植物所等破译构树基因组
构树（Broussonetia papyrifera）又称纸皮树、肥猪树，为桑科构属多年生阔叶乔木，自然分布于我国大部分地区和东南亚，是一种典型的乡土树种和先锋植物。构树雌雄异株，种子数量多，易繁殖，生长快，表型性状和遗传多样性丰富，基因组紧凑，可作木本植物研究的模式材料。同时，构树有着悠久的开发历史，是一种多用途资源植物。然而，以往关于构树的研究主要集中在构树纤维特点、制浆造纸的工艺、饲用价值和饲喂方法、生态绿化、环境适应性等方面，缺乏对构树基础生物学深入系统的研究，从而严重影响构树应用价值的开发。 近日，中国科学院植物研究所沈世华研究组与多家单位合作，利用二代Illumina和三代PacBio单分子测序技术，结合mate-pair大片段文库、光学图谱、遗传图谱以及Hi-C等辅助组装策略，报告了一个高质量的、染色体级别的构树基因组（2n = 2x = 26）。该基因组序列386.83Mb，覆盖度接近100%，其中99.2......阅读全文
版纳植物园叶绿体比较基因组学研究取得进展
樟科油丹属树种木材质优，国际市场上的商品名为“medang”，和楠木树种的亲缘关系较近。以往的分子系统学研究表明油丹属为复系类群，但与润楠属、鳄梨属和楠属等的系统关系尚不明晰。 近日，中国科学院西双版纳热带植物园生物多样性研究组以分布于印度南部的油丹模式种Alseodaphne semecar
能源植物小桐子基因组中发现3个开花抑制基因
开花是高等植物由营养生长进入生殖生长的重要标志，受促进或抑制开花基因的双重调控。FT/TFL1基因家族在植物的成花过程中起着重要的作用，其中TFL1（TERMINAL FLOWER 1）类基因发挥着抑制开花的功能。 中国科学院西双版纳热带植物园能源植物分子育种研究组的博士研究生李超琼与科研人员
研究发现植物叶绿体基因组可以全部转录的新机制
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能、供给地球上的其它生物能量来源的重要细胞器，对叶绿体的功能和叶绿体基因组转录机制的研究一直以来是全球细胞生物学家、遗传学家和分子生物学家孜孜以求的研究热点。中国科学院昆明植物研究所研究员高立志带领的研究团队，历时五年，通过对三种高等植物（水稻、玉米和拟南芥
昆明植物所在南方菟丝子基因组学研究中取得进展
自然界绝大部分植物都通过叶片的光合作用和根部的水分和营养吸收维持自养生存，而寄生植物则是一类通过寄生在自养植物上获取能量和营养的植物。寄生植物独特的起源、演化和特殊生理生态长期以来吸引着研究者的目光。旋花科茎寄生植物菟丝子寄生行为在实验室中方便控制和观察，近年来已成为许多探索寄生植物生理生态和进
武汉植物园在淫羊藿叶绿体基因组研究中获进展
淫羊藿为小檗科淫羊藿属植物，是我国常用大宗中药材，具有较多的药用价值和广阔的开发前景。当前淫羊藿药材主要依靠野生资源，存在基原植物混乱、质量参差不齐等问题。叶绿体基因组信息可以用于植物的系统分类、品种鉴定，但目前还没有对我国淫羊藿属植物开展过叶绿体基因组的研究。 中国科学院武汉植物园副研究员张
PacBio构建目前最高质量的植物基因组参考序列
来自中科院遗传与发育生物学研究所，四川农业大学的研究人员发表了题为“Sequencing and de novo assembly of a near complete indica rice genome”的文章，对一个籼稻基因组蜀恢498（R498）进行PacBio单分子测序，结合遗传图谱和
植物基因组DNA提取使用什么样的离心机做
植物基因组DNA提取使用什么样的离心机做?具体步骤怎么样？植物组织提取基因组DNA 一、材料 幼嫩叶子。 二、设备 移液器，冷冻高速离心机，台式高速离心机，水浴锅，陶瓷研钵，50ml离心管（有盖）及5ml和1.5ml离心管，弯成钩状的小玻棒。（这时选择设备的时候注意选择那种通用性强的，可以一机配多种
1600亿碱基对，这种蕨类植物拥有已知最大基因组
人类基因组由30亿个碱基对组成。可与太平洋新喀里多尼亚等岛屿上的一种蕨——Tmesipteris oblanceolate相比，就小巫见大巫了。因为这种蕨拥有有史以来发现的最大基因组，包含了1600亿个碱基对。相关研究近日发表于《交叉科学》。这一发现可以帮助科学家了解基因组是如何长得如此之大的，以及
