Nature新文章解析三大基因组
发表在最新一期(12月19日)《自然》(Nature)杂志上的一篇新文章，揭示了三个重要生物――水蛭(leech)、海蠕虫(Capitella teleta)和青贝(limpet)基因组。通过这一研究，来自莱斯大学、加州大学伯克利分校和美国能源部联合基因组研究所(JGI)的科学家们将冠轮动物(Lophotrochozoans)的基因组数量增加了一倍以上。 冠轮动物是一种种类繁多的动物类群，包括软体动物(如蜗牛、蛤类和章鱼)以及环节动物(如水蛭和蚯蚓)。像人类和所有其他动物一样，冠轮动物的进化历史可以追溯到最早的多细胞生物。然而在5亿多年以前，冠轮动物进化树分支便与生成人类的分支分离。 “包括人类在内的大多数动物，都具有左右对称的体制，它们的左右两侧就像是彼此的镜中像。当你聚焦所有的两侧对称物种时，可以将它们分为三个大群，即生物学家所谓的分支(clade)，”研究的共同作者、莱斯大学生态学和进化生物学助理教授N......阅读全文
“活化石”软体动物基因组揭示眼睛进化密码
眼睛是我们接收外界信息的一个重要器官，通过眼睛我们才能看到这个多样的世界。但人类的视觉和其他物种有着很大的差别，更有一些物种眼睛的结构和色彩感知能力远不如人类，虽然其近亲进化出了复杂的眼睛，那些眼睛只有简单结构的“古老”物种，是如何保持其原始眼睛特征的？ 5月11日，《自然-生态与进化》杂志
古代软体动物形似榴莲
软体动物是地球上最多样化的动物群体之一，但它们的起源是个谜。一块新发现的约5.1亿年前的软体动物化石——类似于切成两半的榴莲，为了解最早的软体动物提供了线索。8月1日，相关成果发表于《科学》。完整的多刺世山虫化石类似榴莲（左）；它的刺（右）是由一种叫做甲壳质的有机化合物构成的。图片来源：G Zhan
古代软体动物形似榴莲
软体动物是地球上最多样化的动物群体之一，但它们的起源是个谜。一块新发现的约5.1亿年前的软体动物化石——类似于切成两半的榴莲，为了解最早的软体动物提供了线索。8月1日，相关成果发表于《科学》。完整的多刺世山虫化石类似榴莲（左）；它的刺（右）是由一种叫做甲壳质的有机化合物构成的。论文作者之一、英国牛津
染色体水平冬瓜参考基因组发布
近日，广东省农业科学院蔬菜研究所发布了染色体水平冬瓜参考基因组。相关研究发表于Scientific Data，广东省农业科学院蔬菜研究所副研究员罗文龙和副研究员闫晋强为该论文共同第一作者，广东省农业科学院蔬菜研究所研究员江彪为通讯作者。广东省农业科学院蔬菜研究所于2019年对黑皮大冬瓜B227进行基
最早软体动物像鼻涕虫
现在的软体动物包含诸多类型，从章鱼和牡蛎到蜗牛和蛞蝓，如此复杂的构成让科学家难以想象，这些动物的最古老的共同祖先看上去像什么。 现在，研究人员从摩洛哥东南部挖掘的少量具有4.8亿年历史的化石显示，这些软体动物的祖先可能类似一只长有刺的蛞蝓，其头部有一个小小的脚趾甲状的壳。古生物学家将这种动物归
“蚕姑娘”性染色体基因组密码破解
7月8日，西南大学教授代方银团队首次获得了家蚕W染色体完整基因组序列，并揭示了鳞翅目昆虫W染色体起源与进化新机制。相关研究成果近日发表于期刊《科学进展》。 家蚕性别的决定机制一直受到科学界关注。以家蚕为代表的鳞翅目昆虫性染色体在昆虫界独树一帜。不同于大多数昆虫性染色体组为XX/XY系统，其性染
研究发布碧凤蝶染色体水平基因组
蝴蝶因其丰富的形态多样性，自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一，近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型，已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。凤蝶科是具有重要进化地位的蝴蝶支系，其丰富的色彩和形态等多样性是昆虫生态与进
“蚕姑娘”性染色体基因组密码破解
7月8日，记者从西南大学获悉，该校教授代方银团队首次获得了家蚕W染色体完整基因组序列，并揭示了鳞翅目昆虫W染色体起源与进化新机制。相关研究成果近日发表于期刊《科学进展》。家蚕性别的决定机制一直受到科学界关注。以家蚕为代表的鳞翅目昆虫性染色体在昆虫界独树一帜。不同于大多数昆虫性染色体组为XX/XY系统
染色体级别的银杏参考基因组公开
银杏果实 曹福亮供图 作为裸子植物银杏纲唯一的孑遗物种，银杏不仅具有特殊的科学研究价值，而且具有重要的应用价值。 近日，南京林业大学联合中国农业科学院农业基因组研究所在《自然—植物》在线发表了染色体级别的银杏参考基因组，是目前已发表的组装质量最高的裸子植物参考基因组。 论文共同通讯作者、中国工
