蛋白质组学及其在植物生态毒理学研究中的应用

摘 要:蛋白质组学是近年来兴起的生命科学的前沿领域。当从mRNA水平考虑和对单个蛋白质进行研究已无法满足后基因组时代要求时,蛋白质组学应运而生。蛋白质组学能阐明基因组所表达的真正执行生命活动的全部蛋白质的表达规律和生物功能。蛋白质组学主要的研究内容分为:表达蛋白质组学、功能蛋白质组学和结构蛋白质组学。目前在植物生态毒理学研究中,一般通过研究在有毒物质胁迫下植物的蛋白质组与正常条件下植物蛋白质组的表达、结构、功能等的区别来实现的。评述了蛋白质组学的产生背景、基本含义和主要研究内容,综述了蛋白组学在植物生态毒理学研究中的应用。点击这里进入下载页面:进入下载页面......阅读全文

综述:基于质谱技术的糖蛋白质组学与糖组学研究进展

   糖是组成生命体的四大类重要分子之一,糖蛋白质是由糖链与肽链中的特定氨基酸残基以糖苷键共价连接而成的蛋白质。糖蛋白质普遍存在于生物体内,在很多生命过程中起着重要作用,如蛋白质的折叠、细胞之间的相互识别、炎症反应等。同时,糖基化修饰在疾病中,特别是肿瘤的发生、发展和转移过程中也起到重要作用,许多疾

Nat-Rev-Cancer综述:肿瘤蛋白质基因组学

导 读       肿瘤蛋白质基因组学(Cancer proteogenomics)是将基于质谱(MS)的蛋白质丰度和翻译后修饰(PTM)信息与临床前肿瘤模型和肿瘤样本的基因组、表观基因组和转录组数据相结合的组学技术。基因组学和表观基因组学为解释可能发生的生物过程提供了基础知识,蛋白质组学是对已经发

植物蛋白质组学和糖基化(二)

4. 注释( 1 ) 每个实验均使用新鲜的 3 mol/L 甲醇- HCl 和硅烷化试剂。( 2 ) 要仔细识别蛋白质印迹,因为 WGA 既能识别 N-糖苷的 GlcNAc,也能识别 O-GlcNAc。( 3 ) 用于在硝酸纤维素印迹膜上封闭结合位点的溶液应避免糖蛋白污染。所以我们建议在这一步骤中使

蛋白质组学揭示植物干旱胁迫的分子机制

 Significant and unique changes in phosphorylation levels of four leaf phosphoproteins in two apple rootstock genotypes under drought stress.干旱胁迫对

植物蛋白质组学和糖基化实验

实验材料链霉亲和素-过氧化物酶                                                                  牛胰核糖核酸酶 B                                                            

植物蛋白质组学和糖基化(一)

 1. 前言与其他真核细胞一样,植物细胞中,糖基化通常发生在分泌蛋白质上,虽然在细胞质蛋白和核蛋白上也发现一些糖基化反应。根据寡糖部分和蛋白质骨架之间的连接方式,可将糖基化分为两种类型:N -糖基化和 O-糖基化。植物中 N-糖基化研究最多。1.1 N-糖基化与其他真核细胞一样,在植物细胞中,N-糖

顽拗性植物组织的蛋白质组学研究实验

顽拗性植物组织的蛋白质组学研究(苯酚法提取蛋白质)实验材料植物组织                                                          试剂、试剂盒苯酚                                                  

2025蛋白质组学大会之蛋白质组学新技术

2025年10月13日上午,蛋白质组学新技术(Emerging proteomics technologies)专题分论坛顺利召开。本场会议由本领域学者陆豪杰教授、王初教授、谭敏佳教授、秦伟捷教授和Yasushi Ishihama教授共同召集和组织。来自海内外的多位知名学者围绕该领域的前沿进展,分享

植物蛋白质组学和糖基化实验1

实验材料链霉亲和素-过氧化物酶牛胰核糖核酸酶 B甲基比喃甘露糖苷卵清白蛋白试剂、试剂盒DIG 糖链检测试剂TTBS 缓冲液Lectin- biotinTBS 缓冲液实验步骤3.1 这个蛋白质是糖蛋白吗只有一种方法能全面的回答“这个蛋白质是糖蛋白吗?”这个问题。这需要使用能检测并定量印记上糖蛋白的总糖