研究揭示植物基因组倍性变化和适应性进化机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518047.shtm
植物基因组DNA提取使用什么样的离心机做
植物基因组DNA提取使用什么样的离心机做?具体步骤怎么样？植物组织提取基因组DNA 一、材料 幼嫩叶子。 二、设备 移液器，冷冻高速离心机，台式高速离心机，水浴锅，陶瓷研钵，50ml离心管（有盖）及5ml和1.5ml离心管，弯成钩状的小玻棒。（这时选择设备的时候注意选择那种通用性强的，可以一机配多种
动物、植物、微生物中提取高质量的基因组DNA
概 述 基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出，而小分子DNA则
叶下珠科药用植物基因组研究获新进展
近日，我国科学家在叶下珠科药用植物基因组研究方面取得新进展，研究揭示了多次杂交与多倍化事件共同塑造了叶下珠科复杂的物种形成历史。相关成果发表于《植物学杂志》（The Plant Journal）。叶下珠科包含超过2000个物种，大部分具有药用功能。叶下珠科的物种具有多种不同的染色体倍性和复杂的演化历
研究揭示植物基因组倍性变化和适应性进化机制
日，中山大学生命科学学院教授施苏华、副教授何子文团队以红树植物杯萼海桑所在支系为对象，全面分析基因组进化轨迹，探索倍性变化（多倍化-重二倍化过程）在基因组进化中的作用，研究全球气候变化背景下的植物适应性进化机制。相关成果发表于《自然-通讯》。 该研究基于高质量的基因组数据，使用共线性分析、非同
动物、植物、微生物中提取高质量的基因组DNA
基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出，而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀
昆明植物所建立叶绿体基因组遗传信息获取技术体系
在分子生物学和基因组时代，叶绿体基因组为植物分类、系统发育和物种鉴定等提供了不可或缺的遗传信息。随着新一代测序技术的快速发展，叶绿体基因组学已经成为植物系统基因组学和超级条形码研究的热点，也是中国科学院昆明植物研究所三个重大突破目标——iFlora 研究的重要内容。 昆明植物所种质资源库多年来
遗传发育所等联合研究建立植物基因组引导编辑技术体系
基因组编辑技术可以定向修饰植物基因组，从而大大加速植物育种的进程，是实现作物精准育种的重要技术突破。然而，作物的许多重要农艺性状是由基因组中的单个或少数核苷酸的改变或突变造成的。基于CRISPR/Cas系统的基因组编辑，可利用外源修复模板通过同源重组介导的修复方式（HDR）实现目标基因特定核苷酸
两篇Nature遗传：迄今为止最古老的植物基因组
最近，一个国际研究小组首次成功地对铜器时代的大麦基因组进行了测序。这是迄今重建的最古老的植物基因组。这些6000年前的种子是从以色列Judean沙漠Masada要塞南崖靠近死海的Yaram洞穴获得的。从遗传学来说，史前大麦非常类似于目前种植在Levant南部的大麦，从而支持目前“大麦驯化发生在U
高彩霞研究组等合作建立优化植物基因组引导编辑系统
近日，中科院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组与美国哈佛大学刘汝谦研究组合作，建立并优化了适用于植物的引导编辑系统（PPE），并在重要农作物水稻和小麦基因组中实现精确的碱基替换、增添或删除。相关成果近日在线发表于《自然—生物技术》。 基因组编辑技术可以定向修饰植物基因组，从而大大加速植物育种进
“千种动植物基因组计划”一期启动100多种测序
由深圳华大基因研究院发起的“千种动植物基因组计划”，一期已启动100多种动植物基因组测序分析项目，其中近一半的项目已经完成或接近尾声。 华大基因5月13日召开发布会称，该“千种计划”在重要物种基因组学研究领域和巨型基因组数据库构建上取得阶段性进展，该计划将加速全球基因组学研
植物所解析高粱驯化改良过程中的基因组印记
作物驯化和遗传改良，在人类从游牧狩猎到定居的生活方式过渡过程中起到关键作用。高粱是谷类作物，具有多种用途，如食物、饲料、酿酒、制糖和生产生物燃料等。面对可持续发展的需求和应对气候环境的挑战，揭示高粱驯化和改良过程的基因组选择，探索种间杂交以及平行/趋同进化的遗传机制至关重要。 中国科学院植物研
