华人学者提出新概念：利用tRNA测序解析肠道微生物组
来自芝加哥大学的研究人员开发了一种高通量RNA测序新方法，分析研究肠道微生物组的活性。 与一般的RNA测序不同，这些新工具分析的是转移RNA——tRNA，也就是将DNA中编码的遗传信息转化为执行基本生物功能的蛋白质的RNA。如果能过清楚地了解tRNA动态，科学家就能了解天然存在的微生物组的活性，并研究它们对环境变化的反应，例如变化的温度或营养物质的变化。 这一研究成果公布在Nature Communications杂志上，由芝加哥大学生物化学和分子生物学教授潘涛（Tao Pan）博士领导完成。早年毕业于德国萨尔布吕肯大学的潘教授从事RNA研究多年，曾发现tRNA的非翻译作用，这种甲基化对于tRNA的稳定性具有重要意义（Cell里程碑成果：tRNA居然还有另外的作用）。 转录组是特定细胞或组织在特定时间或状态下转录出来的所有RNA的集合。通过对转录组的研究可以揭示生物体的基因表达，研究结构变异及发现新基因。新的RNA测序......阅读全文
华人学者提出新概念：利用tRNA测序解析肠道微生物组
来自芝加哥大学的研究人员开发了一种高通量RNA测序新方法，分析研究肠道微生物组的活性。 与一般的RNA测序不同，这些新工具分析的是转移RNA——tRNA，也就是将DNA中编码的遗传信息转化为执行基本生物功能的蛋白质的RNA。如果能过清楚地了解tRNA动态，科学家就能了解天然存在的微生物组的活性
tRNA测序，约吗？
高通量RNA测序（RNA-seq）技术的使用让我们认识了细胞中无比精彩的RNA世界。然而，目前的方法无法检测高度修饰或大量折叠的RNA，如tRNA。近日，《Nature Methods》上的两种方法通过在文库制备前去除tRNA的修饰，解决了tRNA测序的技术难题。 尽管tRNA被认为是看家RN
基因测序找出肠道核心微生物群
人类肠道中有数以万亿计的微生物，也称为肠道菌群，与多种疾病如肠炎、肥胖、糖尿病等都有关系。最近，比利时鲁汶大学和荷兰格林宁根大学两个团队分别在《科学》杂志发表论文，通过两项大型研究计划找出了肠道核心微生物群，为进一步建立生物标记体系，评估肠道菌群是否正常提供了线索。 肠道微生物组能产生维生素
基因测序找出肠道核心微生物群－有助于判断多种疾病
人类肠道中有数以万亿计的微生物，也称为肠道菌群，与多种疾病如肠炎、肥胖、糖尿病等都有关系。最近，比利时鲁汶大学和荷兰格林宁根大学两个团队分别在《科学》杂志发表论文，通过两项大型研究计划找出了肠道核心微生物群，为进一步建立生物标记体系，评估肠道菌群是否正常提供了线索。 肠道微生物组能产生维生素、
肠道免疫系统由肠道微生物守护！
科学家们早就知道肠道细菌对宿主有各种各样的作用，例如分解膳食纤维、制造维生素K和B7等等。然而，一项新研究揭示，微生物还有另一个作用。 布朗大学的研究小组发现，小鼠体内肠道微生物正在参与调控宿主免疫。与其说宿主的防御系统可能攻击这些有益细菌，不如说细菌可以与动物的免疫系统和平共存。 对立的外
肠道微生物影响饮食效果
当你试着在新年里改善自己的饮食时，体内的微生物群却可能会“捣乱”。近日，刊登在《细胞—宿主和微生物》期刊上的论文称，研究人员探索了为何小鼠从自由的美式饮食转换到健康低卡路里的植物性饮食后，没有立刻出现效果。他们发现，若想一项新饮食计划取得成功，必须去除某些人体肠道细菌。 “如果我们想开饮食处方
肠道微生物可以影响体重
根据最近发表在《Mayo Clinic Proceedings》杂志上的一篇文章，对于特定人群来说，肠道微生物的特殊活性或许有助于减肥。这一效应不依赖于控制饮食以及日常锻炼等行为。 “我们知道不同人的减肥效率存在差别，即使在接受了相同的卡路里摄入以及相同强度的锻炼之后依然如此”，该研究的作者P
肠道微生物加入抗癌斗争
2015年，Bertrand Routy还是法国古斯塔夫·鲁西癌症中心的一位博士生，他常去医院收集癌症患者的粪便样本。医生嘲笑他，甚至给他取了个外号：便便先生。 但Routy的研究结果发布后，人们停止了对这类研究的嘲笑。研究表明，某些肠道细菌似乎可以提高人们对抗癌治疗的反应。医生也盼望研究者能
肠道微生物药物的研发
