植物所等破译构树基因组
构树(Broussonetia papyrifera)又称纸皮树、肥猪树,为桑科构属多年生阔叶乔木,自然分布于我国大部分地区和东南亚,是一种典型的乡土树种和先锋植物。构树雌雄异株,种子数量多,易繁殖,生长快,表型性状和遗传多样性丰富,基因组紧凑,可作木本植物研究的模式材料。同时,构树有着悠久的开发历史,是一种多用途资源植物。然而,以往关于构树的研究主要集中在构树纤维特点、制浆造纸的工艺、饲用价值和饲喂方法、生态绿化、环境适应性等方面,缺乏对构树基础生物学深入系统的研究,从而严重影响构树应用价值的开发。 近日,中国科学院植物研究所沈世华研究组与多家单位合作,利用二代Illumina和三代PacBio单分子测序技术,结合mate-pair大片段文库、光学图谱、遗传图谱以及Hi-C等辅助组装策略,报告了一个高质量的、染色体级别的构树基因组(2n = 2x = 26)。该基因组序列386.83Mb,覆盖度接近100%,其中99.2......阅读全文
植物水势仪测出了植物水势高低说明什么?
植物在土壤-植物-大气的连续系统中,植物的根茎不断从土壤中吸收水分,而叶片又不断地向周围环境蒸发散失掉水分,在这种水势的梯度系统中,植物的根——茎——叶之间也一定存在着水势梯度关系,使木质导管中的细小水柱受空气低水势的负压影响,形成水分向上运输的拉力。当植物枝条或叶片被切下时,导管中这种被拉紧的
植物所揭示植物暗形态建成的调控机制
植物根据黑暗或光照环境的差异采取截然不同的生长模式。在黑暗中,植物幼苗快速长高(暗形态建成),这种方式便于穿透土壤,并见光进行光合自养生长;而在光下,幼苗的纵向生长速度明显减慢(光形态建成),有利于减少能量消耗并保持茎干粗壮。植物的这种生长方式由光信号转导通路调控,但其调节机制仍不十分清楚。
植物系统学实验:苔藓植物门(Bryophyta)
一、目的要求 通过对代表种类的观察,掌握藓纲植物 的形态、构造、生活史,了解不同的生活型。 二、实验材料 葫芦藓属、金发藓属等十几个属的配子体,生活的原丝体,孢蒴纵切、孢子体、精子器纵切. 三、实验内容和方法 1.取葫芦藓(Funaria)配子体和孢子体,观察下列内容
植物表型分析系统—植物表型的名词解释
“植物表型是指能够反映植物细胞、组织、器官、植株和群体的结构及功能特征的物理、生理和生化性质,其本质实际是植物基因图谱的时序三维表达及其地域分异特征和代际演进规律”。这是目前所见最精辟的定义。 那么什么是高通量植物表型的?高通量植物表型技术是从器官、个体到群体水平上高通量、自动化获取产量、抗性
植物水势压力室如何正确测定植物水势?
植物水分生理研究的指标有很多,植物水势是其中一项重要的指标之一。为什么要研究植物水势?植物水势可以直接反应出植物水分的缺少程度以及抗旱性强弱。一般来说,当植物水势低时,则是植物需水的反应。因此,在农业生产过程中,通常利用测定的植物组织水势的变化作为灌溉的参考指标,而测定植物组织水势变化时我们通常会使
植物细胞分裂和植物分生组织实验
实验方法原理1. 了解植物细胞分裂的三种方式;认识分生组织在植物体上的位置及其类型。2. 掌握植物细胞有丝分裂和减数分裂各时期的特征;掌握分生组织的结构特点。实验材料洋葱根尖鸭跖草大蒜苗永久制片油菜茎尖新鲜茎段胡桃刺槐枝条小麦幼茎试剂、试剂盒冰醋酸醋酸洋红龙胆紫醋酸碘化钾番红水仪器、耗材显微镜水
简述植物凝集素对植物病毒的作用
植物病毒不含聚糖,没有凝集素的作用位点,因此植物凝集素对植物病毒无抑制作用。Peumans和Van Damme(1995)综述道,一种称为核糖体失活蛋白型的特殊类型凝集素对植物病毒具有抑制活性,其机理尚不清楚。但有杀虫活性的凝集素可能会阻止或减少虫传播病毒病害的传播。
植物凝集素对植物病原真菌的作用
已有实验证明,植物凝集素能结合真菌细胞、抑制孢子萌发和菌丝体生长。植物凝集素对真菌的抗生效应可能与它特异结合暴露于真菌细胞壁表面的糖复合物并导致真菌细胞壁及菌体结构形态改变有关,凝集素可与真菌表面的葡聚糖、半乳糖、甘露糖等多糖结合,干扰真菌细胞壁的合成,影响其细胞的正常代谢。Peumans和Va
植物所发现植物表皮蜡质合成新机制
植物表皮蜡质对于减少水分蒸腾、提高耐旱性、减弱紫外光伤害以及抵抗病虫害等具有重要作用。蜡质主要由超长链脂肪酸及其衍生物(醛、醇、烷烃、酮和酯类等)组成。超长链脂肪酸分别进入酰基还原途径生成偶数碳链的伯醇和酯类,脱羰途径生成偶数碳链的醛和奇数碳链的烷烃。在拟南芥茎表皮中烷烃进一步转化为仲醇和酮,而
