甲基化特异性PCR——亚硫酸氢钠法
甲基化特异性PCR主要用于特意位点甲基化的检测。实验方法原理MSP是一种简便、特异的、敏感的检测单基因甲基化的方式。其基本原理是用亚硫酸氢钠处理基因 组DNA,未甲基化的胞嘧啶变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变,然后用3对特异性的引物对所测基因的同一核苷酸序列进行扩增。扩增产物用DNA琼脂糖凝胶电泳,凝胶扫描观察分析结果。实验材料DNA试剂、试剂盒亚硫酸氢钠氢醌石蜡油乙醇仪器、耗材水浴锅PCR仪实验步骤1. 在50 ul 体系中,DNA(2~5 ug)经NaOH(终浓度值0.2 mol/L)在37℃变性10 Min。2. 对于ng级别的人基因组DNA,在进行修饰前加入2 ug蛙鱼精DNA为载体。3. 加入30 ul 刚配制好的10 mmo/L 氢醌与520/1的40.5%亚硫酸氢钠混匀。4. 然后用石蜡油隔绝空气的条件下,避光在50%温育16 h。5. 修饰后的DNA过W......阅读全文
甲基化特异性PCR——亚硫酸氢钠法
甲基化特异性PCR主要用于特意位点甲基化的检测。实验方法原理MSP是一种简便、特异的、敏感的检测单基因甲基化的方式。其基本原理是用亚硫酸氢钠处理基因 组DNA,未甲基化的胞嘧啶变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变,然后用3对特异性的引物对所测基因的同一核苷酸序列进行扩增。扩增产物用DNA琼脂糖凝胶电泳,
亚硫酸氢盐测序法检测甲基化的介绍
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR,在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶,最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BSP-直接测序方法。将PCR产物克隆至载体后进行测序,可以提高测序成功率,
关于甲基化的亚硫酸氢盐测序法介绍
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR,在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶,最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BSP-直接测序方法。将PCR产物克隆至载体后进行测序,可以提高测序成功率,
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化
实验材料 DNA试剂、试剂盒 NaOH苯二酚(氢醌)亚硫酸氢钠石蜡油仪器、耗材 离心管恒温水浴锅铝箔纸实验步骤 1.将约2ugDNA于1.5mlEP管中使用DDW稀释至50ul; 2.加5.5ul新鲜配制的3M NaOH; 3. 42℃水浴30min; 水浴期间配制: 4.10mM对苯二酚(氢醌)
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化
实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较,判断是否CpG位点的甲基化状态。实验材料DNA
亚硫酸氢盐测序法检测DNA的甲基化
亚硫酸氢盐测序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR,在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶,最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BS
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化
DNA甲基化 实验方法原理 重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化——DNA甲基化
亚硫酸氢盐修饰后测序法主要可用来检测甲基化。基化实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较
甲基化特异性PCR
亚硫酸氢钠法 实验方法原理 MSP是一种简便、特异的、敏感的检测单基因甲基化的方式。其基本原理是用亚硫酸氢钠处理基因 组DNA,未甲基化的胞嘧啶变成尿嘧啶
亚硫酸氢钠测定法
本法系依据亚硫酸氢钠与过量的碘反应,用硫代硫酸钠滴定液滴定多余的碘。根据硫代硫酸钠滴定液的消耗量,可计算出供试品中亚硫酸氢钠的含量。 测定法 精密量取供试品适量(相当于含亚硫酸氢钠量2.5mg),置具塞锥形瓶中,精密加入0.05mol/L碘溶液(称取碘13.0g,加碘化钾36g与水50ml溶
甲基化检测方法(亚硫酸氢盐修饰后测序法)
甲基化是目前的研究热点,就我所做的一点工作并其中一点心得,与大家分享。希望能够对大家有所帮助。 第一部分 基因组DNA的提取。 这一步没有悬念,完全可以购买供细胞或组织使用的DNA提取试剂盒,如果实验室条件成熟,自己配试剂提取完全可以。DNA比较稳定,只要在操作中不要使用暴力,提出的基因组DNA应
甲基化特异性PCR
实验方法原理 MSP是一种简便、特异的、敏感的检测单基因甲基化的方式。其基本原理是用亚硫酸氢钠处理基因 组DNA,未甲基化的胞嘧啶变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变,然后用3对特异性的引物对所测基因的同一核苷酸序列进行扩增。扩增产物用DNA琼脂糖凝胶电泳,凝胶扫描观察分析结果。实验材料 DNA
简述亚硫酸氢钠的急救措施
皮肤接触:立即脱去污染的衣着,用大量流动清水冲洗。就医。 眼睛接触:立即提起眼睑,用大量流动清水或生理盐水彻底冲洗至少15分钟。就医。 吸入:迅速脱离现场至空气新鲜处。保持呼吸道通畅。如呼吸困难,给输氧。如呼吸停止,立即进行人工呼吸。就医。 食入:饮足量温水,催吐。就医。
亚硫酸氢钠甲萘醌的检查方法