在人类的肠道里存在一个巨大的微生物群体，称之为“肠道微生态系统”，其作为宿主最重要的微生态系统组成部分，大约包含有15000~36000个菌种，由专性厌氧菌（＞99%）、兼行厌氧菌和好氧菌共同组成，这些细菌共同构成胃肠道的动态微生态平衡。肠道在消化、吸收各种营养物质的同时又能将细菌及其代谢产物通
微塑料改变海鸟肠道微生物
与摄入微塑料较少的海鸟相比，摄入大量塑料颗粒的海鸟的消化系统含有更多样化的细菌。但目前尚不清楚肠道微生物组多样性的增加对海鸟意味着什么。相关研究3月27日发表于《自然-生态与进化》。海洋环境中存在大量微塑料污染。图片来源：blickwinkel/Alamy海鸟很容易吃到微塑料（宽度小于5毫米的碎片）
张成岗：与肠道微生物对话
张成岗 2月24日清晨，呼吸着北京的早春清冷的空气，张成岗驱车前往河北省保定市。他此行的目的地是保定监狱，打算与那里的管理者讨论一下“菌心说”与预防犯罪相关研究的事宜，为下一步研究作准备。 “菌心说”是张成岗于2013年提出的概念，其核心内容是认为人体内存在的菌群决定了身体甚至心理的状态。“我还
微塑料改变海鸟肠道微生物
与摄入微塑料较少的海鸟相比，摄入大量塑料颗粒的海鸟的消化系统含有更多样化的细菌。但目前尚不清楚肠道微生物组多样性的增加对海鸟意味着什么。相关研究3月27日发表于《自然-生态与进化》。 海鸟很容易吃到微塑料（宽度小于5毫米的碎片），因为它们常在这些污染物聚集的海洋区域觅食。本月发表的另一项研究表
“万能”的肠道微生物
公元前300多年，西方“医学之父”希波克拉底曾扬言：“所有疾病始于肠道”。 两千多年后，医学工作者们发表了众多研究成果，他的观点正在一点一点地被证实。当我们谈到许多慢性疾病的发病机制时（比如慢性肠炎、糖尿病，甚至阿尔茨海默症、衰老、肥胖症、药物疗效等），我们逐渐意识到，肠道微生物几乎是绕不开
Science：肠道微生物干扰了药效
在最近一项研究中，加州大学旧金山分校的研究人员描述了微生物组如何干扰药物预期作用的第一个具体例子。他们专注于左旋多巴（L-dopa），这是帕金森病的主要治疗药物，他们确定了数万亿种细菌中的哪些细菌负责降解药物以及如何阻止这种微生物干扰现象的发生。 帕金森病会攻击大脑中产生多巴胺的神经细胞，如果
生活方式决定肠道微生物
肠道菌群负责人体健康和营养的许多方面，但是大多数研究都集中在“西方”人群。目前，包括德国Max Planck进化人类学研究所在内的一项国际合作研究，首次分析了一个现代狩猎采集群体(坦桑尼亚的哈扎人)的肠道菌群。这项工作的结果表明，哈扎人拥有独特的肠道微生物属性，其特征在其他任何人群中都没有见
肠道微生物竟可逆转肥胖
从参与帕金森发病，到延缓“渐冻症”的进展，肠道微生物都肩负重任，而昨日，美国犹他大学的研究人员在其“功劳簿”上再次画上了浓墨重彩的一笔:肠道中的特定菌群--梭菌，可阻止免疫系统受损的小鼠发胖！不仅推动了肠道微生物的研究，也让我们重新认识了肥胖与免疫系统的关系。 据不完全统计，全世界范围内，现约
肠道微生物与老年相关疾病
按照WHO的标准，一个国家或地区65岁人口超过7%，或≥60岁人口超过10%即为老龄化。根据国家统计局2017年最新数据，我国≥60周岁人口为24090万人，占总人口的17.3%，其中≥65周岁人口为15831万人，占总人口的11.4%。我国已经成为世界上老年人口最多的国家，呈现出老龄化速度快、老年
肠道微生物DNA的提取方法
实验概要肠道微生物DNA是进行微生物分子生态学研究的前提。能否获得高的DNA提取率和高质量的DNA，从而真实地反映微生物群落的实际情况，是保障研究结果是否可靠的关键。如何获取高质量、较完整的肠道菌群基因组DNA是肠道微生物研究中的关键。本研究采用物理方法，化学方法，酶解法等进行DNA提取，并对其进行
肠道微生物最新研究进展
肠道是人体最大的消化和排毒器官，其回旋盘转的结构被形象地称为人体第二大脑。肠道中寄生着数以计亿的细菌，它们是人体内最重要的一种外环境，各种微生物按一定比例组合，相互制约，相互依存，在质和量上形成一种生态平衡。然而肠道菌群并不都是人类的朋友，按特性来讲，它们可分为3大类，即好菌、坏菌和中性菌。当人
新型肠道微生物研究模型——HIO