海洋所等在软体动物系统演化研究中获进展
近日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院海洋研究所在软体动物系统演化方面的研究成果。该研究首次构建了掘足纲（Scaphopoda）贝类染色体水平基因组，并在系统基因组学水平证实了Diasoma假说（掘足纲-双壳纲为姐妹群），解决了长达半个世纪关于掘足纲分类地位的争议。软体动物门起
关于基因组的大小和进化介绍
1、基因组大小： 基因组大小是一个拷贝的单倍体基因组中DNA碱基对的总数。 基因组大小与原核生物和低等真核生物的形态复杂性呈正相关 [8]。然而，在软体动物和上述所有其它高等真核生物之后，这种相关性已不再存在 [8]，主要是因为重复DNA的缘故。 2、基因组进化： 基因组不仅仅是生物体基
Nature新文章解析三大基因组
发表在最新一期(12月19日)《自然》(Nature)杂志上的一篇新文章，揭示了三个重要生物――水蛭(leech)、海蠕虫(Capitella teleta)和青贝(limpet)基因组。通过这一研究，来自莱斯大学、加州大学伯克利分校和美国能源部联合基因组研究所(JGI)的科学家们将冠轮动物
基因组学为生物学家们揭示软体动物神经系统演化的奥秘
本周的英国《自然》杂志在13日公开的基因学论文中，发表了章鱼的基因组序列，为生物学家们提供了一个机会，得以深入了解这一类神奇生物复杂神经系统的演化过程。 章鱼属于软体动物门头足纲，它的“伙伴”还包括鱿鱼和墨鱼，都是有着丰富而复杂行为的积极捕食者。在无脊椎动物当中，它们拥有多个引人注目的形态特征
微阵列—比较基因组杂交技术检测染色体异常
【摘要】近年微阵列一比较基因组杂交(microarraycomparativegenomichybirdization，microarray．CGH)技术被应用到临床细胞遗传学领域。该技术是选择DNA特殊片段作为靶，固化在载体上，形成密集、有序的分子微阵列。然后，从测试标本中提取DNA，将测试DNA
龙井茶树染色体级别基因组组装成功
龙井43 中国农科院供图 近日，《自然—通讯》在线发表了我国科学家在茶树全基因组组装和茶树起源演化研究上取得的重要突破。该项研究由中国农业科学院茶叶研究所（以下简称茶叶所）和中国农业科学院深圳农业基因组研究所（以下简称基因组所）主导并携手中国科学院昆明动物研究所（以下简称昆
染色体级别的铁线蕨基因组首次绘制
日前，中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合国内外8家科研院所首次绘制了染色体级别的铁线蕨基因组，揭示了蕨类植物孢子发育、真叶植物起源和种子演化、茉莉素信号通路进化等分子机制。相关研究成果发表在《自然—植物（Nature Plants）》。 真蕨植物以孢子体和配子体均具有光合自养能力为主要特
染色体级别橡胶基因组研究揭秘乳胶生物合成
橡胶树是大戟科植物。在植物界大约2500种产胶植物中，橡胶树产生的以聚异戊二烯为主要功能成分的天然胶乳约占全球天然橡胶的98% 以上。图片来源于网络 比起可能造成巨大环境污染的人工合成橡胶产业，天然橡胶因其良好的弹性、伸展性、耐老化等综合理化性能而具有不可替代性，是任何国家必须具备的重要战略
上海师大团队破解染色体级别基因组密码
中新网上海12月16日电 (记者 许婧)上海师范大学16日发布消息称，该校王全华研究团队在菠菜基因组研究领域又取得一项重大标志性研究成果。团队联合康奈尔大学Boyce Thompson研究所(BTI)费章君教授课题组等多家科研机构完成了新一代菠菜基因组精细图谱绘制、重要农艺性状遗传基础和菠菜驯化
昆明动物所发布碧凤蝶染色体水平基因组
蝴蝶因其丰富的形态多样性，自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一，近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型，已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。凤蝶科是具有重要进化地位的蝴蝶支系，其丰富的色彩和形态等多样性是昆虫生态与进
用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验
实验方法原理比较基因组杂交（CGH)是一种能够在一步全基因组筛查程序，描述G带不能发现的细胞遗传物质增加或减少的分子细胞遗传学技术。CGH优于进行全染色体涂染（wcp)的常规荧光原位杂交（FISH)和多色FISH之处，是它不仅能够识别增加的未知片段的染色体来源，而且还可将该片段定位于特定的染色体区带
