抑制细菌转录终止检测技术筛选RNA结合蛋白实验
一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。实验材料N-表达质粒E.coil N567 感受态细菌试剂、试剂盒储存液缓冲液仪器、耗材蛋白胨培养基蛋白胨平板N-表达质粒组合文库培养板实验步骤―、材料与设备1. 通过比较 β-半乳糖苷酶表达差异导致的细菌克隆颜色变化检测多肽与 RNA 间的作用(1) 储存液:氨苄青霉素(100 mg/ml),氯霉素(40 mg/ml,甲醇溶液),X-Gal(40 mg/ml,二甲基甲酰胺溶液),IPTG(100 mmol/L),可在 -20℃ 保存数月。(2) 蛋白胨培养基:10 g 蛋白胨,5 g NaCl,定容 1 L,灭菌后保存。(3) 蛋白胨平板:10 g 蛋白胨,5 g NaCl,15 g 琼脂粉,定容至......阅读全文
诱骗RNA结合蛋白不与癌细胞中的天然RNA分子结合
科学家也开始变得“狡猾”,开始用欺骗来对抗癌症。希伯莱大学的研究人员发明了一种诱饵,可以阻止癌症用于转移的RNA结合蛋白。 近年来,RNA结合蛋白在肿瘤生长中起着重要作用已经成为不争的事实。这些蛋白在所有细胞中都很活跃,尤其是在癌细胞中,它们与RNA分子结合,加速癌细胞的生长。不幸的是,目前还
依赖ρ因子的转录终止
ρ因子是一种分子量为46kDa的蛋白质,以六聚体为活性形式。
转录终止因子的定义
中文名称转录终止因子英文名称transcription termination factor定 义辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等),其作用导致转录终止。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
推动癌症发展的RNA结合蛋白
最近,一项关于白血病细胞基因表达的研究,发现了一种RNA结合蛋白,在推动癌症的发展过程中起着重要的作用。该蛋白通常活跃在胎儿组织,在成年人体内是关闭的,但它在一些癌细胞中被再度活化。这种表达模式使它成为抗癌药物的一个有吸引力的靶标,因为阻断它的活动,不太可能造成严重的副作用。 这项新的研究,发
研究揭示噬菌体蛋白调控宿主转录的分子机制
7月11日,国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所合成生物学重点实验室张余研究组与浙江大学医学院冯钰研究组合作完成的题为Structural basis for transcription anti
随机RNA文库的SELEX筛选实验
随机RNA文库的SELEX筛选实验可用于:(1)体外诊断;(2)体内治疗等。实验方法原理SELEX 技术是一种利用随机寡核苷酸(DNA 或 RNA)文库筛选靶分子的特异性配基的组合化学技术。最常用的是随机 RNA 文库,因为 RNA 分子中除 G-C、A-U 碱基对以外,还有 G-U 等变偶碱基对的
随机RNA文库的SELEX筛选实验
实验方法原理 SELEX 技术是一种利用随机寡核苷酸(DNA 或 RNA)文库筛选靶分子的特异性配基的组合化学技术。最常用的是随机 RNA 文库,因为 RNA 分子中除 G-C、A-U 碱基对以外,还有 G-U 等变偶碱基对的存在,可以形成发夹、假结、凸环、G-四聚体等多种空间结 构,它
随机RNA文库的SELEX筛选实验
实验方法原理 SELEX 技术是一种利用随机寡核苷酸(DNA 或 RNA)文库筛选靶分子的特异性配基的组合化学技术。最常用的是随机 RNA 文库,因为 RNA 分子中除 G-C、A-U 碱基对以外,还有 G-U 等变偶碱基对的存在,可以形
RNA干扰(转录后基因沉默)实验
RNA干扰 实验方法原理 1. 病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内,并利用宿主细胞进行转录时,常产生一些dsR
RNA干扰(转录后基因沉默)实验
RNA干扰(RNA interference, RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。目前主要用于(1)特异性剔除或关闭特定基因的表达 (2)探索基因功能和传染性疾病及恶性肿瘤的治疗 (3)使
转录终止的结构功能特点
转录终止: 当RNA链延伸到转录终止位点时,RNA聚合酶不再形成新的磷酸二酯键,RNA-DNA杂合物分离,转录泡瓦解,DNA恢复成双链状态,而RNA聚合酶和RNA链都被从模板上释放出来,这就是转录的终止(termination)。
转录终止因子的概念介绍
中文名称转录终止因子英文名称transcription termination factor定 义辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等),其作用导致转录终止。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
真核生物的转录终止
真核生物的转录终止,是和这类转录后修饰密切相关的。真核mRNA3’端在转录后发生修饰,加上多聚腺苷酸(polyA)的尾巴结构。大多数真核生物基因末端有一段AATAAA共同序列,再下游还有一段富含GT序列,这些序列称为转录终止的修饰点。真核RNA转录终止点在越过修饰点延伸很长序列之后,在特异的内切核酸
研究揭示RNA甲基化调控Rloop形成及转录终止机制
R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构,在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等,但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高
PNAS:片段筛选发现HIV逆转录酶抑制剂
