比较分子生理基因组学—cDNA阵列的异种杂交实验

近几年来, DNA 微阵列已经被公认是分子生物学研究的一种标准方法。特别是在生物医学研究方面,常用物种的微阵列一面世就得到广泛应用。但是对于非模式生物来说 ,微阵列的应用尚未得到充分开展,而这些物种往往表现出一些很有趣的生理表型。对大多数比较生物学的研究者来说,制备一个新物种的 D N A 阵列或微阵列是一项成本高、工作量大的实验,这也是阻碍这方面应用的主要原因。异源阵列杂交的方法可作为另一个选择,即用一个物种的阵列筛选另一个物种的应激诱导基因。实验步骤一、材料这里用到的所有化学试剂都为分子生物学等级,或者用它们最高纯度的等效物。所有的塑料和玻璃制品,包括瓶子和移液器吸头都要高压灭菌,在核酸实验操作过程中必须始终戴手套。 cDNA A T L A S阵列从Clontech购得。人 19K cDNA 阵列从Ontario 癌症研究所购得。1 总 RNA 的提取(1)焦 碳 酸 二 乙 酯(DEPC) (Sigma-Aldrich,......阅读全文

DNA杂交实验方法

杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。其基本原理就是应用核酸分子的变性和复性的性质,使来源不同的DNA(或RNA)片段,按碱基互补关系形成杂交双链分子(heteroduplex)。杂交双链可以在DNA与DNA链之间,也可在RNA与DNA链之间形成。使双螺旋解开成

分子杂交的实验原理

分子杂交是通过配对碱基对之间的非共价键(主要是氢键)结合,从而形成稳定的双链区。杂交分子的形成并不要求两条单链的碱基顺序完全互补,所以不同来源的核酸单链只要彼此之间有一定程度的互补顺序(即某种程度的同源性)就可以形成杂交双链。分子杂交可在DNA与DNA、RNA与RNA或RNA与DNA的二条单链之间进

原位杂交实验步骤

原位杂交实验步骤一质粒制备1质粒的转化和扩增1.1制备XL1-Blue感受态细菌1.  取400uL XL1-Blue菌种加入到含200ml LB培养基的锥形瓶中,37 ℃、100  rpm培养4h,离心,倒置,以冰冷的0.1 mol/L CaCl_2重悬细菌,冰浴30 min,  离心,弃上清,倒

荧光原位杂交实验——荧光原位杂交技术

荧光原位杂交可应用于:(1)动植物基因组结构研究;(2)染色体精细结构变异分析;(3)病毒感染分析;(4)肿瘤遗传学和基因组进化研究。实验方法原理用已知的标记单链核酸为探针,按照碱基互补的原则,与待检材料中未知的单链核酸进行异性结合,形成可被检测的杂交双链核酸。由于DNA分子在染色体上是沿着染色体纵

FISH荧光原位杂交实验(原位杂交)

1. 实验目的        通过实验了解荧光原位杂交技术的基本原理和在生物学、医学领域的应用。掌握原位杂交技术的操作方法,熟练掌握荧光显微镜的使用方法。2. 实验原理        荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization FISH)是一门新兴的分子细胞遗

分子杂交技术菌落原位杂交的实验操作步骤

  1. 将少数菌落转移到硝酸纤维素滤膜上:  (1) 在含有选择性抗生素的琼脂平板上放一张硝酸纤维素滤膜。  (2) 用无菌牙签将各个菌落先转移至滤膜上,再转移至含有选择性抗生素但未放滤膜的琼脂主平板上。应按一定的格子进行划线接种(或打点)。每菌落应分别划线于两个平板的相同位置上。最后,在滤膜和主

分子杂交技术菌落原位杂交的实验相关介绍

  对分散在若干个琼脂平板上的少数菌落(100-200)进行克隆筛选时,可采用本方法。将这些菌落归并到一个琼脂主平板以及已置于第二个琼脂平板表面的一张硝酸纤维素滤膜上。经培养一段时间后,对菌落进行原位裂解。主平板应贮存于4℃直至得到筛选结果。  1、材料:待检测的细菌平皿,已标记好的探针,硝酸纤维素

杂交探针的检测实验3

实验步骤 1.  暗室中,以42~45℃水浴,温育盛有4盎司(113.3 g)Kodak NTB-2放射自显影胶乳瓶30 min。同时,在500 ml 三角瓶中预热等体积的水至相同温度。 2.  胶乳熔化后,缓慢沿三角瓶壁(以一角度)倒入瓶中并混匀(轻旋1~2次,防止气泡产生)。

