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肠道微生物DNA的提取方法

实验概要肠道微生物DNA是进行微生物分子生态学研究的前提。能否获得高的DNA提取率和高质量的DNA,从而真实地反映微生物群落的实际情况,是保障研究结果是否可靠的关键。如何获取高质量、较完整的肠道菌群基因组DNA是肠道微生物研究中的关键。本研究采用物理方法,化学方法,酶解法等进行DNA提取,并对其进行比较,经过优化得到最佳的提取方法,使其符合以后PCR扩增要求以及其它后续研究工作。试验结果表明用液氮研磨加CTAB提取液的方法提取的肠道微生物总DNA的效果高于其它方法。并且通过电泳以及PCR检测,所提取的DNA的质量适于进一步的分子生物学研究。实验材料健康成年对虾购于市场,挑取生长较好、大小均一的,于超净台下取肠道,无菌操作。实验步骤1. DNA提取方法方法A: 1) 取0.02g虾肠加入总量1mL PBS匀浆,液氮研磨 2) 加入250uL 0.5% Twee......阅读全文

Nature首次解密肚子里的基因组密码

  我们身体里含有大量的微生物基因组,数量比我们本身的基因组多得多,一项最新研究表明,我们肚子肠道里的微生物基因组,就如同人类DNA个体之间存在差异一样,也是大不相同。   这项研究是第一个分类记录肠道微生物遗传变异的研究成果,肠道是我们人类摄取营养成分,合成维生素,防止感染,以及生产天然降低炎症

DNA提取:为微生物研究扫清障碍

  近年来,尽管测序技术在快速发展,但DNA提取方法却鲜有改进。对于宏基因组研究,这是必需的一步。然而,许多微生物无法在实验室中培养,这成为分析大量微生物样品的一个主要瓶颈。参与美国NIH的人类微生物组计划(Human Microbiome Project)以及地球微生物组计划(Earth Mi

微生物分子生物学检测新技术问世

  日前,中国地质科学院水环所经过积极探索,反复试验,建立了适合土样和地下水样的微生物分子生物学检测高新技术。   微生物分子生物学检测技术通过对不同样品微生物DNA的提取,将提取的DNA进行扩增并识别,来确定样品中微生物的多样性和种属,具有先进性和准确性,免去了烦琐、需时长的培养过程,可检出传统

如何选择最佳的全血DNA、RNA提取方法?

从全血中提取DNA和RNA应该说是最基本的工作了,提取的DNA和RNA质量的好坏直接影响了下游的实验和分析,可供选择的方法非常多,乱花渐欲迷人眼,如何选择最适合的方法,成了很多人实验开始前最难以抉择的事情。我们从两个方面,层层剥茧,分析最佳的实验方法。 1、全血的采集保存和DNA的提取I. 用含抗凝

Nature:风险!微生物组可能泄露个人隐私

   源自人类粪便的细菌DNA可作为“肠道纹”(gut print)来识别个人身份。  通过寄居某人体内的微生物DNA可识别出此人的身份。  研究人员发现,通过寄居人体的微生物集成DNA,能够特异性地识别出个人的身份,这就产生了个人隐私问题。  这项发现刊登于5月11日的《美国国家科学院期刊》(Pr

不同品牌试剂盒提取土壤DNA的结果对比

1.引言 提取高浓度、大片段、多样性程度高、具有代表性的土壤微生物总DNA对土壤微生物多样性研究至关重要。然而,土壤是一个非常复杂的异质体系,其中含有的腐植酸及腐植酸类似物、酚类化合物、重金属离子等,在DNA提取过程中如不能有效去除,将直接影响后续的PCR扩增、核酸杂交、内切酶消化等分子操作。用传统

Nautre:婴儿身上的首批细菌来自出生前?

  受孕后不久,人类胚胎便开始组装一个对其生存至关重要的器官——胎盘。胎盘是胎儿与母体之间物质交换的重要器官,它将母体血液中的氧气、营养素和免疫分子运送到正在发育的胎儿身上,同时胎盘也是防止感染的屏障。一个多世纪以来,医生们认为这种短暂的结构——就像胎儿和子宫本身一样——是无菌的,除非出现了什么问题

微生物DNA进行人体识别引发隐私担忧

   研究人员已经发现寄生于人体的微生物的聚集DNA,它又被称为‘gut print’,可以唯一地识别某个人。但这引发了隐私问题。  研究结果于5月11日发表在《美国国家科学院院刊》上,表明它可能识别人体微生物栖息研究方面的匿名参与者。该微生物将会透露个人健康、饮食或种族方面的细节。4月29日发表在

