新研究解析栽培草莓“祖先”基因组图谱

草莓具有重要的经济价值和营养价值,现代八倍体栽培草莓起源于两个八倍体野生种——弗州草莓和智利草莓的种间杂交。近日,中国科学院昆明植物研究所研究员朱安丹课题组深入解析了八倍体草莓的起源和遗传分化特征。相关成果在线发表于《自然-植物》。 朱安丹表示,由于草莓属系统发育解析涉及未知的祖先、同源染色体交换和不完全谱系分选等问题,八倍体草莓的二倍体祖先问题至今仍存在较大争议。此外,八倍体草莓在驯化过程中的亚基因组的同源偏向性表达及转变模式并不明确。 该研究提出了一套适用于多倍体的ALLHiC迭代挂载流程,构建了两个八倍体野生草莓——弗州草莓和智利草莓染色体水平的高质量分型基因组。研究人员完成了八倍体草莓亚基因组的分离,并在此基础上采用不同的分析方法重新追溯了八倍体草莓的二倍体祖先。 研究结果纠正了国外学者在亚基因组分配上的错误,并进一步确定森林草莓和饭沼草莓是八倍体草莓现存的二倍体祖先种。研究还探讨了八倍体草莓在驯化过程中的同源......阅读全文

研究解析栽培草莓“祖先”的基因组图谱

草莓具有重要的经济和营养价值,现代八倍体栽培草莓起源于两个八倍体野生种弗州草莓和智利草莓的种间杂交。近日,中国科学院昆明植物研究所研究员朱安丹专题组深入解析了八倍体草莓的起源和遗传分化特征。相关研究成果在线发表于《自然-植物》。朱安丹表示,由于草莓属系统发育解析涉及未知的祖先、同源染色体交换和不完全

草莓和可可树基因组图谱出炉

  据美国物理学家组织网12月26日报道,在26日出版的《自然—遗传学》杂志上,两组科学家表示,他们分别解开了野生草莓和克里奥洛可可树的基因密码,新发现有助于育种专家培育出品质更高的草莓和可可树品种。   英国生物工艺学和生物学研究委员会(BBSRC)和其他4个国家的70名研究人员绘制出了野生草莓

首个草莓完整基因组发布

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494423.shtm草莓是蔷薇科植物,在世界范围内被广泛栽植。其约有25个种,倍性十分丰富,从二倍体到十倍体均有。森林草莓作为草莓二倍体模式种,有很大的研究价值。2018年GigaScience发表了利用

日破译人工栽培草莓基因组

  日本研究人员27日报告说,他们破译了人工栽培草莓的基因组,这一成果将有助于开发更好看好吃并能抵抗虫害的新品种草莓。   位于千叶县木更津市的上总DNA研究所在英国《DNA研究》杂志网络版上介绍说,研究人员将人工栽培草莓品种“丽红”的染色体DNA序列分成片段,分析碱基对的排列,并与4种野生草莓进

草莓甜度可控啦-基因组编辑能精细调控草莓糖分含量

  无性繁殖植物在农业生产中具有重要地位,但是长期无性繁殖导致性状多样性的严重匮乏极大阻碍了无性繁殖作物的育种发展。在育种设计中,对数量性状的精细调控可以避免产生剧烈的性状变化,并且可以极大丰富性状多样性,对推进精准育种有重要意义。基因组编辑技术通过对调控元件的遗传操作可以实现对数量性状的改良。对于

Nature-Genetics:多种技术解析草莓基因组

  近日,美国密歇根州立大学和加州大学戴维斯分校的研究人员组装出近乎完整的栽培草莓基因组,并揭示了这种复杂的异源多倍体的起源和进化过程。  一转眼又到了草莓上市的季节。这种小巧可爱的果实有着酸甜可口的味道,可搭配出各种各样的美妙滋味。不过,对于草莓的基因组,你又了解多少?  世界各地广泛种植的凤梨草

最大动物基因组图谱——南极磷虾基因组图谱破译

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm   ? Cell官网截图。黄海水产研究所供图   日前,由中国水产科学研究院黄海水产研究所联合青岛华大基因研究院、德国阿尔弗雷德?魏格纳研究所、澳大利亚联邦科学

科学家搭建草莓基因组数据库

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓为蔷薇科草莓属,因芳香多汁、营养丰富受到喜爱,在全国各地均可种植。栽培草莓为异源多倍体,基因组复杂,杂合度高。 2019年,《自然—遗传学》发表了利用三代测序数据组装的高

Nature公布大麦基因组图谱

  大麦是世界上最重要的粮食作物之一,17日Nature公布了目前为止最完善的大麦基因组测序图谱。这项由美国农业部主导的大工程,在德国、日本、芬兰、澳大利亚、英国、美国和中国科学家们的共同努力下,历经六年终于取得了重大进展。大麦基因组图谱将成为人们提高大麦产量、增强大麦抗虫抗病能力、增加大麦营养价值

