CMD1基因通过去甲基化调控莱茵衣藻对高光强的适应性
DNA甲基化是指DNA序列上特定的碱基通过共价键结合的方式获得一个甲基基团的化学修饰过程,是一种普遍存在于生物体的DNA修饰方式。DNA甲基化能够在不改变DNA序列的前提下改变遗传表现,是表观遗传学的核心研究领域之一。目前的研究表明,DNA甲基化与基因组印记、X染色体失活、转座因子抑制、衰老和癌症发生等密切相关,因此是表观遗传学研究的重点和热点之一[1]。 CpG二核苷酸中的胞嘧啶上第5位碳原子在甲基化转移酶(DNMTs)的催化下,发生甲基化的形成5mC。目前发现5mC广泛分布于原核与真核生物中。在哺乳动物中催化5mC去甲基化主动修饰(AM,active modification)功能的是一种名为TET的双加氧酶。如图1所示,TET双加氧酶可以将5mC逐步氧化为5hmC,5fC和5caC,最终在主动移除基团(AR, active removal)或是被动稀释(PD,passive dilution)的作用下实现5mC的去甲......阅读全文
CMD1基因通过去甲基化调控莱茵衣藻对高光强的适应性
DNA甲基化是指DNA序列上特定的碱基通过共价键结合的方式获得一个甲基基团的化学修饰过程,是一种普遍存在于生物体的DNA修饰方式。DNA甲基化能够在不改变DNA序列的前提下改变遗传表现,是表观遗传学的核心研究领域之一。目前的研究表明,DNA甲基化与基因组印记、X染色体失活、转座因子抑制、衰老和癌
维生素C直接参与产生一种全新的DNA修饰
近日,国际学术期刊《Nature》在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所徐国良研究组联合多家单位合作完成的研究成果“A vitamin-C-derived DNA modification catalysed by an algal TET homologue”。研究首次在莱茵衣藻(Ch
新研究发现维生素C直接参与DNA修饰
近日,国际权威学术期刊《自然》在线发表了来自中科院上海生物化学与细胞生物学研究所徐国良院士联合复旦大学唐惠儒教授和中科院武汉水生生物研究所黄开耀研究员等多个课题组合作完成的研究成果“A vitamin-C-derived DNA modification catalysed by an alga
莱茵衣藻光保护蛋白PsbS快速瞬间积累和功能
FluorCam叶绿素荧光系统发表文献选录—莱茵衣藻光保护蛋白PsbS快速瞬间积累和功能 所有光合生物都必须要应对过量光照来避免光合氧化胁迫。对于植物和绿藻来说,高光的最快响应机制就是非光化学淬灭(NPQ)。这一过程允许将过量能量以热量形式安全地耗散掉。PsbS蛋白是这一过程中的重要传感器。为了确定
关于莱茵衣藻等36种“三新食品”的公告
根据《中华人民共和国食品安全法》规定,审评机构组织专家对莱茵衣藻等3种新食品原料、喹啉黄铝色淀等18种食品添加剂新品种、磷酸锆(2:1)等15种食品相关产品新品种的安全性评估材料进行审查并通过。特此公告。附件:莱茵衣藻等36种“三新食品”的公告文本国家卫生健康委2022年5月5日
中国科学家3篇Cell文章表观遗传学重大发现
一度被认为在线虫和果蝇中即便不是不存在但也不会多见的DNA甲基化表观遗传标记,实际上普遍存在于这些生物体和藻类的整个基因组,且其并非发生于在哺乳动物中已知被修饰的胞嘧啶而是在腺嘌呤上。来自中外的华人科学家将这一重大发现发布在4月30日《细胞》(Cell)杂志上的3篇研究论文中。 西班
中国科学家3篇Cell文章表观遗传学重大发现
一度被认为在线虫和果蝇中即便不是不存在但也不会多见的DNA甲基化表观遗传标记,实际上普遍存在于这些生物体和藻类的整个基因组,且其并非发生于在哺乳动物中已知被修饰的胞嘧啶而是在腺嘌呤上。来自中外的华人科学家将这一重大发现发布在4月30日《细胞》(Cell)杂志上的3篇研究论文中。 西班牙塞维利亚
Cell子刊:挑战传统理论的lncRNA
一度被认为在线虫和果蝇中即便不是不存在但也不会多见的DNA甲基化表观遗传标记,实际上普遍存在于这些生物体和藻类的整个基因组,且其并非发生于在哺乳动物中已知被修饰的胞嘧啶而是在腺嘌呤上。来自中外的华人科学家将这一重大发现发布在4月30日《细胞》(Cell)杂志上的3篇研究论文中。 西班牙塞维利亚
植物所揭示莱茵衣藻m6A表观转录组图谱
m6A是广泛存在于真核生物mRNA中的表观修饰,与RNA命运相关。近年来,m6A修饰在植物胚胎发育、茎尖分生组织的命运决定、表皮毛发生、根部发育、叶形态发生、开花转变、胁迫响应、果实成熟及孢子发生等多个生物学过程中发挥重要功能。然而,m6A在藻类中的功能尚不清楚。藻类包含从单细胞到多细胞的多种细
看表观新修饰6mA甲基化如何助力IF飙升!
DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,科研者们已经在真核生物中(果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等)发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化,且DNA-6m
表观新修饰6mA甲基化助力IF飙升(一)
DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,科研者们已经在真核生物中(果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等)发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化,且DNA-
科学家揭示莱茵衣藻中依赖LHCSR3的超快能量猝灭机制
近日,中国科学院植物研究所研究员田利金团队与合作者创新性地制备了既保留能量猝灭功能又具有低散射效应的莱茵衣藻微型细胞碎片样品,获得了高信噪比的飞秒瞬态吸收数据,在揭示依赖LHCSR3蛋白的超快能量猝灭机制方面取得了新进展。相关研究成果发表于《自然—通讯》。光合微藻固碳占全球总固碳量的50%以上,是生
科学家揭示莱茵衣藻中依赖LHCSR3的超快能量猝灭机制
近日,中国科学院植物研究所研究员田利金团队与合作者创新性地制备了既保留能量猝灭功能又具有低散射效应的莱茵衣藻微型细胞碎片样品,获得了高信噪比的飞秒瞬态吸收数据,在揭示依赖LHCSR3蛋白的超快能量猝灭机制方面取得了新进展。相关研究成果发表于《自然—通讯》。光合微藻固碳占全球总固碳量的50%以上,是生
衣藻的遗传技术(转化)实验
实验材料细胞试剂、试剂盒EcoRI 酶仪器、耗材SGII 培养基实验步骤1. 500 ml 烧瓶中装 250 ml SGII 培养基,在通气和恒定光照条件下,培养细胞至 5X106 /ml 密度。2. 用 EcoRI 酶切质粒。3. 去细胞壁,低速离心浓缩细胞,在 SGII-NO3 培养基重悬细胞为
衣藻的遗传技术(转化)实验
实验材料细胞试剂、试剂盒EcoRI 酶仪器、耗材SGII 培养基实验步骤1. 500 ml 烧瓶中装 250 ml SGII 培养基,在通气和恒定光照条件下,培养细胞至 5X106 /ml 密度。2. 用 EcoRI 酶切质粒。3. 去细胞壁,低速离心浓缩细胞,在 SGII-NO3 培养基重悬细胞为
衣藻的遗传技术(转化)实验
衣藻的遗传技术(转化) 实验材料 细胞 试剂、试剂盒
衣藻的遗传技术(转化)实验
实验材料 细胞 试剂、试剂盒 EcoRI 酶 仪器、耗材
在纤毛虫鉴定了DNA6mA甲基转移酶复合物及阐明生物学功能
DNA甲基化是表观遗传调控的重要组成部分,在调控基因组印记,X染色体失活,转座子抑制,基因表达,胚胎发育等方面发挥重要作用。真核生物中最主要的DNA甲基化修饰是5-甲基胞嘧啶(5mC)。由于其在真核生物中的丰富性和重要性,以前的研究集中表征5mC。相反,N6-甲基腺嘌呤DNA(6mA)修饰是原核
李小波博士等发现光合作用所需的多个候选基因
莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)是一种非常有价值的真核模式生物,被广泛用于与光合作用、呼吸作用、脂类合成、细胞运动(生物鞭毛)、非生物胁迫等生物学过程相关的功能研究(图1)【1】。长期以来,通过同源重组将外源基因插入是敲除莱茵衣藻基因的主要方式,与外源基因的随机插入
二本本科生以共同一作发四大名刊PNAS,每天14个小时实验
田广梅 2018年4月,世界四大名刊之一的PNAS(美国科学院院报)杂志在线发表了题为New class of tranion factors controls flagellar assembly by recruiting RNA polymerase II in Chlamydomonas(
《科学》:衣藻基因组基本测定完成