Nature:风险!微生物组可能泄露个人隐私

  研究人员发现,通过寄居人体的微生物集成DNA,能够特异性地识别出个人的身份,这就产生了个人隐私问题。  这项发现刊登于5月11日的《美国国家科学院期刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences)上。文章指出,在一项匿名试验研究中,通过寄生于

婴儿的第一批细菌来自出生时刻吗

  大多数婴儿首次接触微生物是在出生期间,研究人员如此认为。图片来源: Edgard Garrido/Reuters  怀孕后,人类胚胎开始形成一个重要的器官,它对胚胎的成长至关重要:胎盘。胎盘既是胚胎的生命线,又是它的监护者:它会把母亲血液中的氧气、营养和免疫分子输送给发育中的胎儿,它同时还是阻隔

聚焦微生物研究-(系列一)

适用于您微生物学应用的活菌 PCR 技术对存活微生物实施快速、敏感和特异性检测是许多微生物学研究和质控对照领域的基本需求。real-time PCR 等基于 DNA的扩增技术能够提供所需的速度和特异性。活菌 PCR 是微生物学研究的新一代技术,它将细胞的存活信息与 PCR 类检测法的速度和

OMNI BeadRuptor 24 Elite研磨珠均质器应用于土壤样品中DNA提取

OMNI BeadRuptor 24 Elite研磨珠均质器应用于土壤样品中DNA提取应用笔记Omni国际土壤DNA试剂盒优于公司M土壤DNA分离试剂盒,用于从土壤样品中提取DNAOmni国际有限公司Shari Garrett介绍土壤DNA的分子分析是检测土壤微生物和微生物多样性的直接解决方案。从土

大便中的肠道细菌或能预测结直肠癌

   说起大便,很多人可能会掩鼻皱眉。如今越来越多的科学研究试图从粪便中分析肠道菌群的特点,以期获得有关疾病的线索。  肠道菌群是指生活在肠道中的微生物群体,它们可用于预测结直肠癌的发生。结直肠癌是消化道最常见的恶性肿瘤之一。它是女性第二大常见癌症,也是男性第三大常见癌症。  近日,一国际科学家团队

细菌学诊断中的新技术

随着现代科学技术的不断发展,特别是免疫学、生物化学、分子生物学的不断发展,新的细菌诊断技术和方法已广泛用于食品微生物的鉴别。传统的细菌分离、培养及生化反应,已远远不能满足对各种病原微生物的诊断以及流行病学的研究。近年来国内外学者不断努力,已创建不少快速、简便、特异、敏感、低耗且适用的细菌学诊断方法,

这篇文章大揭秘! 细菌DNA在人体内脏中分布几何?

  据英国《自然·代谢》杂志9日发表的一项最新研究,科学家首次详细分析了细菌脱氧核糖核酸(DNA)在人体内脏中的分布情况。  我们都知道,人类体表和肠道布满了细菌,如肠道内寄生着多达10万亿个细菌,它们能影响体重和消化能力、抵御感染和自体免疫疾病的患病风险,同时控制人体对癌症治疗药物的反应。但长期以

10万亿个细菌如何在人体中分布

  据英国《自然·代谢》杂志9日发表的一项最新研究,科学家首次详细分析了细菌脱氧核糖核酸(DNA)在人体内脏中的分布情况。  我们都知道,人类体表和肠道布满了细菌,如肠道内寄生着多达10万亿个细菌,它们能影响体重和消化能力、抵御感染和自体免疫疾病的患病风险,同时控制人体对癌症治疗药物的反应。但长期以

细菌学诊断新技术

 随着现代科学技术的不断发展,特别是免疫学、生物化学、分子生物学的不断发展,新的细菌诊断技术和方法已广泛用于食品微生物的鉴别。传统的细菌分离、培养及生化反应,已远远不能满足对各种病原微生物的诊断以及流行病学的研究。近年来国内外学者不断努力,已创建不少快速、简便、特异、敏感、低耗且适用的细菌学诊断方法

细菌学诊断技术(一)

  随着现代科学技术的不断发展,特别是免疫学、生物化学、分子生物学的不断发展,新的细菌诊断技术和方法已广泛用于食品微生物的鉴别。传统的细菌分离、培养及生化反应,已远远不能满足对各种病原微生物的诊断以及流行病学的研究。近年来国内外学者不断努力,已创建不少快速、简便、特异、敏感、低耗且适用的细菌学诊断方

细菌学诊断新技术

    随着现代科学技术的不断发展,特别是免疫学、生物化学、分子生物学的不断发展,新的细菌诊断技术和方法已广泛用于食品微生物的鉴别。传统的细菌分离、培养及生化反应,已远远不能满足对各种病原微生物的诊断以及流行病学的研究。近年来国内外学者不断努力,已创建不少快速、简便、特