碳四植物和碳三植物的特点比较
碳四植物常写作C4植物。生长过程中从空气中吸收二氧化碳首先合成苹果酸或天门冬氨酸等含四个碳原子化合物的植物,如玉米、甘蔗等。而小麦、水稻等作物先合成磷甘油酸等三碳原子分子,为C3植物。C4植物较之C3植物具有生长能力强、二氧化碳利用率高、需水分量少等许多优点。禾本科经济植物中约有300种属C4植物。
植物系统学实验:苔藓植物门(Bryophyta)
一、目的要求通过对代表种类的观察,掌握藓纲植物的形态、构造、生活史,了解不同的生活型。 二、实验材料葫芦藓属、金发藓属等十几个属的配子体,生活的原丝体,孢蒴纵切、孢子体、精子器纵切. 三、实验内容和方法1.取葫芦藓(Funaria)配子体和孢子体,观察下列内容 : (1) 配子体形态:矮小,高约1—
植物细胞分裂和植物分生组织实验
实验方法原理1. 了解植物细胞分裂的三种方式;认识分生组织在植物体上的位置及其类型。 2. 掌握植物细胞有丝分裂和减数分裂各时期的特征;掌握分生组织的结构特点。实验材料洋葱根尖
植物细胞结构与植物徒手切片观察试验(二)
5. 植物细胞的内含物观察(1)淀粉粒 取马铃薯块茎做徒手切片,先在低倍镜下观察,可见到其薄壁细胞中含有许多白色 的颗粒即淀粉粒。换高倍镜观察,可以看到淀粉粒的轮纹,并可找到具有两个脐的淀粉粒。 (2)贮藏蛋白质取蓖麻种子,剥去种皮,用肥厚的胚乳做徒手切片。先把切片放入盛有纯酒精的培养皿中洗涤数分
植物细胞结构与植物徒手切片观察试验(一)
实验方法原理 1. 了解植物细胞形态的多样性;简易染色技术。2. 掌握植物细胞的结构和植物徒手切片技术。3. 识别和鉴定植物细胞中常见的后含物。实验材料 洋葱青辣椒红辣椒马铃薯块茎鸭跖草菠菜叶山楂番茄麦粒蓖麻扁豆花苹果种子根试剂、试剂盒 甲基蓝碱性紫间苯三酚酒精氢氟酸蒸馏水仪器、耗材 显微镜解
植物学技术:植物原生质体的制备
原生质体是指植物细胞去掉细胞壁的裸露部分。它在培养条件下,①具有再生细胞壁,进行连续的细胞分裂并再生成完整植株的能力;②具有摄取外源大分子、细胞器,以及细菌,病毒的能力,因此是进行遗传操作,基因转移的好材料;③通过同种和异种植物的原生质体融合,可产生异核体,实现体细胞杂交,培育出新品种。 实验原理去
基因组所发布表观基因组关联研究开放平台EWAS-Open-Platform
近日,由中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心(NGDC)开发的表观基因组关联研究资源开放平台EWAS Open Platform上线。相关研究成果以EWAS Open Platform: integrated data, knowledge and toolkit
北京基因组所等解析NK细胞白血病功能基因组
侵袭性NK细胞白血病(ANKL)起源于NK细胞异常增殖,病情进展迅速,多数患者在极短时间内发生多器官衰竭,部分患者会出现吞噬血细胞的现象,病情凶险。ANKL患者即使积极接受正规治疗,平均生存时间也仅有几个月。目前,临床上ANKL的治疗面临两大问题:患者对传统化疗方案不敏感,医学界没有统一的治疗标
北京基因组所等解析NK细胞白血病功能基因组
侵袭性NK细胞白血病(ANKL)起源于NK细胞异常增殖,病情进展迅速,多数患者在极短时间内发生多器官衰竭,部分患者会出现吞噬血细胞的现象,病情凶险。ANKL患者即使积极接受正规治疗,平均生存时间也仅有几个月。目前,临床上ANKL的治疗面临两大问题:患者对传统化疗方案不敏感,医学界没有统一的治疗标
北京基因组所开发出比较群体基因组学新算法
随着基因组测序技术的发展,物种和群体水平基因组数据呈指数增长。这些数据为在基因组水平鉴定和解析自然选择机制提供了机遇。然而,目前的分析方法面临着技术瓶颈和挑战。其中,关键问题是如何高效准确地检测作用于非编码区的自然选择效应。同时,能够高效、高性能地分析多物种大样本数据,成为方法学方面的迫切要求。
研究发现人类合子基因组激活起始于父源基因组
表观遗传修饰包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质可及性和染色质高级结构等,在基因的表达调控中发挥重要作用。人类精子和卵细胞的染色质表观修饰状态存在较大差异。在受精后的早期胚胎里,来自精子的父源染色质和来自卵细胞的母源染色质会经历剧烈的表观遗传修饰重编程,最终达到两者类似的模式。人类胚胎的合子基因
