研究发现去甲基化酶REF6是基因组中靶向的重要因素
核小体是真核生物染色质的基本单位，由DNA缠绕组蛋白八聚体构成。组蛋白翻译后共价修饰是表观遗传调控的重要方式之一，通过影响染色质的状态而调控基因表达等过程。组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化修饰(H3K27me3)通过维持基因的沉默状态，在动植物细胞命运决定以及生长发育中发挥重要的调控作用。基因组中特定位点的H3K27me3修饰水平由组蛋白甲基转移酶和去甲基化酶进行动态调控。中国科学院遗传与发育生物学研究所曹晓风研究组前期研究发现，拟南芥组蛋白H3K27me3去甲基化酶REF6/JMJ12能够通过其自身的锌指结构域特异性的识别拟南芥基因组中CTCTGYTY基序从而去除H3K27me3/me2甲基化修饰，调控基因的时空表达水平(Lu, et al. Nature Genetics, 2011； Cui, et al. Nature Genetics, 2016)。进一步研究发现，并非所有的CTCTGYTY基序都能够被REF6识......阅读全文
生化与细胞所DNA去甲基化机制研究有新发现
高等生物的基因组DNA中除含有腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)四种常见的碱基形式外，还含有胞嘧啶的修饰形式：5-甲基胞嘧啶(5mC)，被称为第5种碱基。而且它可以进一步被氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)，也被称为第6碱基。这些修饰形式在表观调控中都具有重要的作用，但它们
上海生科院揭示拟南芥DNA主动去甲基化调控新机制
12月9日，《细胞研究》（Cell Research）杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为A pair of transposon-derived proteins function in a histone acetyltransferase c
上海生化细胞所发现受精卵DNA去甲基化重要机制
近日，中科院上海生科院生化与细胞所一项最新研究发现，小鼠早期胚胎中母源和父源基因组在单细胞的受精卵阶段，均会发生大规模的DNA主动和被动去甲基化，DNA双加氧酶Tet3介导了主动去甲基化的发生，而糖苷酶TDG并不参与该过程。相关研究成果在线发表于学术期刊
科学家揭示去甲基化酶在肿瘤中的致病机理
11月21日，肿瘤学研究领域的国际权威杂志《癌症研究》在线发表了武汉大学李枫教授团队和中国科学院北京基因组所吕雪梅研究员最新合作研究成果。该研究以“KDM4B通过激活LINE-1促进DNA损伤”为题，解析了组蛋白去甲基化酶（KDM4B）在肿瘤中所扮演的新角色，从全新角度揭示了KDM4B在肿瘤细
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用
表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成，还有文章探究过其在急性白血病中的作用，但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在Molecular
Oncogene：组蛋白去甲基化酶如何影响癌症相关的糖酵解
糖酵解途径（glycolysis）是肿瘤细胞中重要的能量来源途径，然而，目前对于这条代谢相关途径的调控方式的了解，还十分有限。来自厦门大学生命科学学院，南京大学等处的研究人员发现JMJD1A作为一个组蛋白去甲基化酶，它能够影响膀胱肿瘤细胞糖代谢途径关键酶的启动子上组蛋白甲基化修饰水平，从而影响酶
研究发现TNFα会刺激炎症基因响应，诱发DNA主动去甲基化
近期，中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室研究员朱冰课题组在eLife上，在线发表题为Sustained TNF-α stimulation leads to transcriptional memory that greatly enhances signal sensitivit
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用
文章导读 表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成，还有文章探究过其在急性白血病中的作用，但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在M
上海药物所小分子调控核酸去甲基化研究取得阶段进展
中科院上海药物研究所杨财广课题组与蒋华良课题组合作，基于mRNA中N6位甲基化修饰的腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)去甲基化酶FTO结构开展小分子调控研究，首次获得了对核酸去甲基化酶，例如FTO具有酶活和细胞活性的小分子抑制剂。论文于10月11日在线发表于《美国化学会
朱健康院士团队揭示植物DNA主动去甲基化的完整调控途径
近日，PNAS杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为“Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylation in Arabidops
我科学家发现新组蛋白去甲基化酶及其调控机理
陈德桂研究组发现新组蛋白去甲基化酶及其调控机理 继4个月前生化与细胞所陈德桂研究组与景乃禾研究组合作发表一个新的组蛋白去甲基化酶KIAA1718(KDM7A)的发现及其在胚胎干细胞神经分化过程中的功能，及两周前陈德桂研究组与基因敲除与转基因小鼠平台合作发表另一个新的组蛋白去
揭示DNA去甲基化与阿尔茨海默病病变之间的关联
阿尔茨海默病（Alzheimer Disease，AD）是一种与衰老密切相关而复杂的多因素疾病，其发病机理较复杂。AD主要的神经病理特征为β-淀粉样蛋白沉积形成斑块和微管蛋白tau过度磷酸化形成神经纤维缠结。学界研究之前的AD病人脑组织样本和模型小鼠，发现在AD神经元退行性病变过程中存在明显的表
去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制
研究揭示酿酒酵母组蛋白去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制 11月10日，Biochemical Journal在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所丁建平组关于酿酒酵母组蛋白去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制的研究成果。 人和酵母等真核生物中存在一类含有
研究揭示拟南芥组蛋白去甲基化酶JMJ13的结构功能
3月21日，《自然-通讯》（Nature Communications）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心杜嘉木研究组、中科院遗传与发育生物学研究所曹晓风研究组和河北师范大学孙大业研究组合作完成的题为The Arabidopsis H3