几近完整的高质量草莓参照基因组公布

  据英国《自然·遗传学》杂志25日在线发表的一项研究,美国科学家报告了一个几近完整的草莓参照基因组。该高质量基因组不但为了解草莓起源和演化历史提供了新见解,还对未来改善其品种及提高抗病性大有助力。  八倍体栽培种草莓卡姆罗莎有8组染色体,也被称为花园草莓,因其味美清香而深受喜爱。  此次,美国密歇

草莓基因组研究取得成果-|《自然遗传学》

  《自然-遗传学》本周在线发表的一篇论文Origin and evolution of the octoploid strawberry genome报告了一个几近完整的草莓参照基因组。该基因组为了解这一广受欢迎的水果的起源和演化历史提供了新见解。八倍体草莓的演化史。Edger et al.  八

首次绘制小麦表观基因组图谱

  最近,英国利物浦大学的科学家们,对小麦中调节基因活性的遗传性分子变化,进行了首次全基因组范围的调查,这可能成为提高作物育种技术的一种新工具。相关研究结果发表在最新一期的《Genome Biology》。延伸阅读:权威期刊发布首个小麦单体型图谱。  表观遗传标记是一种化学标签,将自己附着在DNA上

基因组图谱的方法和意义

中文名称基因组图谱英文名称genomic map定  义展示一种生物全基因组结构的图谱。按建立图谱的研究目的方法和精细程度,可以有不同的形式,包括以遗传学方法建立的遗传连锁图谱,按距离绘出基因位置分布的物理图谱,经测定核酸序列建立的核苷酸序列图谱,以及标记出可表达序列的转录图谱等。应用学科生物化学与

首个家鸡基因组图谱绘制完成

西南大学教授徐洛浩课题组以中国特有家鸡品系胡须鸡为材料,在国际上率先绘制出首个家鸡全基因组图谱。2月13日,相关研究成果以《家鸡基因组完成图的演化分析》为题,发表在美国《国家科学院院刊》上。这是继去年人类基因组完成图公布以来,首个发表的脊椎动物基因组完成图,也是基因组完成图谱绘制技术首次在经济动物中

揭秘:帝王蟹的基因组图谱

  科学家成功获得高质量帝王蟹基因组图谱   帝王蟹 唐伯平供图  帝王蟹基因组染色体图谱 唐伯平供图  帝王蟹和其他泛甲壳动物的系统演化关系 唐伯平供图  近日,《分子生态资源》发表了首个歪尾类螃蟹的高质量基因组图谱,即一种重要经济蟹类蓝帝王蟹(Paralithodes platypus)的基因组

Scientific-Reports:创建首个全面基因组图谱

  近日,澳大利亚加文医学研究所的研究人揭示身体不同部位脂肪积聚所造成的伤害的驱动因素。他们的一项新研究比较了皮肤下的脂肪细胞和腹部内的有害脂肪,创建了第一个全面的基因组图谱。该图谱揭示了在细胞发育早期独特的特征,不同类型的脂肪似乎“硬捆绑”(hard-wire)在一起。该研究发表于Scientif

小须鲸全基因组图谱获破译

  11月25日,韩国海洋科学技术研究所、深圳华大基因研究院等宣布成功破译了小须鲸全基因组图谱,并对鲸类独特生理习性的遗传学机制进行了分析。相关成果在线发表于《自然—遗传学》杂志。 人们一直痴迷于海洋生物是如何演化为陆生生物的。鲸类的进化却反其道而行之,由陆生向水生演化,和陆生偶蹄动物如牛、猪等

玉米基因组更详细图谱出炉

  美国研究人员12日在《自然》杂志网络版上发表论文称,他们利用新一代测序技术对玉米自交系B73进行测序,得到了新的、更详细的基因组图谱。研究显示,玉米具有良好的表型可塑性,不同品系玉米的基因组差异明显。这意味着在全球气候环境变化不断加剧的情况下,玉米仍有巨大的发展空间。  玉米是生物学研究中的重要

老鼠基因组单体型图谱出炉

美国的研究人员希望通过对15只常用于生物医药研究的小鼠的DNA进行研究来帮助科研人员确定出与环境疾病敏感性相关的基因。目前这些数据被存放在了基因变异数据目录之下,即小鼠基因组单体型图谱(将染色体分隔成许多小的片段),从而帮助研究人员找出小鼠中影响健康和疾病的基因和遗传变异。这个单体型图谱公布在7月2