通过100余位科学家的努力,衣藻(一种单细胞土生藻类)的基因组已经基本测定完成。在10月12日的《科学》杂志上,研究人员发表了他们对莱氏衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)基因组的分析报告。研究人员在衣藻基因组中发现了动植物早期进化的线索,尤其是在光合作用和鞭毛进化方面。
中外百余名科学家《科学》公布重要测序结果
生物通报道:来自美国加州大学洛杉矶分校,法国巴黎第六大学(Université Paris 6),中国中山大学生物技术研究中心,比利时列日大学(University of Liège)等多处研究机构,由115名科学家的组成的研究团体,历经三年完成了莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhar
水生所在微藻脂质合成关键酶功能分化研究中取得进展
乙酰CoA:二酰基甘油酰基转移酶(DGAT)是催化三酯酰甘油(TAG)的最后一步合成的关键酶,也是TAG合成的限速酶。DGAT在植物种子发育与萌发、叶片新陈代谢、幼苗发育等生物学过程中发挥重要作用。在动物中,由于与TAG合成及代谢紧密相关,DGAT可作为治疗肥胖、糖尿病等代谢性疾病的药物靶标。D
国际研究小组完成团藻基因组测序
德国比勒费尔德大学9日报告说,一个有德国研究者参加的国际研究小组最近完成了对最简单的多细胞生物团藻的基因组测序。科研人员希望以此帮助探寻单细胞生物向多细胞生物演变的奥秘。 单细胞生物怎么能演变为多细胞生物乃至人这样高度复杂的生物,一直是生物研究的重要课题。一个由德国、美国、
国际研究小组完成多细胞团藻基因组测序
德国比勒费尔德大学7月9日报告说,一个国际研究小组最近完成了对最简单的多细胞生物团藻的基因组测序。科研人员希望以此帮助探寻单细胞生物向多细胞生物演变的奥秘。 单细胞生物怎么能演变为多细胞生物乃至人这样高度复杂的生物,一直是生物研究的重要课题。一个由德国、美国、加拿大和日本科研人员组成
DNA的去甲基化过程
DNA的去甲基化由基因内部的片段及与其结合的因子所调控。有两种假说可以解释DNA去甲基化的分子机制。一种假说与DNA半保留复制联系在一起,为被动去甲基化。如果甲基化的DNA经半保留复制后不被甲基化,其DNA则处于半甲基化状态,半甲基化的DNA如再次发生DNA半保留复制,而DNA甲基化活性仍被抑制,则
欧阳证:基于细胞电迁移电穿孔的单细胞质谱分析方法
单细胞分析对研究细胞在转录组学、蛋白组学以及代谢组学等方面的异质性有着重要的意义。目前,科学家们开发了大量的单细胞分析方法和技术,例如荧光分析法、微流控芯片、流式细胞仪、单细胞测序等。质谱分析,因其低样品消耗量、高灵敏度、高定量准确性等优势,已经被广泛应用于单细胞蛋白组学、脂质组学和代谢组学分析
施扬、何川教授发表Nature综述:新表观遗传学标记
N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenine,6mA)是一种广泛存在于原核生物的甲基化修饰碱基,主要在宿主防御系统中起作用。最近科学家们发现,6mA在真核生物中也比较普遍,而且承担着重要的生物学功能。 哈佛大学的施扬(Yang Shi)教授和芝加哥大学的何川(Chuan He)教授日前在
科学家发现高等真核生物中DNA新修饰方式
DNA甲基化作为重要表观遗传机制调控基因的表达,从而影响一系列的生物学过程,如细胞命运决定、发育和组织、器官的稳态维持。医学上,DNA甲基化失调与人类疾病密切相关,如肿瘤。DNA甲基化以多种修饰方式[5-methylcytosine (5mC), N6-methyladenine (6mA) 和
美国完成团藻基因组测序-有望破解光合作用玄机
在为交通运输提供碳中性(平衡)燃料这条漫长且艰难的道路上,美国能源部正寻求多种途径力图实现自己的目标。能源部的努力包括探寻自然界中潜在的新型燃料资源,它们包括从陆地上可作为纤维质原料的植物(如快速生长的树木和多年生牧草)到水中及其他生长环境中的产油生物(如海藻和细菌),极具多样性。