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用（二）
4.ALKBH5抑 制胰腺ai细胞生长和转移将过表达ALKBH5的ai细胞移植到裸鼠体内，发现过表达ALKBH5的ai细胞生成的肿 瘤体积明显小于对照组，并且细胞生长的指示分子Ki-67的表达也明显降低。染色显示过表达ALKBH5的组织中侵袭和转移的指示分子MMP-2和MMP-9表达降低，敲
昆明动物所揭示DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用
3月21日，EMBO Reports在线发表了中国科学院昆明动物研究所李家立课题组的研究论文，该文揭示了DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用。昆明动物所助理研究员蒋德伟为文章第一作者，研究员李家立为通讯作者。 准确而有效的DNA损伤与修复应答对机体各种类型的细胞维持基因组完整性是十分重
上海植物逆境研究中心在植物DNA去甲基化调控研究进展
6月15日，国际权威学术期刊Science在线发表了中科院上海植物逆境生物学研究中心、中科院上海生命科学研究院植物生理生态所朱健康课题组的研究论文A Histone Acetyltransferase Regulates Active DNA Demethylation in
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用（一）
文章导读表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成，还有文章探究过其在急性白血病中的作用，但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在M
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用（三）
总结本文作者通过RNA-seq, m6A-seq, MeRIP-qPCR, ChIP, CoIP,双荧光素酶实验等方法，研究发现去甲基化酶ALKBH5缺失会加重胰腺ai的发生和不良临床病理表现特征。ALKBH5的过度表达可降低了体外肿 瘤的增殖、迁移和侵袭活性，改善了体内肿 瘤生长，而ALK
研究揭示RNA去甲基化酶的氧化还原修饰调控番茄果实成熟机制
活性氧作为重要的信号分子，在植物抵御病原菌侵染、响应逆境胁迫以及维持正常生长发育的多个生物学过程中发挥重要的调控作用。在多种活性氧分子中，过氧化氢具有较长的半衰期，可调控干细胞分化、花粉管伸长、气孔发育、果实成熟等植物发育过程，但过氧化氢如何与其他信号途径协同作用，共同调控植物发育过程却不甚清楚。中
母体维生素C调节DNA去甲基化和雌性胎儿生殖细胞发育
通常来说，发育被认为是基因组固有调控的，不过目前这种观点已经被刷新。证据表明，发育很容易受到外界环境调节的影响，并可能产生长期后果，当然这其中也包括哺乳动物。所以呢，由于这种表观遗传效应的潜在可能性，研究者们对具有这种潜能的生殖细胞一直青睐有加。 哺乳动物的生殖细胞经历了广泛的DNA去甲基化，
伊成器等学者解析去甲基化酶底物特异性的分子机制
核酸的可逆化学修饰对细胞命运的调控具有重要作用。E. coli AlkB蛋白是首个核酸氧化去甲基化酶，通过识别并作用于1-甲基腺嘌呤这一类型的DNA/RNA损伤来维持基因组的稳定性。目前已发现9 个AlkB的人类同源蛋白，其中许多蛋白对细胞生命活动的维持都起到重要作用。例
研究揭示双加氧酶的低复杂度结构域调控DNA氧化去甲基化
1月4日，《自然-结构与分子生物学》（Nature Structural & Molecular Biology）在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心杜雅蕊/徐国良团队完成的题为Auto-suppression of Tet dioxygenases protects the mouse o
我国揭示KDM5亚家族组蛋白去甲基化酶的底物识别机制
12月12日，中国科学院植物逆境生物学研究中心杜嘉木课题组，中科院院士、中科院遗传与发育生物学研究所曹晓风课题组合作完成的论文，以Structure of the Arabidopsis JMJ14-H3K4me3 Complex Provides Insight into the Substr
研究揭示双加氧酶的低复杂度结构域调控DNA氧化去甲基化
《自然-结构与分子生物学》（Nature Structural & Molecular Biology）在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心杜雅蕊/徐国良团队完成的题为Auto-suppression of Tet dioxygenases protects the mouse oocy
我国学者发现ALKBH1识别与催化DNA－6mA去甲基化结构
DNA 6mA（N6-甲基腺苷）作为DNA的第二种修饰形式，是哺乳动物基因组表观遗传调控的重要组成。基因组6mA的水平在生物体内具有调节组织发育、性别比例、基因表达、X染色体失活等多种作用，阐明其调控机制是解码这一新型修饰碱基生物学功能的关键。2016年，耶鲁大学Andrew Xiao首次报道A
甲基化的甲基化的功能
甲基化是蛋白质和核酸的一种重要的修饰，调节基因的表达和关闭，与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关，是表观遗传学的重要研究内容之一。 最常见的甲基化修饰有DNA甲基化和组蛋白甲基化。DNA甲基化能关闭某些基因的活性，去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、D
DNA去甲基化酶TET3调控I型干扰素表达新机制
7月14日，国际学术期刊《细胞-报告》（Cell Reports）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王红艳研究组的最新研究成果：TET3 inhibits type I IFN production independent of DNA demethylation。
NCB－|－这一次，FTO是snRNA的m6Am去甲基化酶
RNA的m6A修饰是RNA表观遗传学研究领域的大热门，近年来相关研究多次登上高分杂志。从胚胎发育到疾病进程，从RNA的稳定性到可变剪接和翻译效率，m6A的功能几乎无处不在（图1）。图1 由于m6A是一种RNA修饰，若想知道它在某一体系（发育阶段或癌症）中的作用，目前大部分研究都是基于影响m6A
遗传发育所曹晓风团队开辟水稻表观遗传研究新方向
DNA测序技术发明之后，科学家们认为自己可以通过DNA全基因组测序解析生命的全部密码。渐渐的，他们发现有些重要信息并不编码于DNA序列里面，即便基因序列没有发生变化，生物体的表型也可以改变。这种研究被称为“表观遗传学”，继传统遗传学之后，表观遗传学如火如荼地发展起来了。曹晓风供图 中科院院士、