“六谷”丰登？——首个染色体水平基因组组装完成
中国菰 中国农科院供图 中国菰 （Zizania latifolia） 原产于中国，属于禾本科稻族菰属，主要分布于中国、韩国、日本和印度等国家。中国菰的颖果为菰米，在我国古代是重要的“六谷”之一。 近日，中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队与中国水稻研
用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验（三）
六、中期染色体标本的变性1.在染色缸中加入大约50mL变性液，将染色缸放于75〜76℃水浴中。预热变性液使其温度达到（73±2)℃。2.从-20℃冰箱中取出实验所需的标本，室温下系列乙醇脱水，各2min。3.室温干燥片子（5min)，或在实验室抽风橱中微风吹过标本使标本干燥。4.在37〜40℃电热板
用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验（二）
二、正常男性中期染色体标本的制备1.准备一个封闭环境，其相对湿度约55%(可在50%〜60%变化），温度24〜26.5℃。2.将巴斯德吸管置于玻璃载片上方2〜4in处，让一滴细胞悬液滴在玻片的左侧。然后迅速将第二滴细胞悬液滴在玻片右侧（见注释7)3.在固定液全部蒸发前，将玻片浸入盛有新鲜固定液的染色
研究从基因组水平揭示食肉目染色体进化规律
染色体进化是物种形成和演化的重要驱动因素。具有显著核型差异的食肉目动物为染色体进化研究提供了很好的研究素材。虽然前人通过比较染色体涂色法建立了食肉目内许多物种的染色体比较图谱，但这些研究的分辨率比较低，尚没有深入到精细的核苷酸水平，也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物种间的共线性区块、染色体重排以
用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验（一）
实验方法原理 比较基因组杂交（CGH)是一种能够在一步全基因组筛查程序，描述G带不能发现的细胞遗传物质增加或减少的分子细胞遗传学技术。CGH优于进行全染色体涂染（wcp)的常规荧光原位杂交（FISH)和多色FISH之处，是它不仅能够识别增加的未知片段的染色体来源，而且还可将该片段定位于特定的染色体区
象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展
象腿蕉（Ensete glaucum）是芭蕉科中耐寒的蕉类植物，原产于中国云南和东南亚地区，具有观赏、饲用和药用价值。中国科学院华南植物园教授John Seymour Heslop Harrison带领的研究团队，采用单分子纳米孔、Illumina测序策略，结合染色体构像捕获技术，发表了首个象腿蕉染
象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展
中国科学院华南植物园海外知名学者John Seymour Heslop Harrison教授领导的研究团队，在象腿蕉染色体级别基因组组装研究方面取得新进展。相关研究发表于Gigascience。王梓维为该文第一作者，John Seymour Heslop Harrison和刘青副研究员为通讯作者，华
鸭嘴兽基因组图谱揭秘独特的性染色体
鸭嘴兽可能是世界上长得最奇怪的动物。据说，当欧洲学者第一次见到这种鸭子嘴、海狸尾、水獭足的动物时，他们认为这是一场精心设计的骗局。它看上去既像爬行动物又像哺乳动物，还像鸟类。实际上，它属于稀有的单孔类动物。 鸭嘴兽不仅有一些奇特的身体特征，其新的基因组版本也强调了它一些不寻常的遗传特性。在上周
软体动物体轴发育机制新进展
11月10日，中国科学院海洋研究所刘保忠研究团队在软体动物背腹轴发育机制方面取得重要研究进展，相关成果以题为《冠轮动物发育演化新认知：BMP2/4-Chordin调控软体动物背腹轴发育》的研究论文发表于生物学Top期刊《分子生物学与进化》（Molecular Biology and Evolut
加拿大科学家发现现代软体动物祖先
北京时间5月29日消息，据英国《独立报》报道，加拿大科学家发现一种好似从萨尔瓦多·达利画作中走出来的动物。根据他们的分析，这种怪异的生活在大约5亿年前的海洋动物可能就是鱿鱼、章鱼、乌贼以及其他所有头足类软体动物的母亲。 在对来自加拿大伯吉斯页岩的化石样本进行分析之后，科学家发现了这