杂交探针的检测实验2

实验材料胶乳试剂、试剂盒显影剂仪器、耗材浸泡盒水浴锅玻片架实验步骤1.  在42℃~45℃水浴溶化小份稀释的胶乳10 min,将胶乳倒入或吸入洁净的玻片包装盒中(浸泡盒)。 2.  将玻片缓慢并轻柔地浸入浸泡盒中,缓慢取出并垂直放置在试管架上或将玻片置于干燥器中2 h,使其干燥。3.  将充分干燥的

杂交探针的检测实验1

放射自显影胶片用于检测与细胞学样品进行杂交的32P或35S-标记探针,并可应用于在大的器官或组织进行的实验,欲获得单细胞水平结果,需要用乳胶放射自显影。实验步骤1.  将载玻片以胶带固定于硬纸板或废胶片上。2.  将Du Pont Cronex 成像胶片(MRF 34 Clear) 轻压在玻片上4℃

杂交和数据处理实验

            实验方法原理 实验材料 Cy3-和 Cy5-标记的 cDNA 玻璃微阵列 试剂、试剂盒

电镜原位杂交技术实验

            实验方法原理 从理论上讲,前包埋原位杂交技术的敏感性高于后包埋原位杂交技术,因为前者可观察到来自整个切片厚度的信号。但是,探针并不一定能穿透整个切片厚度,特别是用较长的探针。为了增加穿透性,经常应用冻融法或者蛋白酶和去污剂处理,而这样做会导致

电镜原位杂交技术实验

实验方法原理 从理论上讲,前包埋原位杂交技术的敏感性高于后包埋原位杂交技术,因为前者可观察到来自整个切片厚度的信号。但是,探针并不一定能穿透整个切片厚度,特别是用较长的探针。为了增加穿透性,经常应用冻融法或者蛋白酶和去污剂处理,而这样做会导致一些胞内成分如核糖体的丢失,严重时会造成超微结构的形态改变

杂交和数据处理实验

测定每个固定化 cDNA 点上荧光度的比值,人们得以度量一个样品库中信使与另一个库中信使的相对比值。如果一系列的样品都与一个共同的参照比较的话,所有样品中信息的相对量就可以作比较,得出它们之间的相似和差异。实验材料Cy3-和 Cy5-标记的 cDNA玻璃微阵列试剂、试剂盒DEPC处理的水SDSSSC

FISH-荧光原位杂交实验

实验概要1. 通过实验了解荧光原位杂交技术的基本原理和实验技术 2. 掌握原位杂交技术的操作方法及荧光显微镜的使用方法 3. 了解其在生物学、医学领域的应用实验原理荧光原位杂交(Fluorescence  in situ hybridization  FISH)是一门新兴的分子细胞遗传学技术,是20

电镜原位杂交技术实验

电镜原位杂交实验可以用于:(1)研究特定核苷酸序列的亚细胞定位;(2)许多研究者已经从光学显微观察扩展到对超微结构的观察。(3)特别是利用地高辛或生物素作为报告分子的非放射性探针,不必像放射性探针那样需要长时间暴露,因此整个过程可以在 24 h 内完成。实验方法原理从理论上讲,前包埋原位杂交技术的敏

荧光原位杂交实验步骤

荧光原位杂交实验步骤1)探针变性将探针在75oC恒温水浴中温育5min,立即置0oC,5~10min,使双链DNA探针变性。2)标本变性①将制备好的染色体玻片标本于50oC培养箱中烤片2~3h。(经Giemsa染色的标本需预先在固定液中退色后再烤片)。       ②取出玻片标本,将其浸在70~75

DNA印迹杂交分析实验

实验方法原理 本方案适合于用100~1 000 bp 长的放射性标记的DNA探针对Southern转印、斑点及狭线印迹进行杂交分析。实验材料 DNA试剂、试剂盒 SDSSSC仪器、耗材 水浴锅培养箱实验步骤   用6×SSC润湿带有固定了的DNA的膜。2.  将膜的DNA面朝上置于杂交管中,ATP溶

菌落原位杂交实验介绍

对分散在若干个琼脂平板上的少数菌落(100-200)进行克隆筛选时,可采用该方法。将这些菌落归并到一个琼脂主平板以及已置于第二个琼脂平板表面的一张硝酸纤维素滤膜上。经培养一段时间后,对菌落进行原位裂解。主平板应贮存于4℃直至得到筛选结果。将少数菌落转移到硝酸纤维素滤膜上(1) 在含有选择性抗生素的琼