当一个生命出生时，大自然为小家伙们的消化系统准备了可用一辈子的无价的馈礼——益生菌。《eLife》新文章表明，人体非常常见的大肠杆菌有助于新生儿肠道内衬排布，能为即将入住的多样化菌群繁殖激增做好准备。 植入了大肠杆菌（绿色）的HIO 大家都知道粪便中的主要细菌是大肠杆菌，它们除了分解食物产生
肠道糖基化在维护肠道微生物稳态中的作用
人类肠道中含有极其丰富的微生物，其所含基因总数是人类基因组的150余倍。这些微生物通过相互竞争、互补和协同，构成了微生物-微生物和微生物-宿主关系的复杂网络。在此基础上，肠道微生物各组分间相对平衡，保持稳态，从而实现其与宿主互利共生。对于宿主，其肠道内存在多种屏障以维持肠内微生物的稳态。其中包括
喝红酒或能提高肠道微生物多样性－增强肠道健康
近日，一项刊登在国际杂志Gastroenterology上的研究报告中，来自伦敦国王学院的科学家们通过研究发现，与不喝红酒的人群相比，喝红酒的人群机体肠道微生物多样性较高（肠道健康的一个标志），同时其患肥胖风险较低，机体坏胆固醇水平较低。文章中，研究人员对916对英国女性双胞胎进行研究，分析了啤
肠道糖基化在维护肠道微生物稳态中的作用
人类肠道中含有极其丰富的微生物，其所含基因总数是人类基因组的150余倍。这些微生物通过相互竞争、互补和协同，构成了微生物-微生物和微生物-宿主关系的复杂网络。在此基础上，肠道微生物各组分间相对平衡，保持稳态，从而实现其与宿主互利共生。对于宿主，其肠道内存在多种屏障以维持肠内微生物的稳态。其中包括
肠道糖基化在维护肠道微生物稳态中的作用
人类肠道中含有极其丰富的微生物，其所含基因总数是人类基因组的150余倍。这些微生物通过相互竞争、互补和协同，构成了微生物-微生物和微生物-宿主关系的复杂网络。在此基础上，肠道微生物各组分间相对平衡，保持稳态，从而实现其与宿主互利共生。对于宿主，其肠道内存在多种屏障以维持肠内微生物的稳态。其中包括
PLoS－ONE：新研究揭示肠道微生物与肠道疾病的关系
近日，德州农工大学兽医学院的一项研究提供了关于狗的肠道细菌如何影响胃肠道健康的新见解，这可能有助于开发针对两种胃肠道疾病的新疗法。 在10月31日发表于《 PLOS ONE》的这项研究中，博士生Amanda Blake测量了狗粪便中细菌代谢产物——粪便乳酸和次级胆汁酸（BA）的水平。 粪便中
甲硫氨酸tRNA
中文名称甲硫氨酸tRNA英文名称methionine tRNA定 义真核生物的一种起始tRNA，携带甲硫氨酸进入核糖体，进入新生肽链的N端。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
tRNA的结构
1.tRNA结构保守：70-80个碱基。2.二级结构：三叶草。3.五个主要臂：(1)接受臂：携带氨基酸；(2)TΨC臂；(3)反密码子臂；(4)双氢尿嘧啶臂（DHU）；(5)附加臂：大小反映了整个tRNA分子的大小，根据其大小，tRNA分为两类：第Ⅰ类tRNA，3/4 tRNA只有3-5个碱基的附加
氨酰tRNA
中文名称氨酰tRNA英文名称aminoacyl tRNA定 义转移核糖核酸的3′端通过酯键与氨基酸连接生成，进入核糖体的A位参与蛋白质生物合成。由氨酰tRNA合成酶催化tRNA与活化氨基酸(即氨酰AMP)反应得到。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
口腔微生物与肠道微生物的同源性
3月30日，由生物谷主办的2018(第四届)肠道微生态与健康国际研讨会隆重召开。在分会场四“肠道微生物与其他疾病”中，来自四川大学华西口腔医学院的李雨庆副教授为我们作了题为“口腔微生物与肠道微生物生物同源性”的精彩报告。 李雨庆副教授是四川省微生物学会的理事兼秘书长、口腔生物学教研室主任、口腔
酶制剂对肠道微生物的影响
饲料通过家禽的胃时，被胃内的盐酸和胃蛋白酶杀菌。食糜进入十二指肠后由于pH值的变化以及大量消化酶、胆汁、卵磷脂和溶菌酶的流入，故在十二指肠存活的细菌很少。由于胰酶的高浓度和肠细胞的高效吸收活性，肠道上段的消化效率最高(Uni等，1999).随着食糜通过小肠，分解和吸收作用逐渐下降(Campbell等