近日,来自澳大利亚的科学家在国际学术期刊PNAS发表了一项最新研究进展,他们通过研究发现了三种针对HIV-1逆转录酶的片段化抑制剂,能够有效抑制HIV-1逆转录酶活性,为HIV-1预防和治疗药物开发提供了重要信息。 基于片段筛选的方法可用于发现新的活性位点或变构抑制剂以进行治疗干预。在该项研究
人冷诱导RNA结合蛋白(CIRBP)ELISA检测试剂盒检测原理
检测原理试剂盒采用双抗体夹心法酶联免疫吸附试验(ELISA)。往预先包被人冷诱导RNA结合蛋白(CIRBP)捕获抗体的包被微孔中,依次加入标本、标准品、HRP标记的检测抗体,经过温育并彻底洗涤。用底物TMB显色,TMB在过氧化物酶的催化下转化成蓝色,并在酸的作用下转化成终的黄色。颜色的深浅和样品中的
RNA-反转录
实验材料 poly(A)+RNA 反转录酶 鼠源反转酶 或禽源反转录酶 试剂、试剂盒 oligo
RNA-反转录
实验材料 poly(A)+RNA反转录酶鼠源反转酶 或禽源反转录酶试剂、试剂盒 oligo(dT)12-18 lmol LTris-Cl 1mol LTris-Cl lmol LKC1 25 mmol LMgCl2 dNTP 混合物 0.lmol LDTT RNasin实验步骤 一材料与设备1)p
中科院团队揭示细菌固有转录的“刹车”机制
1月12日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心合成生物学重点实验室张余研究团队、美国威斯康辛大学麦迪逊分校Robert Landick团队与浙江大学冯钰团队合作,在《自然》(Nature)上,发表题为Structural basis for intrinsic transcription termi
脱氧核酶实验
实验方法原理 随着体外分子实验技术的发展,近年来相继发现了许多具有不同催化功能的 DNA 分子,这些被称为脱氧核酶的催化型 DNA 分子可以催化切割反应、连接反应、卟啉环金属化等许多化学反应,而且还具有 DNA 激酶活性。实验材料 脱氧核酶试剂、试剂盒 脱氧核酶切割缓冲液终止缓冲液脂质体仪器、耗材
脱氧核酶实验
实验方法原理 随着体外分子实验技术的发展,近年来相继发现了许多具有不同催化功能的 DNA 分子,这些被称为脱氧核酶的催化型 DNA 分子可以催化切割反应、连接反应、卟啉环金属化等许多化学反应,而且还具有 DNA 激酶活性。
细菌RNA制备实验——革兰氏阴性细菌中提取
实验材料RNA试剂、试剂盒STET氯仿乙酸钠氯化铯无水乙醇EDTA仪器、耗材离心机分光光度计摇床实验步骤1. 培养100 ml 大肠杆菌或500 ml 蓝细菌至对数生长期,加入1/20体积终止缓冲液,置于冰上。2. 于4℃用JA-10转子17 700 g 离心5 min 收集细胞。3. 用2
研究揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制
9月25日,中国科学院上海免疫与感染研究所王程远研究组联合美国罗格斯大学Richard Ebright团队、美国科罗拉多州立大学Thomas Santangelo团队,在《自然》(Nature)上发表了题为Structural basis of archaeal FttA-dependent tra
研究揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制
9月25日,中国科学院上海免疫与感染研究所王程远研究组联合美国罗格斯大学Richard Ebright团队、美国科罗拉多州立大学Thomas Santangelo团队,在《自然》(Nature)上发表了题为Structural basis of archaeal FttA-dependent tra
ELISA检测筛选到的靶分子结合肽
【材料和试剂】 (1)酶标板,酶标仪 (2)湿盒 (3)吸水纸 (4)LB培养基 (5)PEG/NaCl (6)T (7)0.1M NaHCO3(pH 8.6) (8)HRP底物缓冲液 ABTS贮存液:在100ml 50mM的柠檬酸钠溶液(pH 4.0)中溶解22
脱氧核酶实验
随着体外分子实验技术的发展,近年来相继发现了许多具有不同催化功能的 DNA 分子,这些被称为脱氧核酶的催化型 DNA 分子可以催化切割反应、连接反应、卟啉环金属化等许多化学反应,而且还具有 DNA 激酶活性。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理随着体外分子实验技术的发展,近年
关于信使RNA的终止子和终止因子
一、定义 二、所有原核生物的终止子在终点之前都有一个回文结构,可使酶减慢移动或暂停合成。大肠杆菌有两类终止子: 1. 简单终止子,回文区有一段富含GC对的序列,回文后有寡聚尿苷。 2.依赖ρ的终止子,必须在有ρ因子时才能发挥作用,不含GC对,也无寡聚尿苷。ρ因子是蛋白质,可与酶作用,释放R
DNA结合蛋白测定实验
本实验主要用于检测粗制提取物中序列特异性的DNA结合蛋白。实验方法原理本分析方法是一种简单、快速和极为灵敏的用于检测粗制提取物中序列特异性的DNA结合蛋白的方法。在电泳时,与末端标记的DNA片段特异结合的蛋白质阻滞了片段的迁移,因而产生对应于蛋白-DNA复合物的清晰电泳条带。实验材料质粒DNA试剂、
DNA结合蛋白测定实验
实验方法原理 本分析方法是一种简单、快速和极为灵敏的用于检测粗制提取物中序列特异性的DNA结合蛋白的方法。在电泳时,与末端标记的DNA片段特异结合的蛋白质阻滞了片段的迁移,因而产生对应于蛋白-DNA复合物的清晰电泳条带。
DNA结合蛋白测定实验
实验材料 质粒DNA试剂、试剂盒 dNTPDNA聚合酶Klenow酶TETAE溴化乙锭TEMED过硫酸铵BSA仪器、耗材 培养箱离心管实验步骤 1. 用一种或多种限制性内切酶在100 μl 体积中消化10 μg 质粒人,产生25~100 bp 的含有结合位点的DNA片段,并至少有一端是5’突出的