NatureMethods公布2018年度技术
岁末，Nature Methods年度技术出炉——无限制行为动物成像（Imaging in freely behaving animals）。 入选理由为：成像技术和荧光传感器的技术进步帮助科学家们更加详细分析动物各种行为背后的神经元活动，这些动物包括大鼠，小鼠，鱼，果蝇和线虫。 一般来说，受限制动物有利于实验人员对其受试动物的感觉环境进行精确控制，例如研究视觉引导或嗅觉引导的行为。然而，受限制动物对于研究更复杂的行为，特别是社会行为方面就会有局限性。近年来的技术发展实现了在自由行为的动物中对神经元活动成像，这能帮助科学家研究细胞，神经环路和全脑水平下的自然行为的神经元基础机制，因此被选为2018年度技术。 人脑包含了百亿级神经元和百万亿级的神经突触，其结构和功能上极其复杂精密的连接，涌现出意识和思想。目前各国脑科学计划的一个核心方向就是打造用于解析脑连接图谱和功能动态图谱的研究工具。其中，如何整合微观神经元和神经突触......阅读全文
Nature－Methods－|－深度学习：二维图片到三维的变换
荧光显微镜在生命科学等学科中有重要作用。通过激发样本的特异性荧光标记，荧光显微镜可以准确揭示生物内部特定的组织，结构和活动。 2019年11月4日，来自UCLA的Aydogan Ozcan教授科研团队在Nature Methods上发表题为“Three-dimensional virtual
Comparison－of－lysis－methods
Comparison of lysis methodsSonicationmost efficient method of cell fractionationproblem: heat build up which can denature proteins (proportionate to l
Staining－Methods－for－cell
death Z. Xia 10/2/95The simplest way: trypan blue. Dead cells stain blueNon-fixed cells: FDA(fluorescein diacetate)-green, alive cells; P.I. (propidiu
遗传学大牛Nature－Methods发表新成果－用CRISPR打造DNA条码
生物通报道：细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争，为此它们演化出了多种防御机制，CRISPR–Cas9适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合，可以在引导RNA的指引下，靶标并切割入侵者的遗传物质。2012年研究者们利用这一特点，将CRISPR系统制成
Nature指数公布2018全球大学/机构综合排名
最近，Nature指数公布了2017年12月到2018年11月大学/机构排名。 在全球大学/机构综合排名中，中国科学院位居榜首，另外有17大学/机构顺利挺进全球前100名，其中湖南大学，武汉大学，厦门大学，华中科技大学成功突入100名；湖南大学首次入围全球大学前100强； 在全球生命科学领域
Nat－Methods：高端成像技术让癌细胞无所遁形
利用高科技的成像方法，来自华盛顿大学的科学家就可以在组织深处清楚地看到早期发育中的癌细胞，这或许比之前利用荧光蛋白来观察癌细胞要更加清晰直观，相关研究发表于国际杂志Nature Methods上。 研究者Lihong Wang表示，通过遗传性地修饰胶质母细胞瘤细胞使其表达BphP1蛋白，我们就
Analysis－and－Reconstitution－of－Phycobiliproteins:－Methods－for－the－...
Analysis and Reconstitution of Phycobiliproteins: Methods for the Characterization of Bilin Attachment ReactionsPhycobiliproteins are a homologous fam
Plant－Genome－Annotation－Methods
Annotation of plant genomic sequences can be separated into structural and functional annotation. Structural annotation is the foundation of all g
Basic－Methods－of－Culturing－Drosophila
实验概要Basic Methods of Culturing Drosophila实验步骤Stockkeeping1. Mechanics Most stocks can be successfully cultured by periodic mass transfer of a
General－Laboratory－Methods－for－Tetrapyrroles
There are thousands of porphyrins and metalloporphyrins, and hundreds of new derivatives appear each year. This variety arises because the cyclic
Methods－for－Xylem－Sap－Collection
Xylem and phloem are essential for the exchange of solutes and signals among organs of land plants. The synergy of both enables the transport and
Staining－Methods－for－cell－death
The simplest way: trypan blue. Dead cells stain blueNon-fixed cells: FDA(fluorescein diacetate)-green, alive cells; P.I. (propidium iodide)-red, dead
Nature－Methods：研究人员建立功能性血管状系统类脑器官
2019年10月7日，来自耶鲁大学干细胞中心In-Hyun Park研究组在Nature Methods杂志发表了题为“Engineering of human brain organoids with a functional vascular-like system”的文章，在其前期研究的基
Nature－Methods：徐涛院士等团队研制出新型干涉定位显微镜
基于单分子定位的超分辨显微成像技术自2006年提出以来发展迅速，该技术巧妙利用特殊荧光分子的光开关特性，结合单分子成像和质心拟合算法，绕过衍射现象的限制，把荧光显微镜的分辨率提高了一个数量级，解析了众多未知的细胞纳米结构，提升了对细胞结构的认知。但长期以来，受定位原理的限制，其轴向分辨率比侧向低