植物蛋白质组学和糖基化实验(二)

刀豆球蛋白 A (ConA)- 过氧化物酶方法(根据参考文献 20 修改的方法)。( 1 ) 通过 1D 或 2D 电泳分离,并转移到硝酸纤维素膜上。( 2 ) 用 TTBS 缓冲液浸泡印迹膜 1 h。( 3 ) 将印迹膜在含有 ConA ( 25 μg/ml)的 TTBS 缓冲液中,室温下温育 2

植物蛋白质组学和糖基化实验(五)

1. 含高甘露糖型 N-糖苷糖蛋白的鉴定本方法是我们实验室以油菜籽为实验材料建立的,本方法也适用于其他植物材料。( 1 ) 将 6 g 植物材料放入 4°C 预冷的研钵中,加入 50 ml 预冷的 TBS 缓冲液,研磨萃取蛋白质(见注释 13),接着 10000 g 离心萃取物 30 min,去

植物蛋白质组学和糖基化实验(一)

实验材料 链霉亲和素-过氧化物酶牛胰核糖核酸酶 B甲基比喃甘露糖苷卵清白蛋白试剂、试剂盒 DIG 糖链检测试剂TTBS 缓冲液Lectin- biotinTBS 缓冲液实验步骤 3.1 这个蛋白质是糖蛋白吗只有一种方法能全面的回答“这个蛋白质是糖蛋白吗?”这个问题。这需要使用能检测并定量印记上糖蛋白

植物蛋白质组学和糖基化实验(四)

3.3 我的糖基化蛋白在哪实验人员可通过这个方法获得关于糖苷在蛋白骨架上的分布及糖苷本身的结构信息。这类实验可在纯化的糖蛋白或者从 1D 或 2D 电泳胶上分离出来的蛋白上进行,首先,用蛋白内切酶消化蛋白质,通过高效液相色谱(HPLC) 分离消化后的肽和糖肽混合物。对含有糖苷的收集组分进行糖

植物蛋白质组学和糖基化实验(三)

3. 糖基释放后的蛋白质分析1 ) 糖基释放的化学处理方法还原性氨化反可应选择性的解离糖蛋白上的 O-糖苷(见注释 10) 。去糖基化的蛋白用 1D SDS-PAGE 分析,将其迁移情况与其糖基化形式的蛋白进行比较,电泳迁移率的增加是 O-连糖苷出现在蛋白上的证据(见注释 11)。( 1 ) 将 1

蛋白质组学在植物科学研究中的应用

1 植物群体遗传蛋白质组学 1.l 遗传多样性蛋白质研究基于基因组学的一些遗传标记,如RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)、RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)、SSR(Simple Sequen

植物蛋白质组学和糖基化实验2

3. 糖基释放后的蛋白质分析1 ) 糖基释放的化学处理方法还原性氨化反可应选择性的解离糖蛋白上的 O-糖苷(见注释 10) 。去糖基化的蛋白用 1D SDS-PAGE 分析,将其迁移情况与其糖基化形式的蛋白进行比较,电泳迁移率的增加是 O-连糖苷出现在蛋白上的证据(见注释 11)。( 1 ) 将 1

2025蛋白质组学大会之蛋白质组学与多组学的融合

  本次分论坛以“Proteomics Marries Other Omics(蛋白质组学与多组学的融合)”为主题,围绕蛋白质组学在疾病机制研究、代谢重编程、肿瘤学与免疫学中的最新应用展开。会议旨在探讨蛋白质组学与代谢组学、转录组学等多组学技术的深度融合与交叉创新,为精准医学与系统生物学的发展提供新

蛋白质组与蛋白质组学简介2

3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合,然后将DNA从被修饰的碱基处切割,电泳分离,结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰,不能切断,可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白

蛋白质组与蛋白质组学简介1

一、蛋白质组概念:一个细胞、一个组织或一个机体全部基因所表达的全部蛋白质。 二、蛋白质组学研究范畴 1.蛋白质和蛋白质间 2.蛋白质和核酸之间 3.蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定 4.蛋白质结构分析 5.生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表

顽拗性植物组织的蛋白质组学研究(苯酚法提取蛋白质)