铁树“开花”:苏铁喜获完整基因组图谱

苏铁基因组图谱研究由来自22个科研机构的65位科学家联合完成。  苏铁目系统发育树支持现存苏铁是在经历大量灭绝以后,几次辐射演化的后代。如今苏铁有2科10属。(刘阳供图)  也许你不熟悉苏铁类植物,但你一定听说过“铁树开花”这个成语,比喻事情很难实现。相传因受苏东坡青睐,铁树得名“苏铁”。作为现存最

玉米基因组更详细图谱出炉

  美国研究人员12日在《自然》杂志网络版上发表论文称,他们利用新一代测序技术对玉米自交系B73进行测序,得到了新的、更详细的基因组图谱。研究显示,玉米具有良好的表型可塑性,不同品系玉米的基因组差异明显。这意味着在全球气候环境变化不断加剧的情况下,玉米仍有巨大的发展空间。  玉米是生物学研究中的重要

基因组物理图谱的主要构架途径

基因组物理图谱的构建不需要经过减数分裂的世代群体,可直接利用DNA分子分析,主要有以下三种构建途径:限制性酶图谱。利用限制性内切酶构建图谱,对于DNA分子长度在50kb以下的片段,一般没有什么困难。而对于大于50kb的DNA分子,可选用稀有切点的内切酶酶切DNA。(1)用识别较多核苷酸的内切酶,如N

OPGEN全基因组图谱应用系列——鞭虫全基因组测序

鞭虫是一种常见的土壤传播寄生虫,地理分布广,感染率高,寄生于人体盲肠,导致人体慢性感染,对人类危害巨大。鞭虫的全基因组测序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,发表在世界顶级期刊《Nature Genetics》上。该研究通过对2种不同

草莓季来袭!莲都23个草莓种植基地草莓检测结果在此!

  现在正值草莓季,莲都区的草莓已经全面上市,为保障广大消费者舌尖上的安全,保障莲都草莓质量安全,莲都区农业局近期对辖区内23个草莓种植基地,开展质量安全监督抽检。  都检查了哪些项目?检测结果如何?赶紧随小编一起来看看吧~  检测项目  区农业局随机抽取草莓样品23批次进行监督抽检。检测内容包括:

印度绘制出结核杆菌基因组图谱

  印度科学与工业研究理事会会长布拉姆哈查里近日宣布,印度研究人员成功绘制出了结核杆菌的基因组图谱,这将有助于研发有效治疗结核病的新型药物。   综合当地媒体报道,来自印度全国的数百名研究人员参与绘制出了包含4000个基因的结核杆菌基因组图谱。   据悉,印度将在互联

草鱼全基因组序列图谱绘制完成

  近日,记者从中国科学院水生生物研究所获悉,该所鱼类功能基因组学学科组负责的草鱼全基因组序列图谱绘制完成。该成果由水生生物研究所、中国科学院国家基因研究中心和中山大学等机构合作完成,相关研究成果于5月4日在线发表于《自然—遗传学》杂志。  据该所研究员汪亚平介绍,该研究采用鸟枪法测序策略,分别对一

新基因图谱揭示基因组交叉地带

  据英国《新科学家》网站近日报道,美国科学家绘制出了目前世界上最先进的人类基因图谱,该图谱能帮助更准确地识别某些影响特定人群的遗传病根源。   这一基因图谱发现,西非人后裔的基因中有着欧洲人后裔所没有的基因重组的高发地带,这有可能是导致特定人种先天性疾病诸如贫血症的遗传学原因。当然

牡蛎全基因组序列图谱绘制完成

牡蛎基因组部分序列及其分析牡蛎基因组计划(OGP)团队成员在深圳华大基因研究院讨论项目中国科学院海洋研究所和深圳华大基因研究院签约仪式牡蛎是产量最大的海水养殖动物  牡蛎养殖  近日,牡蛎基因组计划(Oyster Genome Project,OGP)项目组宣布,

-首个越南人基因组图谱绘制完成

  越南科学家日前首次成功绘制出一名越南人的基因组图谱。   越通社报道说,来自河内国家大学下属科技大学的研究小组1月16日公布了这份基因组图谱绘制与分析的初步结果。   该研究组主任黎士荣表示,2013年年底,研究小组收到一名越南人的基因组数据,在此基础上对其进行分析排序,成功绘制出基因组图谱

历经13年-小麦基因组图谱绘制完成

经过13年努力,来自20个国家73个研究机构的200多名科学家终于绘制完成完整的小麦基因组图谱。这项“里程碑”工作为培育产量更高、营养更丰富、气候适应性更强的小麦品种奠定基础。 国际小麦基因组测序协会16日在说,他们以一种叫做“中国春”的小麦遗传研究模式品种为材料,研究整合了21条小麦染色