Nature－Methods－|－单细胞多模态测序的未来：UDAseq如何引领新革命？
近年来，单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）在揭示复杂生物系统和探索遗传学及临床研究中取得了突破性进展。然而，仅依赖单一的转录组信息往往难以区分分子相似但功能差异显著的细胞类别。因此，融合多种模态信息的单细胞测序技术逐渐成为研究热点，通过同时获取单个细胞的多维数据，研究人员能够更全面地解析细胞
清华大学Nature－Methods发文：新型的冷冻电镜三维重构算法
蛋白质是生命体的最主要组成元素，作为一种生物大分子机器，蛋白质功能的实现高度依赖于其复杂的三维原子结构。了解蛋白质的结构及其与功能的关系对探索生命的基本原理，理解疾病的分子机制以及药物的研发具有重要的意义。基于粒子滤波的三维重构算法示意图。 冷冻电子显微镜，简称冷冻电镜，使用电子束作为光源，是
Nature－Methods－|－向阳飞等建立功能性血管状系统类脑器官
如果说宇宙蕴藏无数奥秘，那么大脑必定是其中最难解谜团之一。对人类大脑的研究不仅关乎我们对人体内这一最复杂器官发育与功能的理解，相关的病理学、药物发现、再生医学等研究更是与国计民生直接相关。基于干细胞、发育生物学、生物材料等多学科理论与技术的类脑器官近年来发展迅速，为研究人类大脑发育、功能、疾病乃
2018年新技术：空间转录组学技术
——也许不久的将来，定位组织中的基因表达就会成为一种常规技术了。 对于基因表达研究来说，空间一直都是具有挑战性的前沿研究领域。但是随着越来越多的研究人员获得了技术进展，这已经不再是令人望而生畏的领域了。这些方法的多样性和创造性使其成为一个值得关注的技术方向。 空间基因表达对于理解组织中细胞的
科学家们研发出人工受体或将强化抗肿瘤疫苗Nature－Methods
树突状细胞（DC）是一种功能强大的抗原呈递细胞，是抗肿瘤免疫疗法的关键细胞。现在，科学家们研发出一种人工受体，能够改善DC呈递抗原的方式，提高免疫细胞识别、攻击肿瘤细胞的效率。这一研究于1月22日在线发表在《Nature methods》期刊。 Two images of EVIR-eng
Nature－Methods－|－郑晔开发三维基因组数据高保真模拟新工具
染色体构象捕获3C（chromosome conformation capture【1】）和Hi-C（high-throughput chromosomeconformation capture【2,3】）测序技术已经逐渐成熟，成为研究远距离基因调控机制的重要方法。越来越多的学者提出分析Hi-C
Nature－Methods－：中国学者开发了新的干涉单分子定位显微镜
各种基于图像的中心位置估计(称为质心拟合)方法，如二维高斯拟合方法，在单分子定位显微镜(SMLM)中已被广泛用于精确确定每个荧光团的位置。然而，如何将单分子横向定位精度提高到分子尺度(< 2 nm)来实现高通量纳米结构成像仍然是一个挑战。图片来源：WANG Guoyan Wang and OU
Nature－Methods－：北大汤富酬团队揭示单个细胞内高阶染色质结构
调控基因组元件的高阶三维(3D)组织为基因调控提供了拓扑基础，但尚不清楚哺乳动物基因组中的多个调控元件如何在单个细胞内相互作用。 2023年8月28日，北京大学汤富酬团队在Nature Methods （IF=48）在线发表题为“scNanoHi-C: a single-cell long-r
Guide－to－Cell－Proliferation－and－Apoptosis－Methods
Chapter 1: Cell Death - Apoptosis and Necrosis1.1Introduction21.1.1Terminology of cell death21.1.2Differences between necrosis and apoptosis31.1.3Apop
The－TRC－shRNA－Design－Methods－and－Rules
OverviewWe design shRNA molecules with an algorithm. Our algorithm uses several criteria to rank potential 21mer targets within each human and mouse R
The－Fungal－Genetics－Stock－Center－Methods
Some basic Neurospora methods compiled at StanfordVogel's Minimal MediumD. D. Perkins - Hints for the care, feeding and breeding of NeurosporaStra
COMPARISION－OF－DIFFERENT－PROTEIN－DETERMINATION－METHODS
COMPARISION OF DIFFERENT PROTEIN DETERMINATION METHODSCompanyMethodDetection RangeApplications -CompatibilityAssay protocolPrecautions-InterferencesA
Tissue－Culture－Methods3
REFERENCES:R. Ian Freshney, Culture of Animal cells: A manual of basic techniques, Wiley-Liss, 1987.VI. TISSUE CULTURE PROCEDURESEach student should m
Tissue－Culture－Methods1
I. TYPES OF CELLS GROWN IN CULTURETissue culture is often a generic term that refers to both organ culture and cell culture and the terms are often us
Tissue－Culture－Methods2
IV. MAINTENANCECultures should be examined daily, observing the morphology, the color of the medium and the density of the cells. A tissue culture log
2018年新技术：追踪细胞血统
秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis elegans）是著名的模式动物，以其细胞家族树而闻名，通过一系列的细胞分裂产生各种成体细胞类型。在二十世纪七十年代中期，科学家们付出了巨大的努力，在无数个小时的基本显微镜探索中记录了这棵细胞树，这是一个传奇。 近几十年来，体内标记和追踪细胞的方法已