叶下珠科药用植物基因组研究获新进展
近日，我国科学家在叶下珠科药用植物基因组研究方面取得新进展，研究揭示了多次杂交与多倍化事件共同塑造了叶下珠科复杂的物种形成历史。相关成果发表于《植物学杂志》（The Plant Journal）。叶下珠科包含超过2000个物种，大部分具有药用功能。叶下珠科的物种具有多种不同的染色体倍性和复杂的演化历
版纳植物园完成蓖麻基因组bZIP家族鉴定与表达分析
蓖麻是双子叶胚乳型植物的典型代表，是大戟科中重要的油料作物，其种子油被广泛地应用在工业上。bZIP(basic leucine zipper)转录因子广泛分布于真核生物中，在植物中涉及多种生物进程，其中ABF亚族更是ABA信号途径中重要的调控因子。 中国科学院西双版纳热带植物园分子遗传
武汉植物园葡萄基因组学研究取得新进展
葡萄是世界上第二大果树作物，鲜果及用其加工品葡萄酒一直广受消费者喜爱。随着社会对葡萄需求量进一步增加，如何高效快速地培育优良葡萄品种是目前葡萄产业发展的瓶颈。近年来，通过新一代测序技术和生物信息学手段相结合，对植物基因组结构和特点深入解析，将获得的信息应用于分子辅助或基因工程育种
濒危植物报春苣苔交配系统转变基因组效应获揭示
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/10/488438.shtm 近日，中国科学院华南植物园植物科学研究中心研究员康明团队以苦苣苔科报春苣苔（Primulina tabacum）为对象，研究揭示了濒危植物报春苣苔交配系统由异交向自交转变的基因
植物所揭示丁香属全基因组、演化历史及花香形成机制
丁香属为温带起源的木本芳香植物，是木犀科（Oleaceae）中较为古老的类群，全属30余种（变种），除3种在巴尔干半岛和北海道分布以外，其余在中国均有野生分布。作为观赏植物，丁香拥有约1400年的栽培历史和约200年的育种历史，其药用功能的开发和芳香精油的利用由来已久。然而，丁香属全基因组信息的
石菖蒲及单子叶植物祖先基因组演化研究获进展
2022年7月14日，Nature Plants在线发表了来自中国科学院武汉植物园王青锋、陈进明团队与法国合作者的重要成果，公布了单子叶植物最早期分支菖蒲目中的重要水生药用植物石菖蒲（Acorus tatarinowii）的基因组，相关研究初步揭示了单子叶植物祖先早期基因组演化过程和规律，为理解包括
遗传发育所利用CRISPRCas系统对植物进行定点基因组编辑
CRISPR-Cas系统是继锌指核酸酶(ZFNs)和TALEN核酸酶之后的另一个可精确定点编辑基因组DNA的新技术，具有设计构建简单快速等优点。目前已在人类细胞系、斑马鱼、小鼠、果蝇和酵母等多个物种中利用，但CRISPR-Cas系统能否在植物中使用尚无报道。 中国科学院遗传与发育生物学研究
－Pacbio单分子实时测序技术于药用植物基因组研究应用
药源短缺成为限制临床治疗和新药研发的最大瓶颈，因此，开发新的药物来源途径是迫切需要解决的问题。利用现代生物技术和次生代谢工程手段是未来生产药物最有潜力的发展方向。我国药用植物有1 万多种，大多数药用植物遗传背景不清楚，基因组信息缺乏，遗传信息和功能基因的研究亦极为薄弱。例如人参属（Panax）
荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合转基因片段实验
实验材料核苷酸试剂、试剂盒冰水8-羟基喹啉秋水仙素固定剂酶解缓冲液仪器、耗材载玻片玻璃盖玻片解剖针及镊子实验步骤原位杂交的基本操作方法（图 14 .2 ) 演化自 Southern 杂交：标底是玻片上的染色体和细胞核，探针是带标记的待测 DNA 序列 [ 本书中即是转基因和对照，图 14.3(a)
荧光原位杂交技术检测植物基因组中整合的转基...（三）
3.5 杂交混合变性和杂交( 1 ) 离心管中准备杂交液，见表14. 1，充分混合。 ( 2 ) 在离心管中加入 34 μl 杂交液、2 μl 转基因探针、1 μl 指示探针或对照探针，蒸馏水补齐至 40 μl，作为探针混合液。( 3 ) 探针变性，放入 70°C 水浴锅 10 min , 然后置冰