土壤微生物总DNA的提取方法比较

实验概要通过对比不同DNA提取及纯化方法,选择和优化适合于土壤样品不同分子量DNA提取及纯化的技术路线。实验原理土壤是微生物最大的栖息地,20世纪80年代,微生物学家采用免培养(culture-in-dependent)方法,即直接从土壤中提取微生物总DNA的技术,使得在基因水平研究这些未培养微生物

【盘点】单细胞测序研究进展一览

  细胞是生物学的基本单位,近年来研究人员正努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。而应用而生的就是单细胞测序技术,该技术是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。而随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并对逐个细胞进行序列比较已经开始

DNA提取 I:土壤的分子生物学特性

在前面的文章(Soil molecular biology),围绕提取土壤样品DNA、RNA相关问题做了简单的引导介绍,比如PCR抑制因子、裂解注意事项等。今天将详细介绍土壤微生物DNA提取的细节,以及如何使用MO BIO PowerSoil® DNA Isolation Kit获得更好的提取效果。

微生物鉴定技术贯穿食品安全始终

  随着人们生活水平的不断提高,食品安全问题愈发受到重视,微生物对食品的污染问题也随之备受关注。微生物包括细菌、真菌等,有些微生物还是致病菌,对人体的危害很大,因此食品中微生物的检测非常重要。  微生物鉴定技术在检验检疫,食品、化妆品等产品致病菌的检测,动物源性致病菌的检测,植物病原细菌、真菌的检测

微生物鉴定技术贯穿食品安全始终

  随着人们生活水平的不断提高,食品安全问题愈发受到重视,微生物对食品的污染问题也随之备受关注。微生物包括细菌、真菌等,有些微生物还是致病菌,对人体的危害很大,因此食品中微生物的检测非常重要。  微生物鉴定技术在检验检疫,食品、化妆品等产品致病菌的检测,动物源性致病菌的检测,植物病原细菌、真菌的检测

2013值得关注的技术:微生物组功能研究

  《Nature Methods》杂志将2012年度技术授予了定向蛋白质组学(targeted proteomics)。同时,杂志还介绍了2013年值得关注的技术,包括纳米孔测序仪(Disruptive nanopores)、微生物组功能研究(Probing microbiome func

消化系统的10个秘密

  消化道犹如贯穿人体的一条河流。食物进入消化系统,会进行复杂的分解消化,并将营养输送至身体的每个细胞。然而,关于消化系统,还有很多不解之谜。美国“罗代尔生活网”最新载文,总结了经科学证实的“消化道的10个秘密”。  1.如果将消化系统摊平,其面积可以覆盖一个网球常  2.大约70%的免疫系统位于消

梳理保存微生物组样品同时不改变其多样性的方法

  在过去十年左右,研究人员已花费几十亿美元对栖息于不同地点(如人体、土壤和海洋)中的微生物进行分门别类。对这些不同的微生物组,我们所知的大多数信息都是通过日益复杂的下一代测序技术获得的。比如,科学家们通常对编码16S rRNA---细菌核糖体小亚基中的一种组分---的基因进行高通量测序来测量样品中

Cell重磅发布15万人体微生物基因组! 揭示微生物新物种

  微生物宏基因组是当今世界最热门的科研领域之一。越来越多的研究表明,人体微生物发挥着重要的健康作用,但大部分多样性仍未得到充分探索,尤其是在除肠道以外的身体部位及非西方人群。  在今日发表在Cell期刊的一项研究中,由意大利特伦托大学Nicola Segata领导的研究团队利用来自不同地理位置、生

如何提取土壤中的高通量核酸?

土壤是指地球表面的一层疏松的物质,由各种颗粒状矿物质、有机物质、水分、空气、微生物等组成,能生长植物。土壤微生物的数量很大,1克土壤中就含有4000~7000种近10亿个细菌。1亩地耕层土壤中,微生物的重量能达到300-3000公斤。而其中90%以上的微生物都是无法直接培养的。因此,提取土壤中的微生

惊讶!肠道微生物或能团队合作来改善机体健康

  我们机体的消化道中居住者数万亿个微生物,其中主要是细菌,其能帮助我们消化食物,制造维生素、增加机体免疫系统、抵御外来细菌感染,同时还能产生多种分子来影响机体健康的多个方面,此前研究人员研究肠道微生物的组成非常复杂,想要识别这些微生物就必须在实验室中进行培养,然而很多微生物都无法在实验室中进行培养