糖基转移酶的小分子抑制剂编辑氮连接连接糖基化位点

蛋白质的N连接的糖基化是一种重要的蛋白翻译后修饰,对蛋白质的折叠、稳定性和生理功能均起着重要的作用。N连接糖基化修饰主要是通过糖基转移酶(OST)将寡糖逐渐转移到蛋白质中的NXT/S (X≠P) 序列上的天冬酰胺上。OST含有两个独立编码的催化亚基,分别为SST3A和STT3B。SST3A负责大部分序列位点和共翻译过程中的糖基化修饰,STT3B负责负责小部分序列位点和后翻译过程中的糖基化修饰,或者STT3A遗漏的位点的糖基化。过去45年来研究糖基化的功能主要是衣霉素,这种高毒性天然产物能够几乎抑制所有的N连接糖基化。近年来,作者通过高通量筛选出来一种的新的OST的小分子抑制剂NGI-1,并且没有衣霉素抑制剂带来的细胞毒性,且更倾向对SST3B抑制。因此作者想设计出来一系列的NGI-1类似物来实现蛋白质糖基化位点的选择性修饰。 NGI-1小分子抑制剂对SST3A和STT3B抑制效果 作者首先研究了NGI-1系列类似小分子抑......阅读全文

糖基转移酶的小分子抑制剂编辑氮连接连接糖基化位点

  蛋白质的N连接的糖基化是一种重要的蛋白翻译后修饰,对蛋白质的折叠、稳定性和生理功能均起着重要的作用。N连接糖基化修饰主要是通过糖基转移酶(OST)将寡糖逐渐转移到蛋白质中的NXT/S (X≠P) 序列上的天冬酰胺上。OST含有两个独立编码的催化亚基,分别为SST3A和STT3B。SST3A负责大

解析糖基化修饰及位点分析

  经常听到糖基化修饰,今天带大家一探究竟。什么是糖基化修饰呢?糖基化是在糖基转移酶的控制下,蛋白质或脂质附加上糖类的过程,发生于内质网和高尔基体。糖基化修饰是一类非常重要的翻译后修饰,大部分膜蛋白和分泌蛋白均为糖蛋白,糖基化修饰不仅影响蛋白质的空间构象、活性、运输和定位,同时在信号转导、分子识别,

酶的活性位点的作用

酶的活性位点通常是蛋白质表面一个能够让底物结合和嵌入的凹陷或裂隙,底物通常通过不同的相互反应结合位点上与现存的氨基酸结合,如:氢键、离子键、范德华力相互作用或偶极-偶极相互作用。例如,底物可能通过氢键结合在丝氨酸残基上,也可通过离子键结合在天冬氨酸残基上,或通过范德华力结合在苯丙氨酸残基上。这些结合

酶的活性位点的定义

酶的活性位点通常是蛋白质表面一个能够让底物结合和嵌入的凹陷或裂隙,底物通常通过不同的相互反应结合位点上与现存的氨基酸结合,如:氢键、离子键、范德华力相互作用或偶极-偶极相互作用。例如,底物可能通过氢键结合在丝氨酸残基上,也可通过离子键结合在天冬氨酸残基上,或通过范德华力结合在苯丙氨酸残基上。这些结合

糖基化位点检测

  经常听到糖基化修饰,今天带大家一探究竟。什么是糖基化修饰呢?糖基化是在糖基转移酶的控制下,蛋白质或脂质附加上糖类的过程,发生于内质网和高尔基体。糖基化修饰是一类非常重要的翻译后修饰,大部分膜蛋白和分泌蛋白均为糖蛋白,糖基化修饰不仅影响蛋白质的空间构象、活性、运输和定位,同时在信号转导、分子识别,

DNA-酶-I-超敏感位点作图

实验材料 真核细胞试剂、试剂盒 缓冲液 AEDTA乙醇裂解缓冲液磷酸盐缓冲液台盼蓝染料DNA 酶 I 稀释缓冲液DNA 酶 I 溶液蛋白酶 K 溶液RNA 酶溶液酚:氯仿SDS 缓冲液TE仪器、耗材 Sorvall H1000B 转头或等价物带螺帽的试管振荡水浴锅实验步骤 材料缓冲液和溶液贮存液、缓

DNA-酶-I-超敏感位点作图

DNA 酶 I 超敏感位点作图法经常用于定位真核基因的调控区。由于还未被理解的原因,基因带有对 DNA 酶 I 切割敏感的分开的序列,而且这些所谓超敏感位点图谱是随基因的激活状态而变化的(Weintrauband Gmudine1976)。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J.