DIG试剂盒杂交实验

实验概要Southern技术是指以Southern名字命名的DNA转移杂交技术。它可用于基因组特定DNA序列的定位,可以测定相关片段的同源性、可以从c库、基因组文库中筛选完整基因等。用一种或多种限制性内切酶对基因组DNA加以切割,通过琼脂糖凝胶电泳分离酶切片段,随后,使DNA在原位变性,并从凝胶转移

DNA印迹杂交分析实验

放射标记法             实验方法原理 本方案适合于用100~1 000 bp 长的放射性标记的DNA探针对Southern转印、斑点及狭线印迹进行杂交分析。  

原位杂交实验操作步骤

一质粒制备1质粒的转化和扩增1.1制备XL1-Blue感受态细菌1.取400uLXL1-Blue菌种加入到含200mllb培养基的锥形瓶中,37℃、100rpm培养4h,离心,倒置,以冰冷的0.1mol/LCaCl_2重悬细菌,冰浴30min,离心,弃上清,倒置,再加4ml(含15%甘油)冰冷的Ca

杂交和数据处理实验

实验方法原理 实验材料 Cy3-和 Cy5-标记的 cDNA 玻璃微阵列试剂、试剂盒 DEPC处理的水SDS SSC酵母 tRNADenhardt 溶液仪器、耗材 热循环仪65℃ 水浴芯片杂交盒图像分析软件实验步骤 实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1. 计算所需要的杂交液体积。计算

果蝇单因子杂交实验(图)

根据孟德尔的颗粒遗传学理论,基因是一个独立的结构与功能单位.在杂合状态时不发生混淆,完整地从一代传递到下一代.由该基因的显隐性决定其在下一代的性状表现。单因子杂交是指一对等位基因间的杂交。孟德尔第一定律指出,一对杂合状态的等位基因保持相对的独立性,其自交后代中表型分离比为 3 : l 。本实验将观察

Northern印迹和总RNA杂交实验——杂交和放射自显影

实验材料mRNA试剂、试剂盒甲酰胺SSPEDenhardt 试剂SDS仪器、耗材滤膜实验步骤1. 滤膜进行 1~2 小时预杂交。在 42℃:50% 甲酰胺5x SSPE2 x Denhardt 试剂0.1% SDS或者在 68℃:6x SSC2x Denhardt 试剂0.1% SDS2. 把已变性

荧光原位杂交实验方法

荧光原位杂交实验方法,实验原理荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization FISH)是一门新兴的分子细胞遗传学技术,是20世纪80年代末期在原有的放射性原位杂交技术的基础上发展起来的一种非放射性原位杂交技术。目前这项技术已经广泛应用于动植物基因组结构研究、染色

多重端粒荧光原位杂交实验

实验方法原理实验材料永生化淋巴细胞株试剂、试剂盒青霉素谷氨酰胺胎牛血清植物血球凝集素胸苷秋水仙胺KCl甲醇冰乙酸柠檬酸钠SSC甘油生物素-16-dUTP地高辛-11- dUTP10 XdNTP 混合物仪器、耗材超净台细胞培养瓶Nunc 管培养基相差显微镜染色缸加热板装有Pinkel滤光片轮的CCD显

原位杂交实验要求及步骤

实验材料 新鲜组织或细胞样品试剂、试剂盒 PBSPB甘氨酸多聚甲醛Denhardt溶液抗体稀释液预杂交液显色液无水乙醇仪器、耗材 水浴锅离心机尼龙膜点样器

Northern印迹和总RNA杂交实验

试剂、试剂盒 甲醛凝胶溶液RNA 电泳缓冲液仪器、耗材 凝胶模梳齿凝胶用具实验步骤 1. 用肥皂和水彻底清洗凝胶模,梳齿和凝胶用具。2. 准备甲醛凝胶溶液。甲醛凝胶溶液(300 ml 1% 琼脂糖凝胶):琼脂糖,3.0 g10x RNA 电泳缓冲液,30 ml     Milli-Q 或用玻璃器皿蒸

Northern印迹和总RNA杂交实验

Northern印迹分析杂交和放射自显影试剂、试剂盒甲醛凝胶溶液                                                                  RNA 电泳缓冲液