物?
英国癌症研究所和皇家马斯登医院的研究人员近日证实,基于血液的基因分型检测可准确检测特定的生物标志物,有望指导转移性乳腺癌的靶向治疗。 研究人员利用Guardant Health的液体活检分析和Bio-Rad的微滴式数字PCR(ddPCR)检测来鉴定患者循环肿瘤DNA(ctDNA)中的突变,包括
单核苷酸多态性易于基因分型的介绍
SNPs 的二态性,也有利于对其进行基因分型。对SNP进行基因分型包括三方面的内容: (1)鉴别基因型所采用的化学反应,常用的技术手段包括:DNA分子杂交、引物延伸、等位基因特异的寡核苷酸连接反应、侧翼探针切割反应以及基于这些方法的变通技术; (2)完成这些化学反应所采用的模式,包括液相反应
关于原发性肾小球疾病的临床分型和病理分型介绍
(一)原发性肾小球疾病的临床分型 1、急性肾小球肾炎。 2、急进性肾小球肾炎。 3、慢性肾小球肾炎。 4、隐匿性肾小球肾炎。 5、肾病综合征。 (二)原发性肾小球疾病的病理分型 依据世界卫生组(WHO)1982年制定的肾小球疾病病理学分类标准: 1、轻微病变性肾小球肾炎 2、局
生物芯片及基因芯片的概述
“生物芯片”实际上是一种微型多参数生物传感器。它通过在一个微小的基片表面固定大量的分子识别探针,或构建微分析单元和系统,实现对化合物、蛋白质、核酸、细胞或其他生物组分准确、快速、大信息量的筛选或检测。基因芯片,又称DNA微探针阵列(microanav),是一种最重要的生物芯片。它集成了大量的密集排列
关于贴附型细胞的分型的介绍
1.成纤维型细胞:(fibroblast) 来自中胚层 特点:与体内成纤维细胞形态相似,胞体梭型或不规则三角形,中央有圆形核,胞质向外伸出2~3个长短不同的突起。细胞在生长时呈放射状,漩涡或火焰状走行。 起源:细胞来自中胚层间充质组织。 除真正的成纤维细胞、心肌、平滑肌、成骨细胞、血管内皮