Nature-Biotechnology定义病毒基因组标准:何谓高质量基因组
据说,地球上的微生物总量超过了银河系中的恒星数量,而且病毒总量也要比之前预计的多得多。 在最新的Nature Biotechnology杂志上,美国能源部(DOE)联合基因组研究所(JGI)构建了重要的病毒序列数据库,同时提出了病毒基因组标准,指出了三类基因组质量的分级。 目前虽然许多病毒未
国际癌症基因组联盟公布逾1万个癌症基因组数据
国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium,简称"ICGC")近日向科研界公布了超过1万个癌症基因组的数据。这些数据能更好地帮助全世界的癌症研究者从基因方面了解癌症,加快对癌症的研究并帮助更多癌症靶向治疗的发展。 安大略癌症研究所所
Nature:全基因组测序重新定义癌症之王基因组突变蓝图
近日,一项发表于国际著名杂志Nature上的研究论文中,来自英国和澳大利亚的研究人员对100位胰腺癌患者癌症组织的基因组进行了深入分析,结果发现了4种不同的亚型,这或许可以帮助后期开发治疗胰腺癌患者的新型疗法。文章中研究人员利用全基因组测序技术揭示了肿瘤基因组结构性改变的光谱模式,该技术可以帮助
昆明植物所五含笑属植物新品种获得国家植物新品种权证书
由中国科学院昆明植物研究所孙卫邦研究员为第一培育人,孙卫邦、李从仁、罗桂芬、韩春艳、吉利、傅旭阳共同培育的含笑属植物新品种“玉馨含笑”、 “点绛唇”、“妃子笑”、“胭脂醉”、“赤龙爪”,近日获得国家林业局颁发的植物新品种权证书,品种权号依次为:20120005、20120006、 201
我国牵头完成高质量豌豆参考基因组和泛基因组解析
9月22日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位,成功绘制了中国豌豆基因组高质量精细物理图谱,构建了栽培和野生豌豆泛基因组,解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构,为揭示豌豆起源驯化,以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支
破译对虾基因组-获国际首个高质量对虾基因组参考图谱
由中国科学院海洋研究所相建海和李富花研究组主导的研究团队,与国内外多家单位共同合作,历时十年成功破译凡纳滨对虾基因组,获得国际首个高质量对虾基因组参考图谱,研究成果于1月21日在《自然-通讯》(Nature communications)在线发表,为甲壳动物研究及对虾基因组育种和分子改良提供了重
北京基因组所构建完成质体基因组结构变异数据库
多相催化是实现高效定向化学转化的关键技术,其中的一个重要基础科学问题是如何通过精确设计和调控催化活性位结构及所在环境,从而强化其定向催化功能并创造新型高效催化剂。近日,中国科学技术大学熊宇杰教授课题组和江俊教授课题组继在电催化体系中提出表面极化概念后,再次通过与黄伟新教授课题组合作,证实界面极化
海洋所成功破译对虾基因组并获得国际首个基因组图谱
由中国科学院海洋研究所相建海和李富花研究组主导的研究团队,与国内外多家单位共同合作,历时十年成功破译凡纳滨对虾基因组,获得国际首个高质量对虾基因组参考图谱,研究成果于1月21日在《自然-通讯》(Nature communications)在线发表,为甲壳动物研究及对虾基因组育种和分子改良提供了重
中国大豆基因组公布并发现该基因组组装错误
大豆是重要的粮食经济作物,为人类提供了主要的油料和蛋白资源。大豆起源于中国,古称“菽”,约在5000年前由其野生种驯化而来,随后广泛传播于世界各地。大豆在引种和改良过程中产生了遗传瓶颈效应,使来自不同主产区的大豆品种间具有显著的遗传变异。目前,我们广泛采用的大豆参考基因组来源于美国品种“Will
中国启动十万人基因组计划:绘制国人精细基因组图谱
科学家们希望通过绘制中国人精细基因组图谱,来研究疾病健康和基因遗传的关系。 此次启动的“中国十万人基因组计划”覆盖地域包含我国主要地区,涉及人群除汉族外,还将选择人口数量在500万以上的壮族、回族等9个少数民族。 基因是DNA上有遗传效应的片断,人类的生、老、病、死等都与基因有关。而基因组和