DNA-酶-I-超敏感位点作图

            实验材料 真核细胞 试剂、试剂盒 缓冲液 A EDTA 乙醇 裂解缓冲液

凝血酶切割位点的定义

中文名称凝血酶切割位点英文名称thrombin cleavage site定  义基因工程表达系统中融合蛋白常用的连接序列,凝血酶处理可将融合蛋白中目的蛋白与非目的蛋白的肽段分离,最适切割位点是:P4-P3-P2-Arg↓-P1′-P2′,式中P4和P3为疏水氨基酸,P1′和P2′为非酸性氨基酸,↓

叶绿体电子传递链的抑制剂作用位点

DCMU和DBMIB阻止电子传递反应,而还原态的百草枯自动氧化为基本离子,导致超氧和其他活性氧种类的形成。

蛋白酶的分类及作用位点

 蛋白酶分类作用位点已知抑制物氨基肽酶金属蛋白酶带有自由氨基的L-氨基酸氨基末端;不能分解由X-Pro、·D或·Q组成的肽键2,2,双吡啶,1.1()-菲咯啉菠萝蛋白酶巯基蛋白酶无特异性α2巨球蛋白,TPCK,TLCK,烷化羧肽酶A锌金属蛋白酶带有自由氨基酸的L—氨基酸羧基端;不能分解R、P或羟脯氨

蛋白酶的分类及作用位点

蛋白酶分类作用位点已知抑制物氨基肽酶金属蛋白酶带有自由氨基的L-氨基酸氨基末端;不能分解由X-Pro、·D或·Q组成的肽键2,2,双吡啶,1.1()-菲咯啉菠萝蛋白酶巯基蛋白酶无特异性α2巨球蛋白,TPCK,TLCK,烷化羧肽酶A锌金属蛋白酶带有自由氨基酸的L—氨基酸羧基端;不能分解R、P或羟脯氨酸

限制[性酶切]位点的定义和应用

中文名称限制[性酶切]位点英文名称restriction site定  义限制性内切酶在DNA双链上所识别的一些特殊序列。在分子生物学和基因工程中常用的Ⅱ型限制性内切酶识别的多为4、6或8对核苷酸的双链回文序列。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

识别位点

中文名称识别位点英文名称recognition site定  义限制性内切酶特异结合的核苷酸序列。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

剪接位点

中文名称剪接位点英文名称splicing site;splice site定  义剪接体可识别的RNA前体中内含子和外显子连接边界的序列和接头位点。根据位置不同可以分为供体和接纳体剪接位点。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

单抗药物的分子质量、氨基酸序列以及糖基化位点鉴定-一

1. 前言单抗药物主要是由两条重链和两条轻链通过链内和链间二硫键以及非共价键组成,分子质量大约在 150 kD 左右,每条重链和轻链在 N 端都包含一个可变区域,在 C 端都包含一个恒定区域,并且在每条重链上还存在一个 N 糖基化位点,该位点含有不同的糖链结构,如图 1 所示。目前,在生

单抗药物的分子质量、氨基酸序列以及糖基化位点鉴定-三

经过 Protein Deconvolution 2.0 软件去卷积处理之后的单抗分子质量分布图(图 3),根据单抗的氨基酸序列理论分子质量进行计算,将观察到的质谱峰进行归属,可以初步推断该单抗药物存在多种形式的糖链结构,主要包括 G0、G0F、G1F 和 G2F,该结论与常见的单抗组成基本

单抗药物的分子质量、氨基酸序列以及糖基化位点鉴定-二

质谱分析条件:具体见表 4; 表 3. 氨基酸序列测定的色谱分析条件表 4. 氨基酸序列测定的质谱分析条件 2.2.3 数据分析方法采用 Proteome Discoverer 1.3 软件对原始谱图进行数据库搜索,具体搜库参数为:包含单抗氨基酸序列的数据库;半胱氨酸(C)烷基化(+57.021