实验材料植物组织试剂、试剂盒苯酚提取缓冲液沉淀液等电聚焦缓冲液仪器、耗材低温粉碎机实验步骤3.1 蛋白质提取( 1 ) 新鲜植物组织在液氮中冷冻,然后在自动低温粉碎机中预先冷却的钢杯中将材料研磨成细碎的粉末(见注释 4) 。( 2 ) 在一个 15 ml 的离心管(falcon  tube) 中加入

顽拗性植物组织的蛋白质组学研究(苯酚法提取蛋白质)

1. 前言提取蛋白质是蛋白质组学研究的第一步。植物组织的蛋白质含量较低,并且存在多种非蛋白质成分,如细胞壁及贮藏多糖、脂质和酚类化合物,使蛋白质的提取难度增大 。植物蛋白质的可溶性与它们的细胞内定位关系密切,传统的蛋白质提取方法是用水合缓冲液、去垢剂或直接沉淀法 [1] 。除了普遍使用的 TCA

顽拗性植物组织的蛋白质组学研究(苯酚法提取蛋白质...

顽拗性植物组织的蛋白质组学研究(苯酚法提取蛋白质)实验实验材料 植物组织试剂、试剂盒 苯酚提取缓冲液沉淀液等电聚焦缓冲液仪器、耗材 低温粉碎机实验步骤 3.1 蛋白质提取( 1 ) 新鲜植物组织在液氮中冷冻,然后在自动低温粉碎机中预先冷却的钢杯中将材料研磨成细碎的粉末(见注释 4) 。( 2 ) 在

2025蛋白质组学大会之单细胞蛋白质组学研究

  2025年10月13日上午10:10,第12届AOHUPO大会暨第8届AOAPO大会、π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会“Single Cell Proteomics”分论坛在广州白云国际会议中心汕头厅(Shantou Hall)成功举行。  本场论坛由浙江大学方群

2025蛋白质组学大会之微生物蛋白质组学

2025年10月14日下午,聚焦于微生物蛋白质组学领域的专题分会场在广州白云国际会议中心107会议室正式拉开帷幕。会议由王恒樑、马庆伟、刘小云、李乐园四位教授召集,现场由刘小云、Paola Roncada教授主持。来自意大利卡坦扎罗“大希腊”大学、比利时根特大学、复旦大学、西湖大学、国家蛋白质科学中

综述:代谢组学在疾病中的应用

   代谢组学经历了迅猛的技术演化在过去二十年。尤其是广泛靶向代谢组学技术的新起,实现一次性检测坚定上千种物质,同时能够定量。整合了非靶向和靶向代谢物检测技术的优点,创造性实现了高通量、高灵敏度靶向代谢物检测,为定性、定量检测大批量、低丰度代谢物提供了高效的方法。   应用代谢组学的定义事件的预测生

Nature子刊实验室洞察:高通量蛋白质组学方法学综述

    在后基因组时代,蛋白质组学在生物医学研究中发挥着重要作用。2022年8月,Nature子刊《Laboratory Investigation》发表了一篇高通量蛋白组的mini-review,概述了高通量蛋白质组学技术、统计和算法的进展。    蛋白质组学作为蛋白质组实验和数据分析的结合,从整

APT文献-|-蛋白质组学揭示植物干旱胁迫的分子机制

  Significant and unique changes in phosphorylation levels of four leaf phosphoproteins in two apple rootstock genotypes under drought stress.   干旱胁

植物磷酸化蛋白质组学技术研发方面获进展

  蛋白质磷酸化是在激酶催化下将磷酸基团转移到底物蛋白质上的可逆过程,是能够调控蛋白质结构与功能且参与细胞内信号转导的重要翻译后修饰,在植物的生长、发育、环境适应以及作物的产量和品质调控中发挥着重要作用。深度解析磷酸化蛋白质组,是探讨磷酸化如何参与这些生物学过程以及筛选与作物重要农艺性状相关的关键磷

APT文献-|-蛋白质组学揭示植物干旱胁迫的分子机制

   Significant and unique changes in phosphorylation levels of four leaf phosphoproteins in two apple rootstock genotypes under drought stress.   干旱

2025蛋白质组学大会之跨物种蛋白质组学研究

  2025年10月14日下午,第12届AOHUPO大会、第8届AOAPO大会、π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会“Cross-species Proteomics(跨物种蛋白质组学)”分会场于广州白云国际会议中心国际会堂顺利举行。会议由中国科学院北京基因组研究所 (国