磺酸亚硫酸氢钠甲萘醌取本品0.1g,加水5ml溶解后,加邻二氮菲试液2滴,不得发生沉淀。水分取本品,照水分测定法(通则0832第一法1)测定,含水分应为9.0%~13.0%。
甲基化检测方法(亚硫酸氢盐修饰后测序法)2
此步细节:1:在使用注射器时,一定要用力均匀且轻,如使用暴力,会将小柱内的薄膜挤破,失去作用。2:乙酸铵、糖原不需新鲜配制,糖原配好后放在-20度保存,乙酸铵室温即可,因为这样浓度的乙酸铵非常难溶,一旦放在4度,取出用时也会有很多溶质析出。3:异丙醇、70%乙醇都不需要新鲜配制,但如果用量大,现场配
甲基化检测方法(亚硫酸氢盐修饰后测序法)1
第一部分 基因组DNA的提取。这一步没有悬念,完全可以购买供细胞或组织使用的DNA提取试剂盒,如果实验室条件成熟,自己配试剂提取完全可以。DNA比较稳定,只要在操作中不要使用暴力,提出的基因组DNA应该是完整的。此步重点在于DNA的纯度,即减少或避免RNA、蛋白的污染很重要。因此在提取过程中需使用蛋
甲基化检测方法(亚硫酸氢盐修饰后测序法)(2)
第三部分 修饰后DNA纯化回收EP管如无特别说明均为高压蒸汽灭菌的。1. 将移液器枪头伸入石蜡油层下,先轻轻加压使其中一小段石蜡油排出,然后吸取混合液至一洁净1.5mlEP管中。2:以下使用Promega Wizard Cleanup DNA纯化回收系统(Promega,A7280)1)70℃水浴预
关于DNA甲基化检测的操作方法介绍
1、DNA甲基化检测— 基因组DNA的提取及浓度测定,设计引物时要求所扩增的片段中必须含有一个或一个以上的CpG岛,以保证检测可以正常进行。 2、DNA甲基化检测— 基因组DNA进行化学修饰,主要采用亚硫酸氢钠修饰,注意温度和时间的掌握,修饰后的DNA单链比较脆弱,操作应轻柔,避免剧烈振荡。适
关于甲基化特异性PCR的基本信息介绍
甲基化特异性PCR(Methylation-Specific PCR,MS-PCR)是一种特异位点甲基化检测技术。 一、甲基化特异性PCR的技术原理: 其基本原理是用亚硫酸氢钠处理基因组DNA,未甲基化的胞嘧啶变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。因此从理论上讲,用不同的引物做PCR,即可检测出
MSP(甲基化特异性PCR)介绍
甲基化特异性 PCR(Methylmion Specific PCR,MSP)及其改进方法是检测基因甲基化的经典方法.MSP法的原理是首先用亚硫酸氢钠修饰处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶都被转化为 尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶则不变。然后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物并进行聚合酶链反应(P
关于甲基化检测的检测程序介绍
1.甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP) 用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能
关于基因表观修饰的方式—甲基化检测的程序介绍
1.甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP) 用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能
甲基化特异性的PCR
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到扩增片段,则说明该位点存在甲基化;反之,说明被检测的位点不存在甲基化。
甲基化特异性-PCR-实验
实验材料 样本 DNA试剂、试剂盒 NaOH对苯二酚重亚硫酸钠矿物油DNA Wizard cleanup kit (Promega) 或等同物异丙醇 糖苷配糖基乙酸胺乙醇10 X PCR 扩增缓冲液4dNTP 混合物Taq DNA 聚合酶仪器、耗材 水浴设备Vacuum manifold带控制管温度
亚硫酸氢钠甲萘醌的含量测定方法
亚硫酸氢钠取本品约1.5g,精密称定,置l00ml量瓶中,加水振摇使溶解并稀释至刻度,摇匀,精密量取15ml,置具塞锥形瓶中,精密加碘滴定液(0.05mol/L)25ml,密塞混合,放置5分钟,缓缓加盐酸1ml,用硫代硫酸钠滴定液(0.1mol/L)滴定,至近终点时,加淀粉指示液3ml,继续滴定至蓝
亚硫酸氢钠甲萘醌的基本性状
本品为白色结晶性粉末;无臭或微有特臭;有引湿性;遇光易分解。本品在水中易溶,在乙醇或乙醚中几乎不溶。
简述亚硫酸氢钠的操作与处置
操作注意事项:密闭操作,局部排风。防止粉尘释放到车间空气中。操作人员必须经过专门培训,严格遵守操作规程。建议操作人员佩戴自吸过滤式防尘口罩,戴化学安全防护眼镜,穿橡胶耐酸碱服,戴橡胶耐酸碱手套。避免产生粉尘。避免与氧化剂、酸类、碱类接触。配备泄漏应急处理设备。倒空的容器可能残留有害物。 储存注
亚硫酸氢钠甲萘醌的鉴别方法
(1)取本品约50mg,加水5ml溶解后,滴加0.lmol/L氢氧化钠溶液,即发生鲜黄色沉淀。(2)取本品约80mg,加水2ml溶解后,加稀盐酸数滴,温热,即发生二氧化硫的臭气。(3)本品的红外光吸收图谱应与对照的图谱(光谱集457图)一致。
亚硫酸氢钠的基本信息介绍
亚硫酸氢钠,是一种无机化合物,化学式为NaHSO3,为白色结晶性粉末,有二氧化硫的不愉快气味,主要用作漂白剂、防腐剂、抗氧化剂、细菌抑制剂。 分子式:NaHSO3 分子量:104.0609 CAS号:7631-90-5 EINECS号:231-673-0
关于甲基化特异性PCR的技术原理介绍
甲基化特异性PCR(Methylation-Specific PCR,MS-PCR)是一种特异位点甲基化检测技术。 1、技术原理: 其基本原理是用亚硫酸氢钠处理基因组DNA,未甲基化的胞嘧啶变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。因此从理论上讲,用不同的引物做PCR,即可检测出这种差异,从而确定基