生物酶学基础蛋白酶的分类及作用位点

蛋白酶分类作用位点已知抑制物氨基肽酶金属蛋白酶带有自由氨基的L-氨基酸氨基末端;不能分解由X-Pro、·D或·Q组成的肽键2,2,双吡啶,1.1()-菲咯啉菠萝蛋白酶巯基蛋白酶无特异性α2巨球蛋白,TPCK,TLCK,烷化羧肽酶A锌金属蛋白酶带有自由氨基酸的L—氨基酸羧基端;不能分解R、P或羟脯氨酸

进入位点

中文名称进入位点英文名称entry site定  义特指氨酰tRNA进入核糖体的部位。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科) 

加帽位点

中文名称加帽位点英文名称cap site定  义mRNA中加帽结构的部位,该位点在前体mRNA的5'端。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

ADC-单抗药物的分子量、氨基酸序列、糖基化位点以...(一)

ADC 单抗药物的分子量、氨基酸序列、糖基化位点以及ADC 药物结合位点鉴定1. 前言单克隆抗体药物是具有高度特异性的靶向药物,能够特异性作用于肿瘤细胞,被誉为治疗恶性肿瘤的“生物导弹”。ADC 抗体药,则是在抗体蛋白的特定天然氨基酸上非定点偶联具有抗肿瘤作用的化疗药物(或称小分子药物),以增加

ADC-单抗药物的分子量、氨基酸序列、糖基化位点以...(二)

2.1.3 数据分析方法采用 Protein Deconvolution 2.0 软件对原始质谱图进行去卷积处理,得到完整的蛋白质分子量信息。 2.2 氨基酸序列、糖基化位点和 ADC 药物结合位点测定 2.2.1 仪器和试剂质谱仪器:Q-Exactive(赛默飞世尔科技,美国);色谱仪器:Acce

ADC-单抗药物的分子量、氨基酸序列、糖基化位点以...(四)

3.2 糖基化位点确定ADC 单抗蛋白与其他单抗蛋白相同,也都包含 N-糖基化修饰,一般发生在保守序列 NXS 或 NXT 中(X 为除脯氨酸外的任意氨基酸)。在糖链完整的情况下,直接进行 trypsin 酶解,我们在搜库时进行 G0F 糖基化可变修饰设定,可以直接获得该 N 糖基化位点:重

ADC-单抗药物的分子量、氨基酸序列、糖基化位点以...(三)

经过 Protein Deconvolution 2.0 软件去卷积处理之后的单抗分子量分布图如下所示(图 4),根据单抗的氨基酸理论序列分子量进行计算,将观察到的质谱峰进行归属,从图中我们观察到,该 ADC 单抗分子之间存在 956 Da 左右的质量增加,由此推断该单抗分子结合了不同数目的

亚甲基四氢叶酸还原酶相关SNP位点

  (1)MTHFR C677T rs1801133;  (2)MTHFR A1298C rs1801131;  (3)MTRR A66G rs1801394;  研究认为,以上位点多态性与多种疾病相关:  (1)妇幼保健类:神经管缺陷、先天性心脏病、唇腭裂、妊娠期高血压疾病,自发性流产;  (2)

限制[性酶切]位点保护试验的方法和应用

中文名称限制[性酶切]位点保护试验英文名称restriction site protection experiment定  义当一段DNA被某些蛋白质(如转录因子、组蛋白等)结合后,这段DNA上的限制性酶切位点就不会被相应的限制性酶切开。因此将待研究的DNA与蛋白质一起保温,再用该DNA链上已知的限

蛋白质糖基化的检测实验——酶脱糖基化

实验方法原理用酶或化学脱糖基化、通过选择性标记或通过凝集素亲和层析法是检测蛋白糖基化常用方法。实验材料蛋白样品试剂、试剂盒磷酸钠缓冲液蛋白溶液β-巯基乙醇NP-40 溶液仪器、耗材SDS-PAGE玻璃器皿植物凝集素柱实验步骤一、用 PNGaseF(N-多糖酶)处理1. 以 0.1 mol/L 磷酸钠

nut-位点的定义

中文名称nut 位点英文名称nut site定  义噬菌体基因组中抗终止因子N蛋白的识别位点。N蛋白对nut位点的识别和随之发生的相互作用,使RNA聚合酶能忽略终止信号而持续通过终止子。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

什么是活性位点

者一般用在大分子化学中,活性位点指的是可以发生化学反应的集团。活性位点少,发生有效碰撞的机率就少,也就是说反应比较单一,容易被控制